MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D174

Total Repeats: 8418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021739	T	6	6	1295578	1295583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_021739	TATTTT	2	12	1295587	1295598	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021739	CTTT	2	8	1295615	1295622	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_021739	CTGAG	2	10	1295643	1295652	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4005	NC_021739	AAC	2	6	1295653	1295658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_021739	TTGAAA	2	12	1295670	1295681	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_021739	A	6	6	1295736	1295741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_021739	A	6	6	1297047	1297052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_021739	TAAAA	2	10	1297070	1297079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_021739	TAC	2	6	1297088	1297093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_021739	CAAC	2	8	1297169	1297176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4012	NC_021739	ATT	2	6	1297187	1297192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_021739	ACTA	2	8	1297212	1297219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_021739	TGG	2	6	1297311	1297316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_021739	A	6	6	1297392	1297397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_021739	CAA	2	6	1297400	1297405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_021739	T	7	7	1297564	1297570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021739	GGT	2	6	1297626	1297631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_021739	A	6	6	1299917	1299922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021739	T	6	6	1301314	1301319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021739	ATC	2	6	1301325	1301330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_021739	TCAAA	2	10	1301393	1301402	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4023	NC_021739	A	6	6	1302490	1302495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_021739	CAA	2	6	1303942	1303947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_021739	T	6	6	1303958	1303963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_021739	A	8	8	1304005	1304012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_021739	AGC	2	6	1304087	1304092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_021739	CCA	2	6	1304135	1304140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_021739	AGC	2	6	1304185	1304190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_021739	CCA	2	6	1304233	1304238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_021739	CTC	2	6	1304251	1304256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_021739	AGC	2	6	1304282	1304287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_021739	CCA	2	6	1304330	1304335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4034	NC_021739	A	6	6	1304367	1304372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_021739	TAG	2	6	1304384	1304389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_021739	TTTTA	2	10	1304411	1304420	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_021739	TCA	2	6	1304422	1304427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_021739	CT	3	6	1307076	1307081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_021739	TATC	2	8	1307155	1307162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_021739	AAT	2	6	1307177	1307182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_021739	CA	3	6	1307184	1307189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_021739	A	6	6	1309080	1309085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_021739	T	6	6	1309099	1309104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021739	CAA	2	6	1309107	1309112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_021739	ATT	2	6	1309829	1309834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_021739	GTGCA	2	10	1309866	1309875	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4047	NC_021739	TGA	2	6	1309918	1309923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_021739	ATA	2	6	1309935	1309940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_021739	TGA	2	6	1310083	1310088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_021739	AT	3	6	1310229	1310234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_021739	TTC	2	6	1310275	1310280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_021739	GGC	2	6	1310290	1310295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_021739	ATG	2	6	1310390	1310395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_021739	ATT	2	6	1310439	1310444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_021739	GAA	2	6	1310485	1310490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_021739	TAA	2	6	1310529	1310534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_021739	A	6	6	1310606	1310611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_021739	A	7	7	1310631	1310637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_021739	T	6	6	1310703	1310708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_021739	CAA	3	9	1310719	1310727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_021739	A	6	6	1310726	1310731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_021739	GGC	2	6	1310749	1310754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_021739	TCTT	2	8	1310755	1310762	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_021739	TTTTGC	2	12	1310794	1310805	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4065	NC_021739	TTAAA	2	10	1310850	1310859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_021739	CGA	2	6	1310863	1310868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_021739	CAC	2	6	1310892	1310897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_021739	GTC	2	6	1310967	1310972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_021739	GATT	2	8	1311067	1311074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_021739	TCT	2	6	1311075	1311080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_021739	TTC	3	9	1311090	1311098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_021739	ACA	2	6	1311183	1311188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_021739	AC	3	6	1311192	1311197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_021739	CGT	2	6	1311210	1311215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_021739	CAA	2	6	1311222	1311227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_021739	AC	3	6	1311233	1311238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_021739	AGC	2	6	1311387	1311392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_021739	ACG	2	6	1311441	1311446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_021739	TGA	2	6	1311521	1311526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_021739	CCG	2	6	1311549	1311554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_021739	ACC	2	6	1311636	1311641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_021739	TGTC	2	8	1311677	1311684	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_021739	GCTT	2	8	1311695	1311702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4084	NC_021739	CTC	2	6	1311755	1311760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_021739	GAG	2	6	1311774	1311779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_021739	CCA	2	6	1311799	1311804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_021739	GGT	2	6	1311859	1311864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_021739	ATTTCA	2	12	1312015	1312026	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4089	NC_021739	CAT	2	6	1312054	1312059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_021739	GCC	2	6	1312129	1312134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_021739	GGCA	2	8	1312200	1312207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4092	NC_021739	TAA	2	6	1312254	1312259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021739	CAGC	2	8	1312267	1312274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_021739	TC	3	6	1312382	1312387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_021739	ACC	2	6	1312412	1312417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_021739	TAA	2	6	1312442	1312447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_021739	TCA	2	6	1312511	1312516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_021739	CTAAC	2	10	1312591	1312600	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4099	NC_021739	TTA	2	6	1312623	1312628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_021739	CAG	2	6	1312801	1312806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_021739	CGACT	2	10	1312920	1312929	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4102	NC_021739	CTTT	2	8	1312944	1312951	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4103	NC_021739	TGG	2	6	1312955	1312960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_021739	GTT	2	6	1313050	1313055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_021739	CACC	2	8	1313079	1313086	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4106	NC_021739	GT	3	6	1313087	1313092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_021739	TCGGT	2	10	1313295	1313304	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4108	NC_021739	GGA	2	6	1313613	1313618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_021739	C	6	6	1313623	1313628	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4110	NC_021739	TTG	2	6	1313663	1313668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_021739	TCGC	2	8	1313781	1313788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_021739	CTA	2	6	1313791	1313796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_021739	CA	3	6	1313861	1313866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_021739	TAG	2	6	1313887	1313892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_021739	TTC	2	6	1313894	1313899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_021739	CTT	2	6	1313982	1313987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_021739	A	7	7	1314079	1314085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_021739	T	6	6	1314138	1314143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_021739	TC	3	6	1314212	1314217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4120	NC_021739	ATC	2	6	1314272	1314277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_021739	AAT	2	6	1314293	1314298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_021739	ATG	2	6	1314330	1314335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_021739	GAT	2	6	1314346	1314351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_021739	TGG	2	6	1314352	1314357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_021739	CCT	2	6	1314382	1314387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_021739	AGGC	2	8	1314395	1314402	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4127	NC_021739	CTC	2	6	1314404	1314409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_021739	TTC	2	6	1314446	1314451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_021739	TCGCT	2	10	1314460	1314469	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4130	NC_021739	GTG	2	6	1314486	1314491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_021739	ACC	2	6	1314509	1314514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4132	NC_021739	ACC	2	6	1314544	1314549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4133	NC_021739	T	6	6	1314580	1314585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_021739	TCT	2	6	1314587	1314592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4136	NC_021739	AGG	2	6	1314642	1314647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4138	NC_021739	GT	3	6	1314783	1314788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4165	NC_021739	TCAA	2	8	1316323	1316330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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