MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 12433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015731	GCA	2	6	1647469	1647474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_015731	TCTG	2	8	1647515	1647522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_015731	TCA	2	6	1647622	1647627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_015731	CAC	2	6	1647648	1647653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_015731	GCC	2	6	1647699	1647704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_015731	TGCG	2	8	1647710	1647717	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_015731	ATG	2	6	1647729	1647734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_015731	CAA	2	6	1647776	1647781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_015731	CATT	2	8	1647785	1647792	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5510	NC_015731	A	6	6	1647823	1647828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_015731	GCT	2	6	1647877	1647882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_015731	TG	3	6	1647980	1647985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_015731	GGC	2	6	1647994	1647999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_015731	TTC	2	6	1648073	1648078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_015731	TCAA	2	8	1648092	1648099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5516	NC_015731	TTTC	2	8	1648125	1648132	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5517	NC_015731	GCT	2	6	1648206	1648211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_015731	ATG	2	6	1648215	1648220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_015731	CAA	2	6	1648265	1648270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_015731	TAAG	2	8	1648289	1648296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_015731	GCT	2	6	1648302	1648307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_015731	A	7	7	1648316	1648322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_015731	AAT	2	6	1649532	1649537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_015731	GTG	2	6	1649545	1649550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_015731	CAC	2	6	1649559	1649564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5526	NC_015731	G	6	6	1649573	1649578	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_015731	A	6	6	1649589	1649594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_015731	TG	3	6	1649673	1649678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_015731	ACAT	2	8	1649801	1649808	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5530	NC_015731	AAT	2	6	1649822	1649827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_015731	ATATC	2	10	1649865	1649874	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5532	NC_015731	T	6	6	1649886	1649891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_015731	A	6	6	1649901	1649906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_015731	TCCT	2	8	1649929	1649936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_015731	TAAA	2	8	1649939	1649946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_015731	TAATG	2	10	1649949	1649958	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_015731	GAG	2	6	1649981	1649986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_015731	TTAAT	2	10	1649990	1649999	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_015731	ATG	2	6	1650026	1650031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_015731	TGT	2	6	1650088	1650093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_015731	ATAA	2	8	1650096	1650103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_015731	AG	3	6	1650136	1650141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_015731	GAT	2	6	1650253	1650258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_015731	AG	3	6	1650359	1650364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_015731	GAC	2	6	1654775	1654780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_015731	AAT	2	6	1654799	1654804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_015731	CAT	2	6	1654850	1654855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_015731	GGGGT	2	10	1654897	1654906	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_015731	TAA	2	6	1655998	1656003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_015731	TAC	2	6	1657127	1657132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_015731	AAT	2	6	1658592	1658597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_015731	ATA	2	6	1658710	1658715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_015731	TTAA	2	8	1662326	1662333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_015731	A	6	6	1662360	1662365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_015731	ACTGA	2	10	1662393	1662402	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5556	NC_015731	TCAA	2	8	1666680	1666687	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5557	NC_015731	TAA	2	6	1666689	1666694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_015731	TGAA	2	8	1667627	1667634	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_015731	CAA	2	6	1668737	1668742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_015731	GAT	2	6	1668877	1668882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_015731	TCCAT	2	10	1668892	1668901	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5562	NC_015731	CAA	2	6	1668932	1668937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_015731	AGAT	2	8	1668950	1668957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_015731	AT	3	6	1673168	1673173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_015731	ACT	2	6	1673198	1673203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_015731	TCAAG	2	10	1673205	1673214	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5567	NC_015731	CCT	2	6	1674016	1674021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5568	NC_015731	GTT	2	6	1675511	1675516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_015731	GTA	2	6	1675530	1675535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_015731	TG	3	6	1675537	1675542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_015731	CTC	2	6	1675554	1675559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5572	NC_015731	CCT	2	6	1677208	1677213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5573	NC_015731	ATGA	2	8	1677283	1677290	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_015731	AGCGC	2	10	1677303	1677312	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5575	NC_015731	GAT	2	6	1677323	1677328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_015731	GTATCC	2	12	1677352	1677363	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5578	NC_015731	ATG	2	6	1677388	1677393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_015731	GT	3	6	1677429	1677434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_015731	GTG	2	6	1677447	1677452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_015731	GCGCT	2	10	1677475	1677484	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5582	NC_015731	TGT	2	6	1677523	1677528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_015731	TTG	2	6	1677536	1677541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_015731	ACGCT	2	10	1677549	1677558	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5585	NC_015731	GGA	2	6	1677582	1677587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_015731	TCCAT	2	10	1677589	1677598	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5587	NC_015731	T	6	6	1680371	1680376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_015731	T	6	6	1680394	1680399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_015731	TGT	3	9	1680408	1680416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5592	NC_015731	TTC	2	6	1680632	1680637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_015731	TG	3	6	1680647	1680652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_015731	GCG	2	6	1680662	1680667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_015731	TGG	2	6	1680700	1680705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_015731	GC	3	6	1680722	1680727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_015731	TCA	2	6	1680765	1680770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5599	NC_015731	CAC	2	6	1680872	1680877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_015731	CG	3	6	1680895	1680900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_015731	TTG	2	6	1680933	1680938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_015731	CCA	2	6	1680983	1680988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_015731	TTA	2	6	1681059	1681064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_015731	GCT	2	6	1681171	1681176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_015731	GAC	2	6	1681237	1681242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5609	NC_015731	ATG	2	6	1681292	1681297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5611	NC_015731	TGT	2	6	1681344	1681349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_015731	TGG	2	6	1681355	1681360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_015731	ATT	2	6	1682827	1682832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_015731	GCG	2	6	1682850	1682855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_015731	TGC	3	9	1685120	1685128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_015731	TTG	2	6	1685134	1685139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_015731	T	6	6	1685172	1685177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_015731	TACG	2	8	1685353	1685360	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5619	NC_015731	ATCA	2	8	1685369	1685376	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_015731	GAAA	2	8	1685400	1685407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_015731	TGG	2	6	1686714	1686719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_015731	CGG	2	6	1686757	1686762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_015731	T	6	6	1687414	1687419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5625	NC_015731	ATT	2	6	1687486	1687491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_015731	TG	4	8	1687518	1687525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_015731	GTTCG	2	10	1687908	1687917	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5628	NC_015731	AAAT	2	8	1688012	1688019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_015731	CTTG	2	8	1689386	1689393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5630	NC_015731	CAA	2	6	1689510	1689515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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