MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 chromosome

Total Repeats: 67890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007484	GAT	2	6	200705	200710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163718
4002	NC_007484	G	6	6	200767	200772	0 %	0 %	100 %	0 %	77163718
4003	NC_007484	GTT	2	6	200867	200872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163718
4004	NC_007484	AGAGCG	2	12	200887	200898	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	77163718
4005	NC_007484	GCA	2	6	200967	200972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163718
4006	NC_007484	GGT	2	6	200992	200997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163718
4007	NC_007484	GC	3	6	201049	201054	0 %	0 %	50 %	50 %	77163718
4008	NC_007484	AG	3	6	201068	201073	50 %	0 %	50 %	0 %	77163718
4009	NC_007484	GAT	2	6	201080	201085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163718
4010	NC_007484	ATCG	2	8	201137	201144	25 %	25 %	25 %	25 %	77163718
4011	NC_007484	AGA	3	9	201187	201195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163718
4012	NC_007484	GCT	2	6	201236	201241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163718
4013	NC_007484	GAA	2	6	201290	201295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163718
4014	NC_007484	T	6	6	201311	201316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_007484	TTG	2	6	201351	201356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163719
4016	NC_007484	GTT	2	6	201379	201384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163719
4017	NC_007484	GCT	2	6	201433	201438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163719
4018	NC_007484	TGC	2	6	201471	201476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163719
4019	NC_007484	TGA	2	6	201483	201488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163719
4020	NC_007484	GA	3	6	201646	201651	50 %	0 %	50 %	0 %	77163719
4021	NC_007484	GCT	2	6	201689	201694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_007484	TCT	2	6	201827	201832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163720
4023	NC_007484	AGGGG	2	10	201856	201865	20 %	0 %	80 %	0 %	77163720
4024	NC_007484	A	6	6	201888	201893	100 %	0 %	0 %	0 %	77163720
4025	NC_007484	GGT	2	6	202003	202008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163720
4026	NC_007484	AGT	2	6	202009	202014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163720
4027	NC_007484	CT	3	6	202040	202045	0 %	50 %	0 %	50 %	77163720
4028	NC_007484	GCT	2	6	202106	202111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163720
4029	NC_007484	TTG	2	6	202131	202136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163720
4030	NC_007484	AGT	2	6	202150	202155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163720
4031	NC_007484	AGC	2	6	202156	202161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163720
4032	NC_007484	CAG	2	6	202194	202199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_007484	TAAA	2	8	202206	202213	75 %	25 %	0 %	0 %	77163721
4034	NC_007484	CTT	2	6	202230	202235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163721
4035	NC_007484	GCG	2	6	202246	202251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163721
4036	NC_007484	GAC	2	6	202369	202374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163721
4037	NC_007484	ATC	2	6	202429	202434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163721
4038	NC_007484	TCA	2	6	202469	202474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163721
4039	NC_007484	CAAG	2	8	202485	202492	50 %	0 %	25 %	25 %	77163721
4040	NC_007484	TTC	2	6	202567	202572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163721
4041	NC_007484	CTG	2	6	202588	202593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163721
4042	NC_007484	TTC	2	6	202600	202605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163721
4043	NC_007484	CCA	2	6	202744	202749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163721
4044	NC_007484	GAG	2	6	202840	202845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163721
4045	NC_007484	CAG	2	6	202923	202928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163721
4046	NC_007484	T	6	6	202936	202941	0 %	100 %	0 %	0 %	77163721
4047	NC_007484	GC	3	6	202948	202953	0 %	0 %	50 %	50 %	77163721
4048	NC_007484	GGCT	2	8	203045	203052	0 %	25 %	50 %	25 %	77163721
4049	NC_007484	TTC	2	6	203092	203097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163721
4050	NC_007484	TCC	2	6	203143	203148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163721
4051	NC_007484	CTTA	2	8	203149	203156	25 %	50 %	0 %	25 %	77163721
4052	NC_007484	AG	3	6	203232	203237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_007484	T	6	6	203285	203290	0 %	100 %	0 %	0 %	77163722
4054	NC_007484	CAT	2	6	203403	203408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163722
4055	NC_007484	A	6	6	203415	203420	100 %	0 %	0 %	0 %	77163722
4056	NC_007484	TAC	2	6	203569	203574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163722
4057	NC_007484	CT	3	6	203589	203594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4058	NC_007484	GTT	2	6	203661	203666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_007484	TTA	2	6	203737	203742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_007484	ATG	2	6	203755	203760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_007484	GAG	2	6	203785	203790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_007484	GAA	2	6	203797	203802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_007484	T	6	6	203803	203808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_007484	T	7	7	203810	203816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_007484	TTG	2	6	203824	203829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_007484	TGA	2	6	203938	203943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_007484	TTG	2	6	204104	204109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163723
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4069	NC_007484	AGC	2	6	204234	204239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163723
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4071	NC_007484	AGC	2	6	204392	204397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163723
4072	NC_007484	GC	3	6	204442	204447	0 %	0 %	50 %	50 %	77163723
4073	NC_007484	GAA	2	6	204495	204500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163723
4074	NC_007484	CAG	2	6	204542	204547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163723
4075	NC_007484	GAG	2	6	204593	204598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163723
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4077	NC_007484	TCCAG	2	10	204744	204753	20 %	20 %	20 %	40 %	77163723
4078	NC_007484	CAG	2	6	204968	204973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163723
4079	NC_007484	CAG	2	6	205046	205051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163723
4080	NC_007484	TTGC	2	8	205052	205059	0 %	50 %	25 %	25 %	77163723
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4084	NC_007484	TAAAT	2	10	205141	205150	60 %	40 %	0 %	0 %	77163723
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4088	NC_007484	GA	3	6	205545	205550	50 %	0 %	50 %	0 %	77163724
4089	NC_007484	TGG	2	6	205634	205639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163724
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4092	NC_007484	GCC	2	6	205776	205781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163725
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4094	NC_007484	GAA	2	6	205826	205831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163725
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4097	NC_007484	GGT	2	6	205913	205918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163725
4098	NC_007484	GGC	2	6	205996	206001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163725
4099	NC_007484	TAT	2	6	206121	206126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163725
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4104	NC_007484	ATT	2	6	206279	206284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163725
4105	NC_007484	GAC	2	6	206301	206306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163725
4106	NC_007484	CCG	2	6	206371	206376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_007484	TTAA	2	8	206403	206410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_007484	T	6	6	206420	206425	0 %	100 %	0 %	0 %	77163726
4109	NC_007484	CTA	2	6	206530	206535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163726
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4112	NC_007484	GGCA	2	8	206606	206613	25 %	0 %	50 %	25 %	77163726
4113	NC_007484	TC	3	6	206663	206668	0 %	50 %	0 %	50 %	77163726
4114	NC_007484	TGCG	2	8	206740	206747	0 %	25 %	50 %	25 %	77163726
4115	NC_007484	ACG	2	6	206791	206796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163726
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4122	NC_007484	AG	3	6	206910	206915	50 %	0 %	50 %	0 %	77163726
4123	NC_007484	ATT	2	6	206977	206982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163726
4124	NC_007484	CATC	2	8	206996	207003	25 %	25 %	0 %	50 %	77163726
4125	NC_007484	T	6	6	207005	207010	0 %	100 %	0 %	0 %	77163726
4126	NC_007484	TGA	2	6	207056	207061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163726
4127	NC_007484	GAG	2	6	207150	207155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163726
4128	NC_007484	TTA	2	6	207165	207170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163726
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4130	NC_007484	TGG	2	6	207240	207245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163727
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4142	NC_007484	ATT	2	6	207913	207918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163727
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4144	NC_007484	ATC	2	6	208088	208093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4146	NC_007484	T	6	6	208202	208207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_007484	CTT	2	6	208208	208213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4148	NC_007484	GTA	2	6	208265	208270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163728
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4152	NC_007484	TATT	2	8	208431	208438	25 %	75 %	0 %	0 %	77163728
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4161	NC_007484	GCT	2	6	208805	208810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163728
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4166	NC_007484	TGG	2	6	209170	209175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163728
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4215	NC_007484	TCC	2	6	211832	211837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4216	NC_007484	CAC	2	6	211946	211951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4221	NC_007484	TA	3	6	212078	212083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4222	NC_007484	ATAAAA	2	12	212094	212105	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4252	NC_007484	CTG	2	6	213404	213409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163732
4253	NC_007484	CAGGC	2	10	213428	213437	20 %	0 %	40 %	40 %	77163732
4254	NC_007484	AACA	2	8	213695	213702	75 %	0 %	0 %	25 %	77163732
4255	NC_007484	AGCC	2	8	213719	213726	25 %	0 %	25 %	50 %	77163732
4256	NC_007484	GCCG	2	8	213769	213776	0 %	0 %	50 %	50 %	77163732
4257	NC_007484	TGA	2	6	213826	213831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163732
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4381	NC_007484	T	6	6	219875	219880	0 %	100 %	0 %	0 %	77163737
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4487	NC_007484	AGC	2	6	225854	225859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163740
4488	NC_007484	GTAAG	2	10	225876	225885	40 %	20 %	40 %	0 %	77163740
4489	NC_007484	TGC	2	6	225917	225922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163740
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4492	NC_007484	GCTC	2	8	226061	226068	0 %	25 %	25 %	50 %	77163740
4493	NC_007484	GA	3	6	226110	226115	50 %	0 %	50 %	0 %	77163740
4494	NC_007484	TCC	2	6	226156	226161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163740
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4497	NC_007484	AGC	2	6	226580	226585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4498	NC_007484	TGA	2	6	226728	226733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_007484	T	6	6	226738	226743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_007484	T	8	8	226834	226841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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