MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 10981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_018224	GCT	2	6	2652003	2652008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_018224	CGG	2	6	2652018	2652023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_018224	GA	3	6	2652026	2652031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_018224	CGA	2	6	2652035	2652040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_018224	ACTA	2	8	2652104	2652111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8006	NC_018224	CTGT	2	8	2652120	2652127	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8007	NC_018224	GAT	2	6	2652129	2652134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_018224	GAG	2	6	2652169	2652174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_018224	GTCG	2	8	2652182	2652189	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8010	NC_018224	GCGG	2	8	2652190	2652197	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8011	NC_018224	TCC	2	6	2654665	2654670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8012	NC_018224	TCG	2	6	2654683	2654688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_018224	GGT	2	6	2654693	2654698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_018224	TTA	2	6	2654755	2654760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_018224	TCG	2	6	2654810	2654815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_018224	TGA	2	6	2656984	2656989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_018224	AAGC	2	8	2657044	2657051	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8018	NC_018224	AGCGG	2	10	2657056	2657065	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8019	NC_018224	CGA	2	6	2657591	2657596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_018224	GCC	2	6	2657644	2657649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8021	NC_018224	A	6	6	2659836	2659841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_018224	CGT	2	6	2659860	2659865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_018224	AGG	2	6	2660996	2661001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_018224	TC	3	6	2665410	2665415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8025	NC_018224	CCG	2	6	2666026	2666031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8026	NC_018224	GCC	2	6	2666062	2666067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8027	NC_018224	CCG	2	6	2666354	2666359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8028	NC_018224	CGA	2	6	2666378	2666383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_018224	CCG	2	6	2666421	2666426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8030	NC_018224	GTC	2	6	2667895	2667900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_018224	GACG	2	8	2667941	2667948	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8032	NC_018224	CT	3	6	2667985	2667990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_018224	TCGGT	2	10	2668007	2668016	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8034	NC_018224	TCGA	2	8	2668069	2668076	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8035	NC_018224	GGCC	2	8	2668377	2668384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8036	NC_018224	CGC	2	6	2668401	2668406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_018224	CTGTC	2	10	2668439	2668448	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8038	NC_018224	TCTGC	2	10	2668475	2668484	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8039	NC_018224	TG	3	6	2668489	2668494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_018224	CA	3	6	2669261	2669266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_018224	ACC	2	6	2671034	2671039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8042	NC_018224	ATC	2	6	2671070	2671075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_018224	GTCG	2	8	2671883	2671890	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8044	NC_018224	GCC	2	6	2671916	2671921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_018224	GGA	2	6	2671960	2671965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_018224	TA	3	6	2671967	2671972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_018224	AC	3	6	2671985	2671990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8048	NC_018224	CGA	2	6	2672716	2672721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_018224	TCG	2	6	2675250	2675255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_018224	CGG	2	6	2675294	2675299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_018224	CG	3	6	2675778	2675783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_018224	CGA	2	6	2675787	2675792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_018224	GCC	2	6	2675804	2675809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8054	NC_018224	TCC	2	6	2675862	2675867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8055	NC_018224	GGC	2	6	2675908	2675913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_018224	TCC	2	6	2677036	2677041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8057	NC_018224	CGA	2	6	2677082	2677087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_018224	T	6	6	2678173	2678178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_018224	CGT	2	6	2678235	2678240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_018224	CGG	2	6	2678244	2678249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_018224	CGG	2	6	2678259	2678264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_018224	CGG	2	6	2678520	2678525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_018224	CGA	2	6	2679519	2679524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_018224	TC	3	6	2679551	2679556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8065	NC_018224	GCG	2	6	2679613	2679618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_018224	CCCG	2	8	2679629	2679636	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8067	NC_018224	CGG	3	9	2681292	2681300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_018224	CGGT	2	8	2681366	2681373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8069	NC_018224	GCC	2	6	2681807	2681812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8070	NC_018224	CGTC	2	8	2682754	2682761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8071	NC_018224	CCATAC	2	12	2683162	2683173	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
8072	NC_018224	GCG	2	6	2684066	2684071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_018224	GA	3	6	2687749	2687754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_018224	CCG	2	6	2687789	2687794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8075	NC_018224	GCA	2	6	2690332	2690337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_018224	CCG	2	6	2690374	2690379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8077	NC_018224	AGTG	2	8	2690420	2690427	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_018224	GACC	2	8	2690509	2690516	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8079	NC_018224	CGTC	2	8	2690545	2690552	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8080	NC_018224	GAC	2	6	2690585	2690590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_018224	CCG	2	6	2690642	2690647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_018224	CCGG	2	8	2690699	2690706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8083	NC_018224	GTC	2	6	2690724	2690729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_018224	ACG	2	6	2690739	2690744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_018224	GCG	3	9	2690760	2690768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_018224	GCTC	2	8	2690780	2690787	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8087	NC_018224	TCCGT	2	10	2690817	2690826	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8088	NC_018224	CAG	2	6	2690849	2690854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_018224	CGCT	2	8	2690864	2690871	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8090	NC_018224	CGA	2	6	2690915	2690920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_018224	AGA	2	6	2690937	2690942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_018224	GTG	2	6	2690943	2690948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_018224	ACG	2	6	2690957	2690962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_018224	CTG	2	6	2690964	2690969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_018224	TCT	2	6	2692175	2692180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_018224	GGTC	2	8	2692531	2692538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8097	NC_018224	CGA	2	6	2692559	2692564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_018224	TTGA	2	8	2692639	2692646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_018224	TA	3	6	2692694	2692699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_018224	CGA	2	6	2692752	2692757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_018224	CGG	2	6	2695577	2695582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_018224	ACCG	2	8	2697838	2697845	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8103	NC_018224	GC	3	6	2697870	2697875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8104	NC_018224	GCC	2	6	2698654	2698659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8105	NC_018224	GAGC	2	8	2698660	2698667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8106	NC_018224	GCG	2	6	2699492	2699497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_018224	GAC	2	6	2699531	2699536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_018224	C	6	6	2699634	2699639	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8109	NC_018224	ACG	2	6	2700012	2700017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_018224	TA	3	6	2700115	2700120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_018224	TCCG	2	8	2700126	2700133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8112	NC_018224	TCGC	2	8	2702255	2702262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8113	NC_018224	GCC	2	6	2702274	2702279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8114	NC_018224	CGA	2	6	2702303	2702308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_018224	GCC	2	6	2703124	2703129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8116	NC_018224	ACG	2	6	2703150	2703155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_018224	TCGC	2	8	2703164	2703171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8118	NC_018224	CGG	2	6	2703213	2703218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_018224	GCG	2	6	2704605	2704610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_018224	TTC	2	6	2704613	2704618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_018224	AGC	2	6	2704659	2704664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_018224	TA	4	8	2704717	2704724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_018224	AGGG	2	8	2704737	2704744	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_018224	CGGA	2	8	2704848	2704855	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8125	NC_018224	CCGG	2	8	2704862	2704869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8126	NC_018224	ACT	2	6	2704904	2704909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_018224	TC	3	6	2705302	2705307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8128	NC_018224	CG	3	6	2705349	2705354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8129	NC_018224	TCG	2	6	2705421	2705426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8130	NC_018224	GCG	2	6	2705483	2705488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8131	NC_018224	TCC	2	6	2705499	2705504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8132	NC_018224	GTGC	2	8	2705529	2705536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8133	NC_018224	TCG	2	6	2705537	2705542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8162	NC_018224	CG	3	6	2719075	2719080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8231	NC_018224	TCGC	2	8	2752724	2752731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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8394	NC_018224	GGT	2	6	2793203	2793208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8395	NC_018224	CGC	2	6	2793273	2793278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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