MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 42850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_021192	CGGCGA	2	12	1884808	1884819	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19002	NC_021192	GCG	2	6	1884876	1884881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19003	NC_021192	GTT	2	6	1884894	1884899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19004	NC_021192	TGC	2	6	1884940	1884945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19005	NC_021192	GCG	2	6	1884972	1884977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19006	NC_021192	GCG	2	6	1884991	1884996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19007	NC_021192	AGAA	2	8	1885056	1885063	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19008	NC_021192	GAC	2	6	1885100	1885105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19009	NC_021192	CGAC	2	8	1885139	1885146	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19010	NC_021192	GCG	2	6	1885254	1885259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19011	NC_021192	CAG	3	9	1885261	1885269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19012	NC_021192	CGA	2	6	1885335	1885340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19013	NC_021192	CAG	2	6	1885387	1885392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19014	NC_021192	GC	3	6	1885417	1885422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19015	NC_021192	GAA	2	6	1885460	1885465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19016	NC_021192	GCC	2	6	1885466	1885471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19017	NC_021192	GC	3	6	1885493	1885498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19018	NC_021192	GC	3	6	1885513	1885518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19019	NC_021192	GCC	2	6	1885536	1885541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19020	NC_021192	CA	3	6	1885545	1885550	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19021	NC_021192	GAC	2	6	1885562	1885567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19022	NC_021192	GC	3	6	1885595	1885600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19023	NC_021192	CGC	2	6	1885604	1885609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19024	NC_021192	GAA	2	6	1885643	1885648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19025	NC_021192	CGG	3	9	1885654	1885662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19026	NC_021192	ACA	2	6	1885753	1885758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19027	NC_021192	CAG	2	6	1885763	1885768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19028	NC_021192	GC	3	6	1885781	1885786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19029	NC_021192	CAT	2	6	1885868	1885873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19030	NC_021192	GCCC	2	8	1886015	1886022	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19031	NC_021192	TGG	2	6	1886027	1886032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19032	NC_021192	TCG	2	6	1886113	1886118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19033	NC_021192	AGG	2	6	1886122	1886127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19034	NC_021192	CCG	2	6	1886131	1886136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19035	NC_021192	CCCAG	2	10	1886145	1886154	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19036	NC_021192	CGA	2	6	1886155	1886160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19037	NC_021192	CAG	2	6	1886172	1886177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19038	NC_021192	TGC	2	6	1886338	1886343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19039	NC_021192	TCG	2	6	1886359	1886364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19040	NC_021192	CGT	2	6	1886365	1886370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19041	NC_021192	CGA	2	6	1886437	1886442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19042	NC_021192	CATCGA	2	12	1886470	1886481	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19043	NC_021192	CGGG	2	8	1886531	1886538	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19044	NC_021192	CGC	2	6	1886603	1886608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19045	NC_021192	ACA	2	6	1886632	1886637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19046	NC_021192	CAC	2	6	1886739	1886744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19047	NC_021192	ATCG	2	8	1886774	1886781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19048	NC_021192	TCG	2	6	1886812	1886817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19049	NC_021192	AAC	2	6	1886894	1886899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19050	NC_021192	CCG	2	6	1886930	1886935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19051	NC_021192	CGG	2	6	1886942	1886947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19052	NC_021192	GCA	2	6	1887013	1887018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19053	NC_021192	CGA	2	6	1887021	1887026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19054	NC_021192	TCG	2	6	1887067	1887072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19055	NC_021192	CGG	2	6	1887104	1887109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19056	NC_021192	GGCC	2	8	1887120	1887127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19057	NC_021192	CGG	2	6	1887152	1887157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19058	NC_021192	GTA	2	6	1887213	1887218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19059	NC_021192	CCGA	2	8	1887235	1887242	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19060	NC_021192	GC	3	6	1887265	1887270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19061	NC_021192	CG	3	6	1887273	1887278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19062	NC_021192	CGG	2	6	1887334	1887339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19063	NC_021192	GC	3	6	1887355	1887360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19064	NC_021192	CAA	2	6	1887369	1887374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19065	NC_021192	CAG	2	6	1887446	1887451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19066	NC_021192	CTT	2	6	1887521	1887526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19067	NC_021192	GCC	2	6	1887539	1887544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19068	NC_021192	ATTG	2	8	1887579	1887586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19069	NC_021192	GCT	2	6	1887609	1887614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19070	NC_021192	CGC	2	6	1887622	1887627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19071	NC_021192	CCGCGG	2	12	1887669	1887680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19072	NC_021192	GCGCC	2	10	1887698	1887707	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19073	NC_021192	TCC	2	6	1887726	1887731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19074	NC_021192	ACC	2	6	1887756	1887761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19075	NC_021192	GC	3	6	1887787	1887792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19076	NC_021192	TTG	2	6	1887960	1887965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19077	NC_021192	GCGCT	2	10	1887974	1887983	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19078	NC_021192	GCG	2	6	1887993	1887998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19079	NC_021192	TCG	2	6	1888038	1888043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19080	NC_021192	GCGG	2	8	1888072	1888079	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19081	NC_021192	GGGT	2	8	1888157	1888164	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19082	NC_021192	AGC	2	6	1888167	1888172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19083	NC_021192	CAGG	2	8	1888199	1888206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19084	NC_021192	GC	3	6	1888220	1888225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19085	NC_021192	AGC	2	6	1888253	1888258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19086	NC_021192	CAC	2	6	1888297	1888302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19087	NC_021192	GGCGC	2	10	1888303	1888312	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19088	NC_021192	CGAC	2	8	1888478	1888485	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19089	NC_021192	ACCG	2	8	1888577	1888584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19090	NC_021192	CCT	2	6	1888598	1888603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19091	NC_021192	TGC	2	6	1888628	1888633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19092	NC_021192	GC	3	6	1888643	1888648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19093	NC_021192	TGCG	2	8	1888655	1888662	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19094	NC_021192	TCGA	2	8	1888691	1888698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19095	NC_021192	GGTAT	2	10	1888780	1888789	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19096	NC_021192	AC	3	6	1888890	1888895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19097	NC_021192	CGG	2	6	1888905	1888910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19098	NC_021192	CACCTG	2	12	1888932	1888943	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19099	NC_021192	GGT	2	6	1888993	1888998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19100	NC_021192	T	6	6	1889000	1889005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19101	NC_021192	CGG	2	6	1889010	1889015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19102	NC_021192	CGC	2	6	1889271	1889276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19103	NC_021192	CGA	2	6	1889298	1889303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19104	NC_021192	CGCT	2	8	1889338	1889345	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19105	NC_021192	CGG	2	6	1889490	1889495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19106	NC_021192	CTG	2	6	1889567	1889572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19107	NC_021192	CGC	2	6	1889650	1889655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19108	NC_021192	TCG	2	6	1889676	1889681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19109	NC_021192	GGCC	2	8	1889686	1889693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19110	NC_021192	CAA	2	6	1889725	1889730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19111	NC_021192	GCTG	2	8	1889755	1889762	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19112	NC_021192	CAG	2	6	1889802	1889807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19113	NC_021192	CGTT	2	8	1889818	1889825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19114	NC_021192	ACGTCG	2	12	1889839	1889850	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19115	NC_021192	ACGCC	2	10	1889914	1889923	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19116	NC_021192	CGA	2	6	1889966	1889971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19117	NC_021192	TGT	3	9	1890038	1890046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19118	NC_021192	CGC	2	6	1890056	1890061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19119	NC_021192	CGG	2	6	1890069	1890074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19120	NC_021192	GCC	2	6	1890143	1890148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19121	NC_021192	CGGC	2	8	1890164	1890171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19122	NC_021192	TGC	2	6	1890250	1890255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19123	NC_021192	G	6	6	1890277	1890282	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19124	NC_021192	TGT	2	6	1890283	1890288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19125	NC_021192	TGC	3	9	1890310	1890318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19126	NC_021192	GATCGG	2	12	1890350	1890361	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19127	NC_021192	GTCG	2	8	1890365	1890372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19128	NC_021192	TGC	2	6	1890427	1890432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19129	NC_021192	CGT	2	6	1890443	1890448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19130	NC_021192	CGC	2	6	1890476	1890481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19131	NC_021192	GC	3	6	1890494	1890499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19132	NC_021192	CGC	3	9	1890497	1890505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19133	NC_021192	CGG	2	6	1890526	1890531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19134	NC_021192	GCT	2	6	1890539	1890544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19135	NC_021192	GAT	2	6	1890606	1890611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19136	NC_021192	GCG	2	6	1890670	1890675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19137	NC_021192	GATCGC	2	12	1890686	1890697	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19138	NC_021192	GGC	2	6	1890710	1890715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19139	NC_021192	CGG	2	6	1890751	1890756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19140	NC_021192	GCC	2	6	1890768	1890773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19141	NC_021192	GCC	2	6	1890777	1890782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19142	NC_021192	AACCG	2	10	1892034	1892043	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19143	NC_021192	TCG	2	6	1892045	1892050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19144	NC_021192	AC	3	6	1892066	1892071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19145	NC_021192	CG	3	6	1892165	1892170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19146	NC_021192	TGC	2	6	1892244	1892249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19147	NC_021192	CGG	2	6	1892254	1892259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19148	NC_021192	ACC	2	6	1892303	1892308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19151	NC_021192	CGGG	2	8	1892429	1892436	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19152	NC_021192	GGC	2	6	1892554	1892559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19153	NC_021192	CCG	2	6	1892678	1892683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19157	NC_021192	GC	3	6	1892970	1892975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19158	NC_021192	TGG	2	6	1893005	1893010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19159	NC_021192	TGC	2	6	1893109	1893114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19162	NC_021192	GCGGA	2	10	1893166	1893175	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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19164	NC_021192	GCG	2	6	1893196	1893201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19171	NC_021192	CCTA	2	8	1893356	1893363	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19178	NC_021192	GCC	2	6	1893796	1893801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19195	NC_021192	CGA	2	6	1894702	1894707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19196	NC_021192	CAGC	2	8	1894756	1894763	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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19243	NC_021192	TGA	2	6	1900479	1900484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19244	NC_021192	TGA	2	6	1900535	1900540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19245	NC_021192	GCT	2	6	1900584	1900589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19247	NC_021192	TCGAGG	2	12	1900634	1900645	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19248	NC_021192	CGC	2	6	1900680	1900685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19249	NC_021192	ACG	2	6	1900718	1900723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19250	NC_021192	GGC	2	6	1900742	1900747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19251	NC_021192	GCC	3	9	1900834	1900842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19253	NC_021192	GC	3	6	1900906	1900911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19254	NC_021192	CG	3	6	1901033	1901038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19255	NC_021192	GTCA	2	8	1901044	1901051	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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