MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 chromosome

Total Repeats: 49268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011035	TTC	2	6	448263	448268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194098118
10002	NC_011035	GTC	2	6	448320	448325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098118
10003	NC_011035	AAG	2	6	448342	448347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194098118
10004	NC_011035	GAC	2	6	448389	448394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194098118
10005	NC_011035	GTT	2	6	448428	448433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194098118
10006	NC_011035	TCT	2	6	448474	448479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194098118
10007	NC_011035	T	6	6	448479	448484	0 %	100 %	0 %	0 %	194098118
10008	NC_011035	GATT	2	8	448542	448549	25 %	50 %	25 %	0 %	194098118
10009	NC_011035	AATA	2	8	448648	448655	75 %	25 %	0 %	0 %	194098119
10010	NC_011035	GCC	2	6	448779	448784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098119
10011	NC_011035	GCGG	2	8	448904	448911	0 %	0 %	75 %	25 %	194098119
10012	NC_011035	CAA	2	6	448917	448922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194098119
10013	NC_011035	CGT	2	6	448943	448948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098119
10014	NC_011035	TGAA	2	8	448966	448973	50 %	25 %	25 %	0 %	194098119
10015	NC_011035	GGC	2	6	449046	449051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098119
10016	NC_011035	GC	3	6	449072	449077	0 %	0 %	50 %	50 %	194098119
10017	NC_011035	TGCCGT	2	12	449296	449307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_011035	TGC	2	6	449324	449329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098120
10019	NC_011035	GC	5	10	449404	449413	0 %	0 %	50 %	50 %	194098120
10020	NC_011035	TGT	2	6	449427	449432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194098120
10021	NC_011035	GGTC	2	8	449436	449443	0 %	25 %	50 %	25 %	194098120
10022	NC_011035	TCA	2	6	449465	449470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098120
10023	NC_011035	CGA	2	6	449526	449531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194098120
10024	NC_011035	TG	3	6	449564	449569	0 %	50 %	50 %	0 %	194098120
10025	NC_011035	GTT	2	6	449656	449661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194098121
10026	NC_011035	GGC	2	6	449682	449687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098121
10027	NC_011035	GCG	2	6	449777	449782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098121
10028	NC_011035	TTG	2	6	449801	449806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_011035	GAT	2	6	449811	449816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_011035	GAT	2	6	449881	449886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194098122
10031	NC_011035	CGC	2	6	449893	449898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098122
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10033	NC_011035	TGATT	2	10	449928	449937	20 %	60 %	20 %	0 %	194098122
10034	NC_011035	GCG	2	6	449962	449967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098122
10035	NC_011035	CG	3	6	449966	449971	0 %	0 %	50 %	50 %	194098122
10036	NC_011035	AGG	2	6	449972	449977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194098122
10037	NC_011035	GCT	2	6	450021	450026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098122
10038	NC_011035	CGG	2	6	450032	450037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098122
10039	NC_011035	CAAA	2	8	450092	450099	75 %	0 %	0 %	25 %	194098122
10040	NC_011035	AGG	2	6	450113	450118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194098122
10041	NC_011035	GGAC	2	8	450231	450238	25 %	0 %	50 %	25 %	194098122
10042	NC_011035	GACG	2	8	450240	450247	25 %	0 %	50 %	25 %	194098122
10043	NC_011035	TGA	2	6	450260	450265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194098122
10044	NC_011035	ATG	2	6	450266	450271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194098122
10045	NC_011035	ATG	2	6	450346	450351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194098122
10046	NC_011035	GGA	2	6	450384	450389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194098122
10047	NC_011035	ATGGTG	2	12	450583	450594	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	194098122
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10049	NC_011035	GGC	2	6	450696	450701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098122
10050	NC_011035	GGCT	2	8	450712	450719	0 %	25 %	50 %	25 %	194098122
10051	NC_011035	CGG	2	6	450723	450728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098122
10052	NC_011035	CTG	2	6	450748	450753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098122
10053	NC_011035	GTGCGG	2	12	450764	450775	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	194098122
10054	NC_011035	GGC	2	6	450804	450809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098122
10055	NC_011035	T	6	6	450881	450886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_011035	GCG	2	6	450911	450916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098123
10057	NC_011035	ATC	2	6	450934	450939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098123
10058	NC_011035	CCATTT	2	12	450987	450998	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	194098123
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10060	NC_011035	CGC	2	6	451059	451064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098123
10061	NC_011035	CG	3	6	451122	451127	0 %	0 %	50 %	50 %	194098123
10062	NC_011035	CGC	2	6	451155	451160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098123
10063	NC_011035	GC	3	6	451261	451266	0 %	0 %	50 %	50 %	194098123
10064	NC_011035	CCAG	2	8	451332	451339	25 %	0 %	25 %	50 %	194098123
10065	NC_011035	CAT	2	6	451375	451380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098123
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10068	NC_011035	GCT	2	6	451556	451561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098123
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10074	NC_011035	CGG	2	6	451978	451983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098123
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10076	NC_011035	TCG	2	6	452003	452008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098123
10077	NC_011035	ATGG	2	8	452023	452030	25 %	25 %	50 %	0 %	194098123
10078	NC_011035	CAAT	2	8	452111	452118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10079	NC_011035	GCC	2	6	452122	452127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10080	NC_011035	GCAG	2	8	452155	452162	25 %	0 %	50 %	25 %	194098124
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10082	NC_011035	CTGC	2	8	452192	452199	0 %	25 %	25 %	50 %	194098124
10083	NC_011035	ATACA	2	10	452201	452210	60 %	20 %	0 %	20 %	194098124
10084	NC_011035	CA	3	6	452209	452214	50 %	0 %	0 %	50 %	194098124
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10087	NC_011035	CAG	2	6	452278	452283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194098124
10088	NC_011035	ATCA	2	8	452303	452310	50 %	25 %	0 %	25 %	194098124
10089	NC_011035	CCG	2	6	452352	452357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098124
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10092	NC_011035	TGAAA	2	10	452629	452638	60 %	20 %	20 %	0 %	194098124
10093	NC_011035	GC	3	6	452721	452726	0 %	0 %	50 %	50 %	194098124
10094	NC_011035	TCG	3	9	452955	452963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098124
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10096	NC_011035	AG	3	6	453109	453114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_011035	TAA	2	6	453205	453210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_011035	TCGG	2	8	453357	453364	0 %	25 %	50 %	25 %	194098125
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10102	NC_011035	CGGCG	2	10	453534	453543	0 %	0 %	60 %	40 %	194098125
10103	NC_011035	GAC	2	6	453600	453605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194098125
10104	NC_011035	CG	3	6	453625	453630	0 %	0 %	50 %	50 %	194098125
10105	NC_011035	TGC	2	6	453645	453650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098125
10106	NC_011035	ATG	2	6	453678	453683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194098125
10107	NC_011035	GCG	2	6	453690	453695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098125
10108	NC_011035	GC	3	6	453849	453854	0 %	0 %	50 %	50 %	194098125
10109	NC_011035	GAA	2	6	453864	453869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194098125
10110	NC_011035	T	6	6	453927	453932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_011035	GGC	2	6	453982	453987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098126
10112	NC_011035	CGA	2	6	454031	454036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194098126
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10114	NC_011035	CGCGCA	2	12	454208	454219	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194098126
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10121	NC_011035	TCT	2	6	454666	454671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194098126
10122	NC_011035	GGA	2	6	454680	454685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194098126
10123	NC_011035	GTCG	2	8	454782	454789	0 %	25 %	50 %	25 %	194098127
10124	NC_011035	GCG	2	6	454818	454823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098127
10125	NC_011035	GAT	3	9	454824	454832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194098127
10126	NC_011035	CG	4	8	454880	454887	0 %	0 %	50 %	50 %	194098127
10127	NC_011035	CGC	2	6	454889	454894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098127
10128	NC_011035	GATTTC	2	12	454908	454919	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	194098127
10129	NC_011035	CCTG	2	8	454996	455003	0 %	25 %	25 %	50 %	194098127
10130	NC_011035	GCC	2	6	455013	455018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098127
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10234	NC_011035	GCGG	2	8	459709	459716	0 %	0 %	75 %	25 %	194098132
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10356	NC_011035	CGA	2	6	464565	464570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194098139
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10369	NC_011035	CG	3	6	465238	465243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10482	NC_011035	CAA	3	9	469732	469740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194098143
10483	NC_011035	GAA	2	6	469751	469756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194098143
10484	NC_011035	CGC	2	6	469819	469824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194098143
10485	NC_011035	CAG	2	6	469864	469869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194098143
10486	NC_011035	GCG	2	6	469960	469965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194098143
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10488	NC_011035	CAA	2	6	470022	470027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10489	NC_011035	GGC	2	6	470059	470064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10493	NC_011035	GCA	2	6	470198	470203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194098144
10494	NC_011035	ATC	2	6	470290	470295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194098144
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10500	NC_011035	CTG	2	6	470517	470522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194098144

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