MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 42850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_021192	CGT	2	6	3545030	3545035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35002	NC_021192	CAG	3	9	3545078	3545086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35003	NC_021192	CAAC	2	8	3545134	3545141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35004	NC_021192	GCC	2	6	3545165	3545170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35005	NC_021192	GGC	2	6	3545330	3545335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35006	NC_021192	GGC	2	6	3545343	3545348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35007	NC_021192	CGA	3	9	3545408	3545416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35008	NC_021192	GCG	3	9	3545443	3545451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35009	NC_021192	CGT	2	6	3545480	3545485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35010	NC_021192	TCG	2	6	3545497	3545502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35011	NC_021192	CGA	3	9	3545513	3545521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35012	NC_021192	CAT	2	6	3545556	3545561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35013	NC_021192	ATC	2	6	3545571	3545576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35014	NC_021192	CG	3	6	3545612	3545617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35015	NC_021192	CGC	2	6	3545697	3545702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35016	NC_021192	CTG	2	6	3545710	3545715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35017	NC_021192	ACG	2	6	3545750	3545755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35018	NC_021192	GCA	2	6	3545773	3545778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35019	NC_021192	CTC	2	6	3545779	3545784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35020	NC_021192	CTC	2	6	3547089	3547094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35021	NC_021192	GCG	2	6	3547111	3547116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35022	NC_021192	TGG	2	6	3547878	3547883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35023	NC_021192	GCC	2	6	3547892	3547897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35024	NC_021192	GGC	2	6	3547900	3547905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35025	NC_021192	CGC	2	6	3547920	3547925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35026	NC_021192	CGT	2	6	3548013	3548018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35027	NC_021192	CGG	4	12	3548152	3548163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35028	NC_021192	TCC	2	6	3548210	3548215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35029	NC_021192	CCAG	2	8	3548272	3548279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35030	NC_021192	CGT	2	6	3548288	3548293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35031	NC_021192	AATCG	2	10	3548424	3548433	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35032	NC_021192	CG	3	6	3548432	3548437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35033	NC_021192	CGA	2	6	3548522	3548527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35034	NC_021192	CGG	3	9	3548546	3548554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35035	NC_021192	CCG	2	6	3548583	3548588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35036	NC_021192	CG	3	6	3548607	3548612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35037	NC_021192	ATG	2	6	3548652	3548657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35038	NC_021192	GGC	2	6	3548662	3548667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35039	NC_021192	GGC	2	6	3548718	3548723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35040	NC_021192	CTC	2	6	3548745	3548750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35041	NC_021192	CTG	2	6	3548768	3548773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35042	NC_021192	CGT	2	6	3548776	3548781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35043	NC_021192	CGT	2	6	3548905	3548910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35044	NC_021192	CTG	2	6	3548930	3548935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35045	NC_021192	CAT	2	6	3548936	3548941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35046	NC_021192	CGGC	2	8	3549469	3549476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35047	NC_021192	CG	3	6	3549501	3549506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35048	NC_021192	CAC	2	6	3549534	3549539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35049	NC_021192	GCC	2	6	3549571	3549576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35050	NC_021192	ACC	3	9	3549616	3549624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35051	NC_021192	GC	3	6	3549658	3549663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35052	NC_021192	GTTT	2	8	3549697	3549704	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35053	NC_021192	CGG	2	6	3549727	3549732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35054	NC_021192	GCA	2	6	3549803	3549808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35055	NC_021192	ACTCG	2	10	3549814	3549823	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35056	NC_021192	CGG	2	6	3549830	3549835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35057	NC_021192	GC	3	6	3549891	3549896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35058	NC_021192	CAA	2	6	3549911	3549916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35059	NC_021192	CGC	2	6	3549924	3549929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35060	NC_021192	GTA	2	6	3549944	3549949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35061	NC_021192	CG	3	6	3549966	3549971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35062	NC_021192	TGA	2	6	3550024	3550029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35063	NC_021192	CAGCG	2	10	3550045	3550054	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35064	NC_021192	CGA	2	6	3550136	3550141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35065	NC_021192	TCG	2	6	3550180	3550185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35066	NC_021192	CGGG	2	8	3550226	3550233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35067	NC_021192	TTC	2	6	3550391	3550396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35069	NC_021192	TCG	2	6	3550834	3550839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35070	NC_021192	GTC	2	6	3550860	3550865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35071	NC_021192	TTC	2	6	3550887	3550892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35072	NC_021192	CG	3	6	3550931	3550936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35073	NC_021192	CACCC	2	10	3551428	3551437	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
35074	NC_021192	GAT	2	6	3552489	3552494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35076	NC_021192	CGG	2	6	3552534	3552539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35077	NC_021192	ATGGC	2	10	3552548	3552557	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35078	NC_021192	TAG	2	6	3552565	3552570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35079	NC_021192	CTG	2	6	3552595	3552600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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35081	NC_021192	GC	3	6	3552739	3552744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35082	NC_021192	GCT	2	6	3553004	3553009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35083	NC_021192	CGG	2	6	3553120	3553125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35084	NC_021192	CCG	2	6	3553138	3553143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35085	NC_021192	GAC	2	6	3553155	3553160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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35088	NC_021192	GCT	2	6	3553277	3553282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35089	NC_021192	CAG	2	6	3553293	3553298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35090	NC_021192	GGGC	2	8	3553313	3553320	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35091	NC_021192	CGA	2	6	3553337	3553342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35092	NC_021192	CGA	2	6	3553346	3553351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35093	NC_021192	CCGA	2	8	3553408	3553415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35094	NC_021192	TGT	2	6	3553423	3553428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35095	NC_021192	ATC	2	6	3553452	3553457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35098	NC_021192	CGG	2	6	3554163	3554168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35099	NC_021192	CAG	2	6	3554205	3554210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35100	NC_021192	GCG	2	6	3554222	3554227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35101	NC_021192	TGT	2	6	3554277	3554282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35102	NC_021192	CGT	2	6	3554323	3554328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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35105	NC_021192	CGC	2	6	3554367	3554372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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35107	NC_021192	TGC	2	6	3557427	3557432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35108	NC_021192	CGC	3	9	3557485	3557493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35109	NC_021192	CTG	2	6	3557543	3557548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35110	NC_021192	GCC	2	6	3557549	3557554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35111	NC_021192	GTG	2	6	3557576	3557581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35112	NC_021192	CG	4	8	3557584	3557591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35113	NC_021192	CCG	2	6	3557604	3557609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35114	NC_021192	CG	3	6	3557623	3557628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35115	NC_021192	GTC	2	6	3557648	3557653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35116	NC_021192	CCGAC	2	10	3557655	3557664	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
35117	NC_021192	TCG	2	6	3557679	3557684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35118	NC_021192	ACCTC	2	10	3557685	3557694	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
35119	NC_021192	ACG	2	6	3557703	3557708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35120	NC_021192	CGC	2	6	3557806	3557811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35121	NC_021192	CGC	2	6	3557827	3557832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35122	NC_021192	GTC	2	6	3557885	3557890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35123	NC_021192	CCCAG	2	10	3557938	3557947	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
35124	NC_021192	ACCGC	2	10	3557958	3557967	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
35125	NC_021192	CCGG	2	8	3557997	3558004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35126	NC_021192	CGA	2	6	3558018	3558023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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35255	NC_021192	CGG	2	6	3570084	3570089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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35263	NC_021192	CG	3	6	3570507	3570512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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35377	NC_021192	G	6	6	3596696	3596701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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