MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 42850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_021192	GTC	2	6	4058809	4058814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40002	NC_021192	G	6	6	4058828	4058833	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40003	NC_021192	ACA	2	6	4058960	4058965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40004	NC_021192	GCCG	2	8	4059000	4059007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40005	NC_021192	CGCC	2	8	4059051	4059058	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40006	NC_021192	CAT	2	6	4059139	4059144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40007	NC_021192	TTC	2	6	4059179	4059184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40008	NC_021192	CCG	2	6	4059202	4059207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40009	NC_021192	CTG	2	6	4059245	4059250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40010	NC_021192	TGACCA	2	12	4059259	4059270	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40011	NC_021192	CACC	2	8	4059286	4059293	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
40012	NC_021192	CGC	2	6	4059403	4059408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40013	NC_021192	CGT	2	6	4059430	4059435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40014	NC_021192	GGT	2	6	4059436	4059441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40015	NC_021192	GAG	2	6	4059455	4059460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40016	NC_021192	TCG	2	6	4059462	4059467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40017	NC_021192	CG	3	6	4059479	4059484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40018	NC_021192	GAT	2	6	4059514	4059519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40019	NC_021192	GCTG	2	8	4059595	4059602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40020	NC_021192	GGT	2	6	4059691	4059696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40021	NC_021192	TC	3	6	4059756	4059761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40022	NC_021192	GCG	2	6	4059822	4059827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40023	NC_021192	GCC	2	6	4059846	4059851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40024	NC_021192	CTA	2	6	4059870	4059875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40025	NC_021192	CGC	2	6	4059876	4059881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40026	NC_021192	CCG	2	6	4060405	4060410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40027	NC_021192	GCA	2	6	4061371	4061376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40028	NC_021192	CGT	2	6	4061550	4061555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40029	NC_021192	TGA	2	6	4061589	4061594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40030	NC_021192	CAG	2	6	4061632	4061637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40031	NC_021192	TCG	2	6	4061684	4061689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40032	NC_021192	CAGCGC	2	12	4061708	4061719	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40033	NC_021192	CG	3	6	4061721	4061726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40034	NC_021192	ACC	2	6	4061748	4061753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40035	NC_021192	GCC	2	6	4061768	4061773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40036	NC_021192	CGA	2	6	4061784	4061789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40037	NC_021192	CGG	2	6	4061839	4061844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40038	NC_021192	GCT	2	6	4061910	4061915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40039	NC_021192	CGG	2	6	4061944	4061949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40040	NC_021192	GC	3	6	4061978	4061983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40041	NC_021192	CGT	2	6	4061987	4061992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40042	NC_021192	AGGT	2	8	4062020	4062027	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40043	NC_021192	AGC	2	6	4062031	4062036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40044	NC_021192	CGA	2	6	4062083	4062088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40045	NC_021192	CGC	2	6	4062151	4062156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40046	NC_021192	GAC	2	6	4062201	4062206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40047	NC_021192	CGG	2	6	4062249	4062254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40048	NC_021192	CTG	2	6	4062259	4062264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40049	NC_021192	CCA	2	6	4062290	4062295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40050	NC_021192	CCA	3	9	4062353	4062361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40051	NC_021192	ACG	2	6	4062366	4062371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40052	NC_021192	GAC	4	12	4062372	4062383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40053	NC_021192	CA	3	6	4062969	4062974	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40054	NC_021192	CGG	2	6	4062975	4062980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40055	NC_021192	GC	3	6	4064095	4064100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40056	NC_021192	CAC	2	6	4064123	4064128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40057	NC_021192	CAC	2	6	4064162	4064167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40058	NC_021192	TGGCGG	2	12	4064188	4064199	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40059	NC_021192	GCC	2	6	4064226	4064231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40060	NC_021192	CCG	2	6	4064233	4064238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40061	NC_021192	CAC	2	6	4064252	4064257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40062	NC_021192	AGC	2	6	4064293	4064298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40063	NC_021192	GGC	2	6	4064300	4064305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40064	NC_021192	AAT	2	6	4064403	4064408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40065	NC_021192	TCG	2	6	4064644	4064649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40066	NC_021192	GGT	2	6	4064651	4064656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40067	NC_021192	ACGG	2	8	4064693	4064700	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40068	NC_021192	CGCC	2	8	4064702	4064709	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40069	NC_021192	GCA	2	6	4064732	4064737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40070	NC_021192	CAG	2	6	4064757	4064762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40071	NC_021192	GC	3	6	4064802	4064807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40072	NC_021192	GGTGAC	2	12	4064866	4064877	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40073	NC_021192	CGA	2	6	4064890	4064895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40074	NC_021192	CGA	2	6	4064901	4064906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40075	NC_021192	CGT	2	6	4064964	4064969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40076	NC_021192	CGG	3	9	4065009	4065017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40077	NC_021192	CGT	2	6	4065054	4065059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40078	NC_021192	CCGGCG	2	12	4065065	4065076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40079	NC_021192	ATC	2	6	4065101	4065106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40080	NC_021192	TGG	2	6	4065985	4065990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40081	NC_021192	GC	3	6	4066009	4066014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40082	NC_021192	TGC	3	9	4066053	4066061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40083	NC_021192	CGA	2	6	4066102	4066107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40084	NC_021192	AAC	2	6	4066254	4066259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40085	NC_021192	CGAT	2	8	4066260	4066267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40086	NC_021192	CCG	2	6	4066322	4066327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40087	NC_021192	CAC	2	6	4066336	4066341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40088	NC_021192	GCA	2	6	4066348	4066353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40089	NC_021192	C	7	7	4066354	4066360	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40090	NC_021192	GCC	2	6	4066412	4066417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40091	NC_021192	CTT	2	6	4066453	4066458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40092	NC_021192	AC	3	6	4066509	4066514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40093	NC_021192	CGT	2	6	4066592	4066597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40094	NC_021192	GAG	2	6	4066686	4066691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40095	NC_021192	GGT	2	6	4066696	4066701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40096	NC_021192	CG	3	6	4066729	4066734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40097	NC_021192	AGG	2	6	4066746	4066751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40098	NC_021192	TGC	2	6	4066806	4066811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40099	NC_021192	GCC	2	6	4066822	4066827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40100	NC_021192	CCG	2	6	4066857	4066862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40101	NC_021192	AACG	2	8	4066886	4066893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40102	NC_021192	GAC	2	6	4067072	4067077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40104	NC_021192	CG	3	6	4067116	4067121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40105	NC_021192	GTGA	2	8	4067137	4067144	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40106	NC_021192	CGC	2	6	4067173	4067178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40107	NC_021192	GGCT	2	8	4067242	4067249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40108	NC_021192	GAC	2	6	4067282	4067287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40109	NC_021192	GCG	2	6	4067344	4067349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40110	NC_021192	TG	3	6	4067370	4067375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40111	NC_021192	GGCC	2	8	4067390	4067397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40112	NC_021192	CTG	2	6	4067913	4067918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40113	NC_021192	CAC	2	6	4067930	4067935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40114	NC_021192	GCG	2	6	4067965	4067970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40115	NC_021192	CCG	2	6	4068046	4068051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40116	NC_021192	CGAC	2	8	4068146	4068153	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40117	NC_021192	ATC	2	6	4068168	4068173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40118	NC_021192	CTG	2	6	4070232	4070237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40119	NC_021192	CCGAG	2	10	4070293	4070302	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40120	NC_021192	AAG	2	6	4070339	4070344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40121	NC_021192	TTC	2	6	4070363	4070368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40122	NC_021192	TGG	2	6	4070379	4070384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40123	NC_021192	CTT	2	6	4070401	4070406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40124	NC_021192	TCT	2	6	4070409	4070414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40125	NC_021192	TCG	2	6	4070418	4070423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40126	NC_021192	CCG	2	6	4070496	4070501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40127	NC_021192	CGCAC	2	10	4070579	4070588	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
40128	NC_021192	CG	3	6	4070642	4070647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40129	NC_021192	GGC	2	6	4070677	4070682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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40238	NC_021192	CTGT	2	8	4081290	4081297	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40239	NC_021192	GTC	2	6	4081306	4081311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40240	NC_021192	GCT	2	6	4081398	4081403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40243	NC_021192	CG	3	6	4081628	4081633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40244	NC_021192	GAA	2	6	4081657	4081662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40245	NC_021192	CTG	2	6	4081669	4081674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40246	NC_021192	AGCG	2	8	4081700	4081707	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40247	NC_021192	GCA	2	6	4081893	4081898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40248	NC_021192	GCG	2	6	4081900	4081905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40249	NC_021192	CTG	2	6	4081906	4081911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40250	NC_021192	GC	3	6	4081964	4081969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40251	NC_021192	CGG	2	6	4081975	4081980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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40253	NC_021192	GCC	2	6	4082038	4082043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40254	NC_021192	GCG	2	6	4082085	4082090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40255	NC_021192	TGC	2	6	4082091	4082096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40256	NC_021192	CGGC	2	8	4082101	4082108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40257	NC_021192	TTC	2	6	4082118	4082123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40377	NC_021192	GACC	2	8	4094989	4094996	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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