MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 8316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021738	TGA	2	6	29	34	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021738	TGA	2	6	45	50	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021738	AGTTG	2	10	71	80	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021738	GAA	2	6	96	101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021738	CAC	2	6	110	115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_021738	AAT	2	6	277	282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021738	CCA	2	6	482	487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021738	CTT	2	6	488	493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021738	AT	3	6	523	528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021738	CAG	2	6	548	553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021738	CAA	2	6	593	598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021738	T	6	6	618	623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021738	ATAA	2	8	649	656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021738	A	6	6	972	977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021738	TTG	2	6	979	984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021738	ATA	2	6	998	1003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021738	AGA	2	6	1060	1065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021738	GCGG	2	8	1088	1095	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021738	TCG	2	6	1102	1107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021738	AATG	2	8	1108	1115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021738	CA	3	6	1161	1166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021738	CAC	2	6	1182	1187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_021738	CAG	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021738	ATAA	2	8	1411	1418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021738	ATG	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021738	AAG	2	6	1490	1495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021738	TTGC	2	8	1531	1538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021738	TTC	2	6	1540	1545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021738	A	6	6	1553	1558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021738	A	6	6	1647	1652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021738	ACC	2	6	1687	1692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021738	CCA	2	6	1758	1763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_021738	A	6	6	1780	1785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021738	TG	3	6	1836	1841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021738	AATT	2	8	1895	1902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021738	GA	4	8	2056	2063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021738	TTGG	2	8	2067	2074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021738	TAA	2	6	2079	2084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021738	TTA	2	6	2105	2110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021738	TAA	2	6	6415	6420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021738	A	6	6	6419	6424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021738	TA	3	6	6479	6484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021738	AGT	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021738	ATT	2	6	6511	6516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021738	TCA	2	6	6521	6526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021738	GGTTC	2	10	6756	6765	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021738	TGA	2	6	6832	6837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021738	ATG	2	6	6884	6889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021738	AAG	2	6	7069	7074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021738	ATA	2	6	7225	7230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021738	TG	3	6	7272	7277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021738	CAA	2	6	7305	7310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021738	AGCA	2	8	7358	7365	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021738	AGA	2	6	7401	7406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021738	AATC	2	8	7472	7479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021738	GACA	2	8	8544	8551	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021738	TCT	2	6	8590	8595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021738	TA	3	6	8624	8629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021738	A	6	6	8693	8698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021738	TGCC	2	8	8795	8802	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021738	CAA	2	6	8850	8855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021738	TTA	2	6	8865	8870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021738	T	6	6	8883	8888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021738	GAT	2	6	8903	8908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021738	T	6	6	10488	10493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021738	AG	3	6	10555	10560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021738	A	7	7	10571	10577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021738	A	6	6	10614	10619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021738	T	6	6	10624	10629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021738	A	6	6	10646	10651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021738	CGGA	2	8	10709	10716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021738	GTA	2	6	10749	10754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021738	CCG	2	6	10807	10812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_021738	ACT	2	6	10849	10854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021738	TAT	2	6	10891	10896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021738	AAT	2	6	10981	10986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021738	TTA	2	6	11006	11011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021738	ATTA	2	8	11032	11039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021738	TTA	2	6	11051	11056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021738	TAT	2	6	11072	11077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021738	A	6	6	11760	11765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021738	TTA	2	6	11784	11789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021738	AAATT	2	10	16545	16554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021738	GTT	2	6	16606	16611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021738	CAAATA	2	12	16628	16639	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021738	ATTTT	2	10	16648	16657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021738	TAC	2	6	16688	16693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021738	TAG	2	6	16696	16701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021738	TG	3	6	16708	16713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021738	TAA	2	6	16727	16732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021738	A	6	6	18486	18491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021738	ATA	2	6	18529	18534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021738	AGG	2	6	18543	18548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021738	GTT	2	6	18910	18915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021738	A	7	7	20919	20925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021738	TTG	2	6	20943	20948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021738	AAT	2	6	23928	23933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021738	ACT	2	6	26447	26452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021738	CTAT	2	8	27560	27567	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021738	TA	3	6	27647	27652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021738	ATA	2	6	27675	27680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021738	AG	3	6	27713	27718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021738	TTG	2	6	27733	27738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021738	T	6	6	27750	27755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021738	CAAA	3	12	27781	27792	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021738	TTAT	2	8	27809	27816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021738	GAA	2	6	27840	27845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021738	CT	3	6	30517	30522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021738	GA	4	8	30533	30540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021738	AG	3	6	30572	30577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021738	TCT	2	6	30644	30649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021738	AAG	2	6	30696	30701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021738	CTC	2	6	32626	32631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_021738	A	6	6	32634	32639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021738	ATT	2	6	32702	32707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021738	TGAT	2	8	32725	32732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021738	CT	3	6	32735	32740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021738	G	7	7	32789	32795	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021738	ATT	2	6	34244	34249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021738	A	6	6	34258	34263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021738	T	6	6	34285	34290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021738	ATT	2	6	34309	34314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021738	AAACT	2	10	34319	34328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_021738	T	7	7	34342	34348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021738	CAC	2	6	34410	34415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_021738	TGT	2	6	34430	34435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021738	GTTTT	2	10	35104	35113	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021738	T	7	7	35131	35137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021738	TTAT	2	8	35368	35375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021738	T	6	6	35395	35400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021738	AAT	2	6	35433	35438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021738	ATT	2	6	35523	35528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021738	ACA	2	6	35535	35540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021738	A	6	6	35647	35652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021738	TCAGCA	2	12	35688	35699	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021738	ACC	2	6	35700	35705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_021738	TGT	2	6	35798	35803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021738	A	6	6	35811	35816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021738	CA	4	8	35821	35828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021738	TGA	2	6	35936	35941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021738	TA	3	6	35956	35961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021738	GTA	2	6	35986	35991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021738	GTC	2	6	36016	36021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021738	TGA	2	6	36035	36040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021738	GTG	2	6	36133	36138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021738	AGT	2	6	36458	36463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021738	GTTTT	2	10	36761	36770	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021738	AT	3	6	36773	36778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021738	T	7	7	36790	36796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021738	ATA	2	6	36840	36845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021738	TGTT	2	8	38354	38361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021738	TAT	2	6	38371	38376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021738	TC	3	6	38432	38437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021738	ATTAA	2	10	38465	38474	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021738	ATTA	2	8	39197	39204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_021738	T	6	6	39945	39950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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