MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae FA 1090 chromosome

Total Repeats: 9622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_002946	GCG	2	6	1365927	1365932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_002946	GAAC	2	8	1365944	1365951	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6003	NC_002946	ACA	2	6	1365992	1365997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_002946	A	7	7	1366048	1366054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_002946	TAT	2	6	1366058	1366063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_002946	CTGC	2	8	1366079	1366086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_002946	GAC	2	6	1366159	1366164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_002946	GCT	2	6	1366176	1366181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_002946	GCA	2	6	1366211	1366216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_002946	TGTTTT	2	12	1366220	1366231	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_002946	T	6	6	1366228	1366233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_002946	GTG	2	6	1366270	1366275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_002946	TTCG	2	8	1366309	1366316	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_002946	GATG	2	8	1366317	1366324	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_002946	GCG	2	6	1366399	1366404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_002946	AGA	2	6	1366473	1366478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_002946	ACC	2	6	1366530	1366535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_002946	CCG	2	6	1366596	1366601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_002946	A	6	6	1366628	1366633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_002946	GCA	2	6	1366674	1366679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_002946	CGGTA	2	10	1366684	1366693	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6022	NC_002946	T	6	6	1366711	1366716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_002946	CAAC	2	8	1366759	1366766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_002946	CAG	2	6	1366789	1366794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_002946	GAA	2	6	1366846	1366851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_002946	CAGCGT	2	12	1366885	1366896	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_002946	GAC	2	6	1366900	1366905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_002946	AGA	2	6	1366938	1366943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_002946	AAAGC	2	10	1366958	1366967	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6030	NC_002946	CAATC	2	10	1366998	1367007	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6031	NC_002946	CGA	3	9	1367049	1367057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_002946	TTGG	2	8	1367098	1367105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_002946	TGC	2	6	1367161	1367166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_002946	GC	3	6	1367187	1367192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_002946	GCG	2	6	1367205	1367210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_002946	ATC	2	6	1367218	1367223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_002946	TAA	2	6	1367228	1367233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_002946	CGG	2	6	1367259	1367264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_002946	GCC	2	6	1367316	1367321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_002946	CTT	2	6	1367373	1367378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_002946	CGG	2	6	1367394	1367399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_002946	CGA	2	6	1367409	1367414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_002946	ATC	2	6	1367462	1367467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_002946	CCG	2	6	1367486	1367491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_002946	CTG	2	6	1367548	1367553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_002946	CAG	2	6	1367599	1367604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_002946	GGCT	2	8	1367621	1367628	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6048	NC_002946	GCC	2	6	1367704	1367709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_002946	TTGAT	2	10	1367726	1367735	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_002946	TTGG	2	8	1367911	1367918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_002946	ACC	2	6	1367954	1367959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_002946	TGA	2	6	1367982	1367987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_002946	CGG	2	6	1368013	1368018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_002946	TAA	2	6	1368024	1368029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_002946	AT	3	6	1368041	1368046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_002946	TGA	2	6	1368104	1368109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_002946	CGT	2	6	1368138	1368143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_002946	ATCG	2	8	1368163	1368170	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6059	NC_002946	CG	3	6	1368186	1368191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_002946	AAACC	2	10	1368216	1368225	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6061	NC_002946	GCT	2	6	1368228	1368233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_002946	GCC	2	6	1368365	1368370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_002946	A	6	6	1368391	1368396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_002946	ATC	2	6	1368497	1368502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_002946	CAAAT	2	10	1368521	1368530	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6066	NC_002946	ATA	2	6	1368562	1368567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_002946	TGT	2	6	1368605	1368610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_002946	GGC	2	6	1368613	1368618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_002946	A	6	6	1369922	1369927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_002946	TTA	2	6	1369951	1369956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_002946	A	7	7	1369986	1369992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_002946	CGA	2	6	1371068	1371073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_002946	AAC	2	6	1371096	1371101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6075	NC_002946	T	6	6	1372315	1372320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6077	NC_002946	ATG	2	6	1372397	1372402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_002946	TGG	2	6	1372442	1372447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6080	NC_002946	TTGT	2	8	1372501	1372508	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_002946	GGT	2	6	1372560	1372565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_002946	CGG	2	6	1372621	1372626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_002946	ACCG	2	8	1372657	1372664	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6084	NC_002946	AC	3	6	1372765	1372770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_002946	GACA	2	8	1372772	1372779	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6088	NC_002946	ATTT	2	8	1374375	1374382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6091	NC_002946	TAAA	2	8	1374429	1374436	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_002946	ATT	2	6	1374437	1374442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_002946	AT	3	6	1374456	1374461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_002946	CGC	2	6	1374487	1374492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6095	NC_002946	ATT	2	6	1374522	1374527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_002946	CAAT	2	8	1374535	1374542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6097	NC_002946	T	6	6	1374551	1374556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_002946	GCA	2	6	1374570	1374575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_002946	ATCAA	2	10	1376848	1376857	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6100	NC_002946	A	6	6	1376896	1376901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_002946	GAA	2	6	1382869	1382874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_002946	T	6	6	1382890	1382895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_002946	T	7	7	1382954	1382960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_002946	GCG	2	6	1382966	1382971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_002946	A	6	6	1382996	1383001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_002946	AAG	2	6	1383004	1383009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_002946	CTT	2	6	1383014	1383019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_002946	GTTT	2	8	1383231	1383238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_002946	T	6	6	1383236	1383241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_002946	ACG	2	6	1383257	1383262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_002946	GCC	2	6	1383269	1383274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_002946	CGGCAT	2	12	1383290	1383301	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_002946	GCC	2	6	1384673	1384678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_002946	CGGC	2	8	1384686	1384693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_002946	AAAT	2	8	1384753	1384760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_002946	ATT	2	6	1384764	1384769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_002946	TTA	2	6	1385399	1385404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6119	NC_002946	CCG	2	6	1385509	1385514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_002946	GCC	2	6	1386439	1386444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6121	NC_002946	A	6	6	1388113	1388118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_002946	GGC	2	6	1388184	1388189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_002946	ATC	2	6	1388213	1388218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_002946	CCCG	2	8	1388221	1388228	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6125	NC_002946	CCT	3	9	1388268	1388276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6126	NC_002946	CCCTCC	2	12	1388280	1388291	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
6127	NC_002946	CGG	2	6	1388294	1388299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_002946	TAA	2	6	1388328	1388333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_002946	AAT	2	6	1388355	1388360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_002946	TTC	2	6	1388452	1388457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6132	NC_002946	TAATA	2	10	1389079	1389088	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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