MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 plasmid 2

Total Repeats: 4135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007960	CGA	2	6	10	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007960	GATC	2	8	16	23	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007960	ATC	2	6	146	151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109491
4	NC_007960	GGC	2	6	161	166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109491
5	NC_007960	CCG	2	6	196	201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109491
6	NC_007960	CGC	2	6	206	211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109491
7	NC_007960	TC	3	6	226	231	0 %	50 %	0 %	50 %	92109491
8	NC_007960	GGC	2	6	232	237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109491
9	NC_007960	CGCCGG	2	12	271	282	0 %	0 %	50 %	50 %	92109491
10	NC_007960	GTC	2	6	437	442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109491
11	NC_007960	GCC	2	6	518	523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109491
12	NC_007960	CGG	2	6	557	562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109491
13	NC_007960	GGC	2	6	581	586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109491
14	NC_007960	GCA	2	6	592	597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109491
15	NC_007960	CGG	3	9	758	766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007960	GTCC	2	8	872	879	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007960	TCA	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007960	CTG	2	6	922	927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007960	GA	3	6	957	962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007960	ATG	2	6	1035	1040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007960	CTG	2	6	1046	1051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007960	GC	3	6	1070	1075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007960	A	6	6	1084	1089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007960	TG	3	6	1143	1148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007960	TGG	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007960	TTGC	2	8	1186	1193	0 %	50 %	25 %	25 %	92109492
27	NC_007960	CAC	2	6	1223	1228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92109492
28	NC_007960	CCG	2	6	1292	1297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109492
29	NC_007960	TGT	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92109492
30	NC_007960	GAC	2	6	1315	1320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109492
31	NC_007960	AGA	2	6	1322	1327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109492
32	NC_007960	CT	3	6	1392	1397	0 %	50 %	0 %	50 %	92109492
33	NC_007960	CGG	2	6	1400	1405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109492
34	NC_007960	GAC	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109492
35	NC_007960	ACG	2	6	1451	1456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109492
36	NC_007960	CCGC	2	8	1476	1483	0 %	0 %	25 %	75 %	92109492
37	NC_007960	GTC	2	6	1526	1531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007960	TGC	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007960	ATGC	2	8	1566	1573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007960	CG	3	6	1634	1639	0 %	0 %	50 %	50 %	92109493
41	NC_007960	GGC	2	6	1647	1652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109493
42	NC_007960	ATG	2	6	1666	1671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109493
43	NC_007960	GGC	2	6	1672	1677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109493
44	NC_007960	GCT	2	6	1687	1692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109493
45	NC_007960	TCG	2	6	1724	1729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109493
46	NC_007960	CAGG	2	8	1741	1748	25 %	0 %	50 %	25 %	92109493
47	NC_007960	TCA	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109493
48	NC_007960	GCC	2	6	1826	1831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109493
49	NC_007960	GGCC	2	8	1932	1939	0 %	0 %	50 %	50 %	92109493
50	NC_007960	TCA	2	6	2003	2008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109493
51	NC_007960	GCA	2	6	2013	2018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109493
52	NC_007960	CGT	2	6	2030	2035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109494
53	NC_007960	CGC	2	6	2051	2056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109494
54	NC_007960	CGG	3	9	2065	2073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109494
55	NC_007960	TCG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109494
56	NC_007960	GCG	2	6	2142	2147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109494
57	NC_007960	CTA	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109494
58	NC_007960	ACG	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109494
59	NC_007960	GTCG	2	8	2306	2313	0 %	25 %	50 %	25 %	92109494
60	NC_007960	TAC	2	6	2340	2345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109494
61	NC_007960	GAA	2	6	2384	2389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109494
62	NC_007960	CGA	2	6	2438	2443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109494
63	NC_007960	GGTC	2	8	2446	2453	0 %	25 %	50 %	25 %	92109494
64	NC_007960	GCA	2	6	2502	2507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109494
65	NC_007960	CGA	2	6	2555	2560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109494
66	NC_007960	GCG	2	6	2561	2566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109494
67	NC_007960	ACG	2	6	2622	2627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109494
68	NC_007960	CGT	2	6	2636	2641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109494
69	NC_007960	CCG	3	9	2686	2694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109494
70	NC_007960	ACG	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109494
71	NC_007960	GAC	2	6	2723	2728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109494
72	NC_007960	TGA	2	6	2770	2775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109494
73	NC_007960	GCC	2	6	2793	2798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109494
74	NC_007960	ATCG	2	8	2834	2841	25 %	25 %	25 %	25 %	92109494
75	NC_007960	CG	3	6	2854	2859	0 %	0 %	50 %	50 %	92109494
76	NC_007960	GCG	2	6	2911	2916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109494
77	NC_007960	CGT	2	6	2942	2947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109494
78	NC_007960	CGGG	2	8	3032	3039	0 %	0 %	75 %	25 %	92109494
79	NC_007960	CTG	2	6	3135	3140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109494
80	NC_007960	ATGT	2	8	3147	3154	25 %	50 %	25 %	0 %	92109494
81	NC_007960	CG	3	6	3274	3279	0 %	0 %	50 %	50 %	92109494
82	NC_007960	CTT	2	6	3365	3370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92109494
83	NC_007960	GGC	2	6	3395	3400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109494
84	NC_007960	CGCC	2	8	3439	3446	0 %	0 %	25 %	75 %	92109495
85	NC_007960	CTG	3	9	3470	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109495
86	NC_007960	TTC	2	6	3482	3487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92109495
87	NC_007960	CGC	2	6	3499	3504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109495
88	NC_007960	TC	3	6	3556	3561	0 %	50 %	0 %	50 %	92109495
89	NC_007960	GAC	2	6	3640	3645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109495
90	NC_007960	GTC	2	6	3674	3679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109495
91	NC_007960	TTC	2	6	3692	3697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92109495
92	NC_007960	GC	3	6	3749	3754	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
93	NC_007960	CG	3	6	3756	3761	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
94	NC_007960	GCCG	2	8	3796	3803	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
95	NC_007960	CGG	2	6	3967	3972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109495
96	NC_007960	AGA	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109495
97	NC_007960	CGG	2	6	4078	4083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109495
98	NC_007960	GCA	2	6	4158	4163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109495
99	NC_007960	CAA	2	6	4177	4182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92109495
100	NC_007960	CTG	2	6	4196	4201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109495
101	NC_007960	TGC	2	6	4290	4295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109495
102	NC_007960	CAG	2	6	4360	4365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109495
103	NC_007960	ATC	2	6	4415	4420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109495
104	NC_007960	AC	3	6	4441	4446	50 %	0 %	0 %	50 %	92109495
105	NC_007960	GCT	2	6	4447	4452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109495
106	NC_007960	GGT	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92109495
107	NC_007960	CAT	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109495
108	NC_007960	CTG	2	6	4493	4498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109495
109	NC_007960	TGG	2	6	4515	4520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92109495
110	NC_007960	TGC	2	6	4530	4535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109495
111	NC_007960	CTG	2	6	4571	4576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109495
112	NC_007960	GGCTC	2	10	4578	4587	0 %	20 %	40 %	40 %	92109495
113	NC_007960	CGG	2	6	4603	4608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109495
114	NC_007960	ATCGCG	2	12	4610	4621	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	92109495
115	NC_007960	CGC	2	6	4639	4644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109495
116	NC_007960	GGTC	2	8	4735	4742	0 %	25 %	50 %	25 %	92109495
117	NC_007960	TTC	2	6	4751	4756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92109495
118	NC_007960	CTG	2	6	4760	4765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109495
119	NC_007960	ATC	2	6	4766	4771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109495
120	NC_007960	AGG	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109495
121	NC_007960	GGC	3	9	4858	4866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109495
122	NC_007960	TGT	2	6	4872	4877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92109495
123	NC_007960	TGA	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109495
124	NC_007960	GC	3	6	4999	5004	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
125	NC_007960	GC	3	6	5060	5065	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
126	NC_007960	GCT	2	6	5107	5112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109495
127	NC_007960	CGA	2	6	5121	5126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109495
128	NC_007960	CTG	2	6	5162	5167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109495
129	NC_007960	CAGGA	2	10	5174	5183	40 %	0 %	40 %	20 %	92109495
130	NC_007960	CAT	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109495
131	NC_007960	CCG	2	6	5337	5342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109495
132	NC_007960	GC	3	6	5402	5407	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
133	NC_007960	TCG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109495
134	NC_007960	CGG	2	6	5557	5562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109495
135	NC_007960	GC	3	6	5600	5605	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
136	NC_007960	CAT	2	6	5611	5616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109495
137	NC_007960	GCC	2	6	5685	5690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109495
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139	NC_007960	CAAT	2	8	5741	5748	50 %	25 %	0 %	25 %	92109495
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267	NC_007960	GAG	2	6	11329	11334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109500
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271	NC_007960	GATA	2	8	11526	11533	50 %	25 %	25 %	0 %	92109500
272	NC_007960	AGGC	2	8	11564	11571	25 %	0 %	50 %	25 %	92109500
273	NC_007960	TGA	2	6	11717	11722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109500
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311	NC_007960	TGC	2	6	13504	13509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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350	NC_007960	CGA	2	6	15325	15330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109503
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353	NC_007960	TCG	2	6	15456	15461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109503
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383	NC_007960	TCG	2	6	16873	16878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
384	NC_007960	CGT	2	6	16990	16995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
385	NC_007960	TGG	2	6	17023	17028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92109504
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388	NC_007960	CGA	2	6	17181	17186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109504
389	NC_007960	CGAA	2	8	17233	17240	50 %	0 %	25 %	25 %	92109504
390	NC_007960	CTC	2	6	17260	17265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92109504
391	NC_007960	CAG	2	6	17296	17301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109504
392	NC_007960	TGGG	2	8	17379	17386	0 %	25 %	75 %	0 %	92109504
393	NC_007960	ACC	2	6	17389	17394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92109504
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396	NC_007960	TCC	2	6	17564	17569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92109504
397	NC_007960	AAC	2	6	17585	17590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92109504
398	NC_007960	TTG	2	6	17663	17668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92109504
399	NC_007960	GCC	2	6	17848	17853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109504
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401	NC_007960	CG	3	6	18026	18031	0 %	0 %	50 %	50 %	92109504
402	NC_007960	CGC	2	6	18101	18106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109504
403	NC_007960	ATG	2	6	18165	18170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109505
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480	NC_007960	GTCC	2	8	21646	21653	0 %	25 %	25 %	50 %	92109506
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484	NC_007960	AGGA	2	8	21920	21927	50 %	0 %	50 %	0 %	92109506
485	NC_007960	CGT	2	6	21936	21941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109506
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487	NC_007960	ATGC	2	8	22062	22069	25 %	25 %	25 %	25 %	92109506
488	NC_007960	CGT	2	6	22116	22121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109506
489	NC_007960	TGA	2	6	22140	22145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109506
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491	NC_007960	CGG	2	6	22196	22201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
492	NC_007960	GC	3	6	22246	22251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
493	NC_007960	GAG	2	6	22415	22420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109507
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496	NC_007960	CCG	2	6	22680	22685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109507
497	NC_007960	CGG	2	6	22744	22749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109507
498	NC_007960	GC	3	6	22809	22814	0 %	0 %	50 %	50 %	92109507
499	NC_007960	GCG	2	6	22931	22936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109507
500	NC_007960	ACG	2	6	22949	22954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109507

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