MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Mpl

Total Repeats: 23739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_015583	CAT	2	6	834286	834291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145450
17002	NC_015583	CCA	2	6	834492	834497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145450
17003	NC_015583	AGGA	2	8	834590	834597	50 %	0 %	50 %	0 %	334145450
17004	NC_015583	TCC	2	6	834668	834673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145450
17005	NC_015583	TCG	2	6	834695	834700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145450
17006	NC_015583	CGC	2	6	834786	834791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145450
17007	NC_015583	CTCCCA	2	12	834933	834944	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	334145450
17008	NC_015583	CCA	2	6	835059	835064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145450
17009	NC_015583	CCG	2	6	835116	835121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145450
17010	NC_015583	AGA	2	6	835194	835199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145450
17011	NC_015583	GCA	2	6	835220	835225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145450
17012	NC_015583	ACG	2	6	835268	835273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145450
17013	NC_015583	ACCG	2	8	835276	835283	25 %	0 %	25 %	50 %	334145450
17014	NC_015583	TCC	2	6	835310	835315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145450
17015	NC_015583	CAGG	2	8	835317	835324	25 %	0 %	50 %	25 %	334145450
17016	NC_015583	TTCC	2	8	835334	835341	0 %	50 %	0 %	50 %	334145450
17017	NC_015583	ATTAT	2	10	835380	835389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17018	NC_015583	GCA	2	6	835438	835443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17019	NC_015583	ACA	2	6	835561	835566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334145451
17020	NC_015583	GCG	3	9	835585	835593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145451
17021	NC_015583	CGC	2	6	835634	835639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145451
17022	NC_015583	AGCCGT	2	12	835652	835663	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334145451
17023	NC_015583	ACGC	2	8	835688	835695	25 %	0 %	25 %	50 %	334145451
17024	NC_015583	GCCTT	2	10	835699	835708	0 %	40 %	20 %	40 %	334145451
17025	NC_015583	CG	3	6	835753	835758	0 %	0 %	50 %	50 %	334145451
17026	NC_015583	CG	3	6	835779	835784	0 %	0 %	50 %	50 %	334145451
17027	NC_015583	CTT	2	6	835800	835805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145451
17028	NC_015583	CG	3	6	835832	835837	0 %	0 %	50 %	50 %	334145451
17029	NC_015583	GCG	2	6	835854	835859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145451
17030	NC_015583	GTCATA	2	12	835863	835874	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	334145451
17031	NC_015583	TCT	2	6	835889	835894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145451
17032	NC_015583	CG	3	6	835942	835947	0 %	0 %	50 %	50 %	334145451
17033	NC_015583	AGC	2	6	836062	836067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145451
17034	NC_015583	GCAGC	2	10	836091	836100	20 %	0 %	40 %	40 %	334145451
17035	NC_015583	CCA	2	6	836135	836140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145451
17036	NC_015583	GA	3	6	836246	836251	50 %	0 %	50 %	0 %	334145451
17037	NC_015583	AGG	2	6	836318	836323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145451
17038	NC_015583	CTT	2	6	836382	836387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145451
17039	NC_015583	ATGTTC	2	12	836389	836400	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	334145451
17040	NC_015583	CG	3	6	836491	836496	0 %	0 %	50 %	50 %	334145451
17041	NC_015583	TAC	2	6	836519	836524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145451
17042	NC_015583	CGG	2	6	836567	836572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145451
17043	NC_015583	AGC	2	6	836581	836586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145451
17044	NC_015583	GAT	2	6	836649	836654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145451
17045	NC_015583	ATCCG	2	10	836685	836694	20 %	20 %	20 %	40 %	334145451
17046	NC_015583	AGA	2	6	836729	836734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145451
17047	NC_015583	GCC	2	6	836824	836829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145451
17048	NC_015583	GCG	2	6	836877	836882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145451
17049	NC_015583	GC	3	6	836964	836969	0 %	0 %	50 %	50 %	334145451
17050	NC_015583	GC	3	6	837005	837010	0 %	0 %	50 %	50 %	334145451
17051	NC_015583	AGC	2	6	837078	837083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145451
17052	NC_015583	GCC	3	9	837231	837239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145451
17053	NC_015583	ACC	2	6	837295	837300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145451
17054	NC_015583	GAA	2	6	837360	837365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145451
17055	NC_015583	ATC	2	6	837408	837413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145451
17056	NC_015583	G	7	7	837474	837480	0 %	0 %	100 %	0 %	334145451
17057	NC_015583	TCA	2	6	837568	837573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145452
17058	NC_015583	CGACGC	2	12	837606	837617	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	334145452
17059	NC_015583	GGC	2	6	837636	837641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145452
17060	NC_015583	GC	4	8	837682	837689	0 %	0 %	50 %	50 %	334145452
17061	NC_015583	CGC	2	6	837723	837728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145452
17062	NC_015583	GCG	2	6	837744	837749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145452
17063	NC_015583	TCG	2	6	837752	837757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145452
17064	NC_015583	CAAGC	2	10	837760	837769	40 %	0 %	20 %	40 %	334145452
17065	NC_015583	CAG	2	6	837856	837861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145452
17066	NC_015583	GC	3	6	837938	837943	0 %	0 %	50 %	50 %	334145452
17067	NC_015583	CT	3	6	837968	837973	0 %	50 %	0 %	50 %	334145452
17068	NC_015583	GAT	2	6	837985	837990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145452
17069	NC_015583	GGC	3	9	837991	837999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145452
17070	NC_015583	TTCC	2	8	838038	838045	0 %	50 %	0 %	50 %	334145452
17071	NC_015583	GCTG	2	8	838212	838219	0 %	25 %	50 %	25 %	334145452
17072	NC_015583	GC	3	6	838244	838249	0 %	0 %	50 %	50 %	334145452
17073	NC_015583	GTCC	2	8	838297	838304	0 %	25 %	25 %	50 %	334145452
17074	NC_015583	GCG	2	6	838407	838412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145452
17075	NC_015583	CA	3	6	838509	838514	50 %	0 %	0 %	50 %	334145452
17076	NC_015583	AGGC	3	12	838542	838553	25 %	0 %	50 %	25 %	334145452
17077	NC_015583	ATC	2	6	838696	838701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145452
17078	NC_015583	CGC	2	6	838722	838727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145452
17079	NC_015583	AAAG	2	8	838761	838768	75 %	0 %	25 %	0 %	334145452
17080	NC_015583	AAT	2	6	838817	838822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17081	NC_015583	CGC	2	6	838842	838847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17082	NC_015583	CAT	3	9	838921	838929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145453
17083	NC_015583	CGCC	2	8	838983	838990	0 %	0 %	25 %	75 %	334145453
17084	NC_015583	GC	3	6	839002	839007	0 %	0 %	50 %	50 %	334145453
17085	NC_015583	CAAC	2	8	839107	839114	50 %	0 %	0 %	50 %	334145453
17086	NC_015583	AGG	2	6	839120	839125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145453
17087	NC_015583	CGG	2	6	839182	839187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145453
17088	NC_015583	TTG	2	6	839232	839237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334145453
17089	NC_015583	GAA	2	6	839269	839274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145453
17090	NC_015583	GGC	2	6	839276	839281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145453
17091	NC_015583	TCG	2	6	839327	839332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145453
17092	NC_015583	CAC	2	6	839374	839379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145453
17093	NC_015583	GCT	2	6	839463	839468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145453
17094	NC_015583	CCCGT	2	10	839505	839514	0 %	20 %	20 %	60 %	334145453
17095	NC_015583	G	6	6	839544	839549	0 %	0 %	100 %	0 %	334145453
17096	NC_015583	GCTGC	2	10	839589	839598	0 %	20 %	40 %	40 %	334145453
17097	NC_015583	TCA	2	6	839601	839606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145453
17098	NC_015583	GAT	2	6	839631	839636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145453
17099	NC_015583	CG	3	6	839686	839691	0 %	0 %	50 %	50 %	334145453
17100	NC_015583	CAGCC	2	10	839703	839712	20 %	0 %	20 %	60 %	334145453
17101	NC_015583	GA	3	6	839732	839737	50 %	0 %	50 %	0 %	334145453
17102	NC_015583	GCCC	2	8	839740	839747	0 %	0 %	25 %	75 %	334145453
17103	NC_015583	CGC	2	6	839795	839800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145453
17104	NC_015583	CGA	2	6	839817	839822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145453
17105	NC_015583	CGG	2	6	839925	839930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145453
17106	NC_015583	CCG	2	6	840107	840112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145454
17107	NC_015583	GGA	2	6	840117	840122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145454
17108	NC_015583	CGA	2	6	840206	840211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145454
17109	NC_015583	CGGT	2	8	840252	840259	0 %	25 %	50 %	25 %	334145454
17110	NC_015583	GAC	2	6	840267	840272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145454
17111	NC_015583	T	6	6	840287	840292	0 %	100 %	0 %	0 %	334145454
17112	NC_015583	GCA	2	6	840403	840408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145454
17113	NC_015583	GC	5	10	840557	840566	0 %	0 %	50 %	50 %	334145454
17114	NC_015583	CGGAA	2	10	840584	840593	40 %	0 %	40 %	20 %	334145454
17115	NC_015583	CGC	2	6	840761	840766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145454
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17119	NC_015583	TGA	2	6	840974	840979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145454
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17121	NC_015583	CGGG	2	8	841004	841011	0 %	0 %	75 %	25 %	334145454
17122	NC_015583	CGC	2	6	841064	841069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145454
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17222	NC_015583	CG	4	8	846666	846673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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17243	NC_015583	CAG	3	9	847601	847609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145462
17244	NC_015583	GGC	3	9	847631	847639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145462
17245	NC_015583	GTC	2	6	847661	847666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145462
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17303	NC_015583	GACCG	2	10	850153	850162	20 %	0 %	40 %	40 %	334145465
17304	NC_015583	TAG	2	6	850244	850249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145465
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17488	NC_015583	GCG	2	6	859245	859250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145472
17489	NC_015583	CG	4	8	859249	859256	0 %	0 %	50 %	50 %	334145472
17490	NC_015583	CCG	2	6	859269	859274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145472
17491	NC_015583	TGA	2	6	859290	859295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145472
17492	NC_015583	GCC	2	6	859334	859339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145472
17493	NC_015583	TCG	2	6	859490	859495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145472
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