MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 10981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_018224	CTG	2	6	2509938	2509943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7502	NC_018224	GAC	2	6	2509977	2509982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7503	NC_018224	AACG	2	8	2510005	2510012	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7504	NC_018224	GCC	2	6	2511052	2511057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7505	NC_018224	GTCGA	2	10	2512481	2512490	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7506	NC_018224	CGG	2	6	2512499	2512504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_018224	GTCG	2	8	2512532	2512539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7508	NC_018224	CGC	2	6	2513204	2513209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7509	NC_018224	CTC	2	6	2513238	2513243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7510	NC_018224	GTC	2	6	2513278	2513283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7511	NC_018224	CGCT	2	8	2513288	2513295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7512	NC_018224	TGCC	2	8	2513333	2513340	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7513	NC_018224	CACT	2	8	2513413	2513420	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7514	NC_018224	CGC	2	6	2513463	2513468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7515	NC_018224	CGG	2	6	2514562	2514567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_018224	ACG	2	6	2514597	2514602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_018224	TCA	2	6	2514621	2514626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7518	NC_018224	ACCG	2	8	2514703	2514710	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7519	NC_018224	CCG	2	6	2514717	2514722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7520	NC_018224	CG	3	6	2514735	2514740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7521	NC_018224	GATT	2	8	2514753	2514760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_018224	CGG	2	6	2514821	2514826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7523	NC_018224	CGAC	2	8	2515590	2515597	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7524	NC_018224	GCG	2	6	2517543	2517548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7525	NC_018224	CGA	2	6	2518188	2518193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7526	NC_018224	GCG	2	6	2518210	2518215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7527	NC_018224	AGC	2	6	2518219	2518224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_018224	CGC	2	6	2518270	2518275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7529	NC_018224	AAC	2	6	2518313	2518318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7530	NC_018224	GTG	2	6	2518339	2518344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_018224	CTCC	2	8	2519570	2519577	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7532	NC_018224	AATC	2	8	2519590	2519597	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7533	NC_018224	C	6	6	2524035	2524040	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7534	NC_018224	CGGTGA	2	12	2524078	2524089	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7535	NC_018224	CGC	2	6	2524098	2524103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7536	NC_018224	CACC	2	8	2524109	2524116	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7537	NC_018224	GTT	2	6	2526132	2526137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_018224	GCC	2	6	2526183	2526188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7539	NC_018224	CGAT	2	8	2526457	2526464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7540	NC_018224	CGG	2	6	2526484	2526489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7541	NC_018224	TCG	2	6	2526525	2526530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7542	NC_018224	TTG	2	6	2526536	2526541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_018224	GGT	2	6	2526755	2526760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_018224	TGA	2	6	2526948	2526953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_018224	GTA	2	6	2526955	2526960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_018224	ACG	2	6	2531360	2531365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_018224	CGAA	2	8	2531374	2531381	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7548	NC_018224	GAC	2	6	2531834	2531839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_018224	CGCGT	2	10	2531855	2531864	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7550	NC_018224	T	6	6	2531877	2531882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_018224	CTC	2	6	2531893	2531898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7552	NC_018224	CGAG	2	8	2533425	2533432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7553	NC_018224	CCA	2	6	2535511	2535516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7554	NC_018224	CGA	2	6	2535571	2535576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_018224	CTCG	2	8	2535621	2535628	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7556	NC_018224	CCGT	2	8	2535709	2535716	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7557	NC_018224	ATA	2	6	2535778	2535783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_018224	AGAA	2	8	2536789	2536796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_018224	CTC	2	6	2536808	2536813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7560	NC_018224	GCCCG	2	10	2536897	2536906	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7561	NC_018224	CGAG	2	8	2537158	2537165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7562	NC_018224	GCA	2	6	2537466	2537471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7563	NC_018224	TCA	2	6	2537489	2537494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7564	NC_018224	GGT	2	6	2537497	2537502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_018224	GC	3	6	2537572	2537577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7566	NC_018224	GCT	3	9	2537619	2537627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7567	NC_018224	GAC	2	6	2537694	2537699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7568	NC_018224	AG	3	6	2537780	2537785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_018224	AC	3	6	2537805	2537810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7570	NC_018224	ACT	2	6	2537827	2537832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7571	NC_018224	GGA	2	6	2537857	2537862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_018224	ACG	2	6	2537873	2537878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7573	NC_018224	CTC	2	6	2537909	2537914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7574	NC_018224	CGA	2	6	2537928	2537933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_018224	CGAG	2	8	2537970	2537977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7576	NC_018224	CCG	2	6	2538037	2538042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7577	NC_018224	GTC	2	6	2538053	2538058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7578	NC_018224	CT	3	6	2538762	2538767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7579	NC_018224	CGC	2	6	2538828	2538833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7580	NC_018224	CAG	2	6	2538839	2538844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7581	NC_018224	CGAC	2	8	2538890	2538897	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7582	NC_018224	GGC	2	6	2539022	2539027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7583	NC_018224	CT	3	6	2539029	2539034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7584	NC_018224	AG	3	6	2539193	2539198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7585	NC_018224	CGG	2	6	2539229	2539234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7586	NC_018224	GGC	2	6	2539237	2539242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7587	NC_018224	GTT	2	6	2539294	2539299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7588	NC_018224	CA	3	6	2539367	2539372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7589	NC_018224	TG	3	6	2539381	2539386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7590	NC_018224	GTG	2	6	2539403	2539408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_018224	GCG	2	6	2539409	2539414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7592	NC_018224	CGC	2	6	2539507	2539512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7593	NC_018224	GCC	2	6	2539517	2539522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7594	NC_018224	CGT	2	6	2539548	2539553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7595	NC_018224	ATGTA	2	10	2539643	2539652	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_018224	TG	3	6	2539657	2539662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7597	NC_018224	TCT	2	6	2539736	2539741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7598	NC_018224	GGT	2	6	2539754	2539759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_018224	GTG	2	6	2539810	2539815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_018224	ATAG	2	8	2539925	2539932	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_018224	ACG	2	6	2539948	2539953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7602	NC_018224	CCT	2	6	2539973	2539978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7603	NC_018224	AAC	2	6	2539989	2539994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7604	NC_018224	GAC	2	6	2540083	2540088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7605	NC_018224	AGC	2	6	2540135	2540140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7606	NC_018224	CGTC	2	8	2540175	2540182	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7607	NC_018224	GC	3	6	2540262	2540267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7608	NC_018224	TCC	2	6	2540321	2540326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7609	NC_018224	GTA	2	6	2540357	2540362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7610	NC_018224	CCT	2	6	2540410	2540415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7611	NC_018224	TGC	2	6	2540421	2540426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7612	NC_018224	TAC	2	6	2540598	2540603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7613	NC_018224	CCG	2	6	2540631	2540636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7614	NC_018224	TGT	2	6	2540734	2540739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_018224	AGGC	2	8	2540787	2540794	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7616	NC_018224	CGC	2	6	2540870	2540875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7617	NC_018224	TTCG	2	8	2540963	2540970	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7618	NC_018224	GGC	2	6	2541031	2541036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7619	NC_018224	TGT	2	6	2541091	2541096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7620	NC_018224	GCT	2	6	2541201	2541206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7621	NC_018224	TGC	2	6	2541306	2541311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7622	NC_018224	GGT	2	6	2541320	2541325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_018224	GCT	2	6	2541398	2541403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7624	NC_018224	ACC	2	6	2541438	2541443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7625	NC_018224	ACG	2	6	2541545	2541550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7626	NC_018224	G	6	6	2541573	2541578	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7627	NC_018224	CTC	2	6	2541583	2541588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7628	NC_018224	CGG	2	6	2541843	2541848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7629	NC_018224	GAT	2	6	2541897	2541902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7630	NC_018224	CTA	2	6	2541982	2541987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7631	NC_018224	TG	3	6	2542022	2542027	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7632	NC_018224	GAG	2	6	2542128	2542133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7633	NC_018224	CTCGT	2	10	2542204	2542213	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7634	NC_018224	TCG	2	6	2542216	2542221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7635	NC_018224	CTT	2	6	2542266	2542271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7636	NC_018224	CTTT	2	8	2542378	2542385	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7637	NC_018224	TTC	2	6	2542473	2542478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7638	NC_018224	CTT	2	6	2542522	2542527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7639	NC_018224	CCA	2	6	2542548	2542553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7640	NC_018224	ACA	2	6	2542589	2542594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7641	NC_018224	AC	3	6	2542653	2542658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7642	NC_018224	CGGC	2	8	2542682	2542689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7643	NC_018224	GTG	2	6	2542724	2542729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7644	NC_018224	TCGGT	2	10	2542732	2542741	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7645	NC_018224	TCC	2	6	2542794	2542799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7646	NC_018224	TCC	2	6	2542835	2542840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7647	NC_018224	AGG	2	6	2542847	2542852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7648	NC_018224	TCGA	2	8	2542957	2542964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7649	NC_018224	GT	3	6	2543140	2543145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7650	NC_018224	TAC	2	6	2543190	2543195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7652	NC_018224	TCC	2	6	2543383	2543388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7653	NC_018224	ACC	2	6	2543400	2543405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7654	NC_018224	CGG	2	6	2543485	2543490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7658	NC_018224	GCACA	2	10	2543689	2543698	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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7661	NC_018224	GC	3	6	2543932	2543937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7662	NC_018224	AAT	2	6	2543985	2543990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7663	NC_018224	TCA	2	6	2543996	2544001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7666	NC_018224	ACC	2	6	2544062	2544067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7667	NC_018224	CTG	2	6	2544152	2544157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7669	NC_018224	CA	3	6	2544548	2544553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7670	NC_018224	CCGA	2	8	2544581	2544588	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7688	NC_018224	ACCGA	2	10	2548654	2548663	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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7691	NC_018224	CAG	2	6	2550288	2550293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7693	NC_018224	TCG	2	6	2551443	2551448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7701	NC_018224	GCCGGT	2	12	2553930	2553941	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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7747	NC_018224	CGGG	3	12	2572180	2572191	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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7754	NC_018224	GATC	2	8	2573575	2573582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7755	NC_018224	CTG	2	6	2573643	2573648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7756	NC_018224	CGG	2	6	2573695	2573700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7757	NC_018224	ACGA	2	8	2573729	2573736	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7758	NC_018224	AGCC	2	8	2573820	2573827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7759	NC_018224	AC	3	6	2573871	2573876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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