MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF2

Total Repeats: 2334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_006363	GCA	2	6	74890	74895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027890
2002	NC_006363	CCA	2	6	74899	74904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027890
2003	NC_006363	TCG	2	6	74919	74924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027890
2004	NC_006363	GCG	3	9	74942	74950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027890
2005	NC_006363	TCCC	2	8	74979	74986	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2006	NC_006363	ATG	2	6	75030	75035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_006363	ACC	2	6	75042	75047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2008	NC_006363	GC	3	6	75093	75098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2009	NC_006363	CA	3	6	75103	75108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2010	NC_006363	TGG	2	6	75190	75195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_006363	GCA	2	6	75219	75224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2012	NC_006363	GC	3	6	75233	75238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2013	NC_006363	TGC	2	6	75242	75247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_006363	AGA	2	6	75262	75267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027891
2015	NC_006363	AGC	2	6	75273	75278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027891
2016	NC_006363	CAC	2	6	75306	75311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027891
2017	NC_006363	TCGCGT	2	12	75378	75389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027891
2018	NC_006363	CGG	2	6	75410	75415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027891
2019	NC_006363	GGT	2	6	75422	75427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027891
2020	NC_006363	GCG	2	6	75430	75435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027891
2021	NC_006363	GGT	2	6	75457	75462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027891
2022	NC_006363	CGG	3	9	75500	75508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027891
2023	NC_006363	GTA	2	6	75509	75514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027891
2024	NC_006363	CT	3	6	75533	75538	0 %	50 %	0 %	50 %	54027891
2025	NC_006363	CGGGGT	2	12	75542	75553	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	54027891
2026	NC_006363	CGG	2	6	75592	75597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027891
2027	NC_006363	GCC	3	9	75643	75651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027891
2028	NC_006363	CGA	2	6	75721	75726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2029	NC_006363	AGC	2	6	75780	75785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027892
2030	NC_006363	CGG	2	6	75823	75828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027892
2031	NC_006363	GGC	2	6	75857	75862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027892
2032	NC_006363	GCT	2	6	75873	75878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027892
2033	NC_006363	GCT	2	6	75880	75885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027892
2034	NC_006363	CGAC	2	8	75928	75935	25 %	0 %	25 %	50 %	54027892
2035	NC_006363	AGC	2	6	75945	75950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027892
2036	NC_006363	GCG	2	6	75962	75967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027892
2037	NC_006363	CGC	2	6	76039	76044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027892
2038	NC_006363	TGG	2	6	76116	76121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027893
2039	NC_006363	GGC	2	6	76136	76141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027893
2040	NC_006363	CGG	2	6	76197	76202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027893
2041	NC_006363	AGC	2	6	76223	76228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027893
2042	NC_006363	CGG	2	6	76257	76262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027893
2043	NC_006363	GCG	2	6	76274	76279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027893
2044	NC_006363	GGC	2	6	76338	76343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027893
2045	NC_006363	GCA	2	6	76344	76349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027893
2046	NC_006363	CG	3	6	76419	76424	0 %	0 %	50 %	50 %	54027893
2047	NC_006363	GC	3	6	76522	76527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2048	NC_006363	TCGC	2	8	76546	76553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2049	NC_006363	CTA	3	9	76560	76568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2050	NC_006363	ACC	2	6	76620	76625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2051	NC_006363	CCA	2	6	76632	76637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2052	NC_006363	GCG	2	6	76645	76650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_006363	CCG	2	6	76730	76735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2054	NC_006363	GCG	2	6	76794	76799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027894
2055	NC_006363	CGC	3	9	76826	76834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027894
2056	NC_006363	GTG	2	6	76837	76842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027894
2057	NC_006363	ACT	2	6	76848	76853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027894
2058	NC_006363	GCGCC	2	10	76858	76867	0 %	0 %	40 %	60 %	54027894
2059	NC_006363	GCGAAC	2	12	76902	76913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027894
2060	NC_006363	GTG	2	6	76916	76921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027894
2061	NC_006363	CCGG	2	8	76924	76931	0 %	0 %	50 %	50 %	54027894
2062	NC_006363	AGC	2	6	76947	76952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027894
2063	NC_006363	CG	3	6	76957	76962	0 %	0 %	50 %	50 %	54027894
2064	NC_006363	GAT	2	6	76970	76975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027894
2065	NC_006363	AGC	2	6	76989	76994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027894
2066	NC_006363	TGC	2	6	76995	77000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027894
2067	NC_006363	GC	3	6	76999	77004	0 %	0 %	50 %	50 %	54027894
2068	NC_006363	GCC	2	6	77042	77047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027894
2069	NC_006363	GCA	2	6	77050	77055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027894
2070	NC_006363	GCT	2	6	77068	77073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027894
2071	NC_006363	GGCA	2	8	77082	77089	25 %	0 %	50 %	25 %	54027894
2072	NC_006363	CACC	2	8	77123	77130	25 %	0 %	0 %	75 %	54027894
2073	NC_006363	CGC	2	6	77149	77154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027894
2074	NC_006363	GC	3	6	77161	77166	0 %	0 %	50 %	50 %	54027894
2075	NC_006363	CTCG	2	8	77193	77200	0 %	25 %	25 %	50 %	54027894
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2082	NC_006363	GTTGG	2	10	77526	77535	0 %	40 %	60 %	0 %	54027895
2083	NC_006363	CGA	2	6	77582	77587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027895
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2085	NC_006363	CGGC	2	8	77711	77718	0 %	0 %	50 %	50 %	54027895
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2090	NC_006363	CGA	2	6	77897	77902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027895
2091	NC_006363	ACCG	2	8	77948	77955	25 %	0 %	25 %	50 %	54027895
2092	NC_006363	AGC	2	6	77968	77973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027895
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2097	NC_006363	GTT	2	6	78287	78292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027895
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2099	NC_006363	GGGC	2	8	78310	78317	0 %	0 %	75 %	25 %	54027895
2100	NC_006363	TCG	2	6	78350	78355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027895
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2103	NC_006363	ACT	2	6	78427	78432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027895
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2105	NC_006363	ACCGG	2	10	78448	78457	20 %	0 %	40 %	40 %	54027895
2106	NC_006363	CAC	2	6	78503	78508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027895
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2110	NC_006363	CGG	2	6	78735	78740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027896
2111	NC_006363	TGC	2	6	78741	78746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027896
2112	NC_006363	GGA	2	6	78751	78756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027896
2113	NC_006363	TCA	2	6	78801	78806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027896
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2115	NC_006363	CGG	2	6	78890	78895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027896
2116	NC_006363	TCCC	2	8	78923	78930	0 %	25 %	0 %	75 %	54027896
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2122	NC_006363	CGC	2	6	79119	79124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027897
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2245	NC_006363	CA	3	6	83734	83739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2246	NC_006363	CCG	2	6	83748	83753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2253	NC_006363	CG	3	6	84008	84013	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
2254	NC_006363	CG	5	10	84039	84048	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
2255	NC_006363	CG	5	10	84062	84071	0 %	0 %	50 %	50 %	54027901
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2334	NC_006363	TGG	2	6	86899	86904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.