MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 chromosome

Total Repeats: 49268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011035	GCC	2	6	21981	21986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097622
502	NC_011035	CGCC	2	8	22007	22014	0 %	0 %	25 %	75 %	194097622
503	NC_011035	CGCC	2	8	22034	22041	0 %	0 %	25 %	75 %	194097622
504	NC_011035	GCC	2	6	22117	22122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097622
505	NC_011035	GCA	2	6	22159	22164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097622
506	NC_011035	GGC	2	6	22228	22233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097622
507	NC_011035	TTTGA	2	10	22292	22301	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011035	AAC	2	6	22302	22307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_011035	A	6	6	22312	22317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011035	GTC	2	6	22319	22324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_011035	GAC	2	6	22341	22346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_011035	T	6	6	22348	22353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011035	CGG	2	6	22360	22365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_011035	CGG	2	6	22431	22436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097623
515	NC_011035	GCC	3	9	22465	22473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097623
516	NC_011035	GCG	2	6	22497	22502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097623
517	NC_011035	GTC	2	6	22555	22560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097623
518	NC_011035	TGG	2	6	22569	22574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194097623
519	NC_011035	GCGG	2	8	22583	22590	0 %	0 %	75 %	25 %	194097623
520	NC_011035	CGTC	2	8	22680	22687	0 %	25 %	25 %	50 %	194097623
521	NC_011035	CGG	2	6	22698	22703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097623
522	NC_011035	CAG	2	6	22705	22710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097623
523	NC_011035	GGC	3	9	22783	22791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097623
524	NC_011035	GCC	2	6	22801	22806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097623
525	NC_011035	TGC	2	6	22809	22814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097623
526	NC_011035	CACG	2	8	22866	22873	25 %	0 %	25 %	50 %	194097623
527	NC_011035	CAA	2	6	22879	22884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194097623
528	NC_011035	ATC	2	6	22885	22890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194097623
529	NC_011035	GCC	2	6	22919	22924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097623
530	NC_011035	CCG	3	9	22949	22957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097623
531	NC_011035	GCG	2	6	23084	23089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097623
532	NC_011035	GAC	2	6	23129	23134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097623
533	NC_011035	AAAC	2	8	23169	23176	75 %	0 %	0 %	25 %	194097623
534	NC_011035	TGC	2	6	23177	23182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097623
535	NC_011035	GCG	2	6	23241	23246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097623
536	NC_011035	GGC	2	6	23260	23265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097623
537	NC_011035	CGC	2	6	23280	23285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097623
538	NC_011035	GGTC	2	8	23295	23302	0 %	25 %	50 %	25 %	194097623
539	NC_011035	CAG	2	6	23398	23403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097623
540	NC_011035	CCA	2	6	23409	23414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194097623
541	NC_011035	CAAA	2	8	23466	23473	75 %	0 %	0 %	25 %	194097623
542	NC_011035	GCC	2	6	23480	23485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097623
543	NC_011035	CCA	2	6	23514	23519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194097623
544	NC_011035	CG	3	6	23545	23550	0 %	0 %	50 %	50 %	194097623
545	NC_011035	GAC	2	6	23648	23653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097623
546	NC_011035	TCAA	2	8	23693	23700	50 %	25 %	0 %	25 %	194097623
547	NC_011035	CAT	2	6	23746	23751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194097623
548	NC_011035	CCA	2	6	23808	23813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194097623
549	NC_011035	CG	3	6	23823	23828	0 %	0 %	50 %	50 %	194097623
550	NC_011035	AC	3	6	23869	23874	50 %	0 %	0 %	50 %	194097623
551	NC_011035	TGCC	2	8	23913	23920	0 %	25 %	25 %	50 %	194097623
552	NC_011035	CGC	2	6	23988	23993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097623
553	NC_011035	CAG	2	6	24010	24015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097623
554	NC_011035	CG	3	6	24016	24021	0 %	0 %	50 %	50 %	194097623
555	NC_011035	GCT	2	6	24027	24032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097623
556	NC_011035	CCA	2	6	24033	24038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194097623
557	NC_011035	CGC	2	6	24048	24053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097623
558	NC_011035	TCG	2	6	24065	24070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097623
559	NC_011035	CGC	2	6	24139	24144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097623
560	NC_011035	CG	4	8	24203	24210	0 %	0 %	50 %	50 %	194097623
561	NC_011035	GC	4	8	24275	24282	0 %	0 %	50 %	50 %	194097623
562	NC_011035	GTT	2	6	24289	24294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194097623
563	NC_011035	A	6	6	24296	24301	100 %	0 %	0 %	0 %	194097623
564	NC_011035	CG	5	10	24302	24311	0 %	0 %	50 %	50 %	194097623
565	NC_011035	CAG	2	6	24327	24332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097623
566	NC_011035	CGG	2	6	24348	24353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097623
567	NC_011035	GGC	2	6	24463	24468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_011035	GCG	2	6	24475	24480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_011035	TGC	2	6	24539	24544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097624
570	NC_011035	TATGCC	2	12	24651	24662	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194097624
571	NC_011035	GC	3	6	24663	24668	0 %	0 %	50 %	50 %	194097624
572	NC_011035	CCG	2	6	24706	24711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097624
573	NC_011035	GCG	2	6	24722	24727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097624
574	NC_011035	AGGC	2	8	24736	24743	25 %	0 %	50 %	25 %	194097624
575	NC_011035	CGC	2	6	24749	24754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097624
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577	NC_011035	TTC	2	6	24879	24884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194097624
578	NC_011035	GCGG	2	8	24887	24894	0 %	0 %	75 %	25 %	194097624
579	NC_011035	GCG	2	6	24901	24906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097624
580	NC_011035	CGC	2	6	24920	24925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097624
581	NC_011035	CTT	2	6	24953	24958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194097624
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583	NC_011035	CGG	2	6	25016	25021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097624
584	NC_011035	CGC	2	6	25049	25054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097624
585	NC_011035	CGG	2	6	25070	25075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097624
586	NC_011035	GTC	2	6	25085	25090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097624
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589	NC_011035	GCC	2	6	25269	25274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097624
590	NC_011035	GCG	2	6	25289	25294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097624
591	NC_011035	GCG	2	6	25336	25341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097624
592	NC_011035	GC	5	10	25445	25454	0 %	0 %	50 %	50 %	194097624
593	NC_011035	CTG	2	6	25515	25520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097624
594	NC_011035	CGAG	2	8	25529	25536	25 %	0 %	50 %	25 %	194097624
595	NC_011035	TCG	2	6	25540	25545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097624
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598	NC_011035	GCG	3	9	25588	25596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097624
599	NC_011035	ACA	2	6	25655	25660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194097624
600	NC_011035	CGG	2	6	25670	25675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097624
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606	NC_011035	GCG	2	6	25932	25937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097625
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608	NC_011035	CCG	2	6	25968	25973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097625
609	NC_011035	TCG	2	6	25992	25997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097625
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611	NC_011035	GAC	2	6	26147	26152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097625
612	NC_011035	ATG	2	6	26229	26234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194097625
613	NC_011035	GT	4	8	26243	26250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011035	GGT	2	6	26276	26281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011035	TTTATT	2	12	26297	26308	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	194097626
616	NC_011035	CGG	2	6	26323	26328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097626
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619	NC_011035	TGAT	2	8	26537	26544	25 %	50 %	25 %	0 %	194097626
620	NC_011035	CGG	2	6	26561	26566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097626
621	NC_011035	CGT	2	6	26573	26578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097626
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624	NC_011035	CGC	2	6	26630	26635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097626
625	NC_011035	CTT	2	6	26645	26650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194097626
626	NC_011035	CAT	2	6	26694	26699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194097626
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