MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG01

Total Repeats: 7579

< Previous12345678910111213141516Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_013923	GCC	2	6	366633	366638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583648
7502	NC_013923	C	6	6	366660	366665	0 %	0 %	0 %	100 %	289583648
7503	NC_013923	TCG	2	6	366733	366738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583648
7504	NC_013923	GTC	2	6	366739	366744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583648
7505	NC_013923	CGTG	2	8	366758	366765	0 %	25 %	50 %	25 %	289583648
7506	NC_013923	CCCA	2	8	366786	366793	25 %	0 %	0 %	75 %	289583648
7507	NC_013923	CTG	2	6	366825	366830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583648
7508	NC_013923	GTA	2	6	366891	366896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583648
7509	NC_013923	GTC	2	6	366910	366915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583648
7510	NC_013923	CAC	2	6	366923	366928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583648
7511	NC_013923	CGT	2	6	366953	366958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583648
7512	NC_013923	ACGA	2	8	367002	367009	50 %	0 %	25 %	25 %	289583648
7513	NC_013923	TGA	2	6	367028	367033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583648
7514	NC_013923	CGT	2	6	367035	367040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583648
7515	NC_013923	CGA	2	6	367118	367123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583648
7516	NC_013923	CGA	2	6	367250	367255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583648
7517	NC_013923	CGC	2	6	367300	367305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583648
7518	NC_013923	TCT	2	6	367348	367353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289583648
7519	NC_013923	TCG	2	6	367355	367360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583648
7520	NC_013923	GAA	2	6	367467	367472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583648
7521	NC_013923	TTA	2	6	367514	367519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289583648
7522	NC_013923	TCT	2	6	367553	367558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289583648
7523	NC_013923	CGATCT	2	12	367559	367570	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289583648
7524	NC_013923	ACG	2	6	367817	367822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583649
7525	NC_013923	ACC	2	6	367880	367885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583649
7526	NC_013923	AGA	2	6	367891	367896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583649
7527	NC_013923	AGCC	2	8	367923	367930	25 %	0 %	25 %	50 %	289583649
7528	NC_013923	CA	3	6	367965	367970	50 %	0 %	0 %	50 %	289583649
7529	NC_013923	ACC	2	6	368000	368005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583649
7530	NC_013923	ATC	2	6	368006	368011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583649
7531	NC_013923	AGT	2	6	368073	368078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583649
7532	NC_013923	AAC	2	6	368198	368203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583649
7533	NC_013923	GAACG	2	10	368252	368261	40 %	0 %	40 %	20 %	289583649
7534	NC_013923	CAC	2	6	368287	368292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583649
7535	NC_013923	ACA	2	6	368351	368356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583649
7536	NC_013923	ACA	2	6	368379	368384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583649
7537	NC_013923	CCA	2	6	368403	368408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583649
7538	NC_013923	TCC	2	6	368417	368422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583649
7539	NC_013923	CAG	2	6	368513	368518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583649
7540	NC_013923	TCG	2	6	368519	368524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583649
7541	NC_013923	CCAAG	2	10	368595	368604	40 %	0 %	20 %	40 %	289583649
7542	NC_013923	CAA	2	6	368605	368610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583649
7543	NC_013923	AAT	2	6	368687	368692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289583649
7544	NC_013923	TGC	2	6	368696	368701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583649
7545	NC_013923	TGC	2	6	368743	368748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583649
7546	NC_013923	CAG	2	6	368749	368754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583649
7547	NC_013923	CAA	2	6	368764	368769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583649
7548	NC_013923	TCA	2	6	368779	368784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583649
7549	NC_013923	GCAC	2	8	368817	368824	25 %	0 %	25 %	50 %	289583649
7550	NC_013923	AG	3	6	368832	368837	50 %	0 %	50 %	0 %	289583649
7551	NC_013923	AAC	2	6	368859	368864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583649
7552	NC_013923	CCAATA	2	12	368874	368885	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	289583649
7553	NC_013923	CGA	2	6	368992	368997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583649
7554	NC_013923	ACG	2	6	369061	369066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583649
7555	NC_013923	GGA	2	6	376301	376306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583650
7556	NC_013923	AAC	2	6	376311	376316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583650
7557	NC_013923	GCA	2	6	376329	376334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583650
7558	NC_013923	GCA	2	6	376362	376367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583650
7559	NC_013923	GCT	2	6	376414	376419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583650
7560	NC_013923	AG	3	6	376452	376457	50 %	0 %	50 %	0 %	289583650
7561	NC_013923	AAG	2	6	377660	377665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583651
7562	NC_013923	GTCT	2	8	377811	377818	0 %	50 %	25 %	25 %	289583651
7563	NC_013923	TCT	2	6	377841	377846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289583651
7564	NC_013923	CAT	2	6	377859	377864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583651
7565	NC_013923	AGAC	2	8	377895	377902	50 %	0 %	25 %	25 %	289583651
7566	NC_013923	AC	3	6	377901	377906	50 %	0 %	0 %	50 %	289583651
7567	NC_013923	GAT	2	6	377952	377957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583651
7568	NC_013923	GAA	2	6	377971	377976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583651
7569	NC_013923	GAC	2	6	377979	377984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583651
7570	NC_013923	AGG	2	6	377999	378004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583651
7571	NC_013923	AG	3	6	378020	378025	50 %	0 %	50 %	0 %	289583651
7572	NC_013923	AGTG	2	8	378028	378035	25 %	25 %	50 %	0 %	289583651
7573	NC_013923	AAG	2	6	378038	378043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583651
7574	NC_013923	GTG	2	6	378064	378069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289583651
7575	NC_013923	AC	5	10	378166	378175	50 %	0 %	0 %	50 %	289583651
7576	NC_013923	TC	3	6	378211	378216	0 %	50 %	0 %	50 %	289583651
7577	NC_013923	TC	3	6	378232	378237	0 %	50 %	0 %	50 %	289583651
7578	NC_013923	GATA	3	12	378255	378266	50 %	25 %	25 %	0 %	289583651
7579	NC_013923	TA	3	6	378265	378270	50 %	50 %	0 %	0 %	289583651

< Previous12345678910111213141516Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.