MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis 053442 chromosome

Total Repeats: 46026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010120	TGG	2	6	463646	463651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_010120	ATA	2	6	463735	463740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_010120	T	6	6	463755	463760	0 %	100 %	0 %	0 %	161869438
10004	NC_010120	CAG	2	6	463857	463862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869438
10005	NC_010120	GAA	2	6	463919	463924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161869438
10006	NC_010120	GAT	2	6	463983	463988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869438
10007	NC_010120	GC	3	6	463995	464000	0 %	0 %	50 %	50 %	161869438
10008	NC_010120	TTTTC	2	10	464004	464013	0 %	80 %	0 %	20 %	161869438
10009	NC_010120	GAAA	2	8	464030	464037	75 %	0 %	25 %	0 %	161869438
10010	NC_010120	AAT	2	6	464070	464075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161869438
10011	NC_010120	CGTG	2	8	464114	464121	0 %	25 %	50 %	25 %	161869438
10012	NC_010120	TAT	2	6	464141	464146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161869438
10013	NC_010120	CAG	2	6	464191	464196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869438
10014	NC_010120	GAA	2	6	464220	464225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161869438
10015	NC_010120	TA	3	6	464284	464289	50 %	50 %	0 %	0 %	161869438
10016	NC_010120	CGT	2	6	464340	464345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869438
10017	NC_010120	GAA	3	9	464385	464393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161869438
10018	NC_010120	GCA	2	6	464420	464425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869438
10019	NC_010120	GAT	2	6	464457	464462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869438
10020	NC_010120	GCGG	2	8	464463	464470	0 %	0 %	75 %	25 %	161869438
10021	NC_010120	ATT	2	6	464638	464643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161869438
10022	NC_010120	A	7	7	464654	464660	100 %	0 %	0 %	0 %	161869438
10023	NC_010120	AGC	2	6	464754	464759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869438
10024	NC_010120	GCC	2	6	464763	464768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869438
10025	NC_010120	CGA	2	6	464849	464854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869438
10026	NC_010120	CGC	3	9	464874	464882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869438
10027	NC_010120	GAA	2	6	464997	465002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161869438
10028	NC_010120	CGG	2	6	465005	465010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869438
10029	NC_010120	TTC	2	6	465016	465021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869438
10030	NC_010120	GCC	2	6	465066	465071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869438
10031	NC_010120	ATTT	2	8	465074	465081	25 %	75 %	0 %	0 %	161869438
10032	NC_010120	CAG	2	6	465090	465095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869438
10033	NC_010120	GTTG	2	8	465140	465147	0 %	50 %	50 %	0 %	161869438
10034	NC_010120	AGC	2	6	465337	465342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869438
10035	NC_010120	AGG	2	6	465368	465373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161869438
10036	NC_010120	GAC	2	6	465446	465451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869438
10037	NC_010120	T	7	7	465500	465506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_010120	GC	3	6	465566	465571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10039	NC_010120	AGCAC	2	10	465638	465647	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10040	NC_010120	CAGG	2	8	465694	465701	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10041	NC_010120	ACC	2	6	465757	465762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10042	NC_010120	TGCC	2	8	465806	465813	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10043	NC_010120	ACC	2	6	465826	465831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10044	NC_010120	CAG	2	6	465853	465858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_010120	AAC	2	6	465979	465984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_010120	CAA	3	9	465990	465998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_010120	GGT	2	6	466084	466089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_010120	CGG	3	9	466137	466145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_010120	AGC	2	6	466251	466256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_010120	GCG	2	6	466382	466387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_010120	AGGCGT	2	12	466494	466505	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10052	NC_010120	ATTG	2	8	466539	466546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_010120	CCA	2	6	466586	466591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10054	NC_010120	TC	3	6	466623	466628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10055	NC_010120	ACC	2	6	466636	466641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_010120	GCA	2	6	466651	466656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_010120	GGC	2	6	466675	466680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_010120	AG	3	6	466686	466691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_010120	GGA	2	6	466719	466724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_010120	AAC	2	6	466756	466761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_010120	CTG	2	6	466772	466777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_010120	GCCG	2	8	466792	466799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10063	NC_010120	AAAGC	2	10	466814	466823	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10064	NC_010120	CGG	2	6	466863	466868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_010120	TAC	2	6	466872	466877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_010120	ATG	2	6	466883	466888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_010120	CTA	2	6	466889	466894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_010120	CCA	2	6	466922	466927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10069	NC_010120	TAT	2	6	466959	466964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_010120	TGC	2	6	467007	467012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_010120	CA	3	6	467036	467041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10072	NC_010120	CTTT	2	8	467059	467066	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10073	NC_010120	AAC	2	6	467101	467106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_010120	GGT	2	6	467130	467135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_010120	TGA	2	6	467145	467150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_010120	ACA	2	6	467273	467278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_010120	TCA	2	6	467285	467290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_010120	GCA	2	6	467291	467296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_010120	CAGG	2	8	467335	467342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10080	NC_010120	GCA	2	6	467464	467469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_010120	ATT	2	6	467482	467487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_010120	CTG	2	6	467501	467506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_010120	TCT	2	6	467529	467534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_010120	CGG	2	6	467712	467717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10086	NC_010120	TGG	2	6	467750	467755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_010120	TAA	2	6	467820	467825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_010120	CGT	2	6	467908	467913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_010120	GGC	2	6	468003	468008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_010120	CAG	2	6	468030	468035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_010120	TAC	2	6	468057	468062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_010120	CAT	2	6	468102	468107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_010120	ATG	2	6	468184	468189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10095	NC_010120	GCA	2	6	468391	468396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_010120	CA	3	6	468510	468515	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10097	NC_010120	TGC	2	6	468678	468683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_010120	TGA	2	6	468684	468689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_010120	ACA	2	6	468747	468752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_010120	GGT	2	6	468841	468846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_010120	TGC	2	6	468870	468875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_010120	AAG	2	6	468938	468943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_010120	CAG	2	6	469035	469040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_010120	CT	3	6	469075	469080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10105	NC_010120	CAAAAT	2	12	469146	469157	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10106	NC_010120	CGC	2	6	469216	469221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10107	NC_010120	TGG	2	6	469338	469343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_010120	GCA	2	6	469385	469390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_010120	AGA	2	6	469431	469436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_010120	A	6	6	469463	469468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_010120	ACC	3	9	469510	469518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10112	NC_010120	CA	3	6	469602	469607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10113	NC_010120	AGC	3	9	469723	469731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_010120	CAGG	2	8	469753	469760	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10115	NC_010120	CGG	2	6	469833	469838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_010120	ATT	2	6	470029	470034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_010120	AGT	2	6	470095	470100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_010120	CAA	2	6	470114	470119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_010120	GCA	2	6	470128	470133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10122	NC_010120	CAT	2	6	470208	470213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10124	NC_010120	CGG	2	6	470297	470302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_010120	CAG	2	6	470367	470372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10127	NC_010120	CCG	2	6	470456	470461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10128	NC_010120	CGG	2	6	470466	470471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_010120	GCC	2	6	470536	470541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10130	NC_010120	AAC	2	6	470553	470558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10131	NC_010120	CGA	2	6	470565	470570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10251	NC_010120	AAT	2	6	476002	476007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161869443
10252	NC_010120	TTG	2	6	476032	476037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869443
10253	NC_010120	TATG	2	8	476054	476061	25 %	50 %	25 %	0 %	161869443
10254	NC_010120	AGG	2	6	476067	476072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161869443
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10262	NC_010120	TGG	2	6	476409	476414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161869443
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10282	NC_010120	A	6	6	476889	476894	100 %	0 %	0 %	0 %	161869444
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10360	NC_010120	TAAA	2	8	480807	480814	75 %	25 %	0 %	0 %	161869449
10361	NC_010120	ATCAT	2	10	480816	480825	40 %	40 %	0 %	20 %	161869449
10362	NC_010120	A	7	7	480843	480849	100 %	0 %	0 %	0 %	161869449
10363	NC_010120	AGA	2	6	480862	480867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161869449
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10366	NC_010120	T	6	6	481097	481102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10367	NC_010120	GCCT	2	8	481140	481147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10368	NC_010120	GAA	2	6	481161	481166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10370	NC_010120	GGC	2	6	481376	481381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10371	NC_010120	CAG	2	6	481405	481410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10373	NC_010120	T	6	6	481469	481474	0 %	100 %	0 %	0 %	161869450
10374	NC_010120	CAT	2	6	481526	481531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161869450
10375	NC_010120	ACGG	2	8	481576	481583	25 %	0 %	50 %	25 %	161869450
10376	NC_010120	GTTC	2	8	481603	481610	0 %	50 %	25 %	25 %	161869450
10377	NC_010120	TCG	2	6	481707	481712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869450
10378	NC_010120	CTT	2	6	481762	481767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869450
10379	NC_010120	AGC	2	6	481785	481790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869450
10380	NC_010120	CGT	2	6	481804	481809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869450
10381	NC_010120	CG	3	6	481819	481824	0 %	0 %	50 %	50 %	161869450
10382	NC_010120	GAA	2	6	481869	481874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161869450
10383	NC_010120	CGC	2	6	481885	481890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869450
10384	NC_010120	A	6	6	481928	481933	100 %	0 %	0 %	0 %	161869450
10385	NC_010120	CGG	2	6	481939	481944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869450
10386	NC_010120	CAGA	2	8	482018	482025	50 %	0 %	25 %	25 %	161869450
10387	NC_010120	CG	3	6	482058	482063	0 %	0 %	50 %	50 %	161869450
10388	NC_010120	CGC	2	6	482129	482134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869450
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10394	NC_010120	CCA	2	6	482518	482523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161869450
10395	NC_010120	CAG	2	6	482549	482554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869450
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10397	NC_010120	GCC	3	9	482574	482582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10398	NC_010120	TTC	2	6	482594	482599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10399	NC_010120	GCG	2	6	482606	482611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10400	NC_010120	GAC	2	6	482612	482617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10401	NC_010120	AAC	2	6	482785	482790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10402	NC_010120	CTA	2	6	482868	482873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10403	NC_010120	CCCG	2	8	482899	482906	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10404	NC_010120	TCGC	2	8	482912	482919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10405	NC_010120	CCG	2	6	482975	482980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10406	NC_010120	A	6	6	482995	483000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10407	NC_010120	CCG	2	6	483030	483035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10408	NC_010120	CAA	2	6	483234	483239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161869451
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10465	NC_010120	TAAG	2	8	486554	486561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10466	NC_010120	A	6	6	486577	486582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10490	NC_010120	T	6	6	487788	487793	0 %	100 %	0 %	0 %	161869458
10491	NC_010120	GCG	4	12	487891	487902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869458
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10493	NC_010120	GAC	2	6	487969	487974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869458
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10496	NC_010120	GCA	2	6	488096	488101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869458
10497	NC_010120	GATG	2	8	488186	488193	25 %	25 %	50 %	0 %	161869458
10498	NC_010120	TGA	2	6	488252	488257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869458
10499	NC_010120	CGG	2	6	488330	488335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869458
10500	NC_010120	ACG	2	6	488362	488367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869458

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