MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 12433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015731	GT	3	6	460678	460683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015731	AGA	2	6	460689	460694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_015731	CTCC	2	8	460752	460759	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1504	NC_015731	TTG	2	6	460762	460767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015731	TAT	2	6	460776	460781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_015731	GTA	2	6	461008	461013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_015731	TGAATA	2	12	464935	464946	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_015731	ATTA	2	8	465061	465068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_015731	TAA	2	6	465189	465194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015731	TATCT	2	10	465201	465210	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1511	NC_015731	ATT	2	6	465244	465249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_015731	A	6	6	465273	465278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_015731	TGT	2	6	465331	465336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_015731	GTTTT	2	10	465386	465395	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015731	TCT	2	6	465430	465435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_015731	ATT	2	6	465445	465450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_015731	T	6	6	465528	465533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015731	AAG	2	6	467928	467933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_015731	TTA	3	9	467948	467956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015731	AAT	2	6	467957	467962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_015731	T	6	6	468004	468009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_015731	TCA	2	6	468074	468079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_015731	A	7	7	468091	468097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_015731	AAATT	2	10	468131	468140	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015731	ACA	2	6	468149	468154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_015731	T	6	6	469713	469718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015731	AT	3	6	470700	470705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_015731	ATTA	2	8	470717	470724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_015731	ATT	2	6	470834	470839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015731	T	6	6	470838	470843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015731	TGC	2	6	470849	470854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_015731	A	6	6	472927	472932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_015731	TGAT	2	8	472937	472944	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015731	TTAA	2	8	472978	472985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_015731	AAT	2	6	472997	473002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_015731	TCT	2	6	473015	473020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_015731	AGA	2	6	473029	473034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_015731	TTTA	2	8	475206	475213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_015731	A	6	6	475350	475355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_015731	TGTT	2	8	478292	478299	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_015731	AT	3	6	478336	478341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_015731	ACGC	2	8	478360	478367	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_015731	TAAA	2	8	478389	478396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_015731	GCA	2	6	480041	480046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_015731	TCT	2	6	481762	481767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_015731	CAAA	2	8	481794	481801	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_015731	A	6	6	486901	486906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_015731	GAT	2	6	486920	486925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_015731	TAG	2	6	486967	486972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015731	AG	3	6	486971	486976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_015731	TGC	2	6	488264	488269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_015731	ATA	2	6	488294	488299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_015731	ATA	2	6	488301	488306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_015731	CCG	2	6	488316	488321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_015731	GCATA	2	10	488324	488333	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1556	NC_015731	TTG	2	6	488360	488365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_015731	AATA	2	8	491510	491517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015731	CTG	2	6	491527	491532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_015731	AG	3	6	492804	492809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_015731	GACT	2	8	494272	494279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_015731	GCG	2	6	494313	494318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_015731	T	6	6	494381	494386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_015731	AGT	2	6	495475	495480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_015731	TAA	2	6	495484	495489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_015731	ATC	2	6	495547	495552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_015731	ATC	2	6	495678	495683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_015731	TGA	2	6	495686	495691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_015731	TTTC	2	8	495746	495753	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_015731	AACAGA	2	12	495781	495792	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1570	NC_015731	TCATTC	2	12	495867	495878	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_015731	TTG	2	6	495913	495918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_015731	A	6	6	495919	495924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015731	A	6	6	495938	495943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_015731	TGA	2	6	495947	495952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_015731	AGA	2	6	496025	496030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_015731	GAA	2	6	496119	496124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_015731	GATC	2	8	496185	496192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1578	NC_015731	TCAAGA	2	12	496193	496204	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1579	NC_015731	TGA	2	6	496277	496282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_015731	TAT	2	6	496285	496290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_015731	TAT	2	6	497386	497391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015731	CAA	2	6	497810	497815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_015731	CGT	2	6	497870	497875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_015731	T	7	7	499263	499269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015731	TAG	2	6	499274	499279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_015731	GGGTC	2	10	500040	500049	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1587	NC_015731	AAT	2	6	500068	500073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_015731	AGA	2	6	504488	504493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_015731	ACT	2	6	504494	504499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_015731	AAT	2	6	504588	504593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_015731	TTA	2	6	505036	505041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_015731	TAG	2	6	505055	505060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_015731	TTTA	2	8	505070	505077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_015731	T	7	7	505096	505102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015731	TGACT	2	10	505180	505189	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1596	NC_015731	GA	3	6	505232	505237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_015731	TAAT	2	8	505280	505287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_015731	AAG	2	6	505304	505309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_015731	AGT	2	6	505324	505329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_015731	AG	3	6	506196	506201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_015731	CGA	3	9	506257	506265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_015731	AGC	2	6	506269	506274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_015731	AGT	3	9	506277	506285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_015731	AGA	2	6	506329	506334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_015731	AGGG	2	8	506335	506342	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_015731	T	6	6	508491	508496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_015731	AGA	2	6	508503	508508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015731	TAC	2	6	508529	508534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_015731	AGA	2	6	508555	508560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_015731	AGG	2	6	508590	508595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_015731	TCA	2	6	509214	509219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_015731	TGT	2	6	509874	509879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_015731	T	6	6	509884	509889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_015731	GAA	2	6	510134	510139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_015731	ATT	2	6	510148	510153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_015731	ATG	2	6	510199	510204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_015731	TAA	2	6	510235	510240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_015731	AGG	2	6	510275	510280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_015731	TGGGG	2	10	510281	510290	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_015731	AGG	2	6	510371	510376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_015731	TAT	2	6	510421	510426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_015731	GAT	2	6	510445	510450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_015731	ATA	2	6	511091	511096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_015731	ATA	2	6	514231	514236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_015731	TTA	2	6	514730	514735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_015731	ATG	2	6	514753	514758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_015731	GCC	2	6	516881	516886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_015731	TAT	2	6	516887	516892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_015731	GCA	2	6	516899	516904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1631	NC_015731	ATT	2	6	517122	517127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_015731	ATTG	2	8	517141	517148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_015731	AAGT	2	8	517309	517316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_015731	TTG	2	6	517432	517437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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