MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 42850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_021192	GGCG	2	8	3842990	3842997	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38002	NC_021192	CG	3	6	3843039	3843044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38003	NC_021192	CAA	2	6	3843062	3843067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38004	NC_021192	GCG	2	6	3843131	3843136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38005	NC_021192	CGA	2	6	3843185	3843190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38006	NC_021192	GCG	2	6	3843206	3843211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38007	NC_021192	ACCT	2	8	3843240	3843247	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38008	NC_021192	TGC	2	6	3843283	3843288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38009	NC_021192	GCT	2	6	3843293	3843298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38010	NC_021192	GAC	2	6	3843321	3843326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38011	NC_021192	ACCG	2	8	3843339	3843346	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38012	NC_021192	ACG	2	6	3843391	3843396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38013	NC_021192	GAG	2	6	3843429	3843434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38014	NC_021192	GTG	2	6	3843476	3843481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38015	NC_021192	CCAT	2	8	3843584	3843591	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38016	NC_021192	TTC	2	6	3843610	3843615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38017	NC_021192	TGC	2	6	3843704	3843709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38018	NC_021192	GCC	2	6	3843732	3843737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38019	NC_021192	GTC	3	9	3843784	3843792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38020	NC_021192	GCC	2	6	3847022	3847027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38021	NC_021192	CGC	2	6	3847037	3847042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38022	NC_021192	CGA	2	6	3847053	3847058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38023	NC_021192	TCCA	2	8	3847108	3847115	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38024	NC_021192	GTT	2	6	3847171	3847176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38025	NC_021192	GCG	2	6	3847228	3847233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38026	NC_021192	CG	3	6	3847232	3847237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38027	NC_021192	CGT	2	6	3847258	3847263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38028	NC_021192	CCA	2	6	3847265	3847270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38029	NC_021192	GCA	3	9	3847312	3847320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38030	NC_021192	CGA	2	6	3847394	3847399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38031	NC_021192	ACC	2	6	3847530	3847535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38032	NC_021192	GCG	2	6	3847542	3847547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38033	NC_021192	TTC	2	6	3847556	3847561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38034	NC_021192	GCC	2	6	3847572	3847577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38035	NC_021192	CGG	2	6	3847591	3847596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38036	NC_021192	TCG	3	9	3847674	3847682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38037	NC_021192	ACGG	2	8	3847715	3847722	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38038	NC_021192	CT	3	6	3847742	3847747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38039	NC_021192	TGA	2	6	3847799	3847804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38040	NC_021192	CG	3	6	3847814	3847819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38041	NC_021192	TTG	2	6	3847854	3847859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38042	NC_021192	GATC	2	8	3847867	3847874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38043	NC_021192	GGC	2	6	3847901	3847906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38044	NC_021192	GC	3	6	3847926	3847931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38045	NC_021192	CGC	2	6	3847985	3847990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38046	NC_021192	GCGA	2	8	3848009	3848016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38047	NC_021192	ATCC	2	8	3848027	3848034	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38048	NC_021192	CGT	2	6	3848071	3848076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38049	NC_021192	TTC	2	6	3848177	3848182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38050	NC_021192	GCC	2	6	3848266	3848271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38051	NC_021192	C	6	6	3848389	3848394	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38052	NC_021192	CGC	2	6	3848417	3848422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38053	NC_021192	CGG	2	6	3848429	3848434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38054	NC_021192	GGC	2	6	3848463	3848468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38055	NC_021192	CG	3	6	3848494	3848499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38056	NC_021192	GTG	2	6	3848507	3848512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38057	NC_021192	CGA	2	6	3848529	3848534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38058	NC_021192	GGATCG	2	12	3848552	3848563	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38059	NC_021192	ACG	2	6	3848573	3848578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38060	NC_021192	CG	4	8	3848591	3848598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38061	NC_021192	AACC	2	8	3848617	3848624	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38062	NC_021192	ACCG	2	8	3848638	3848645	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38063	NC_021192	GT	3	6	3848664	3848669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38064	NC_021192	TCG	2	6	3848681	3848686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38065	NC_021192	CGA	2	6	3848741	3848746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38066	NC_021192	CCCG	2	8	3848750	3848757	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38067	NC_021192	GCC	2	6	3848818	3848823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38068	NC_021192	AC	3	6	3850557	3850562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38069	NC_021192	CAT	2	6	3850600	3850605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38070	NC_021192	TGA	2	6	3852102	3852107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38072	NC_021192	CCG	2	6	3852183	3852188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38073	NC_021192	ACC	2	6	3852211	3852216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38074	NC_021192	CG	3	6	3852627	3852632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38075	NC_021192	CGC	2	6	3852655	3852660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38076	NC_021192	GCG	2	6	3852674	3852679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38077	NC_021192	CCG	2	6	3852685	3852690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38078	NC_021192	CTA	2	6	3852708	3852713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38079	NC_021192	GCC	2	6	3852733	3852738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38080	NC_021192	TCAGA	2	10	3852749	3852758	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38081	NC_021192	ACGC	2	8	3852786	3852793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38082	NC_021192	TCCA	2	8	3852948	3852955	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38083	NC_021192	AGGT	2	8	3853063	3853070	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38084	NC_021192	TGA	2	6	3853085	3853090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38085	NC_021192	GCG	2	6	3853187	3853192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38086	NC_021192	GCC	2	6	3853197	3853202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38087	NC_021192	GC	3	6	3853246	3853251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38088	NC_021192	CCA	2	6	3853327	3853332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38089	NC_021192	CCG	2	6	3853401	3853406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38090	NC_021192	CAG	3	9	3853418	3853426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38091	NC_021192	GCA	2	6	3853465	3853470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38092	NC_021192	TCA	2	6	3853471	3853476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38093	NC_021192	ACCA	2	8	3853487	3853494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38094	NC_021192	CCG	2	6	3854419	3854424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38095	NC_021192	GTC	2	6	3854616	3854621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38096	NC_021192	GC	3	6	3854637	3854642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38097	NC_021192	GGCG	2	8	3854645	3854652	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38098	NC_021192	CAAT	2	8	3854671	3854678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38099	NC_021192	GCT	3	9	3854865	3854873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38100	NC_021192	CA	3	6	3854877	3854882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38101	NC_021192	GCG	2	6	3854896	3854901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38102	NC_021192	CCA	2	6	3854963	3854968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38103	NC_021192	GCC	2	6	3854995	3855000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38104	NC_021192	GCCC	2	8	3860364	3860371	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38105	NC_021192	CAC	2	6	3860380	3860385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38106	NC_021192	CGA	2	6	3860824	3860829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38107	NC_021192	TCG	2	6	3860847	3860852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38108	NC_021192	GCA	2	6	3860863	3860868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38109	NC_021192	CGG	2	6	3860873	3860878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38110	NC_021192	GCG	2	6	3860890	3860895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38111	NC_021192	CAT	2	6	3860921	3860926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38112	NC_021192	CGA	2	6	3860933	3860938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38113	NC_021192	CCG	2	6	3860975	3860980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38114	NC_021192	GCC	2	6	3861036	3861041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38115	NC_021192	GAT	2	6	3861056	3861061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38116	NC_021192	CGC	2	6	3861079	3861084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38117	NC_021192	AGC	2	6	3861111	3861116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38118	NC_021192	TTC	2	6	3861162	3861167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38119	NC_021192	TCCA	2	8	3861168	3861175	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38120	NC_021192	TCG	2	6	3861198	3861203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38121	NC_021192	CGGGCC	2	12	3861294	3861305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38122	NC_021192	C	6	6	3861304	3861309	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38123	NC_021192	GCC	2	6	3861327	3861332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38124	NC_021192	CAC	3	9	3861359	3861367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38125	NC_021192	GC	3	6	3861417	3861422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38126	NC_021192	ACC	2	6	3861501	3861506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38127	NC_021192	TGT	2	6	3861533	3861538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38128	NC_021192	CAA	2	6	3861568	3861573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38129	NC_021192	CGG	2	6	3861577	3861582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38130	NC_021192	CAC	2	6	3861584	3861589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38131	NC_021192	CAGC	2	8	3861602	3861609	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38132	NC_021192	GCT	2	6	3861626	3861631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38133	NC_021192	GCG	2	6	3861643	3861648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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38138	NC_021192	CCG	2	6	3861826	3861831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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38140	NC_021192	GCCG	2	8	3863505	3863512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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38143	NC_021192	ATG	2	6	3863650	3863655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38159	NC_021192	CCG	2	6	3864592	3864597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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38169	NC_021192	GCC	2	6	3865687	3865692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38170	NC_021192	CCCG	2	8	3865736	3865743	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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38241	NC_021192	CGG	2	6	3875925	3875930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38242	NC_021192	GATC	2	8	3875991	3875998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38243	NC_021192	CCGCC	2	10	3876018	3876027	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
38244	NC_021192	TGAA	2	8	3876047	3876054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38245	NC_021192	GC	3	6	3876055	3876060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38246	NC_021192	CCA	2	6	3876063	3876068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38247	NC_021192	GTG	2	6	3877043	3877048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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38249	NC_021192	GATC	2	8	3879214	3879221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38250	NC_021192	AAC	2	6	3879249	3879254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38252	NC_021192	GCG	2	6	3879317	3879322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38253	NC_021192	GAAT	2	8	3879330	3879337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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