MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis M04-240196 chromosome

Total Repeats: 48390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_017515	TCT	2	6	1634034	1634039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35003	NC_017515	ATA	2	6	1634051	1634056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35004	NC_017515	TAA	2	6	1634058	1634063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35005	NC_017515	GTT	2	6	1634085	1634090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35006	NC_017515	AAT	2	6	1634100	1634105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35007	NC_017515	A	6	6	1634147	1634152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35009	NC_017515	GATT	2	8	1634253	1634260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35010	NC_017515	T	6	6	1634266	1634271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35011	NC_017515	A	7	7	1634331	1634337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35013	NC_017515	TAA	2	6	1634395	1634400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35014	NC_017515	ATC	2	6	1634402	1634407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35022	NC_017515	TGT	2	6	1634549	1634554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35091	NC_017515	CGG	2	6	1637419	1637424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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35105	NC_017515	CG	3	6	1637966	1637971	0 %	0 %	50 %	50 %	385851708
35106	NC_017515	GCG	2	6	1638003	1638008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851708
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35111	NC_017515	A	6	6	1638282	1638287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35112	NC_017515	AC	3	6	1638291	1638296	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35113	NC_017515	CGG	2	6	1638356	1638361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851709
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35120	NC_017515	CGT	3	9	1638686	1638694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851709
35121	NC_017515	GCG	2	6	1638697	1638702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851709
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35123	NC_017515	AGCCCA	2	12	1638715	1638726	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385851709
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35147	NC_017515	A	6	6	1640206	1640211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35154	NC_017515	AC	3	6	1640423	1640428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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35238	NC_017515	TTCA	2	8	1644359	1644366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35239	NC_017515	CTC	2	6	1644381	1644386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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35359	NC_017515	TCA	2	6	1650054	1650059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385851716
35360	NC_017515	GATA	2	8	1650060	1650067	50 %	25 %	25 %	0 %	385851716
35361	NC_017515	GAC	2	6	1650159	1650164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851716
35362	NC_017515	TCG	2	6	1650180	1650185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851716
35363	NC_017515	CGG	2	6	1650199	1650204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851716
35364	NC_017515	TACGG	2	10	1650284	1650293	20 %	20 %	40 %	20 %	385851716
35365	NC_017515	CGG	2	6	1650317	1650322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851716
35366	NC_017515	GTTT	2	8	1650327	1650334	0 %	75 %	25 %	0 %	385851716
35367	NC_017515	TTA	2	6	1650341	1650346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385851716
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35369	NC_017515	GGTT	2	8	1650389	1650396	0 %	50 %	50 %	0 %	385851717
35370	NC_017515	CGG	2	6	1650433	1650438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851717
35371	NC_017515	GAC	2	6	1650484	1650489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851717
35372	NC_017515	TA	3	6	1650600	1650605	50 %	50 %	0 %	0 %	385851717
35373	NC_017515	GCTC	2	8	1650645	1650652	0 %	25 %	25 %	50 %	385851717
35374	NC_017515	ACC	2	6	1650655	1650660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385851717
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35377	NC_017515	CTT	2	6	1650882	1650887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385851717
35378	NC_017515	ATA	2	6	1650902	1650907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385851717
35379	NC_017515	TTG	2	6	1650955	1650960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385851717
35380	NC_017515	T	6	6	1650967	1650972	0 %	100 %	0 %	0 %	385851717
35381	NC_017515	CAG	2	6	1650997	1651002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851717
35382	NC_017515	GCT	3	9	1651047	1651055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851717
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35384	NC_017515	CG	4	8	1651128	1651135	0 %	0 %	50 %	50 %	385851717
35385	NC_017515	CAT	2	6	1651228	1651233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385851717
35386	NC_017515	GCA	2	6	1651329	1651334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851717
35387	NC_017515	GCA	2	6	1651623	1651628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35388	NC_017515	TATAT	2	10	1651657	1651666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35389	NC_017515	TTGCC	3	15	1651721	1651735	0 %	40 %	20 %	40 %	385851718
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35394	NC_017515	CG	3	6	1651905	1651910	0 %	0 %	50 %	50 %	385851719
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35412	NC_017515	T	6	6	1652967	1652972	0 %	100 %	0 %	0 %	385851720
35413	NC_017515	CTT	2	6	1653017	1653022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385851720
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35416	NC_017515	CTG	2	6	1653132	1653137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851720
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35420	NC_017515	ACG	3	9	1653415	1653423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851721
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35423	NC_017515	CGG	2	6	1653588	1653593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851721
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35426	NC_017515	CAATG	2	10	1653750	1653759	40 %	20 %	20 %	20 %	385851721
35427	NC_017515	AGAAA	2	10	1653762	1653771	80 %	0 %	20 %	0 %	385851721
35428	NC_017515	ACC	2	6	1653790	1653795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385851721
35429	NC_017515	GCA	2	6	1653802	1653807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851721
35430	NC_017515	TTC	2	6	1653885	1653890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385851721
35431	NC_017515	GTC	2	6	1653958	1653963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851721
35432	NC_017515	CCG	2	6	1653988	1653993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851721
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35434	NC_017515	TGC	2	6	1654103	1654108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851721
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35442	NC_017515	TGC	2	6	1654541	1654546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851721
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35444	NC_017515	CGG	2	6	1654693	1654698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851721
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35450	NC_017515	TGA	3	9	1655024	1655032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385851721
35451	NC_017515	CGG	2	6	1655060	1655065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851721
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35453	NC_017515	TCA	2	6	1655156	1655161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385851721
35454	NC_017515	GGT	2	6	1655194	1655199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35455	NC_017515	AGA	2	6	1655219	1655224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35456	NC_017515	CCAG	2	8	1655239	1655246	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35457	NC_017515	GGC	2	6	1655259	1655264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35458	NC_017515	GCC	2	6	1655276	1655281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35459	NC_017515	AATC	2	8	1655369	1655376	50 %	25 %	0 %	25 %	385851722
35460	NC_017515	A	6	6	1655446	1655451	100 %	0 %	0 %	0 %	385851722
35461	NC_017515	TTACC	2	10	1655469	1655478	20 %	40 %	0 %	40 %	385851722
35462	NC_017515	GCC	2	6	1655489	1655494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851722
35463	NC_017515	GGC	2	6	1655521	1655526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851722
35464	NC_017515	TGC	2	6	1655558	1655563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851722
35465	NC_017515	ACC	2	6	1655588	1655593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385851722
35466	NC_017515	TTCT	2	8	1655648	1655655	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35467	NC_017515	TA	3	6	1655680	1655685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35468	NC_017515	AT	3	6	1655706	1655711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35469	NC_017515	CCGT	2	8	1655720	1655727	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35470	NC_017515	ACCG	2	8	1655728	1655735	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35471	NC_017515	T	7	7	1655811	1655817	0 %	100 %	0 %	0 %	385851723
35472	NC_017515	CCGCA	2	10	1655830	1655839	20 %	0 %	20 %	60 %	385851723
35473	NC_017515	GCGCC	2	10	1655929	1655938	0 %	0 %	40 %	60 %	385851723
35474	NC_017515	GCA	2	6	1655947	1655952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851723
35475	NC_017515	GAA	2	6	1655972	1655977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385851723
35476	NC_017515	GAC	2	6	1656074	1656079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851723
35477	NC_017515	GCC	2	6	1656119	1656124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851723
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35480	NC_017515	CGCC	3	12	1656187	1656198	0 %	0 %	25 %	75 %	385851723
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35486	NC_017515	TTCCCC	2	12	1656401	1656412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385851723
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35491	NC_017515	TGC	2	6	1656546	1656551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851723
35492	NC_017515	AC	3	6	1656629	1656634	50 %	0 %	0 %	50 %	385851723
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35495	NC_017515	CAA	2	6	1656798	1656803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385851723
35496	NC_017515	A	7	7	1656802	1656808	100 %	0 %	0 %	0 %	385851723
35497	NC_017515	CGA	2	6	1656900	1656905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35498	NC_017515	GAC	2	6	1657054	1657059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35499	NC_017515	ATT	2	6	1657063	1657068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35500	NC_017515	GTA	2	6	1657117	1657122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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