MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 6840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021883	TAAA	2	8	30	37	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021883	AAAT	2	8	41	48	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021883	A	6	6	54	59	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021883	T	6	6	103	108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021883	TAA	2	6	274	279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021883	TA	3	6	299	304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021883	TATAT	2	10	309	318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021883	CT	3	6	343	348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021883	GAT	2	6	365	370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021883	CAG	2	6	403	408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021883	TAG	2	6	420	425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021883	TAC	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021883	GGTT	2	8	2337	2344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021883	CCG	2	6	2406	2411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_021883	T	7	7	3313	3319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021883	CTGC	2	8	3326	3333	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021883	TAA	2	6	3368	3373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021883	T	7	7	3381	3387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021883	TAT	2	6	3394	3399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021883	ATTT	2	8	3408	3415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021883	CAAAAA	2	12	3436	3447	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021883	A	7	7	3443	3449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021883	GTA	2	6	3456	3461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021883	A	6	6	3461	3466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021883	TA	3	6	3518	3523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021883	GAG	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021883	TACT	2	8	5075	5082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021883	GTT	2	6	5186	5191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021883	GGT	2	6	5217	5222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021883	TCTT	2	8	5237	5244	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021883	TGGT	2	8	5262	5269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021883	ACTA	2	8	5313	5320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021883	ACT	2	6	5325	5330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021883	GTT	2	6	5396	5401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021883	GAT	3	9	5406	5414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021883	ATC	2	6	5458	5463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021883	TGG	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021883	GCG	2	6	5613	5618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021883	GGC	2	6	5622	5627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021883	AAG	2	6	5644	5649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021883	TTA	2	6	5710	5715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021883	GTG	2	6	5782	5787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021883	TGGT	2	8	5855	5862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021883	GCC	2	6	5880	5885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_021883	ATTG	2	8	6106	6113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021883	CT	3	6	6121	6126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021883	AC	3	6	6134	6139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021883	TAAC	2	8	6237	6244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021883	TCAC	2	8	6253	6260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021883	TCA	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021883	ACA	2	6	6298	6303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021883	CTT	2	6	6354	6359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021883	GAAA	2	8	6427	6434	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021883	ATTC	2	8	6450	6457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021883	GAT	2	6	6512	6517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021883	TTC	2	6	6542	6547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021883	GCTG	2	8	6565	6572	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021883	CAG	2	6	6600	6605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021883	GAG	2	6	6701	6706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021883	A	6	6	7712	7717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021883	TAC	2	6	9101	9106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021883	CTA	2	6	9131	9136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021883	ATT	2	6	9195	9200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021883	CGAAAA	2	12	9206	9217	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021883	CTT	2	6	9231	9236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021883	T	7	7	9235	9241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021883	A	6	6	9244	9249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021883	GAA	2	6	10393	10398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021883	TCCT	2	8	10407	10414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021883	AAT	2	6	11940	11945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021883	A	6	6	11956	11961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021883	T	6	6	11973	11978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021883	A	6	6	12001	12006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021883	A	6	6	12022	12027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021883	CT	3	6	12072	12077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021883	AGAA	2	8	12090	12097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021883	ATTTT	2	10	12167	12176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021883	AAGC	2	8	13838	13845	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021883	ATA	2	6	14619	14624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021883	TTAA	2	8	15004	15011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021883	ATT	2	6	15052	15057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021883	TAA	2	6	15075	15080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021883	TTTAA	2	10	15089	15098	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021883	ATT	2	6	15101	15106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021883	TAAAT	2	10	15119	15128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021883	A	6	6	15133	15138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021883	A	6	6	15153	15158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021883	ATT	2	6	16666	16671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021883	A	6	6	16679	16684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021883	ACA	2	6	16713	16718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021883	CT	3	6	17640	17645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021883	T	6	6	17647	17652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021883	A	6	6	17686	17691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021883	ATTT	2	8	17714	17721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021883	GAGG	2	8	19951	19958	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021883	GGAG	2	8	19978	19985	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021883	T	6	6	19999	20004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021883	CT	4	8	20029	20036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021883	TC	4	8	20068	20075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021883	TCC	2	6	21607	21612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_021883	TC	3	6	22698	22703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021883	TAG	2	6	22707	22712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021883	ACA	2	6	22720	22725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021883	C	6	6	22729	22734	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_021883	GGAG	2	8	22739	22746	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021883	A	7	7	23804	23810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021883	CTC	2	6	25621	25626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021883	ACC	2	6	25649	25654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_021883	A	6	6	27260	27265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021883	A	6	6	27287	27292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021883	A	6	6	28193	28198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021883	CT	3	6	31449	31454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021883	T	6	6	31499	31504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021883	AC	3	6	31527	31532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021883	ATC	2	6	32692	32697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021883	TTTC	2	8	32786	32793	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021883	T	7	7	32797	32803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021883	AT	3	6	32830	32835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021883	ATT	2	6	32839	32844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021883	AAT	2	6	32892	32897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021883	AC	4	8	32913	32920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021883	TGT	2	6	32928	32933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021883	T	7	7	32933	32939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021883	A	7	7	32966	32972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021883	TAAA	2	8	32980	32987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021883	T	8	8	32989	32996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021883	GAA	2	6	33006	33011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021883	CAA	2	6	33041	33046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021883	ATT	2	6	33100	33105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021883	TG	3	6	33114	33119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021883	CAA	2	6	34411	34416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021883	AGG	2	6	34762	34767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021883	AGG	2	6	35246	35251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021883	CTAAA	2	10	39638	39647	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_021883	AAC	2	6	39652	39657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021883	A	6	6	40082	40087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021883	GTTTT	2	10	40103	40112	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021883	T	6	6	40135	40140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021883	T	6	6	40189	40194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021883	T	6	6	41223	41228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021883	TGA	2	6	41258	41263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021883	A	6	6	41286	41291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021883	A	6	6	41309	41314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021883	GAG	2	6	41383	41388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021883	GTTTT	2	10	41916	41925	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021883	T	6	6	41928	41933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021883	CTA	2	6	41947	41952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_021883	TC	3	6	42582	42587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021883	A	6	6	42592	42597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021883	ATT	2	6	42637	42642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021883	TAG	2	6	42699	42704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021883	T	6	6	44350	44355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021883	CTTTT	2	10	44381	44390	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_021883	ATTT	2	8	44408	44415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_021883	ATC	2	6	44495	44500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_021883	T	7	7	52050	52056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021883	T	6	6	52075	52080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021883	T	7	7	52152	52158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021883	TC	3	6	52162	52167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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167	NC_021883	TAC	2	6	53048	53053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_021883	A	6	6	55649	55654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021883	ATAATT	2	12	55663	55674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_021883	TAC	2	6	55686	55691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_021883	TC	3	6	55944	55949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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183	NC_021883	A	6	6	60463	60468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_021883	ATTTT	2	10	99746	99755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_021883	AAT	2	6	148322	148327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_021883	T	7	7	148378	148384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_021883	T	8	8	148406	148413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_021883	GGC	2	6	148421	148426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_021883	T	6	6	148450	148455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_021883	TTA	2	6	149888	149893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_021883	ATA	2	6	149968	149973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_021883	A	6	6	149999	150004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_021883	AAG	2	6	150010	150015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
457	NC_021883	TCA	2	6	150874	150879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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459	NC_021883	GAT	2	6	154509	154514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_021883	T	7	7	155959	155965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_021883	AT	3	6	158026	158031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_021883	ATT	3	9	158090	158098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_021883	TCAT	2	8	158113	158120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
465	NC_021883	AC	3	6	158190	158195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
466	NC_021883	CAA	2	6	158205	158210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_021883	A	6	6	161362	161367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_021883	CAT	2	6	161379	161384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_021883	A	7	7	161420	161426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_021883	A	6	6	161431	161436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_021883	TAA	2	6	161454	161459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_021883	T	6	6	164121	164126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_021883	ATA	2	6	164189	164194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_021883	AAT	2	6	166757	166762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_021883	T	6	6	166818	166823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_021883	TTA	2	6	170204	170209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_021883	T	6	6	170227	170232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_021883	ATCT	2	8	170321	170328	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
486	NC_021883	GTAC	2	8	170342	170349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
487	NC_021883	GAA	2	6	170356	170361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
488	NC_021883	TTA	2	6	170718	170723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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