MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 12433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015731	CAAA	2	8	1243194	1243201	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_015731	TTA	2	6	1246015	1246020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_015731	TATC	2	8	1246048	1246055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_015731	GTAG	2	8	1246102	1246109	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_015731	AT	3	6	1246138	1246143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_015731	TAT	2	6	1246171	1246176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_015731	TACT	2	8	1250690	1250697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_015731	GCT	2	6	1250698	1250703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_015731	CTT	2	6	1253557	1253562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_015731	CTTG	2	8	1253653	1253660	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4011	NC_015731	ATC	2	6	1254789	1254794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_015731	TTC	2	6	1256804	1256809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_015731	TGC	2	6	1256883	1256888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_015731	GAA	2	6	1256936	1256941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_015731	ATC	2	6	1256989	1256994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_015731	T	6	6	1257009	1257014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_015731	ATGTG	2	10	1258442	1258451	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_015731	ATCC	2	8	1258468	1258475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_015731	T	6	6	1258519	1258524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_015731	GTC	2	6	1258659	1258664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_015731	TAA	2	6	1261151	1261156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_015731	TTG	2	6	1261582	1261587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_015731	AG	3	6	1261648	1261653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_015731	GCC	2	6	1264417	1264422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_015731	A	6	6	1264511	1264516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015731	AAT	2	6	1264584	1264589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_015731	TTCG	2	8	1264610	1264617	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4028	NC_015731	A	6	6	1264629	1264634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_015731	GA	3	6	1264716	1264721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_015731	TGT	2	6	1264767	1264772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015731	TGT	2	6	1267311	1267316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_015731	ATTG	2	8	1267326	1267333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_015731	ATC	2	6	1267373	1267378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_015731	GAAA	2	8	1267381	1267388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_015731	TTATTT	2	12	1267401	1267412	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_015731	AGA	2	6	1267420	1267425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_015731	TTCT	2	8	1267445	1267452	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_015731	T	6	6	1267484	1267489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_015731	T	7	7	1267561	1267567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_015731	T	7	7	1268037	1268043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_015731	AGA	2	6	1268054	1268059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_015731	A	6	6	1268143	1268148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_015731	CATTT	2	10	1268194	1268203	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4044	NC_015731	ATA	2	6	1268228	1268233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_015731	CTT	2	6	1268251	1268256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_015731	TTG	2	6	1268261	1268266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_015731	CT	3	6	1268285	1268290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_015731	CAG	2	6	1268310	1268315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_015731	ATG	2	6	1268522	1268527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_015731	AT	3	6	1268535	1268540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_015731	T	6	6	1268593	1268598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_015731	AAAT	2	8	1268605	1268612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_015731	TCT	2	6	1268669	1268674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_015731	TAA	2	6	1268769	1268774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_015731	TG	3	6	1268775	1268780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_015731	GCA	2	6	1268791	1268796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_015731	AC	3	6	1268802	1268807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4058	NC_015731	ATG	2	6	1268818	1268823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_015731	ATT	2	6	1272994	1272999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_015731	TAT	2	6	1273011	1273016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015731	TTG	2	6	1273032	1273037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015731	T	6	6	1273913	1273918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015731	TAA	2	6	1273947	1273952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_015731	T	6	6	1273967	1273972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_015731	TGGGTT	2	12	1273985	1273996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_015731	GAA	2	6	1274022	1274027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_015731	AAGCA	2	10	1274031	1274040	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4068	NC_015731	CGAG	2	8	1274123	1274130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4069	NC_015731	AAT	2	6	1274137	1274142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_015731	TTGCT	2	10	1274158	1274167	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4071	NC_015731	GCAT	2	8	1274169	1274176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4072	NC_015731	CAG	2	6	1274190	1274195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_015731	TTGA	2	8	1274196	1274203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_015731	TG	3	6	1274853	1274858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_015731	AAT	2	6	1274861	1274866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_015731	T	6	6	1276621	1276626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_015731	GCA	2	6	1276651	1276656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_015731	TGA	2	6	1278096	1278101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_015731	TAA	2	6	1278105	1278110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_015731	GCAT	2	8	1280560	1280567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_015731	TAG	2	6	1280570	1280575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_015731	AAC	2	6	1280605	1280610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_015731	ATT	2	6	1280648	1280653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_015731	AT	3	6	1280661	1280666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_015731	CAT	2	6	1280710	1280715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4087	NC_015731	TTC	2	6	1280803	1280808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_015731	GC	4	8	1280819	1280826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_015731	GCT	2	6	1280851	1280856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_015731	GCC	2	6	1280954	1280959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_015731	GATT	2	8	1281046	1281053	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_015731	T	7	7	1281060	1281066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_015731	TTG	2	6	1281072	1281077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_015731	T	6	6	1281212	1281217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_015731	GTT	2	6	1287313	1287318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_015731	GGT	2	6	1287466	1287471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_015731	TCA	2	6	1287498	1287503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4099	NC_015731	ATA	2	6	1288502	1288507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_015731	ATTG	2	8	1288530	1288537	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_015731	TGT	2	6	1289426	1289431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_015731	TGA	2	6	1289530	1289535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015731	AGA	2	6	1292353	1292358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_015731	ATT	2	6	1293207	1293212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_015731	ATA	2	6	1293220	1293225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015731	ATG	2	6	1293238	1293243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4108	NC_015731	ATT	2	6	1294378	1294383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_015731	T	6	6	1297118	1297123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_015731	A	7	7	1297124	1297130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_015731	T	6	6	1297151	1297156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_015731	TAGCA	2	10	1297160	1297169	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4113	NC_015731	GT	3	6	1297175	1297180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_015731	CTTT	2	8	1297185	1297192	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4115	NC_015731	AAT	2	6	1297208	1297213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_015731	AAT	2	6	1297266	1297271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_015731	TA	3	6	1297626	1297631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_015731	A	7	7	1297661	1297667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_015731	AAC	2	6	1297699	1297704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_015731	TTCC	2	8	1297706	1297713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_015731	TAAG	2	8	1297729	1297736	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_015731	T	6	6	1297742	1297747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_015731	CTT	2	6	1297754	1297759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_015731	A	6	6	1299072	1299077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_015731	T	6	6	1299114	1299119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_015731	GTAC	2	8	1299188	1299195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4127	NC_015731	T	6	6	1299215	1299220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_015731	AAT	2	6	1299240	1299245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_015731	TAT	2	6	1299552	1299557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_015731	AGT	2	6	1299561	1299566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_015731	TG	3	6	1299916	1299921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_015731	GATA	2	8	1299944	1299951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_015731	TAT	2	6	1301043	1301048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_015731	AG	3	6	1301074	1301079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_015731	CTG	2	6	1301130	1301135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_015731	AAT	2	6	1301190	1301195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_015731	TTC	3	9	1301210	1301218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4138	NC_015731	TAA	2	6	1301240	1301245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_015731	AT	3	6	1301255	1301260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_015731	AT	3	6	1301275	1301280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_015731	ATA	2	6	1301317	1301322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_015731	ATTTT	2	10	1301390	1301399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_015731	TA	3	6	1301445	1301450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_015731	ATTG	2	8	1301503	1301510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_015731	A	8	8	1301565	1301572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_015731	TTAG	2	8	1301585	1301592	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_015731	AAG	2	6	1301604	1301609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4151	NC_015731	ATT	2	6	1301795	1301800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_015731	AT	3	6	1301809	1301814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_015731	GTAA	2	8	1301825	1301832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_015731	TC	3	6	1303107	1303112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4155	NC_015731	CCT	2	6	1303124	1303129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4165	NC_015731	CAC	2	6	1303514	1303519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4166	NC_015731	TGA	2	6	1303535	1303540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4168	NC_015731	GCA	2	6	1303591	1303596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4179	NC_015731	ATC	2	6	1307032	1307037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4183	NC_015731	TTG	2	6	1308775	1308780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4194	NC_015731	TAT	2	6	1312336	1312341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4200	NC_015731	GA	5	10	1315205	1315214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4209	NC_015731	A	9	9	1315601	1315609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4210	NC_015731	TGA	2	6	1315645	1315650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4212	NC_015731	ATC	2	6	1316955	1316960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4230	NC_015731	ATT	2	6	1321357	1321362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4246	NC_015731	CTT	2	6	1322437	1322442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4247	NC_015731	TCA	2	6	1322474	1322479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4248	NC_015731	CTCA	2	8	1322488	1322495	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4249	NC_015731	GCT	2	6	1322592	1322597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4250	NC_015731	GCT	2	6	1322641	1322646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4251	NC_015731	TCA	3	9	1322687	1322695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4252	NC_015731	TGAC	2	8	1322703	1322710	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4253	NC_015731	CCG	2	6	1322719	1322724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4254	NC_015731	GAT	2	6	1322740	1322745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_015731	TCA	2	6	1322759	1322764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_015731	ATG	2	6	1322805	1322810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_015731	ATCC	2	8	1322952	1322959	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4258	NC_015731	AGG	2	6	1323005	1323010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_015731	TAA	2	6	1323683	1323688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_015731	TGG	2	6	1325278	1325283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_015731	GGC	2	6	1325329	1325334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_015731	TAA	2	6	1325380	1325385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_015731	A	6	6	1326674	1326679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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