MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 42850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_021192	CGC	2	6	3456523	3456528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34002	NC_021192	TG	4	8	3456544	3456551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34003	NC_021192	CGGG	2	8	3456609	3456616	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34004	NC_021192	GGC	2	6	3456626	3456631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34005	NC_021192	GAG	2	6	3456643	3456648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34006	NC_021192	GC	3	6	3456660	3456665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34007	NC_021192	GCCC	2	8	3456740	3456747	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34008	NC_021192	CGG	2	6	3456756	3456761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34009	NC_021192	CGGC	2	8	3456774	3456781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34010	NC_021192	A	6	6	3456794	3456799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34011	NC_021192	CGG	2	6	3456821	3456826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34012	NC_021192	CCG	2	6	3456833	3456838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34013	NC_021192	CGGT	2	8	3456863	3456870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34014	NC_021192	CTC	2	6	3456941	3456946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34015	NC_021192	GCT	2	6	3456947	3456952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34016	NC_021192	AGC	2	6	3456955	3456960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34017	NC_021192	TCG	2	6	3457027	3457032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34018	NC_021192	CAA	2	6	3457313	3457318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34019	NC_021192	GCA	2	6	3457327	3457332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34020	NC_021192	CCG	2	6	3457384	3457389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34021	NC_021192	GAGAT	2	10	3457426	3457435	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34022	NC_021192	CAC	2	6	3457457	3457462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34023	NC_021192	TCCAG	2	10	3459450	3459459	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34024	NC_021192	CGC	2	6	3459534	3459539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34025	NC_021192	ACG	2	6	3459545	3459550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34027	NC_021192	GCC	2	6	3459595	3459600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34028	NC_021192	CG	3	6	3459627	3459632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34029	NC_021192	GCC	2	6	3459643	3459648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34030	NC_021192	ACC	2	6	3459677	3459682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34031	NC_021192	GCA	2	6	3459700	3459705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34032	NC_021192	CATCGA	2	12	3459708	3459719	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34033	NC_021192	GTC	2	6	3459742	3459747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34034	NC_021192	ACG	2	6	3459770	3459775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34035	NC_021192	GCC	2	6	3459819	3459824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34036	NC_021192	AAC	2	6	3459828	3459833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34037	NC_021192	GC	3	6	3459860	3459865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34038	NC_021192	GCC	2	6	3459926	3459931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34039	NC_021192	GAAT	2	8	3459973	3459980	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34040	NC_021192	AAC	2	6	3460026	3460031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34041	NC_021192	ATG	2	6	3460045	3460050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34042	NC_021192	GGCA	2	8	3460052	3460059	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34043	NC_021192	TGCAC	2	10	3460112	3460121	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34044	NC_021192	GAGCGG	2	12	3460148	3460159	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34045	NC_021192	GAT	2	6	3460167	3460172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34046	NC_021192	GCTCA	2	10	3460234	3460243	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34047	NC_021192	GCA	2	6	3460250	3460255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34048	NC_021192	CAGC	2	8	3460452	3460459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34049	NC_021192	ACT	2	6	3460495	3460500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34050	NC_021192	CCGG	2	8	3460550	3460557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34051	NC_021192	ATC	2	6	3460564	3460569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34052	NC_021192	G	6	6	3461234	3461239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34053	NC_021192	CCG	2	6	3461280	3461285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34054	NC_021192	GCA	2	6	3461289	3461294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34055	NC_021192	GGC	2	6	3461313	3461318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34056	NC_021192	GGTT	2	8	3461396	3461403	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34057	NC_021192	GCT	2	6	3461470	3461475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34058	NC_021192	GAG	2	6	3461498	3461503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34059	NC_021192	CTG	2	6	3461579	3461584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34060	NC_021192	GCG	2	6	3461623	3461628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34061	NC_021192	CGG	3	9	3461652	3461660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34062	NC_021192	GCT	2	6	3461669	3461674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34063	NC_021192	TGG	2	6	3461694	3461699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34064	NC_021192	CGG	2	6	3461762	3461767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34065	NC_021192	GTA	2	6	3461778	3461783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34066	NC_021192	GGT	2	6	3461803	3461808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34067	NC_021192	TGG	2	6	3461824	3461829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34068	NC_021192	TGA	2	6	3461893	3461898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34069	NC_021192	GTT	2	6	3462003	3462008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34072	NC_021192	GTG	2	6	3462182	3462187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34073	NC_021192	TCG	3	9	3462194	3462202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34075	NC_021192	CGAT	2	8	3462247	3462254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34076	NC_021192	CTC	2	6	3462279	3462284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34077	NC_021192	AC	3	6	3462323	3462328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34078	NC_021192	GCA	2	6	3462353	3462358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34082	NC_021192	TGC	2	6	3463883	3463888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34084	NC_021192	CGG	2	6	3463933	3463938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34085	NC_021192	GCCG	2	8	3463949	3463956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34086	NC_021192	CG	3	6	3463979	3463984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34087	NC_021192	TGCC	2	8	3463990	3463997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34088	NC_021192	CGG	2	6	3464002	3464007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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34090	NC_021192	GAG	2	6	3464645	3464650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34091	NC_021192	TCC	2	6	3464672	3464677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34092	NC_021192	CG	3	6	3464716	3464721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34093	NC_021192	TCCA	2	8	3464835	3464842	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34094	NC_021192	GTGGCG	2	12	3464855	3464866	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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34096	NC_021192	TGTGG	2	10	3464952	3464961	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
34097	NC_021192	CAC	2	6	3464967	3464972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34098	NC_021192	CGT	2	6	3464975	3464980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34099	NC_021192	GCTGG	2	10	3464993	3465002	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34100	NC_021192	CCA	2	6	3465052	3465057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34101	NC_021192	C	8	8	3465339	3465346	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34102	NC_021192	GCC	2	6	3465354	3465359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34103	NC_021192	GTCT	2	8	3465407	3465414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34104	NC_021192	GAC	2	6	3465439	3465444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34105	NC_021192	GAC	2	6	3465478	3465483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34106	NC_021192	GC	3	6	3465498	3465503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34107	NC_021192	GCC	2	6	3465511	3465516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34108	NC_021192	TTG	2	6	3465526	3465531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34109	NC_021192	TGC	2	6	3465556	3465561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34110	NC_021192	CGG	2	6	3465627	3465632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34111	NC_021192	TGC	3	9	3465644	3465652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34112	NC_021192	GCA	2	6	3465765	3465770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34113	NC_021192	CGC	2	6	3465810	3465815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34114	NC_021192	TCG	2	6	3465866	3465871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34115	NC_021192	GTC	3	9	3465910	3465918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34116	NC_021192	CAG	2	6	3466498	3466503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34117	NC_021192	GCA	2	6	3466585	3466590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34118	NC_021192	CGCC	2	8	3466594	3466601	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34119	NC_021192	CAA	2	6	3466618	3466623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34120	NC_021192	CAG	2	6	3466658	3466663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34121	NC_021192	GGCA	2	8	3466679	3466686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34122	NC_021192	TCG	2	6	3466692	3466697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34123	NC_021192	GCC	2	6	3466725	3466730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34124	NC_021192	ACA	2	6	3466789	3466794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34125	NC_021192	CTG	2	6	3466847	3466852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34126	NC_021192	CGG	2	6	3466885	3466890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34127	NC_021192	TCG	4	12	3466914	3466925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34128	NC_021192	GTCA	2	8	3466948	3466955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34129	NC_021192	CGG	2	6	3467017	3467022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34130	NC_021192	CGG	2	6	3467029	3467034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34131	NC_021192	AGC	2	6	3467096	3467101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34132	NC_021192	CCG	2	6	3467137	3467142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34133	NC_021192	TCG	2	6	3467153	3467158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34134	NC_021192	TGC	2	6	3467188	3467193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34146	NC_021192	CCCA	2	8	3471103	3471110	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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34155	NC_021192	TCCCA	2	10	3471454	3471463	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
34156	NC_021192	CTG	2	6	3471480	3471485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34159	NC_021192	ACG	2	6	3471587	3471592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34160	NC_021192	CCGGC	2	10	3471753	3471762	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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34164	NC_021192	GTCG	2	8	3471909	3471916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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34166	NC_021192	CGG	2	6	3471943	3471948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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34243	NC_021192	CGGCG	2	10	3480011	3480020	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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34247	NC_021192	GAA	2	6	3480241	3480246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34248	NC_021192	CGG	2	6	3480255	3480260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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34252	NC_021192	GGCA	2	8	3480425	3480432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34253	NC_021192	TGA	2	6	3480437	3480442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34254	NC_021192	CGGGC	2	10	3480449	3480458	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34255	NC_021192	AGA	2	6	3480463	3480468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34256	NC_021192	GT	3	6	3480532	3480537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34257	NC_021192	CAA	2	6	3480560	3480565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34262	NC_021192	GCT	2	6	3481829	3481834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34265	NC_021192	CCG	2	6	3482893	3482898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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34273	NC_021192	GCG	2	6	3483164	3483169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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34282	NC_021192	GGCC	2	8	3484175	3484182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34283	NC_021192	CAA	2	6	3484203	3484208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34287	NC_021192	TCG	2	6	3484435	3484440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34312	NC_021192	GCC	2	6	3487114	3487119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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34359	NC_021192	CTCA	2	8	3491354	3491361	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34360	NC_021192	TGA	2	6	3491719	3491724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34361	NC_021192	GAT	2	6	3491732	3491737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34362	NC_021192	GGTG	2	8	3491780	3491787	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34363	NC_021192	CCA	2	6	3491863	3491868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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34370	NC_021192	CTGG	2	8	3492258	3492265	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34371	NC_021192	GGGC	2	8	3492277	3492284	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34372	NC_021192	ATC	2	6	3492287	3492292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34373	NC_021192	ACC	2	6	3492298	3492303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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