MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 12433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_015731	GCT	2	6	3610984	3610989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12002	NC_015731	AT	3	6	3610990	3610995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_015731	GTTA	2	8	3611009	3611016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_015731	ATTG	2	8	3611041	3611048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12005	NC_015731	A	6	6	3611069	3611074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_015731	ATT	2	6	3611080	3611085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12007	NC_015731	ATT	2	6	3611909	3611914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_015731	AAT	2	6	3611955	3611960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_015731	CAC	2	6	3612024	3612029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12010	NC_015731	AT	3	6	3612041	3612046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12011	NC_015731	CAT	2	6	3612096	3612101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12012	NC_015731	TCG	2	6	3612177	3612182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12013	NC_015731	ATT	2	6	3612210	3612215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12014	NC_015731	GAAT	2	8	3612952	3612959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12015	NC_015731	GAAC	2	8	3612972	3612979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12016	NC_015731	CTG	2	6	3613378	3613383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12017	NC_015731	ACGG	2	8	3613415	3613422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12018	NC_015731	CTG	2	6	3613439	3613444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12019	NC_015731	CAA	2	6	3613518	3613523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12020	NC_015731	CCGC	2	8	3613537	3613544	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12021	NC_015731	CAA	2	6	3613568	3613573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12022	NC_015731	GCT	2	6	3613604	3613609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12023	NC_015731	GAAA	2	8	3613617	3613624	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12024	NC_015731	ATT	2	6	3613663	3613668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12025	NC_015731	A	6	6	3613680	3613685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12026	NC_015731	ATA	2	6	3613694	3613699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12027	NC_015731	CCT	2	6	3616552	3616557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12028	NC_015731	T	6	6	3616561	3616566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12029	NC_015731	ATG	2	6	3616597	3616602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12030	NC_015731	A	6	6	3616605	3616610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12031	NC_015731	GGT	2	6	3616787	3616792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12032	NC_015731	AAG	2	6	3617380	3617385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12033	NC_015731	ACGAT	2	10	3617401	3617410	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12034	NC_015731	CAA	2	6	3617525	3617530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12035	NC_015731	AGTCA	2	10	3618582	3618591	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12036	NC_015731	TC	3	6	3618671	3618676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12037	NC_015731	TTA	2	6	3619182	3619187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12038	NC_015731	CATC	2	8	3619892	3619899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12039	NC_015731	ATT	2	6	3619912	3619917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12040	NC_015731	ATA	2	6	3619935	3619940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12041	NC_015731	TTG	2	6	3621249	3621254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12042	NC_015731	A	6	6	3621260	3621265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12043	NC_015731	TGC	2	6	3621289	3621294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12044	NC_015731	T	6	6	3621302	3621307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_015731	TTTG	2	8	3621321	3621328	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_015731	TTC	2	6	3621369	3621374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12047	NC_015731	ATT	2	6	3621409	3621414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12048	NC_015731	ATG	2	6	3621438	3621443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12049	NC_015731	TTG	2	6	3622333	3622338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12050	NC_015731	GCA	2	6	3624953	3624958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12051	NC_015731	AG	3	6	3627212	3627217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12052	NC_015731	T	6	6	3627359	3627364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_015731	TTA	2	6	3627989	3627994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_015731	CAT	2	6	3628001	3628006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12055	NC_015731	AGGCG	2	10	3628020	3628029	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12056	NC_015731	TAA	2	6	3628039	3628044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12057	NC_015731	AAT	2	6	3628091	3628096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12058	NC_015731	ATT	2	6	3628123	3628128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12059	NC_015731	AGAT	2	8	3628168	3628175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12060	NC_015731	C	6	6	3628180	3628185	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12061	NC_015731	ACT	2	6	3628188	3628193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12062	NC_015731	AAC	2	6	3628221	3628226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12063	NC_015731	T	6	6	3628252	3628257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12064	NC_015731	A	6	6	3628258	3628263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12065	NC_015731	CT	3	6	3628279	3628284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12066	NC_015731	T	6	6	3628534	3628539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12067	NC_015731	TTA	2	6	3628549	3628554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12068	NC_015731	GAATA	2	10	3628622	3628631	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12069	NC_015731	GCA	2	6	3628632	3628637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12071	NC_015731	TAAAT	2	10	3629484	3629493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12072	NC_015731	ATA	2	6	3629502	3629507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12073	NC_015731	AG	3	6	3629570	3629575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12074	NC_015731	TAAA	2	8	3630411	3630418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12075	NC_015731	ATT	2	6	3630424	3630429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12081	NC_015731	CGC	2	6	3634424	3634429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12082	NC_015731	AAG	2	6	3634435	3634440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12083	NC_015731	CAAAG	2	10	3634551	3634560	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12084	NC_015731	GTA	2	6	3635772	3635777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12088	NC_015731	TCA	2	6	3636150	3636155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12091	NC_015731	TGCG	2	8	3636238	3636245	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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12095	NC_015731	A	6	6	3636351	3636356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12098	NC_015731	GGC	2	6	3636522	3636527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12099	NC_015731	TTC	2	6	3636601	3636606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12101	NC_015731	TTTC	2	8	3636653	3636660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12102	NC_015731	GCT	2	6	3636734	3636739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12107	NC_015731	GTTA	2	8	3637045	3637052	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12108	NC_015731	ATG	2	6	3637059	3637064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12109	NC_015731	ATT	2	6	3637094	3637099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12110	NC_015731	T	7	7	3637101	3637107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12112	NC_015731	T	6	6	3637141	3637146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12113	NC_015731	CAA	2	6	3637156	3637161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12114	NC_015731	T	6	6	3637182	3637187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12115	NC_015731	TGT	2	6	3637254	3637259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12117	NC_015731	CATA	2	8	3637339	3637346	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12118	NC_015731	CGA	2	6	3637376	3637381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12121	NC_015731	TATT	2	8	3638419	3638426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12122	NC_015731	TAAA	2	8	3638459	3638466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12123	NC_015731	ATCA	2	8	3638503	3638510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12126	NC_015731	CCTC	2	8	3643562	3643569	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12127	NC_015731	TC	3	6	3643568	3643573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12128	NC_015731	TGT	2	6	3643633	3643638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12390	NC_015731	AGC	3	9	3763714	3763722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12391	NC_015731	CGC	2	6	3763772	3763777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12392	NC_015731	CCA	2	6	3763935	3763940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12393	NC_015731	TTA	2	6	3765530	3765535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12394	NC_015731	CCT	2	6	3766208	3766213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12395	NC_015731	T	6	6	3766561	3766566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12396	NC_015731	TGC	2	6	3766657	3766662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12397	NC_015731	ATTA	2	8	3767208	3767215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12398	NC_015731	TAT	2	6	3769711	3769716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12399	NC_015731	TTG	2	6	3769770	3769775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12400	NC_015731	AAT	2	6	3769797	3769802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12401	NC_015731	GCG	2	6	3769809	3769814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12402	NC_015731	AAAC	2	8	3769820	3769827	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12403	NC_015731	ATAAA	2	10	3769839	3769848	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12410	NC_015731	ATAAG	2	10	3771326	3771335	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12411	NC_015731	CGG	2	6	3773303	3773308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12412	NC_015731	AAT	2	6	3773407	3773412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12413	NC_015731	GT	3	6	3774121	3774126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12414	NC_015731	GCA	2	6	3774135	3774140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12415	NC_015731	TCA	2	6	3774161	3774166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12416	NC_015731	AAC	2	6	3774185	3774190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12419	NC_015731	CTT	2	6	3779214	3779219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12420	NC_015731	A	7	7	3779305	3779311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12421	NC_015731	ATC	2	6	3779321	3779326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12422	NC_015731	CAT	2	6	3779337	3779342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12423	NC_015731	AGC	2	6	3779357	3779362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12424	NC_015731	ATT	2	6	3779405	3779410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12425	NC_015731	CGC	2	6	3779468	3779473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12427	NC_015731	GGA	2	6	3779498	3779503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12428	NC_015731	GTGAG	2	10	3779550	3779559	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12429	NC_015731	AGGC	2	8	3779633	3779640	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12430	NC_015731	GAT	2	6	3779641	3779646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12431	NC_015731	GGCT	2	8	3779738	3779745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12432	NC_015731	TAT	2	6	3779756	3779761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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