MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Mpl

Total Repeats: 23739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_015583	TCTG	2	8	588624	588631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12002	NC_015583	T	6	6	588698	588703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_015583	GC	3	6	588709	588714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12004	NC_015583	GCTG	2	8	588762	588769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12005	NC_015583	CATT	2	8	588782	588789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12006	NC_015583	GTCC	2	8	588859	588866	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12007	NC_015583	AG	3	6	588872	588877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_015583	TTGCAA	2	12	588912	588923	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	334145249
12009	NC_015583	TGG	2	6	588947	588952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334145249
12010	NC_015583	TGG	2	6	588972	588977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334145249
12011	NC_015583	CGG	2	6	589005	589010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145249
12012	NC_015583	TCG	2	6	589035	589040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145249
12013	NC_015583	TTC	2	6	589063	589068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145249
12014	NC_015583	GC	3	6	589110	589115	0 %	0 %	50 %	50 %	334145249
12015	NC_015583	CGC	2	6	589225	589230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145249
12016	NC_015583	CG	4	8	589261	589268	0 %	0 %	50 %	50 %	334145249
12017	NC_015583	GC	3	6	589345	589350	0 %	0 %	50 %	50 %	334145249
12018	NC_015583	CGT	2	6	589363	589368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145249
12019	NC_015583	CG	3	6	589482	589487	0 %	0 %	50 %	50 %	334145249
12020	NC_015583	CTG	2	6	589508	589513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145249
12021	NC_015583	CGG	2	6	589570	589575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145249
12022	NC_015583	CG	3	6	589589	589594	0 %	0 %	50 %	50 %	334145249
12023	NC_015583	AGGA	2	8	589622	589629	50 %	0 %	50 %	0 %	334145249
12024	NC_015583	CCTT	2	8	589630	589637	0 %	50 %	0 %	50 %	334145249
12025	NC_015583	ATC	2	6	589775	589780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145249
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12029	NC_015583	GC	3	6	589887	589892	0 %	0 %	50 %	50 %	334145250
12030	NC_015583	GC	3	6	589927	589932	0 %	0 %	50 %	50 %	334145250
12031	NC_015583	CGC	4	12	589930	589941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145250
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12043	NC_015583	GGGC	2	8	590265	590272	0 %	0 %	75 %	25 %	334145250
12044	NC_015583	TCG	2	6	590291	590296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145250
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12057	NC_015583	GTC	2	6	590740	590745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145250
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12066	NC_015583	G	6	6	591116	591121	0 %	0 %	100 %	0 %	334145250
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12072	NC_015583	GGC	2	6	591362	591367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145251
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12074	NC_015583	GTTCCA	2	12	591395	591406	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	334145251
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12078	NC_015583	GCT	2	6	591506	591511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145251
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12082	NC_015583	CGT	2	6	591671	591676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145251
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12085	NC_015583	GCT	2	6	591921	591926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145252
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12090	NC_015583	CG	3	6	592163	592168	0 %	0 %	50 %	50 %	334145252
12091	NC_015583	GCG	2	6	592275	592280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145252
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12093	NC_015583	CG	3	6	592365	592370	0 %	0 %	50 %	50 %	334145252
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12103	NC_015583	GCAA	2	8	593068	593075	50 %	0 %	25 %	25 %	334145252
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12112	NC_015583	CAT	2	6	593469	593474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145253
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12119	NC_015583	CGG	2	6	593789	593794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12120	NC_015583	GCG	2	6	593800	593805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12121	NC_015583	CGC	2	6	593849	593854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12123	NC_015583	GCC	2	6	593943	593948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12244	NC_015583	GCCG	2	8	600230	600237	0 %	0 %	50 %	50 %	334145258
12245	NC_015583	CTGCCG	2	12	600238	600249	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334145258
12246	NC_015583	GCG	2	6	600350	600355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145258
12247	NC_015583	GC	3	6	600385	600390	0 %	0 %	50 %	50 %	334145259
12248	NC_015583	CG	3	6	600491	600496	0 %	0 %	50 %	50 %	334145259
12249	NC_015583	GAC	2	6	600515	600520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145259
12250	NC_015583	CGG	2	6	600618	600623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145259
12251	NC_015583	TCG	2	6	600642	600647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145259
12252	NC_015583	CG	3	6	600646	600651	0 %	0 %	50 %	50 %	334145259
12253	NC_015583	GCC	2	6	600696	600701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145259
12254	NC_015583	GCC	2	6	600756	600761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145259
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12257	NC_015583	AGC	2	6	600885	600890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145259
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12259	NC_015583	GTA	2	6	600953	600958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145259
12260	NC_015583	CGG	2	6	600964	600969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145259
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12266	NC_015583	GC	3	6	601166	601171	0 %	0 %	50 %	50 %	334145259
12267	NC_015583	GCC	2	6	601176	601181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145259
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12269	NC_015583	AAGAC	2	10	601318	601327	60 %	0 %	20 %	20 %	334145259
12270	NC_015583	GCGG	3	12	601381	601392	0 %	0 %	75 %	25 %	334145259
12271	NC_015583	GC	4	8	601497	601504	0 %	0 %	50 %	50 %	334145259
12272	NC_015583	CAG	2	6	601541	601546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145259
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12274	NC_015583	GCCGC	2	10	601620	601629	0 %	0 %	40 %	60 %	334145259
12275	NC_015583	GGC	2	6	601774	601779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12276	NC_015583	CTT	2	6	601829	601834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145260
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12278	NC_015583	TCG	2	6	601879	601884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145260
12279	NC_015583	GCG	2	6	601887	601892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145260
12280	NC_015583	CG	3	6	601904	601909	0 %	0 %	50 %	50 %	334145260
12281	NC_015583	GC	3	6	601929	601934	0 %	0 %	50 %	50 %	334145260
12282	NC_015583	CTG	2	6	601943	601948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145260
12283	NC_015583	GAAA	2	8	601950	601957	75 %	0 %	25 %	0 %	334145260
12284	NC_015583	TCG	2	6	601993	601998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145260
12285	NC_015583	AGC	2	6	602011	602016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145260
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12288	NC_015583	GCT	2	6	602120	602125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145260
12289	NC_015583	GTCG	2	8	602130	602137	0 %	25 %	50 %	25 %	334145260
12290	NC_015583	AGC	2	6	602149	602154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145260
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12294	NC_015583	CCT	2	6	602440	602445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145260
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12298	NC_015583	GC	3	6	602575	602580	0 %	0 %	50 %	50 %	334145260
12299	NC_015583	CGA	2	6	602682	602687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145261
12300	NC_015583	CAT	2	6	602712	602717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145261
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12304	NC_015583	CG	3	6	602908	602913	0 %	0 %	50 %	50 %	334145261
12305	NC_015583	CGC	2	6	602922	602927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145261
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12307	NC_015583	GC	3	6	603039	603044	0 %	0 %	50 %	50 %	334145261
12308	NC_015583	GCC	2	6	603058	603063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145261
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12310	NC_015583	GAGC	2	8	603223	603230	25 %	0 %	50 %	25 %	334145261
12311	NC_015583	CGC	2	6	603231	603236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145261
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12313	NC_015583	CG	3	6	603259	603264	0 %	0 %	50 %	50 %	334145261
12314	NC_015583	CAG	2	6	603268	603273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145261
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12316	NC_015583	CAG	2	6	603334	603339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145261
12317	NC_015583	GCG	2	6	603359	603364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145261
12318	NC_015583	GTC	2	6	603376	603381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145261
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12320	NC_015583	CG	3	6	603556	603561	0 %	0 %	50 %	50 %	334145261
12321	NC_015583	CAC	2	6	603586	603591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145261
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12324	NC_015583	ACC	2	6	603704	603709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145261
12325	NC_015583	GAT	2	6	603751	603756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145261
12326	NC_015583	GCCGGG	2	12	603758	603769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145261
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12331	NC_015583	TGCC	2	8	603906	603913	0 %	25 %	25 %	50 %	334145261
12332	NC_015583	TCG	2	6	603959	603964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145261
12333	NC_015583	GCCC	2	8	603987	603994	0 %	0 %	25 %	75 %	334145261
12334	NC_015583	CAGG	2	8	604026	604033	25 %	0 %	50 %	25 %	334145261
12335	NC_015583	GC	3	6	604129	604134	0 %	0 %	50 %	50 %	334145261
12336	NC_015583	TCG	2	6	604157	604162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145261
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12339	NC_015583	GTCC	2	8	604213	604220	0 %	25 %	25 %	50 %	334145262
12340	NC_015583	GCC	2	6	604286	604291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145262
12341	NC_015583	CCA	2	6	604306	604311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145262
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12343	NC_015583	CTTGC	2	10	604415	604424	0 %	40 %	20 %	40 %	334145262
12344	NC_015583	GGCA	2	8	604448	604455	25 %	0 %	50 %	25 %	334145262
12345	NC_015583	GCGAG	2	10	604456	604465	20 %	0 %	60 %	20 %	334145262
12346	NC_015583	GCC	2	6	604478	604483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145262
12347	NC_015583	GCA	2	6	604522	604527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145262
12348	NC_015583	GCG	2	6	604533	604538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145262
12349	NC_015583	GCT	2	6	604581	604586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145262
12350	NC_015583	GC	4	8	604588	604595	0 %	0 %	50 %	50 %	334145262
12351	NC_015583	GTGC	2	8	604598	604605	0 %	25 %	50 %	25 %	334145262
12352	NC_015583	TTC	2	6	604611	604616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145262
12353	NC_015583	GCGG	2	8	604646	604653	0 %	0 %	75 %	25 %	334145262
12354	NC_015583	TGCGG	2	10	604664	604673	0 %	20 %	60 %	20 %	334145262
12355	NC_015583	TGC	2	6	604710	604715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145262
12356	NC_015583	GC	3	6	604729	604734	0 %	0 %	50 %	50 %	334145262
12357	NC_015583	CGCGCT	2	12	604735	604746	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334145262
12358	NC_015583	GCC	2	6	604767	604772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145262
12359	NC_015583	AGC	2	6	604800	604805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145262
12360	NC_015583	GCC	2	6	604809	604814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145262
12361	NC_015583	GC	3	6	604838	604843	0 %	0 %	50 %	50 %	334145262
12362	NC_015583	CAG	2	6	604868	604873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145262
12363	NC_015583	CAG	2	6	604886	604891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145262
12364	NC_015583	CCA	2	6	604916	604921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145262
12365	NC_015583	TTCAC	2	10	604937	604946	20 %	40 %	0 %	40 %	334145263
12366	NC_015583	CGA	2	6	605021	605026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145263
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12489	NC_015583	CCA	2	6	610416	610421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145267
12490	NC_015583	TGC	2	6	610497	610502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145267
12491	NC_015583	AGC	2	6	610505	610510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145267
12492	NC_015583	CGA	2	6	610572	610577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145267
12493	NC_015583	GGC	2	6	610621	610626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145267
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12495	NC_015583	CGCGC	2	10	610821	610830	0 %	0 %	40 %	60 %	334145267
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12498	NC_015583	AGCG	2	8	610895	610902	25 %	0 %	50 %	25 %	334145267
12499	NC_015583	GAA	2	6	610905	610910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145267
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