MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7524 chromosome

Total Repeats: 108130

< Previous12...205206207208209210211212213214215216217Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
108001	NC_019684	AC	3	6	6628248	6628253	50 %	0 %	0 %	50 %	427732639
108002	NC_019684	TGCTAG	2	12	6628275	6628286	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	427732639
108003	NC_019684	ACC	2	6	6628408	6628413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427732639
108004	NC_019684	TGA	2	6	6628416	6628421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427732639
108005	NC_019684	CTA	2	6	6628452	6628457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427732639
108006	NC_019684	CTT	2	6	6628521	6628526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427732639
108007	NC_019684	CAA	2	6	6628527	6628532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427732639
108008	NC_019684	TAAT	2	8	6628554	6628561	50 %	50 %	0 %	0 %	427732639
108009	NC_019684	TGA	2	6	6628673	6628678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427732640
108010	NC_019684	TTG	2	6	6628720	6628725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427732640
108011	NC_019684	TGC	2	6	6628734	6628739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427732640
108012	NC_019684	TGC	2	6	6628776	6628781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427732640
108013	NC_019684	CAA	2	6	6628796	6628801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427732640
108014	NC_019684	GCGATC	2	12	6628840	6628851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427732640
108015	NC_019684	AAT	2	6	6628858	6628863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427732640
108016	NC_019684	CTG	2	6	6628895	6628900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427732640
108017	NC_019684	TAC	2	6	6629025	6629030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427732640
108018	NC_019684	TGGC	2	8	6629069	6629076	0 %	25 %	50 %	25 %	427732640
108019	NC_019684	CT	3	6	6629185	6629190	0 %	50 %	0 %	50 %	427732640
108020	NC_019684	GCCGTT	2	12	6629271	6629282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427732640
108021	NC_019684	TTTGGG	2	12	6629417	6629428	0 %	50 %	50 %	0 %	427732640
108022	NC_019684	CGG	3	9	6629474	6629482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427732640
108023	NC_019684	GTT	2	6	6629606	6629611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427732640
108024	NC_019684	GGCG	2	8	6629645	6629652	0 %	0 %	75 %	25 %	427732640
108025	NC_019684	TGC	2	6	6629664	6629669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427732640
108026	NC_019684	AGC	2	6	6629730	6629735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427732640
108027	NC_019684	TACC	2	8	6629894	6629901	25 %	25 %	0 %	50 %	427732640
108028	NC_019684	TGA	2	6	6630029	6630034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427732640
108029	NC_019684	TGC	2	6	6630035	6630040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427732640
108030	NC_019684	TTG	2	6	6630096	6630101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427732640
108031	NC_019684	GGA	2	6	6630186	6630191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427732640
108032	NC_019684	CAA	2	6	6630329	6630334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427732640
108033	NC_019684	CT	3	6	6630347	6630352	0 %	50 %	0 %	50 %	427732640
108034	NC_019684	G	7	7	6630399	6630405	0 %	0 %	100 %	0 %	427732640
108035	NC_019684	CCCA	2	8	6630423	6630430	25 %	0 %	0 %	75 %	427732640
108036	NC_019684	TTC	2	6	6630483	6630488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427732640
108037	NC_019684	TCT	2	6	6630493	6630498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427732640
108038	NC_019684	AGC	2	6	6630549	6630554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427732640
108039	NC_019684	CACT	2	8	6630602	6630609	25 %	25 %	0 %	50 %	427732640
108040	NC_019684	GAA	2	6	6630782	6630787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427732640
108041	NC_019684	AGT	2	6	6630801	6630806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427732640
108042	NC_019684	TGT	2	6	6630877	6630882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427732640
108043	NC_019684	GAG	2	6	6630905	6630910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427732640
108044	NC_019684	GTT	2	6	6630934	6630939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427732640
108045	NC_019684	GTTAGC	2	12	6631117	6631128	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	427732641
108046	NC_019684	CCG	2	6	6631137	6631142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427732641
108047	NC_019684	AC	3	6	6631182	6631187	50 %	0 %	0 %	50 %	427732641
108048	NC_019684	TGG	2	6	6631199	6631204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427732641
108049	NC_019684	TGC	2	6	6631246	6631251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427732641
108050	NC_019684	ACT	2	6	6631277	6631282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427732641
108051	NC_019684	TTC	2	6	6631405	6631410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427732641
108052	NC_019684	GTT	2	6	6631412	6631417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427732641
108053	NC_019684	GCT	2	6	6631481	6631486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427732641
108054	NC_019684	ACT	2	6	6631553	6631558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427732641
108055	NC_019684	CTGA	2	8	6631582	6631589	25 %	25 %	25 %	25 %	427732641
108056	NC_019684	GTAA	2	8	6631690	6631697	50 %	25 %	25 %	0 %	427732641
108057	NC_019684	TG	3	6	6631721	6631726	0 %	50 %	50 %	0 %	427732641
108058	NC_019684	TGA	2	6	6631759	6631764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427732641
108059	NC_019684	GCA	2	6	6631858	6631863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427732642
108060	NC_019684	CCA	2	6	6631878	6631883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427732642
108061	NC_019684	AT	3	6	6631891	6631896	50 %	50 %	0 %	0 %	427732642
108062	NC_019684	TTG	2	6	6631903	6631908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427732642
108063	NC_019684	TTCAGA	2	12	6631911	6631922	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	427732642
108064	NC_019684	TGGT	2	8	6631985	6631992	0 %	50 %	50 %	0 %	427732642
108065	NC_019684	GTT	2	6	6632035	6632040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427732642
108066	NC_019684	GGC	2	6	6632118	6632123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427732642
108067	NC_019684	GTT	2	6	6632142	6632147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427732642
108068	NC_019684	CAA	2	6	6632166	6632171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427732642
108069	NC_019684	GCTA	2	8	6632202	6632209	25 %	25 %	25 %	25 %	427732642
108070	NC_019684	TTC	2	6	6632231	6632236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427732642
108071	NC_019684	ACA	2	6	6632251	6632256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427732642
108072	NC_019684	TGT	2	6	6632283	6632288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427732642
108073	NC_019684	TTA	2	6	6632299	6632304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427732642
108074	NC_019684	ATC	2	6	6632340	6632345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427732642
108075	NC_019684	CGG	2	6	6632420	6632425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427732642
108076	NC_019684	TCA	2	6	6632492	6632497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427732642
108077	NC_019684	GCG	2	6	6632567	6632572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427732642
108078	NC_019684	AC	3	6	6632606	6632611	50 %	0 %	0 %	50 %	427732642
108079	NC_019684	GACAGT	2	12	6632623	6632634	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427732642
108080	NC_019684	TGC	2	6	6632635	6632640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427732642
108081	NC_019684	TCA	2	6	6632641	6632646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427732642
108082	NC_019684	CTGC	2	8	6632662	6632669	0 %	25 %	25 %	50 %	427732642
108083	NC_019684	CTT	2	6	6632687	6632692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427732642
108084	NC_019684	AG	3	6	6632814	6632819	50 %	0 %	50 %	0 %	427732642
108085	NC_019684	ACT	2	6	6632839	6632844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427732642
108086	NC_019684	TAA	2	6	6632942	6632947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427732642
108087	NC_019684	ATTT	2	8	6632959	6632966	25 %	75 %	0 %	0 %	427732642
108088	NC_019684	T	6	6	6633075	6633080	0 %	100 %	0 %	0 %	427732643
108089	NC_019684	TGT	2	6	6633200	6633205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427732643
108090	NC_019684	TGAG	2	8	6633316	6633323	25 %	25 %	50 %	0 %	427732643
108091	NC_019684	ATC	2	6	6633341	6633346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427732643
108092	NC_019684	AATA	2	8	6633403	6633410	75 %	25 %	0 %	0 %	427732643
108093	NC_019684	GCA	2	6	6633437	6633442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427732643
108094	NC_019684	ATC	2	6	6633481	6633486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427732643
108095	NC_019684	GTT	2	6	6633492	6633497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427732643
108096	NC_019684	CCA	2	6	6633522	6633527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427732643
108097	NC_019684	CAG	2	6	6633528	6633533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427732643
108098	NC_019684	TGG	2	6	6633536	6633541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427732643
108099	NC_019684	AAT	2	6	6633565	6633570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427732643
108100	NC_019684	ATG	2	6	6633576	6633581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427732643
108101	NC_019684	TG	3	6	6633588	6633593	0 %	50 %	50 %	0 %	427732643
108102	NC_019684	TCT	2	6	6633772	6633777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427732644
108103	NC_019684	ATT	2	6	6633816	6633821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427732644
108104	NC_019684	TAA	2	6	6633891	6633896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427732644
108105	NC_019684	TTCT	2	8	6633947	6633954	0 %	75 %	0 %	25 %	427732644
108106	NC_019684	GAT	2	6	6633998	6634003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427732644
108107	NC_019684	CAAT	2	8	6634019	6634026	50 %	25 %	0 %	25 %	427732644
108108	NC_019684	AAT	2	6	6634089	6634094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427732644
108109	NC_019684	TAA	2	6	6634131	6634136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427732644
108110	NC_019684	CGC	2	6	6634164	6634169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427732644
108111	NC_019684	TAT	2	6	6634259	6634264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427732644
108112	NC_019684	ATT	2	6	6634347	6634352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427732644
108113	NC_019684	CAT	2	6	6634409	6634414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427732644
108114	NC_019684	CTA	2	6	6634460	6634465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427732644
108115	NC_019684	AGA	2	6	6634491	6634496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427732644
108116	NC_019684	TAA	3	9	6634499	6634507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427732644
108117	NC_019684	A	6	6	6634563	6634568	100 %	0 %	0 %	0 %	427732644
108118	NC_019684	AATC	2	8	6634628	6634635	50 %	25 %	0 %	25 %	427732644
108119	NC_019684	CAC	2	6	6634638	6634643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427732644
108120	NC_019684	ACT	2	6	6634663	6634668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427732644
108121	NC_019684	ACA	2	6	6634672	6634677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427732644
108122	NC_019684	AAT	2	6	6634701	6634706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427732644
108123	NC_019684	TGG	2	6	6634707	6634712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427732644
108124	NC_019684	GTC	2	6	6634753	6634758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427732644
108125	NC_019684	GTTTGT	2	12	6634777	6634788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427732644
108126	NC_019684	ACC	2	6	6634815	6634820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427732644
108127	NC_019684	TCT	2	6	6634907	6634912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427732644
108128	NC_019684	T	6	6	6634921	6634926	0 %	100 %	0 %	0 %	427732644
108129	NC_019684	CTG	2	6	6634933	6634938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427732644
108130	NC_019684	GTC	2	6	6634945	6634950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427732644

< Previous12...205206207208209210211212213214215216217Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.