MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 chromosome

Total Repeats: 49268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011035	CGG	2	6	557519	557524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098242
12502	NC_011035	CGG	3	9	557595	557603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098242
12503	NC_011035	CG	3	6	557638	557643	0 %	0 %	50 %	50 %	194098242
12504	NC_011035	CGG	2	6	557654	557659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098242
12505	NC_011035	GGCG	2	8	557709	557716	0 %	0 %	75 %	25 %	194098242
12506	NC_011035	CG	4	8	557715	557722	0 %	0 %	50 %	50 %	194098242
12507	NC_011035	GGCG	2	8	557757	557764	0 %	0 %	75 %	25 %	194098242
12508	NC_011035	CGG	2	6	557865	557870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098242
12509	NC_011035	GCC	3	9	557952	557960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098242
12510	NC_011035	GGC	2	6	557985	557990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098242
12511	NC_011035	GCT	2	6	558015	558020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098242
12512	NC_011035	GCC	2	6	558046	558051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098242
12513	NC_011035	CG	4	8	558087	558094	0 %	0 %	50 %	50 %	194098242
12514	NC_011035	GATGA	2	10	558196	558205	40 %	20 %	40 %	0 %	194098242
12515	NC_011035	GGC	2	6	558301	558306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098242
12516	NC_011035	CGG	2	6	558345	558350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098242
12517	NC_011035	CTTT	2	8	558356	558363	0 %	75 %	0 %	25 %	194098242
12518	NC_011035	TCG	2	6	558407	558412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098242
12519	NC_011035	CGG	2	6	558456	558461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098242
12520	NC_011035	GGT	2	6	558507	558512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194098242
12521	NC_011035	CGG	2	6	558522	558527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098242
12522	NC_011035	GGC	2	6	558557	558562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_011035	TTG	2	6	558572	558577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_011035	T	6	6	558586	558591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_011035	GGC	2	6	558619	558624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098243
12526	NC_011035	CGG	2	6	558633	558638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098243
12527	NC_011035	GGC	2	6	558657	558662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098243
12528	NC_011035	GCC	2	6	558723	558728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098243
12529	NC_011035	ATT	2	6	558793	558798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194098243
12530	NC_011035	GAT	2	6	558862	558867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194098243
12531	NC_011035	AAG	2	6	559009	559014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194098243
12532	NC_011035	GCC	2	6	559015	559020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098243
12533	NC_011035	CGC	2	6	559077	559082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098244
12534	NC_011035	GCG	2	6	559099	559104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098244
12535	NC_011035	CGG	3	9	559132	559140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098244
12536	NC_011035	G	6	6	559139	559144	0 %	0 %	100 %	0 %	194098244
12537	NC_011035	TGGA	2	8	559146	559153	25 %	25 %	50 %	0 %	194098244
12538	NC_011035	CGG	2	6	559175	559180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098244
12539	NC_011035	TATC	2	8	559202	559209	25 %	50 %	0 %	25 %	194098244
12540	NC_011035	GTT	2	6	559271	559276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194098244
12541	NC_011035	GCC	2	6	559296	559301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098244
12542	NC_011035	GAT	2	6	559329	559334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194098244
12543	NC_011035	GGCG	2	8	559352	559359	0 %	0 %	75 %	25 %	194098244
12544	NC_011035	CGG	2	6	559381	559386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098244
12545	NC_011035	CGG	2	6	559495	559500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098244
12546	NC_011035	CGA	2	6	559624	559629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194098245
12547	NC_011035	CGGC	2	8	559678	559685	0 %	0 %	50 %	50 %	194098245
12548	NC_011035	TGC	2	6	559686	559691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098245
12549	NC_011035	GGC	2	6	559728	559733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098245
12550	NC_011035	TTATGC	2	12	559738	559749	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	194098245
12551	NC_011035	GCG	2	6	559762	559767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098245
12552	NC_011035	GGC	2	6	559845	559850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098246
12553	NC_011035	TGCGCC	2	12	559935	559946	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194098246
12554	NC_011035	GTT	2	6	559962	559967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194098246
12555	NC_011035	G	6	6	559972	559977	0 %	0 %	100 %	0 %	194098246
12556	NC_011035	TGCC	2	8	559981	559988	0 %	25 %	25 %	50 %	194098246
12557	NC_011035	GGGGAC	2	12	560002	560013	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	194098246
12558	NC_011035	CAT	2	6	560035	560040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098246
12559	NC_011035	AGG	2	6	560125	560130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194098246
12560	NC_011035	GCCG	2	8	560154	560161	0 %	0 %	50 %	50 %	194098246
12561	NC_011035	CGG	2	6	560338	560343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098247
12562	NC_011035	GGC	2	6	560400	560405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_011035	TTACC	2	10	560415	560424	20 %	40 %	0 %	40 %	194098248
12564	NC_011035	CGG	2	6	560513	560518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098248
12565	NC_011035	GCCT	2	8	560569	560576	0 %	25 %	25 %	50 %	194098248
12566	NC_011035	GCT	2	6	560585	560590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098248
12567	NC_011035	GCG	2	6	560594	560599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098248
12568	NC_011035	ATC	2	6	560623	560628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098248
12569	NC_011035	TAA	2	6	560638	560643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194098248
12570	NC_011035	TCGGC	2	10	560690	560699	0 %	20 %	40 %	40 %	194098248
12571	NC_011035	GGA	2	6	560844	560849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194098248
12572	NC_011035	GTC	2	6	560907	560912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098248
12573	NC_011035	GGT	2	6	560916	560921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194098248
12574	NC_011035	GCC	2	6	560940	560945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098248
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12577	NC_011035	TGCAG	2	10	561116	561125	20 %	20 %	40 %	20 %	194098248
12578	NC_011035	ACGG	2	8	561216	561223	25 %	0 %	50 %	25 %	194098248
12579	NC_011035	TTG	2	6	561228	561233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194098248
12580	NC_011035	TCTT	2	8	561271	561278	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12581	NC_011035	AAT	2	6	561390	561395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_011035	T	6	6	561431	561436	0 %	100 %	0 %	0 %	194098249
12583	NC_011035	TGAT	2	8	561443	561450	25 %	50 %	25 %	0 %	194098249
12584	NC_011035	T	6	6	561525	561530	0 %	100 %	0 %	0 %	194098249
12585	NC_011035	T	6	6	561603	561608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_011035	GCG	2	6	561638	561643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12587	NC_011035	TGAAT	2	10	561804	561813	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_011035	C	6	6	561846	561851	0 %	0 %	0 %	100 %	194098250
12589	NC_011035	GCC	2	6	561904	561909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098250
12590	NC_011035	GGC	2	6	561923	561928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098250
12591	NC_011035	T	7	7	562013	562019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_011035	ATTTA	2	10	562037	562046	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_011035	TA	3	6	562045	562050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_011035	TTAAT	2	10	562051	562060	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_011035	AGT	2	6	562102	562107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194098251
12596	NC_011035	TAAAT	2	10	562143	562152	60 %	40 %	0 %	0 %	194098251
12597	NC_011035	AAAT	2	8	562162	562169	75 %	25 %	0 %	0 %	194098251
12598	NC_011035	AATAA	2	10	562181	562190	80 %	20 %	0 %	0 %	194098251
12599	NC_011035	CCG	2	6	562214	562219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098251
12600	NC_011035	T	6	6	562252	562257	0 %	100 %	0 %	0 %	194098251
12601	NC_011035	TA	3	6	562278	562283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_011035	ATC	2	6	562287	562292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12603	NC_011035	GAT	2	6	562300	562305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_011035	CAA	2	6	562322	562327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12605	NC_011035	ATTGCT	2	12	562526	562537	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	194098252
12606	NC_011035	T	6	6	562570	562575	0 %	100 %	0 %	0 %	194098253
12607	NC_011035	CGG	2	6	562627	562632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098253
12608	NC_011035	GTT	2	6	562661	562666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194098253
12609	NC_011035	TGT	2	6	562696	562701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194098253
12610	NC_011035	TTG	2	6	562727	562732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194098253
12611	NC_011035	CGG	2	6	562739	562744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098253
12612	NC_011035	ATT	2	6	562850	562855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_011035	A	6	6	562871	562876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_011035	TA	3	6	563045	563050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_011035	GCG	2	6	563061	563066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12616	NC_011035	TAATCA	2	12	563069	563080	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12617	NC_011035	ACG	2	6	563110	563115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12618	NC_011035	GTA	2	6	563221	563226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194098254
12619	NC_011035	GCC	2	6	563227	563232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098254
12620	NC_011035	AG	3	6	563260	563265	50 %	0 %	50 %	0 %	194098254
12621	NC_011035	TTC	2	6	563266	563271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194098254
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12623	NC_011035	GCC	2	6	563351	563356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098254
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12982	NC_011035	T	7	7	580548	580554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12989	NC_011035	CAA	2	6	580785	580790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12999	NC_011035	TCA	2	6	581266	581271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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