MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis 053442 chromosome

Total Repeats: 46026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_010120	CGT	3	9	648222	648230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869618
14002	NC_010120	CGG	2	6	648255	648260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869618
14003	NC_010120	TG	3	6	648337	648342	0 %	50 %	50 %	0 %	161869618
14004	NC_010120	CGG	2	6	648351	648356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869618
14005	NC_010120	AGG	2	6	648368	648373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161869618
14006	NC_010120	GCG	2	6	648476	648481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869618
14007	NC_010120	CCGAA	2	10	648521	648530	40 %	0 %	20 %	40 %	161869618
14008	NC_010120	CG	3	6	648554	648559	0 %	0 %	50 %	50 %	161869618
14009	NC_010120	CTG	2	6	648616	648621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869618
14010	NC_010120	CCG	2	6	648651	648656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869618
14011	NC_010120	GCG	2	6	648666	648671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869618
14012	NC_010120	TGATT	2	10	648678	648687	20 %	60 %	20 %	0 %	161869618
14013	NC_010120	TGT	2	6	648692	648697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869618
14014	NC_010120	GCC	2	6	648718	648723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869618
14015	NC_010120	TGA	2	6	648731	648736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_010120	CGG	2	6	648863	648868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869619
14017	NC_010120	CGT	2	6	648914	648919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869619
14018	NC_010120	GCG	2	6	648975	648980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869619
14019	NC_010120	AGG	2	6	649013	649018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161869619
14020	NC_010120	GGAT	2	8	649040	649047	25 %	25 %	50 %	0 %	161869619
14021	NC_010120	TGC	2	6	649124	649129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869619
14022	NC_010120	GCG	2	6	649238	649243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869619
14023	NC_010120	GCG	2	6	649276	649281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869619
14024	NC_010120	CTT	2	6	649283	649288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869619
14025	NC_010120	GCA	2	6	649342	649347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869619
14026	NC_010120	TCAGAA	2	12	649370	649381	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161869619
14027	NC_010120	GGCGC	2	10	649386	649395	0 %	0 %	60 %	40 %	161869619
14028	NC_010120	TC	3	6	649401	649406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14029	NC_010120	GCAA	2	8	649450	649457	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14030	NC_010120	C	6	6	649472	649477	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14031	NC_010120	T	6	6	649486	649491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_010120	GCA	2	6	649586	649591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869620
14033	NC_010120	CGG	2	6	649622	649627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869620
14034	NC_010120	GCC	2	6	649654	649659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869620
14035	NC_010120	TTC	2	6	649682	649687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869620
14036	NC_010120	GTC	2	6	649713	649718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869620
14037	NC_010120	AAAT	2	8	649725	649732	75 %	25 %	0 %	0 %	161869620
14038	NC_010120	TGCT	2	8	649783	649790	0 %	50 %	25 %	25 %	161869621
14039	NC_010120	GCC	2	6	649964	649969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869621
14040	NC_010120	GGC	2	6	650019	650024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869621
14041	NC_010120	TAT	2	6	650028	650033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161869621
14042	NC_010120	CG	3	6	650044	650049	0 %	0 %	50 %	50 %	161869621
14043	NC_010120	GCC	2	6	650123	650128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869621
14044	NC_010120	GAA	2	6	650226	650231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161869621
14045	NC_010120	CCG	2	6	650251	650256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869621
14046	NC_010120	CGA	2	6	650422	650427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869622
14047	NC_010120	TGCACC	2	12	650430	650441	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161869622
14048	NC_010120	GCGACG	2	12	650445	650456	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	161869622
14049	NC_010120	CAGA	2	8	650485	650492	50 %	0 %	25 %	25 %	161869622
14050	NC_010120	GC	3	6	650497	650502	0 %	0 %	50 %	50 %	161869622
14051	NC_010120	GTC	2	6	650531	650536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869622
14052	NC_010120	GC	3	6	650564	650569	0 %	0 %	50 %	50 %	161869622
14053	NC_010120	GGC	2	6	650575	650580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869622
14054	NC_010120	TGA	2	6	650610	650615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869622
14055	NC_010120	GCC	2	6	650666	650671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869622
14056	NC_010120	TCG	2	6	650676	650681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869622
14057	NC_010120	CGA	2	6	650706	650711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869622
14058	NC_010120	ATTCCG	2	12	650715	650726	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161869622
14059	NC_010120	GAA	2	6	650762	650767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161869622
14060	NC_010120	GCC	2	6	650843	650848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869622
14061	NC_010120	TGA	2	6	650862	650867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869622
14062	NC_010120	CAC	2	6	650917	650922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161869622
14063	NC_010120	GCC	2	6	650930	650935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869622
14064	NC_010120	GCC	2	6	650966	650971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869622
14065	NC_010120	CCT	2	6	650989	650994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161869622
14066	NC_010120	CGG	2	6	651019	651024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869622
14067	NC_010120	CAT	2	6	651035	651040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161869622
14068	NC_010120	CTGC	2	8	651043	651050	0 %	25 %	25 %	50 %	161869622
14069	NC_010120	GCC	2	6	651089	651094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869622
14070	NC_010120	TTC	2	6	651119	651124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869622
14071	NC_010120	CGC	2	6	651141	651146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869622
14072	NC_010120	CCG	2	6	651204	651209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869622
14073	NC_010120	CAAA	2	8	651331	651338	75 %	0 %	0 %	25 %	161869622
14074	NC_010120	ACGGCG	2	12	651366	651377	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	161869622
14075	NC_010120	GC	3	6	651391	651396	0 %	0 %	50 %	50 %	161869622
14076	NC_010120	GCG	2	6	651399	651404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869622
14077	NC_010120	ATTG	2	8	651426	651433	25 %	50 %	25 %	0 %	161869622
14078	NC_010120	TCG	2	6	651527	651532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869623
14079	NC_010120	GCC	2	6	651592	651597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869623
14080	NC_010120	CAG	2	6	651682	651687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869623
14081	NC_010120	TCG	2	6	651719	651724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869623
14082	NC_010120	T	6	6	651744	651749	0 %	100 %	0 %	0 %	161869623
14083	NC_010120	GAA	2	6	651781	651786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161869623
14084	NC_010120	TTG	2	6	651791	651796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869623
14085	NC_010120	TTC	2	6	651802	651807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869623
14086	NC_010120	GCG	2	6	651860	651865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869623
14087	NC_010120	CGG	3	9	651917	651925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869623
14088	NC_010120	GGC	2	6	651958	651963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14089	NC_010120	TGTT	2	8	652008	652015	0 %	75 %	25 %	0 %	161869624
14090	NC_010120	TTC	2	6	652017	652022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869624
14091	NC_010120	TTC	2	6	652035	652040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869624
14092	NC_010120	AGC	2	6	652042	652047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869624
14093	NC_010120	GGC	2	6	652083	652088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869624
14094	NC_010120	TTC	2	6	652101	652106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869624
14095	NC_010120	CGT	2	6	652127	652132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869624
14096	NC_010120	GGT	2	6	652137	652142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161869624
14097	NC_010120	TGT	2	6	652166	652171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869624
14098	NC_010120	ACG	2	6	652249	652254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869624
14099	NC_010120	AGA	2	6	652284	652289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161869624
14100	NC_010120	TCA	2	6	652298	652303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161869624
14101	NC_010120	GCA	2	6	652386	652391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869624
14102	NC_010120	CGATGC	2	12	652439	652450	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161869624
14103	NC_010120	TCT	2	6	652580	652585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869626
14104	NC_010120	GCG	2	6	652625	652630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869626
14105	NC_010120	GGTT	2	8	652638	652645	0 %	50 %	50 %	0 %	161869626
14106	NC_010120	GTC	2	6	652687	652692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869626
14107	NC_010120	TCG	2	6	652700	652705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869626
14108	NC_010120	TCG	2	6	652709	652714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869626
14109	NC_010120	GAA	2	6	652720	652725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161869626
14110	NC_010120	TTTG	2	8	652788	652795	0 %	75 %	25 %	0 %	161869626
14111	NC_010120	TGG	2	6	652806	652811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161869626
14112	NC_010120	CGG	3	9	652922	652930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869625
14113	NC_010120	TGG	2	6	652933	652938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161869625
14114	NC_010120	T	6	6	653008	653013	0 %	100 %	0 %	0 %	161869625
14115	NC_010120	CAG	2	6	653048	653053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869625
14116	NC_010120	AGA	2	6	653070	653075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161869625
14117	NC_010120	CGATT	2	10	653173	653182	20 %	40 %	20 %	20 %	161869625
14118	NC_010120	GGC	2	6	653293	653298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869625
14119	NC_010120	GGGC	2	8	653331	653338	0 %	0 %	75 %	25 %	161869625
14120	NC_010120	GCG	2	6	653349	653354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869625
14121	NC_010120	GCC	2	6	653402	653407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869625
14122	NC_010120	CGG	2	6	653433	653438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869625
14123	NC_010120	GGT	2	6	653443	653448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161869625
14124	NC_010120	TTTG	2	8	653455	653462	0 %	75 %	25 %	0 %	161869625
14125	NC_010120	AGG	2	6	653523	653528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161869625
14126	NC_010120	GC	3	6	653537	653542	0 %	0 %	50 %	50 %	161869625
14127	NC_010120	GGC	2	6	653668	653673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869625
14128	NC_010120	AGG	2	6	653679	653684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161869625
14129	NC_010120	AAG	2	6	653714	653719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161869625
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14131	NC_010120	GGC	2	6	653747	653752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14132	NC_010120	CCTT	2	8	653806	653813	0 %	50 %	0 %	50 %	161869627
14133	NC_010120	GCC	2	6	653826	653831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869627
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14156	NC_010120	TTCGGT	2	12	655221	655232	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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14158	NC_010120	A	6	6	655437	655442	100 %	0 %	0 %	0 %	161869628
14159	NC_010120	CCG	2	6	655454	655459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869628
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14161	NC_010120	ATGG	2	8	655650	655657	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14162	NC_010120	A	6	6	655731	655736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14163	NC_010120	TCA	2	6	655929	655934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14200	NC_010120	TTC	2	6	657432	657437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869631
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14225	NC_010120	CGC	2	6	658878	658883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14226	NC_010120	TGC	2	6	658897	658902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14227	NC_010120	CGT	2	6	658916	658921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14228	NC_010120	TGAC	2	8	658945	658952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14229	NC_010120	CGC	2	6	658964	658969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14230	NC_010120	TCT	2	6	658978	658983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14231	NC_010120	GGT	2	6	659026	659031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14232	NC_010120	T	6	6	659031	659036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14233	NC_010120	TTG	2	6	659044	659049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14234	NC_010120	CGA	2	6	659129	659134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869632
14235	NC_010120	AGGAA	2	10	659221	659230	60 %	0 %	40 %	0 %	161869632
14236	NC_010120	A	6	6	659229	659234	100 %	0 %	0 %	0 %	161869632
14237	NC_010120	CAAT	2	8	659282	659289	50 %	25 %	0 %	25 %	161869632
14238	NC_010120	CCG	2	6	659305	659310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869633
14239	NC_010120	GCC	2	6	659312	659317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869633
14240	NC_010120	GT	3	6	659362	659367	0 %	50 %	50 %	0 %	161869633
14241	NC_010120	GCC	2	6	659374	659379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869633
14242	NC_010120	TTC	2	6	659381	659386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869633
14243	NC_010120	AAGC	2	8	659410	659417	50 %	0 %	25 %	25 %	161869633
14244	NC_010120	CAG	2	6	659423	659428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869633
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14246	NC_010120	CGC	2	6	659464	659469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869633
14247	NC_010120	ACCG	2	8	659495	659502	25 %	0 %	25 %	50 %	161869633
14248	NC_010120	CAG	2	6	659519	659524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869633
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14251	NC_010120	ACC	2	6	659667	659672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161869633
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14254	NC_010120	CGC	2	6	659704	659709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869633
14255	NC_010120	GGC	2	6	659732	659737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869633
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14349	NC_010120	A	7	7	663780	663786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14350	NC_010120	CAGG	2	8	663804	663811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14351	NC_010120	CTGC	2	8	663959	663966	0 %	25 %	25 %	50 %	161869639
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14360	NC_010120	GCA	2	6	664259	664264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869639
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14362	NC_010120	GCG	2	6	664316	664321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869639
14363	NC_010120	TGT	2	6	664328	664333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869639
14364	NC_010120	CGA	2	6	664346	664351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869639
14365	NC_010120	CGC	2	6	664515	664520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869639
14366	NC_010120	CAT	2	6	664547	664552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161869639
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14368	NC_010120	GTC	2	6	664763	664768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14469	NC_010120	TATT	2	8	669853	669860	25 %	75 %	0 %	0 %	161869642
14470	NC_010120	GTAAC	2	10	670123	670132	40 %	20 %	20 %	20 %	161869642
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14472	NC_010120	GATT	2	8	670258	670265	25 %	50 %	25 %	0 %	161869642
14473	NC_010120	GTC	2	6	670305	670310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869642
14474	NC_010120	GTG	2	6	670388	670393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161869642
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14480	NC_010120	TAA	2	6	670705	670710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161869642
14481	NC_010120	GTAATA	2	12	670764	670775	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161869642
14482	NC_010120	CAT	2	6	670778	670783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161869642
14483	NC_010120	TCA	3	9	670786	670794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161869642
14484	NC_010120	TGT	2	6	670880	670885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869642
14485	NC_010120	GC	4	8	670896	670903	0 %	0 %	50 %	50 %	161869642
14486	NC_010120	AGTCA	2	10	670932	670941	40 %	20 %	20 %	20 %	161869642
14487	NC_010120	T	6	6	671070	671075	0 %	100 %	0 %	0 %	161869642
14488	NC_010120	TTG	2	6	671088	671093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869642
14489	NC_010120	ACCGT	2	10	671104	671113	20 %	20 %	20 %	40 %	161869642
14490	NC_010120	T	6	6	671223	671228	0 %	100 %	0 %	0 %	161869642
14491	NC_010120	ATT	2	6	671271	671276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161869642
14492	NC_010120	CCGC	2	8	671314	671321	0 %	0 %	25 %	75 %	161869642
14493	NC_010120	GTT	2	6	671385	671390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869642
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14495	NC_010120	ATG	2	6	671463	671468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869642
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14497	NC_010120	T	6	6	671529	671534	0 %	100 %	0 %	0 %	161869642
14498	NC_010120	T	7	7	671560	671566	0 %	100 %	0 %	0 %	161869642
14499	NC_010120	AAT	2	6	671579	671584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161869642
14500	NC_010120	AAT	2	6	671632	671637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161869642

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