MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis M04-240196 chromosome

Total Repeats: 48390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_017515	AGA	2	6	1009333	1009338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21502	NC_017515	ACG	2	6	1009379	1009384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851107
21503	NC_017515	CGC	2	6	1009398	1009403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851107
21504	NC_017515	CCGG	2	8	1009491	1009498	0 %	0 %	50 %	50 %	385851107
21505	NC_017515	AGG	2	6	1009517	1009522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385851107
21506	NC_017515	TGC	2	6	1009557	1009562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851107
21507	NC_017515	CGGA	2	8	1009608	1009615	25 %	0 %	50 %	25 %	385851107
21508	NC_017515	GACA	2	8	1009631	1009638	50 %	0 %	25 %	25 %	385851107
21509	NC_017515	GAA	2	6	1009730	1009735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385851107
21510	NC_017515	CAT	2	6	1009736	1009741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385851107
21511	NC_017515	CG	3	6	1009826	1009831	0 %	0 %	50 %	50 %	385851107
21512	NC_017515	GGGC	2	8	1009905	1009912	0 %	0 %	75 %	25 %	385851107
21513	NC_017515	GC	3	6	1009956	1009961	0 %	0 %	50 %	50 %	385851107
21514	NC_017515	GC	3	6	1009993	1009998	0 %	0 %	50 %	50 %	385851107
21515	NC_017515	GCA	2	6	1010013	1010018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851107
21516	NC_017515	GGC	2	6	1010085	1010090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851107
21517	NC_017515	GCG	2	6	1010112	1010117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851107
21518	NC_017515	GAAA	2	8	1010128	1010135	75 %	0 %	25 %	0 %	385851107
21519	NC_017515	AACA	2	8	1010238	1010245	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21520	NC_017515	CGG	2	6	1010368	1010373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851108
21521	NC_017515	G	6	6	1010415	1010420	0 %	0 %	100 %	0 %	385851108
21522	NC_017515	GGC	2	6	1010425	1010430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851108
21523	NC_017515	GCC	2	6	1010492	1010497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851108
21524	NC_017515	CTGG	2	8	1010509	1010516	0 %	25 %	50 %	25 %	385851108
21525	NC_017515	AGC	2	6	1010546	1010551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851108
21526	NC_017515	TCA	2	6	1010622	1010627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385851108
21527	NC_017515	T	6	6	1010704	1010709	0 %	100 %	0 %	0 %	385851108
21528	NC_017515	TCC	2	6	1010726	1010731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385851108
21529	NC_017515	TTA	2	6	1010815	1010820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385851108
21530	NC_017515	CCTG	2	8	1010877	1010884	0 %	25 %	25 %	50 %	385851108
21531	NC_017515	A	6	6	1010903	1010908	100 %	0 %	0 %	0 %	385851108
21532	NC_017515	GCG	2	6	1010945	1010950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851108
21533	NC_017515	GAA	2	6	1010987	1010992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385851108
21534	NC_017515	TCG	2	6	1011201	1011206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21535	NC_017515	GGA	2	6	1011254	1011259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21536	NC_017515	TGT	2	6	1011288	1011293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21537	NC_017515	CGG	2	6	1011352	1011357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851109
21538	NC_017515	GCC	2	6	1011363	1011368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851109
21539	NC_017515	ATC	2	6	1011375	1011380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385851109
21540	NC_017515	GCC	2	6	1011394	1011399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851109
21541	NC_017515	GC	3	6	1011447	1011452	0 %	0 %	50 %	50 %	385851109
21542	NC_017515	GCA	2	6	1011539	1011544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851109
21543	NC_017515	CGGCAG	2	12	1011602	1011613	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385851109
21544	NC_017515	ACA	2	6	1011641	1011646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385851109
21545	NC_017515	GACA	2	8	1011666	1011673	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21546	NC_017515	AAT	2	6	1011810	1011815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21547	NC_017515	CGG	3	9	1011847	1011855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21548	NC_017515	TCG	2	6	1011923	1011928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21549	NC_017515	AGCCGG	2	12	1011954	1011965	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21550	NC_017515	A	6	6	1011975	1011980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21551	NC_017515	T	6	6	1011989	1011994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21552	NC_017515	CTGAAA	2	12	1012067	1012078	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21553	NC_017515	ATTT	2	8	1012138	1012145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21554	NC_017515	GTC	2	6	1012266	1012271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851110
21555	NC_017515	GCG	2	6	1012278	1012283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851110
21556	NC_017515	CGA	2	6	1012358	1012363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851110
21557	NC_017515	CAT	2	6	1012376	1012381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385851110
21558	NC_017515	CG	3	6	1012436	1012441	0 %	0 %	50 %	50 %	385851110
21559	NC_017515	GCC	2	6	1012487	1012492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851110
21560	NC_017515	A	6	6	1012512	1012517	100 %	0 %	0 %	0 %	385851110
21561	NC_017515	GAA	2	6	1012569	1012574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385851110
21562	NC_017515	CGC	2	6	1012696	1012701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851110
21563	NC_017515	TGG	2	6	1012717	1012722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385851110
21564	NC_017515	GC	3	6	1012755	1012760	0 %	0 %	50 %	50 %	385851110
21565	NC_017515	GCG	2	6	1012831	1012836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851110
21566	NC_017515	TG	3	6	1012866	1012871	0 %	50 %	50 %	0 %	385851110
21567	NC_017515	CGA	2	6	1012883	1012888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851110
21568	NC_017515	GGCATC	2	12	1012950	1012961	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385851110
21569	NC_017515	GCG	2	6	1013002	1013007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851110
21570	NC_017515	CTT	2	6	1013033	1013038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385851110
21571	NC_017515	GGC	2	6	1013051	1013056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851110
21572	NC_017515	GGC	2	6	1013076	1013081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851110
21573	NC_017515	GCG	3	9	1013086	1013094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851110
21574	NC_017515	CTG	2	6	1013139	1013144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851110
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21576	NC_017515	CTG	2	6	1013217	1013222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851110
21577	NC_017515	GGC	2	6	1013241	1013246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851110
21578	NC_017515	T	6	6	1013295	1013300	0 %	100 %	0 %	0 %	385851110
21579	NC_017515	CAT	2	6	1013366	1013371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385851110
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21581	NC_017515	TCA	2	6	1013492	1013497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385851110
21582	NC_017515	CG	3	6	1013699	1013704	0 %	0 %	50 %	50 %	385851110
21583	NC_017515	CTA	2	6	1013710	1013715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385851110
21584	NC_017515	GCC	2	6	1013719	1013724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851110
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21586	NC_017515	GTGC	2	8	1013881	1013888	0 %	25 %	50 %	25 %	385851110
21587	NC_017515	A	6	6	1013943	1013948	100 %	0 %	0 %	0 %	385851110
21588	NC_017515	GCG	2	6	1013965	1013970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851110
21589	NC_017515	ACTCT	2	10	1014031	1014040	20 %	40 %	0 %	40 %	385851110
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21591	NC_017515	GCC	2	6	1014101	1014106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851110
21592	NC_017515	TCG	2	6	1014256	1014261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851110
21593	NC_017515	GGC	2	6	1014309	1014314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385851110
21594	NC_017515	CTG	2	6	1014345	1014350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851110
21595	NC_017515	TAC	2	6	1014381	1014386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385851110
21596	NC_017515	GCGG	2	8	1014444	1014451	0 %	0 %	75 %	25 %	385851110
21597	NC_017515	TGA	2	6	1014465	1014470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385851110
21598	NC_017515	TAA	2	6	1014500	1014505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21599	NC_017515	ATC	2	6	1014506	1014511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21600	NC_017515	AAAAT	2	10	1014529	1014538	80 %	20 %	0 %	0 %	385851111
21601	NC_017515	ATA	2	6	1014553	1014558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385851111
21602	NC_017515	AAT	2	6	1014570	1014575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385851111
21603	NC_017515	ATTT	2	8	1014595	1014602	25 %	75 %	0 %	0 %	385851111
21604	NC_017515	GGT	2	6	1014612	1014617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385851111
21605	NC_017515	TGG	2	6	1014641	1014646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385851111
21606	NC_017515	GAT	2	6	1014672	1014677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385851111
21607	NC_017515	AGC	2	6	1014749	1014754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851111
21608	NC_017515	AAGT	2	8	1014761	1014768	50 %	25 %	25 %	0 %	385851111
21609	NC_017515	CAG	2	6	1014781	1014786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851111
21610	NC_017515	A	7	7	1014828	1014834	100 %	0 %	0 %	0 %	385851111
21611	NC_017515	CTT	2	6	1014854	1014859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385851111
21612	NC_017515	T	6	6	1014882	1014887	0 %	100 %	0 %	0 %	385851111
21613	NC_017515	ATT	2	6	1014900	1014905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385851111
21614	NC_017515	AGA	2	6	1015001	1015006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385851111
21615	NC_017515	TAA	2	6	1015106	1015111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385851111
21616	NC_017515	AAAT	2	8	1015114	1015121	75 %	25 %	0 %	0 %	385851111
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21970	NC_017515	GCC	2	6	1030161	1030166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385851123
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21974	NC_017515	TGC	3	9	1030264	1030272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385851123
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21993	NC_017515	GCG	2	6	1031260	1031265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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21996	NC_017515	AATC	2	8	1031320	1031327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21997	NC_017515	AAT	2	6	1031334	1031339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21998	NC_017515	T	6	6	1031356	1031361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21999	NC_017515	GAC	2	6	1031542	1031547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385851124
22000	NC_017515	T	6	6	1031552	1031557	0 %	100 %	0 %	0 %	385851124

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