MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 12433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015731	AATC	2	8	1134562	1134569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_015731	A	7	7	1134623	1134629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_015731	GCT	2	6	1134667	1134672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_015731	TTG	2	6	1134690	1134695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_015731	AAT	2	6	1134724	1134729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_015731	GAT	2	6	1134742	1134747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_015731	G	6	6	1134854	1134859	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_015731	ATT	2	6	1134863	1134868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_015731	A	6	6	1135032	1135037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_015731	T	6	6	1135081	1135086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_015731	TGCAAG	2	12	1135113	1135124	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3512	NC_015731	AGTC	2	8	1135140	1135147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_015731	ATT	2	6	1135192	1135197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_015731	TGTTC	2	10	1135274	1135283	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3515	NC_015731	CTTAC	2	10	1135342	1135351	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3516	NC_015731	T	7	7	1138020	1138026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_015731	AATG	2	8	1138056	1138063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_015731	AAG	2	6	1138814	1138819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_015731	TCTA	2	8	1138847	1138854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3520	NC_015731	TGAA	2	8	1139704	1139711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_015731	GAA	2	6	1140168	1140173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_015731	TAA	2	6	1143349	1143354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_015731	T	7	7	1146882	1146888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_015731	CTTT	2	8	1146890	1146897	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_015731	AGC	2	6	1148156	1148161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_015731	AGG	2	6	1148169	1148174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_015731	GA	3	6	1148938	1148943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_015731	GAA	2	6	1148947	1148952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_015731	ACA	2	6	1148955	1148960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_015731	CTT	2	6	1150279	1150284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_015731	CGTA	2	8	1150297	1150304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3532	NC_015731	CAA	2	6	1150355	1150360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_015731	TGG	2	6	1150362	1150367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_015731	TAA	2	6	1152737	1152742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_015731	CAATCA	2	12	1152855	1152866	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_015731	CTT	2	6	1154334	1154339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_015731	AAAC	2	8	1154345	1154352	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3538	NC_015731	TAA	2	6	1154785	1154790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_015731	TGAA	2	8	1154794	1154801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_015731	AGC	2	6	1154847	1154852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_015731	CTG	2	6	1154937	1154942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_015731	A	7	7	1154968	1154974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_015731	A	7	7	1155019	1155025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_015731	TG	3	6	1155032	1155037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_015731	AAT	2	6	1155046	1155051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_015731	ATC	2	6	1155059	1155064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_015731	T	6	6	1155104	1155109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_015731	T	7	7	1155116	1155122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_015731	AAAATA	2	12	1155145	1155156	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_015731	T	7	7	1155179	1155185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_015731	GCA	2	6	1155190	1155195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_015731	ATT	2	6	1155263	1155268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_015731	GGC	2	6	1155325	1155330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_015731	CGAC	2	8	1155359	1155366	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_015731	CTG	2	6	1155389	1155394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_015731	GATT	2	8	1155427	1155434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_015731	CGA	2	6	1155519	1155524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_015731	GAT	2	6	1155578	1155583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_015731	TGG	2	6	1155595	1155600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_015731	CCAGAA	2	12	1155788	1155799	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_015731	GGATTG	2	12	1155827	1155838	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_015731	GCAA	2	8	1155858	1155865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3563	NC_015731	TGG	2	6	1155883	1155888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_015731	T	6	6	1155895	1155900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_015731	GAA	2	6	1155963	1155968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_015731	AT	3	6	1156029	1156034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_015731	ATT	2	6	1156056	1156061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_015731	AATC	2	8	1156062	1156069	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3569	NC_015731	TTA	2	6	1156117	1156122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_015731	GAT	2	6	1156176	1156181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_015731	T	7	7	1156295	1156301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_015731	TG	3	6	1156408	1156413	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_015731	ACCA	2	8	1156425	1156432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_015731	CAA	2	6	1156470	1156475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_015731	TC	3	6	1156497	1156502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_015731	TG	4	8	1156689	1156696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_015731	CGT	2	6	1156701	1156706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_015731	TCT	2	6	1156715	1156720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_015731	GCA	2	6	1156752	1156757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_015731	TTC	2	6	1156768	1156773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_015731	GCC	2	6	1156793	1156798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_015731	CTA	2	6	1156812	1156817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_015731	GAC	2	6	1156863	1156868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_015731	GC	3	6	1156888	1156893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_015731	AGT	2	6	1156912	1156917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_015731	TGT	2	6	1156977	1156982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_015731	CGG	2	6	1156987	1156992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_015731	TGC	3	9	1156995	1157003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_015731	AGT	2	6	1157045	1157050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_015731	CAC	2	6	1157076	1157081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_015731	ATC	2	6	1157194	1157199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_015731	CAA	2	6	1157211	1157216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_015731	CAG	2	6	1157227	1157232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_015731	GATCG	2	10	1157267	1157276	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3595	NC_015731	GCA	2	6	1157289	1157294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_015731	AAT	2	6	1157306	1157311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_015731	CGG	2	6	1157317	1157322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_015731	CTT	2	6	1157337	1157342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_015731	TGA	2	6	1157363	1157368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_015731	CCA	2	6	1157391	1157396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_015731	TGAC	2	8	1157420	1157427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_015731	TTC	2	6	1157437	1157442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_015731	TGT	2	6	1157465	1157470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_015731	GCT	2	6	1157564	1157569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_015731	TTCAT	2	10	1157591	1157600	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3606	NC_015731	AAG	2	6	1157606	1157611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_015731	CCT	2	6	1157633	1157638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_015731	AGA	2	6	1157684	1157689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_015731	GAAAA	2	10	1157712	1157721	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_015731	GTAT	2	8	1157731	1157738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_015731	GT	3	6	1157773	1157778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_015731	TTA	2	6	1158219	1158224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_015731	TAA	2	6	1159620	1159625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_015731	TAAT	2	8	1159694	1159701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_015731	TATT	2	8	1159706	1159713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_015731	AT	3	6	1159715	1159720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_015731	TTA	2	6	1159721	1159726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_015731	A	6	6	1159734	1159739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_015731	GCT	2	6	1159835	1159840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_015731	AAT	2	6	1159902	1159907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_015731	AAT	2	6	1159935	1159940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_015731	AGTG	2	8	1159953	1159960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_015731	TTC	2	6	1160745	1160750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_015731	AGT	2	6	1160806	1160811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_015731	TA	3	6	1160865	1160870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_015731	AAT	2	6	1160912	1160917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_015731	TAATA	2	10	1160923	1160932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_015731	T	6	6	1161023	1161028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_015731	AATG	2	8	1161063	1161070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_015731	ATA	2	6	1161103	1161108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3632	NC_015731	TAT	2	6	1162012	1162017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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