MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 chromosome

Total Repeats: 49268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011035	ACC	2	6	581292	581297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13002	NC_011035	TCA	2	6	581368	581373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_011035	TGC	2	6	581472	581477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098277
13004	NC_011035	AAATAG	2	12	581485	581496	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	194098277
13005	NC_011035	ATTTTT	2	12	581554	581565	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194098278
13006	NC_011035	TTA	2	6	581569	581574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194098278
13007	NC_011035	CCA	2	6	581602	581607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194098278
13008	NC_011035	AGT	2	6	581781	581786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194098278
13009	NC_011035	AC	3	6	581849	581854	50 %	0 %	0 %	50 %	194098278
13010	NC_011035	ACC	2	6	581892	581897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194098278
13011	NC_011035	T	6	6	581903	581908	0 %	100 %	0 %	0 %	194098278
13012	NC_011035	CTG	2	6	581931	581936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098278
13013	NC_011035	T	6	6	582000	582005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_011035	T	6	6	582054	582059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_011035	GCTGTT	2	12	582109	582120	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13016	NC_011035	GCA	2	6	582205	582210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_011035	TGC	2	6	582262	582267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_011035	GCT	2	6	582374	582379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_011035	TA	3	6	582395	582400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_011035	ACT	2	6	582416	582421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_011035	TTTTA	2	10	582464	582473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_011035	T	7	7	582520	582526	0 %	100 %	0 %	0 %	194098279
13023	NC_011035	T	7	7	582533	582539	0 %	100 %	0 %	0 %	194098279
13024	NC_011035	CATT	2	8	582552	582559	25 %	50 %	0 %	25 %	194098279
13025	NC_011035	TATCAA	2	12	582589	582600	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194098279
13026	NC_011035	AT	3	6	582658	582663	50 %	50 %	0 %	0 %	194098279
13027	NC_011035	ATTTT	2	10	582679	582688	20 %	80 %	0 %	0 %	194098279
13028	NC_011035	TCA	2	6	582705	582710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098279
13029	NC_011035	AAT	2	6	582721	582726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194098279
13030	NC_011035	A	6	6	582747	582752	100 %	0 %	0 %	0 %	194098279
13031	NC_011035	CAA	2	6	582754	582759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194098279
13032	NC_011035	ATAA	2	8	582803	582810	75 %	25 %	0 %	0 %	194098279
13033	NC_011035	ATT	2	6	582836	582841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194098279
13034	NC_011035	TCA	2	6	582865	582870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098279
13035	NC_011035	TTAT	2	8	582888	582895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_011035	CTT	2	6	582921	582926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_011035	TCATT	2	10	582942	582951	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13038	NC_011035	ACC	2	6	582955	582960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13039	NC_011035	T	6	6	583079	583084	0 %	100 %	0 %	0 %	194098280
13040	NC_011035	CAT	2	6	583093	583098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098280
13041	NC_011035	TTTTGA	2	12	583132	583143	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	194098280
13042	NC_011035	T	6	6	583264	583269	0 %	100 %	0 %	0 %	194098280
13043	NC_011035	GT	3	6	583451	583456	0 %	50 %	50 %	0 %	194098280
13044	NC_011035	TGC	2	6	583464	583469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098280
13045	NC_011035	GCA	2	6	583533	583538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194098280
13046	NC_011035	T	6	6	583541	583546	0 %	100 %	0 %	0 %	194098280
13047	NC_011035	T	6	6	583595	583600	0 %	100 %	0 %	0 %	194098280
13048	NC_011035	TGC	2	6	583757	583762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098280
13049	NC_011035	TGCTG	2	10	583803	583812	0 %	40 %	40 %	20 %	194098280
13050	NC_011035	CTGT	2	8	583839	583846	0 %	50 %	25 %	25 %	194098280
13051	NC_011035	GAT	2	6	583904	583909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194098280
13052	NC_011035	CAT	2	6	583918	583923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098280
13053	NC_011035	GTT	2	6	583955	583960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194098280
13054	NC_011035	TCA	2	6	583983	583988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098280
13055	NC_011035	A	6	6	583998	584003	100 %	0 %	0 %	0 %	194098280
13056	NC_011035	TAG	2	6	584100	584105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194098280
13057	NC_011035	TA	3	6	584109	584114	50 %	50 %	0 %	0 %	194098280
13058	NC_011035	CTC	2	6	584122	584127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194098280
13059	NC_011035	G	6	6	584129	584134	0 %	0 %	100 %	0 %	194098280
13060	NC_011035	CCG	2	6	584142	584147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098280
13061	NC_011035	CCG	2	6	584220	584225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098280
13062	NC_011035	CGTGTC	2	12	584290	584301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098280
13063	NC_011035	GT	3	6	584351	584356	0 %	50 %	50 %	0 %	194098280
13064	NC_011035	ATC	2	6	584486	584491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098280
13065	NC_011035	GCA	2	6	584536	584541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194098280
13066	NC_011035	CAT	2	6	584564	584569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098280
13067	NC_011035	GCA	2	6	584607	584612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_011035	TGT	2	6	584652	584657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194100169
13069	NC_011035	TGA	2	6	584872	584877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194100169
13070	NC_011035	T	6	6	584882	584887	0 %	100 %	0 %	0 %	194100169
13071	NC_011035	TTTG	2	8	584919	584926	0 %	75 %	25 %	0 %	194100169
13072	NC_011035	TAA	2	6	584998	585003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194100169
13073	NC_011035	AAC	2	6	585032	585037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194100169
13074	NC_011035	GAAA	2	8	585078	585085	75 %	0 %	25 %	0 %	194100169
13075	NC_011035	CG	3	6	585094	585099	0 %	0 %	50 %	50 %	194100169
13076	NC_011035	GTC	2	6	585105	585110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194100169
13077	NC_011035	AAG	2	6	585223	585228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194100169
13078	NC_011035	TGT	2	6	585254	585259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194100169
13079	NC_011035	GGT	2	6	585266	585271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194100169
13080	NC_011035	ACGG	2	8	585299	585306	25 %	0 %	50 %	25 %	194100169
13081	NC_011035	CGC	2	6	585325	585330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194100169
13082	NC_011035	ATAAA	2	10	585547	585556	80 %	20 %	0 %	0 %	194100169
13083	NC_011035	A	6	6	585562	585567	100 %	0 %	0 %	0 %	194100169
13084	NC_011035	CAG	2	6	585578	585583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194100169
13085	NC_011035	TGA	2	6	585609	585614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_011035	TAAA	2	8	585637	585644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_011035	TGT	2	6	585724	585729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194098281
13088	NC_011035	TG	3	6	585864	585869	0 %	50 %	50 %	0 %	194098281
13089	NC_011035	TGAT	2	8	585873	585880	25 %	50 %	25 %	0 %	194098281
13090	NC_011035	CAT	2	6	585913	585918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098281
13091	NC_011035	CGA	2	6	585921	585926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194098281
13092	NC_011035	CTG	3	9	585958	585966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098281
13093	NC_011035	TTA	2	6	586094	586099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_011035	CAG	2	6	586154	586159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194098282
13095	NC_011035	CCG	2	6	586163	586168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098282
13096	NC_011035	GCG	2	6	586180	586185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098282
13097	NC_011035	TCA	2	6	586218	586223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098282
13098	NC_011035	GTT	2	6	586248	586253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194098282
13099	NC_011035	CCA	2	6	586318	586323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194098282
13100	NC_011035	TCC	2	6	586350	586355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194098283
13101	NC_011035	GTT	2	6	586357	586362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194098283
13102	NC_011035	CCG	2	6	586378	586383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098283
13103	NC_011035	AAG	2	6	586470	586475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194098283
13104	NC_011035	GAT	2	6	586511	586516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194098283
13105	NC_011035	GC	3	6	586608	586613	0 %	0 %	50 %	50 %	194098283
13106	NC_011035	CA	3	6	586732	586737	50 %	0 %	0 %	50 %	194098283
13107	NC_011035	TTGG	2	8	586763	586770	0 %	50 %	50 %	0 %	194098283
13108	NC_011035	GCC	2	6	586802	586807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098283
13109	NC_011035	GAA	2	6	586859	586864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194098283
13110	NC_011035	AGA	2	6	586915	586920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194098283
13111	NC_011035	TGC	2	6	586921	586926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098283
13112	NC_011035	CG	3	6	586954	586959	0 %	0 %	50 %	50 %	194098283
13113	NC_011035	CGG	2	6	586972	586977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098283
13114	NC_011035	ACA	2	6	586999	587004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194098283
13115	NC_011035	CAT	2	6	587027	587032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098283
13116	NC_011035	TGG	2	6	587179	587184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194098283
13117	NC_011035	CGG	3	9	587194	587202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098283
13118	NC_011035	GCG	2	6	587226	587231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098283
13119	NC_011035	GCG	3	9	587271	587279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098283
13120	NC_011035	CCG	2	6	587319	587324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098283
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13122	NC_011035	GAA	2	6	587379	587384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194098283
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13229	NC_011035	GGGCTG	2	12	593124	593135	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	194098290
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13233	NC_011035	CAT	2	6	593177	593182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098290
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13242	NC_011035	T	6	6	593555	593560	0 %	100 %	0 %	0 %	194098290
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13256	NC_011035	GGCG	2	8	593987	593994	0 %	0 %	75 %	25 %	194098290
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13362	NC_011035	TTG	2	6	598556	598561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194098297
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13485	NC_011035	T	6	6	605264	605269	0 %	100 %	0 %	0 %	194098306
13486	NC_011035	ATCG	2	8	605330	605337	25 %	25 %	25 %	25 %	194098306
13487	NC_011035	CTT	2	6	605368	605373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194098306
13488	NC_011035	GCCG	2	8	605384	605391	0 %	0 %	50 %	50 %	194098306
13489	NC_011035	CTG	2	6	605399	605404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098306
13490	NC_011035	CGC	2	6	605446	605451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098306
13491	NC_011035	CAC	2	6	605515	605520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194098306
13492	NC_011035	TGC	3	9	605553	605561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098306
13493	NC_011035	GTC	2	6	605630	605635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098306
13494	NC_011035	GCT	2	6	605672	605677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098306
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13496	NC_011035	GTT	2	6	605819	605824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13497	NC_011035	AT	3	6	605849	605854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13498	NC_011035	TA	3	6	605869	605874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_011035	ATA	2	6	605885	605890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194098307
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