MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis M04-240196 chromosome

Total Repeats: 48390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_017515	TCA	2	6	1680563	1680568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36002	NC_017515	AAACCG	2	12	1680588	1680599	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36003	NC_017515	A	7	7	1680658	1680664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36004	NC_017515	CCG	2	6	1680751	1680756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36005	NC_017515	CGA	2	6	1680832	1680837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36006	NC_017515	GAAA	2	8	1680945	1680952	75 %	0 %	25 %	0 %	385851746
36007	NC_017515	GGATTT	2	12	1680978	1680989	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385851746
36008	NC_017515	GGC	2	6	1680999	1681004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851746
36009	NC_017515	GGT	2	6	1681008	1681013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385851746
36010	NC_017515	A	7	7	1681065	1681071	100 %	0 %	0 %	0 %	385851746
36011	NC_017515	CGT	2	6	1681094	1681099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851746
36012	NC_017515	GCG	2	6	1681110	1681115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851746
36013	NC_017515	AGC	2	6	1681166	1681171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851746
36014	NC_017515	GAT	2	6	1681219	1681224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385851746
36015	NC_017515	TTGC	2	8	1681264	1681271	0 %	50 %	25 %	25 %	385851746
36016	NC_017515	AGGG	2	8	1681377	1681384	25 %	0 %	75 %	0 %	385851746
36017	NC_017515	CGG	2	6	1681389	1681394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851746
36018	NC_017515	TGG	2	6	1681459	1681464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385851746
36019	NC_017515	GTC	2	6	1681490	1681495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36020	NC_017515	GAC	2	6	1681520	1681525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36021	NC_017515	TGT	2	6	1681529	1681534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36022	NC_017515	AAT	2	6	1681582	1681587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36023	NC_017515	GCC	2	6	1681681	1681686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851747
36024	NC_017515	AGC	2	6	1681697	1681702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851747
36025	NC_017515	GTG	2	6	1681738	1681743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385851747
36026	NC_017515	GCTG	2	8	1681773	1681780	0 %	25 %	50 %	25 %	385851747
36027	NC_017515	GAAA	2	8	1681827	1681834	75 %	0 %	25 %	0 %	385851747
36028	NC_017515	GTT	2	6	1681875	1681880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385851747
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36030	NC_017515	GCC	3	9	1682023	1682031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851747
36031	NC_017515	CCGA	2	8	1682107	1682114	25 %	0 %	25 %	50 %	385851747
36032	NC_017515	GCA	2	6	1682145	1682150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851747
36033	NC_017515	CAAA	2	8	1682187	1682194	75 %	0 %	0 %	25 %	385851747
36034	NC_017515	CAGC	2	8	1682223	1682230	25 %	0 %	25 %	50 %	385851747
36035	NC_017515	AAG	2	6	1682255	1682260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385851747
36036	NC_017515	TGG	2	6	1682297	1682302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385851747
36037	NC_017515	CGG	2	6	1682340	1682345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851747
36038	NC_017515	GTTT	2	8	1682349	1682356	0 %	75 %	25 %	0 %	385851747
36039	NC_017515	CGA	2	6	1682364	1682369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851747
36040	NC_017515	CAA	2	6	1682370	1682375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385851747
36041	NC_017515	GGC	2	6	1682485	1682490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851747
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36043	NC_017515	GC	3	6	1682507	1682512	0 %	0 %	50 %	50 %	385851747
36044	NC_017515	GGC	2	6	1682563	1682568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851747
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36050	NC_017515	CGC	2	6	1682772	1682777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851747
36051	NC_017515	GC	3	6	1682776	1682781	0 %	0 %	50 %	50 %	385851747
36052	NC_017515	GTCC	2	8	1682785	1682792	0 %	25 %	25 %	50 %	385851747
36053	NC_017515	GAT	2	6	1682844	1682849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385851747
36054	NC_017515	AGC	2	6	1682900	1682905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851747
36055	NC_017515	A	6	6	1682908	1682913	100 %	0 %	0 %	0 %	385851747
36056	NC_017515	GCC	2	6	1682914	1682919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851747
36057	NC_017515	GATT	2	8	1682931	1682938	25 %	50 %	25 %	0 %	385851747
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36059	NC_017515	GAA	2	6	1683007	1683012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385851747
36060	NC_017515	GAT	2	6	1683051	1683056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385851747
36061	NC_017515	CCGG	2	8	1683103	1683110	0 %	0 %	50 %	50 %	385851747
36062	NC_017515	TTG	2	6	1683122	1683127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385851747
36063	NC_017515	CGG	2	6	1683255	1683260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851747
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36065	NC_017515	ACCG	2	8	1683310	1683317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36066	NC_017515	T	6	6	1683344	1683349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36072	NC_017515	CATC	2	8	1683519	1683526	25 %	25 %	0 %	50 %	385851748
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36078	NC_017515	T	7	7	1683840	1683846	0 %	100 %	0 %	0 %	385851748
36079	NC_017515	CGCGC	2	10	1684057	1684066	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36080	NC_017515	TCA	2	6	1684133	1684138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36081	NC_017515	CAG	2	6	1684141	1684146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36082	NC_017515	CAG	2	6	1684162	1684167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36083	NC_017515	CAAGG	2	10	1684177	1684186	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36084	NC_017515	CGG	2	6	1684220	1684225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36085	NC_017515	GCC	2	6	1684229	1684234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36086	NC_017515	AGC	2	6	1684256	1684261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36087	NC_017515	T	6	6	1684285	1684290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36088	NC_017515	TCGG	2	8	1684433	1684440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36089	NC_017515	TGG	2	6	1684470	1684475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36090	NC_017515	ATG	2	6	1684594	1684599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36091	NC_017515	TG	3	6	1684598	1684603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36092	NC_017515	GTT	2	6	1684610	1684615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36093	NC_017515	CTT	2	6	1684719	1684724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36094	NC_017515	TCA	2	6	1684782	1684787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36095	NC_017515	CCA	2	6	1684800	1684805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36096	NC_017515	CGC	2	6	1684806	1684811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36097	NC_017515	CGG	2	6	1684821	1684826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36098	NC_017515	CTGCGC	2	12	1684831	1684842	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36099	NC_017515	TCA	2	6	1684872	1684877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36100	NC_017515	GC	4	8	1684893	1684900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36101	NC_017515	GAT	2	6	1684903	1684908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36102	NC_017515	GAT	2	6	1684915	1684920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36103	NC_017515	TGT	2	6	1684977	1684982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36104	NC_017515	GTT	2	6	1685056	1685061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36105	NC_017515	GGC	2	6	1685098	1685103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36106	NC_017515	ATA	2	6	1685201	1685206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36107	NC_017515	ATG	2	6	1685243	1685248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36108	NC_017515	TTG	2	6	1685324	1685329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36109	NC_017515	GTT	2	6	1685407	1685412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36110	NC_017515	A	6	6	1685442	1685447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36111	NC_017515	CGA	2	6	1685478	1685483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36112	NC_017515	GTCGC	2	10	1685543	1685552	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36113	NC_017515	CGA	2	6	1685553	1685558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36114	NC_017515	CCGA	2	8	1685606	1685613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36115	NC_017515	TTG	2	6	1685627	1685632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36116	NC_017515	TTC	2	6	1685659	1685664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36117	NC_017515	GTTTG	2	10	1685838	1685847	0 %	60 %	40 %	0 %	385851749
36118	NC_017515	CGCC	2	8	1685877	1685884	0 %	0 %	25 %	75 %	385851749
36119	NC_017515	ATCA	2	8	1685934	1685941	50 %	25 %	0 %	25 %	385851749
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36479	NC_017515	A	7	7	1703619	1703625	100 %	0 %	0 %	0 %	385851766
36480	NC_017515	TGCGAC	2	12	1703628	1703639	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385851766
36481	NC_017515	AC	3	6	1703638	1703643	50 %	0 %	0 %	50 %	385851766
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