MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF2

Total Repeats: 2334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006363	TCG	2	6	57166	57171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_006363	GCG	2	6	57172	57177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_006363	CCCG	2	8	57229	57236	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1504	NC_006363	CCGG	2	8	57275	57282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_006363	TGC	2	6	57299	57304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_006363	TGC	3	9	57308	57316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_006363	TGA	2	6	57383	57388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_006363	GCA	2	6	57400	57405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_006363	CGGGG	2	10	57408	57417	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1510	NC_006363	CGG	2	6	57434	57439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_006363	GGT	2	6	57444	57449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_006363	ATG	2	6	57451	57456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_006363	CGC	2	6	57459	57464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_006363	GCG	2	6	57481	57486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_006363	TTG	2	6	57511	57516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_006363	CCA	2	6	57554	57559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_006363	GCG	2	6	57634	57639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027867
1518	NC_006363	CGG	2	6	57691	57696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027867
1519	NC_006363	ACG	2	6	57725	57730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027867
1520	NC_006363	GCT	2	6	57780	57785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027867
1521	NC_006363	CGG	2	6	57827	57832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027867
1522	NC_006363	GCG	2	6	57855	57860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027867
1523	NC_006363	CGC	2	6	57870	57875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027867
1524	NC_006363	CAA	2	6	57924	57929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027867
1525	NC_006363	CCG	2	6	57951	57956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027867
1526	NC_006363	GC	3	6	57987	57992	0 %	0 %	50 %	50 %	54027867
1527	NC_006363	GGC	2	6	58083	58088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027867
1528	NC_006363	GCG	2	6	58098	58103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027867
1529	NC_006363	GCG	2	6	58110	58115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027867
1530	NC_006363	CGA	3	9	58119	58127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027867
1531	NC_006363	CTT	2	6	58170	58175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027867
1532	NC_006363	TGCGCG	2	12	58241	58252	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	54027867
1533	NC_006363	GA	3	6	58280	58285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_006363	CGG	2	6	58304	58309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_006363	TG	3	6	58351	58356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_006363	CG	3	6	58435	58440	0 %	0 %	50 %	50 %	54027868
1537	NC_006363	CGA	2	6	58477	58482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027868
1538	NC_006363	GGT	2	6	58492	58497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027868
1539	NC_006363	CGA	2	6	58537	58542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027868
1540	NC_006363	CTG	2	6	58553	58558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027868
1541	NC_006363	CGG	2	6	58570	58575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027868
1542	NC_006363	CGA	2	6	58579	58584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027868
1543	NC_006363	CCGC	2	8	58593	58600	0 %	0 %	25 %	75 %	54027868
1544	NC_006363	CCG	2	6	58708	58713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027868
1545	NC_006363	ACC	2	6	58749	58754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027868
1546	NC_006363	TCC	2	6	58769	58774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027869
1547	NC_006363	CCG	2	6	58829	58834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027869
1548	NC_006363	CCG	2	6	58860	58865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027869
1549	NC_006363	GGCCG	2	10	58882	58891	0 %	0 %	60 %	40 %	54027869
1550	NC_006363	CACC	2	8	58913	58920	25 %	0 %	0 %	75 %	54027869
1551	NC_006363	CTG	2	6	58921	58926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027869
1552	NC_006363	GCC	2	6	58979	58984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027869
1553	NC_006363	GGC	2	6	59003	59008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027869
1554	NC_006363	CGC	2	6	59028	59033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027869
1555	NC_006363	GC	3	6	59037	59042	0 %	0 %	50 %	50 %	54027869
1556	NC_006363	GAC	2	6	59083	59088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027869
1557	NC_006363	TGC	2	6	59101	59106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027869
1558	NC_006363	CGC	2	6	59115	59120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027869
1559	NC_006363	GC	3	6	59151	59156	0 %	0 %	50 %	50 %	54027869
1560	NC_006363	CGC	3	9	59154	59162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027869
1561	NC_006363	GCC	2	6	59263	59268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027869
1562	NC_006363	AGC	2	6	59288	59293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027869
1563	NC_006363	GCC	2	6	59300	59305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027869
1564	NC_006363	ACG	2	6	59309	59314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027869
1565	NC_006363	CGG	2	6	59351	59356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027869
1566	NC_006363	CGC	2	6	59381	59386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027869
1567	NC_006363	TGG	2	6	59403	59408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027869
1568	NC_006363	CCG	2	6	59486	59491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027869
1569	NC_006363	CCG	2	6	59501	59506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027869
1570	NC_006363	CGG	2	6	59529	59534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027869
1571	NC_006363	CCG	2	6	59543	59548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027869
1572	NC_006363	CCA	2	6	59555	59560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027869
1573	NC_006363	GTC	2	6	59563	59568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027869
1574	NC_006363	TCG	2	6	59570	59575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027869
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1577	NC_006363	CTG	2	6	59610	59615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027869
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1579	NC_006363	ACCG	2	8	59635	59642	25 %	0 %	25 %	50 %	54027869
1580	NC_006363	ACCC	2	8	59668	59675	25 %	0 %	0 %	75 %	54027869
1581	NC_006363	CGG	2	6	59682	59687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027869
1582	NC_006363	TCG	2	6	59693	59698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027869
1583	NC_006363	CAC	2	6	59713	59718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027869
1584	NC_006363	CAC	2	6	59724	59729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027869
1585	NC_006363	CTG	2	6	59743	59748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027869
1586	NC_006363	CGA	2	6	59819	59824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027870
1587	NC_006363	CTCCG	2	10	59825	59834	0 %	20 %	20 %	60 %	54027870
1588	NC_006363	TGT	2	6	59889	59894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027870
1589	NC_006363	CGC	2	6	59914	59919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027870
1590	NC_006363	CTCGA	2	10	59933	59942	20 %	20 %	20 %	40 %	54027870
1591	NC_006363	CGC	2	6	59960	59965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027870
1592	NC_006363	ACC	2	6	59990	59995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027870
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1594	NC_006363	GGC	2	6	60076	60081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027870
1595	NC_006363	CGCC	2	8	60097	60104	0 %	0 %	25 %	75 %	54027870
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1597	NC_006363	GTG	2	6	60130	60135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027870
1598	NC_006363	CGG	2	6	60159	60164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027870
1599	NC_006363	CCG	2	6	60191	60196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027870
1600	NC_006363	TCA	2	6	60240	60245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027870
1601	NC_006363	CGC	2	6	60248	60253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027870
1602	NC_006363	TGC	2	6	60362	60367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027870
1603	NC_006363	CGC	3	9	60401	60409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027870
1604	NC_006363	CCAC	2	8	60414	60421	25 %	0 %	0 %	75 %	54027870
1605	NC_006363	CACC	2	8	60517	60524	25 %	0 %	0 %	75 %	54027870
1606	NC_006363	GCC	3	9	60545	60553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027870
1607	NC_006363	GCC	2	6	60623	60628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027870
1608	NC_006363	CGA	2	6	60633	60638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027870
1609	NC_006363	AGCC	2	8	60709	60716	25 %	0 %	25 %	50 %	54027870
1610	NC_006363	CCT	2	6	60811	60816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027870
1611	NC_006363	GCC	2	6	60844	60849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_006363	AAC	2	6	60850	60855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_006363	CGTC	2	8	60860	60867	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_006363	GTT	2	6	60898	60903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_006363	T	6	6	60902	60907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_006363	CTC	2	6	60954	60959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027871
1617	NC_006363	CCA	2	6	60992	60997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027871
1618	NC_006363	TCC	2	6	61010	61015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027871
1619	NC_006363	CGC	2	6	61020	61025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027871
1620	NC_006363	CTG	2	6	61026	61031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027871
1621	NC_006363	CGA	2	6	61035	61040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027871
1622	NC_006363	GCC	2	6	61049	61054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027871
1623	NC_006363	ACA	2	6	61082	61087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027871
1624	NC_006363	CGC	2	6	61090	61095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027871
1625	NC_006363	CCG	2	6	61140	61145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027871
1626	NC_006363	CACC	2	8	61175	61182	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1627	NC_006363	ACA	2	6	61232	61237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_006363	TCCT	2	8	61245	61252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_006363	GGAA	2	8	61258	61265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_006363	GGTC	2	8	61304	61311	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_006363	CGG	2	6	61316	61321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_006363	TCA	2	6	61341	61346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_006363	TGCGG	2	10	61353	61362	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1634	NC_006363	GC	3	6	61393	61398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_006363	GCA	2	6	61444	61449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1637	NC_006363	CG	3	6	61513	61518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1640	NC_006363	TGG	2	6	61589	61594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027872
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1999	NC_006363	CGG	2	6	74801	74806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027890
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