MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 chromosome

Total Repeats: 56951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_007484	TTC	2	6	314667	314672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163821
5003	NC_007484	CGGGAA	2	12	314678	314689	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	77163821
5004	NC_007484	AAG	2	6	314748	314753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163821
5005	NC_007484	TCG	2	6	314776	314781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163821
5006	NC_007484	CCA	2	6	314905	314910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163821
5007	NC_007484	AG	3	6	314982	314987	50 %	0 %	50 %	0 %	77163821
5008	NC_007484	TCA	2	6	315016	315021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163821
5009	NC_007484	A	7	7	315051	315057	100 %	0 %	0 %	0 %	77163821
5010	NC_007484	TCC	2	6	315058	315063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163821
5011	NC_007484	GCA	2	6	315128	315133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163821
5012	NC_007484	TAG	2	6	315147	315152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163821
5013	NC_007484	TGA	2	6	315171	315176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163821
5014	NC_007484	TTC	2	6	315234	315239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163821
5015	NC_007484	AGC	2	6	315542	315547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163822
5016	NC_007484	ATA	2	6	315558	315563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163822
5017	NC_007484	A	8	8	315638	315645	100 %	0 %	0 %	0 %	77163822
5018	NC_007484	ATTA	2	8	315666	315673	50 %	50 %	0 %	0 %	77163822
5019	NC_007484	TCC	2	6	315687	315692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163822
5020	NC_007484	CAT	2	6	315701	315706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163822
5021	NC_007484	CCT	2	6	315734	315739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163822
5022	NC_007484	ATC	2	6	315795	315800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163822
5023	NC_007484	CCTGGG	2	12	315806	315817	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77163822
5024	NC_007484	TGG	2	6	315844	315849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163822
5025	NC_007484	GGC	2	6	315908	315913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163822
5026	NC_007484	CAA	2	6	315918	315923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163822
5027	NC_007484	TCA	2	6	315941	315946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163822
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5029	NC_007484	C	6	6	316130	316135	0 %	0 %	0 %	100 %	77163823
5030	NC_007484	GCC	2	6	316137	316142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163823
5031	NC_007484	GCT	3	9	316175	316183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163823
5032	NC_007484	TCA	2	6	316219	316224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163823
5033	NC_007484	GCG	2	6	316237	316242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163823
5034	NC_007484	ACG	2	6	316504	316509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163823
5035	NC_007484	CA	3	6	316577	316582	50 %	0 %	0 %	50 %	77163823
5036	NC_007484	ATTTC	2	10	316589	316598	20 %	60 %	0 %	20 %	77163823
5037	NC_007484	GCC	2	6	316629	316634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163823
5038	NC_007484	TACC	2	8	316655	316662	25 %	25 %	0 %	50 %	77163823
5039	NC_007484	TTGC	2	8	316677	316684	0 %	50 %	25 %	25 %	77163823
5040	NC_007484	GGC	2	6	316720	316725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163823
5041	NC_007484	AGC	2	6	316750	316755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163823
5042	NC_007484	CGG	2	6	316831	316836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163823
5043	NC_007484	TCG	2	6	316840	316845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163823
5044	NC_007484	GTT	2	6	316955	316960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163823
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5048	NC_007484	CTTG	2	8	317309	317316	0 %	50 %	25 %	25 %	77163823
5049	NC_007484	AG	3	6	317370	317375	50 %	0 %	50 %	0 %	77163823
5050	NC_007484	CAC	2	6	317397	317402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163823
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5054	NC_007484	TGCGG	2	10	317894	317903	0 %	20 %	60 %	20 %	77163824
5055	NC_007484	GAA	2	6	317907	317912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163824
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5057	NC_007484	GAT	2	6	318072	318077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163824
5058	NC_007484	CT	3	6	318162	318167	0 %	50 %	0 %	50 %	77163825
5059	NC_007484	CGC	2	6	318250	318255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163825
5060	NC_007484	T	7	7	318282	318288	0 %	100 %	0 %	0 %	77163825
5061	NC_007484	TTGC	2	8	318361	318368	0 %	50 %	25 %	25 %	77163825
5062	NC_007484	TTG	2	6	318467	318472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163825
5063	NC_007484	GTA	2	6	318539	318544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163825
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5070	NC_007484	CCTT	2	8	318896	318903	0 %	50 %	0 %	50 %	77163825
5071	NC_007484	A	6	6	319115	319120	100 %	0 %	0 %	0 %	77163826
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5073	NC_007484	CTTG	2	8	319147	319154	0 %	50 %	25 %	25 %	77163826
5074	NC_007484	TGGC	2	8	319169	319176	0 %	25 %	50 %	25 %	77163826
5075	NC_007484	T	6	6	319186	319191	0 %	100 %	0 %	0 %	77163826
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5077	NC_007484	GTGG	2	8	319282	319289	0 %	25 %	75 %	0 %	77163826
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5108	NC_007484	C	6	6	321077	321082	0 %	0 %	0 %	100 %	77163827
5109	NC_007484	TGC	2	6	321153	321158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163827
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5113	NC_007484	CAGGC	2	10	321392	321401	20 %	0 %	40 %	40 %	77163827
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5119	NC_007484	GC	3	6	321545	321550	0 %	0 %	50 %	50 %	77163827
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5124	NC_007484	GGC	3	9	321879	321887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163827
5125	NC_007484	CGC	2	6	321894	321899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163827
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5128	NC_007484	GCC	3	9	321989	321997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163828
5129	NC_007484	CATGG	2	10	322091	322100	20 %	20 %	40 %	20 %	77163828
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5151	NC_007484	CTTT	2	8	323039	323046	0 %	75 %	0 %	25 %	77163828
5152	NC_007484	TGA	2	6	323064	323069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163828
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5233	NC_007484	ATT	2	6	327667	327672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163832
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5241	NC_007484	GAA	2	6	328024	328029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163832
5242	NC_007484	ATA	2	6	328088	328093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163832
5243	NC_007484	GCC	2	6	328121	328126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163832
5244	NC_007484	TAAC	2	8	328158	328165	50 %	25 %	0 %	25 %	77163832
5245	NC_007484	ACCAGC	2	12	328172	328183	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	77163832
5246	NC_007484	A	7	7	328198	328204	100 %	0 %	0 %	0 %	77163832
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5497	NC_007484	CCTGAG	2	12	341483	341494	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77163848
5498	NC_007484	GAT	2	6	341501	341506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163848
5499	NC_007484	GGCCT	2	10	341662	341671	0 %	20 %	40 %	40 %	77163848
5500	NC_007484	TGC	2	6	341698	341703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163848

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