MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 12433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015731	ATT	2	6	1368980	1368985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_015731	T	6	6	1369044	1369049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_015731	TTA	2	6	1369131	1369136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_015731	CAA	2	6	1369247	1369252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_015731	GC	3	6	1369255	1369260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_015731	ATTT	2	8	1369311	1369318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_015731	TTG	2	6	1369380	1369385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_015731	GAGC	2	8	1369386	1369393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4509	NC_015731	CAA	2	6	1369810	1369815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_015731	CCA	2	6	1369821	1369826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_015731	CGA	2	6	1370231	1370236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_015731	TCTAG	2	10	1370446	1370455	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4513	NC_015731	T	6	6	1371357	1371362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_015731	TA	3	6	1371375	1371380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_015731	AATA	2	8	1371421	1371428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_015731	TTG	2	6	1371439	1371444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_015731	AGG	2	6	1371459	1371464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_015731	A	6	6	1371469	1371474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_015731	GAA	2	6	1371599	1371604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_015731	ATT	2	6	1371606	1371611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_015731	GAA	2	6	1371621	1371626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_015731	GGT	2	6	1371627	1371632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_015731	AAC	2	6	1371897	1371902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_015731	GC	3	6	1371955	1371960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_015731	TGA	2	6	1371991	1371996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_015731	CAA	2	6	1372111	1372116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_015731	ATT	2	6	1372136	1372141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_015731	ACT	2	6	1372183	1372188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_015731	GAA	2	6	1372204	1372209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_015731	CAC	2	6	1372241	1372246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4531	NC_015731	GAA	2	6	1372271	1372276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_015731	TTTA	2	8	1372299	1372306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_015731	AGA	2	6	1372333	1372338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_015731	GAT	2	6	1372418	1372423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_015731	TGC	2	6	1372434	1372439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_015731	AAT	2	6	1372442	1372447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_015731	CTT	2	6	1372461	1372466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_015731	CGTA	2	8	1372479	1372486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4539	NC_015731	A	8	8	1375772	1375779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_015731	AG	3	6	1376209	1376214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_015731	GAA	3	9	1376217	1376225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_015731	CTT	3	9	1376247	1376255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_015731	TCT	2	6	1377696	1377701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_015731	AG	3	6	1377746	1377751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_015731	ACAA	2	8	1377763	1377770	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4546	NC_015731	ACT	2	6	1377772	1377777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_015731	AC	3	6	1377790	1377795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_015731	TGA	2	6	1378829	1378834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_015731	CT	3	6	1378892	1378897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_015731	AG	4	8	1379642	1379649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_015731	TCT	2	6	1379914	1379919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_015731	ATT	2	6	1380072	1380077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_015731	TTTCCC	2	12	1380085	1380096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_015731	GAA	2	6	1380105	1380110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_015731	GC	3	6	1381625	1381630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4556	NC_015731	T	6	6	1381704	1381709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_015731	ATT	2	6	1382376	1382381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_015731	TTAT	2	8	1382400	1382407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_015731	ATT	2	6	1382453	1382458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_015731	TAA	2	6	1382466	1382471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_015731	TAA	2	6	1383576	1383581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_015731	TAG	2	6	1383602	1383607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_015731	AAC	2	6	1383681	1383686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_015731	TTAT	2	8	1383710	1383717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_015731	TAG	2	6	1383718	1383723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_015731	TAA	2	6	1383764	1383769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_015731	ACAGG	2	10	1383782	1383791	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4568	NC_015731	GAAA	2	8	1383800	1383807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_015731	TAAT	2	8	1383867	1383874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_015731	ATT	2	6	1383973	1383978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4578	NC_015731	AGT	2	6	1386728	1386733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4580	NC_015731	ATT	2	6	1386824	1386829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_015731	TTG	2	6	1387996	1388001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4583	NC_015731	T	6	6	1388086	1388091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4586	NC_015731	TAA	2	6	1389686	1389691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_015731	AT	3	6	1389701	1389706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_015731	AAT	2	6	1391140	1391145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_015731	TAAT	2	8	1393751	1393758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4591	NC_015731	TAT	2	6	1396147	1396152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_015731	A	6	6	1396154	1396159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_015731	AT	3	6	1396183	1396188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4596	NC_015731	GCC	2	6	1396658	1396663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_015731	TGTT	2	8	1396679	1396686	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_015731	GCC	2	6	1396861	1396866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4601	NC_015731	GCCA	2	8	1397090	1397097	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4602	NC_015731	TCG	2	6	1397132	1397137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_015731	CTT	2	6	1397187	1397192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_015731	GCT	2	6	1397229	1397234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_015731	GAG	2	6	1397292	1397297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4609	NC_015731	GC	3	6	1397720	1397725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_015731	CGAT	2	8	1397737	1397744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4611	NC_015731	GGC	2	6	1397838	1397843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_015731	TTG	2	6	1397846	1397851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4614	NC_015731	TTG	2	6	1398105	1398110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_015731	GAGT	2	8	1398117	1398124	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_015731	CGG	2	6	1398179	1398184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4619	NC_015731	ATT	2	6	1398272	1398277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_015731	CAT	2	6	1398332	1398337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_015731	TCACC	2	10	1398391	1398400	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4622	NC_015731	AAG	2	6	1398415	1398420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_015731	ATT	2	6	1398489	1398494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_015731	AAT	2	6	1398516	1398521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_015731	CAT	3	9	1398523	1398531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4627	NC_015731	TCG	2	6	1398547	1398552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_015731	GAG	2	6	1398553	1398558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_015731	AC	4	8	1398562	1398569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4630	NC_015731	CAA	2	6	1398634	1398639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4632	NC_015731	GAC	2	6	1398819	1398824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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