MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 42850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021192	TCG	2	6	1815371	1815376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18002	NC_021192	GAT	2	6	1815388	1815393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18003	NC_021192	CAG	2	6	1815448	1815453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18004	NC_021192	CCT	2	6	1815489	1815494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18005	NC_021192	GC	4	8	1815495	1815502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18006	NC_021192	GGC	2	6	1815591	1815596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18007	NC_021192	CGGG	2	8	1815610	1815617	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18008	NC_021192	CGG	2	6	1815646	1815651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18009	NC_021192	CCG	2	6	1815655	1815660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18010	NC_021192	GT	3	6	1815681	1815686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_021192	ACC	2	6	1815705	1815710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18012	NC_021192	CGG	2	6	1815715	1815720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_021192	AAG	3	9	1815726	1815734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18014	NC_021192	CCA	2	6	1815812	1815817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18015	NC_021192	CCCCGG	2	12	1815896	1815907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18016	NC_021192	GCC	2	6	1815980	1815985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18017	NC_021192	GGGCC	2	10	1816015	1816024	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18018	NC_021192	CGT	2	6	1816055	1816060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18019	NC_021192	GCT	2	6	1816073	1816078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18020	NC_021192	GCC	2	6	1816103	1816108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18021	NC_021192	TCT	2	6	1817351	1817356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18022	NC_021192	CGG	2	6	1817430	1817435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18023	NC_021192	GCC	2	6	1817512	1817517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18024	NC_021192	AGC	2	6	1817603	1817608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18025	NC_021192	ACC	2	6	1817624	1817629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18026	NC_021192	CGT	2	6	1817643	1817648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18027	NC_021192	GC	3	6	1817762	1817767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18028	NC_021192	CAG	2	6	1817768	1817773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18029	NC_021192	TCG	2	6	1817791	1817796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18030	NC_021192	ACGT	2	8	1818602	1818609	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18031	NC_021192	GCC	2	6	1818628	1818633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18032	NC_021192	GGT	2	6	1818661	1818666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18033	NC_021192	CCAT	2	8	1818670	1818677	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18034	NC_021192	TTC	2	6	1818688	1818693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18035	NC_021192	TCG	2	6	1819087	1819092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18036	NC_021192	CGA	2	6	1819098	1819103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18037	NC_021192	AAG	2	6	1819130	1819135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18038	NC_021192	CGA	2	6	1819185	1819190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18039	NC_021192	TGG	2	6	1819241	1819246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_021192	CGT	2	6	1819347	1819352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18041	NC_021192	CGC	2	6	1819392	1819397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18042	NC_021192	GCG	2	6	1819403	1819408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18043	NC_021192	CCG	2	6	1819454	1819459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18044	NC_021192	TGG	2	6	1819496	1819501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18045	NC_021192	GTG	2	6	1819561	1819566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18046	NC_021192	CGA	2	6	1819671	1819676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18047	NC_021192	GTT	2	6	1819704	1819709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18048	NC_021192	CGA	2	6	1819743	1819748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18049	NC_021192	GCG	3	9	1819763	1819771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18050	NC_021192	GGT	2	6	1819842	1819847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18051	NC_021192	CGC	3	9	1819891	1819899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18052	NC_021192	CGA	3	9	1819942	1819950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18053	NC_021192	CGC	2	6	1819951	1819956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18054	NC_021192	GGC	2	6	1819960	1819965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18055	NC_021192	GGC	2	6	1820011	1820016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18056	NC_021192	GGC	2	6	1820077	1820082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18057	NC_021192	GCAGC	2	10	1820101	1820110	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18058	NC_021192	CGA	2	6	1820119	1820124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18059	NC_021192	TGCG	2	8	1820154	1820161	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18060	NC_021192	GCA	3	9	1820170	1820178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18061	NC_021192	GAC	2	6	1820198	1820203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18062	NC_021192	GCA	2	6	1821051	1821056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18063	NC_021192	CGG	2	6	1821114	1821119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18064	NC_021192	CGC	2	6	1821188	1821193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18065	NC_021192	CAG	2	6	1821211	1821216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18066	NC_021192	GCC	2	6	1821236	1821241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18067	NC_021192	GCGG	2	8	1821244	1821251	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18068	NC_021192	CAT	2	6	1821286	1821291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18069	NC_021192	TGC	3	9	1821351	1821359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18070	NC_021192	ACG	2	6	1821366	1821371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18071	NC_021192	GCT	2	6	1821373	1821378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18072	NC_021192	GCG	2	6	1821438	1821443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18073	NC_021192	CGG	2	6	1821501	1821506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18074	NC_021192	CAA	2	6	1821668	1821673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18075	NC_021192	CGC	2	6	1821695	1821700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18076	NC_021192	CGC	2	6	1821740	1821745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18077	NC_021192	TCG	2	6	1821784	1821789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18078	NC_021192	CTC	2	6	1821825	1821830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18079	NC_021192	CCCG	2	8	1821858	1821865	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18080	NC_021192	ACG	2	6	1821883	1821888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18081	NC_021192	AGG	2	6	1821946	1821951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18082	NC_021192	CG	3	6	1821984	1821989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18083	NC_021192	GTC	2	6	1822065	1822070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18084	NC_021192	TGG	2	6	1822123	1822128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18086	NC_021192	CAA	2	6	1822208	1822213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18087	NC_021192	GTG	2	6	1822215	1822220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18088	NC_021192	CTGG	2	8	1822235	1822242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18089	NC_021192	GTGTC	2	10	1822309	1822318	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18090	NC_021192	TCG	2	6	1822342	1822347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18091	NC_021192	CGG	2	6	1822352	1822357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18092	NC_021192	ACC	2	6	1822405	1822410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18093	NC_021192	GGT	2	6	1822418	1822423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18094	NC_021192	GGC	2	6	1822519	1822524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18095	NC_021192	GAG	2	6	1822608	1822613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18096	NC_021192	GGT	2	6	1822676	1822681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18097	NC_021192	CGA	2	6	1822691	1822696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18098	NC_021192	CATCGA	2	12	1822712	1822723	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18099	NC_021192	CAAG	2	8	1822754	1822761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18100	NC_021192	GAG	2	6	1822779	1822784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18101	NC_021192	ACG	2	6	1822819	1822824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18103	NC_021192	GC	3	6	1822898	1822903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18104	NC_021192	GCCGAG	2	12	1822923	1822934	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18105	NC_021192	CGC	3	9	1822973	1822981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18106	NC_021192	GGC	2	6	1822985	1822990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18107	NC_021192	CGCGG	2	10	1822995	1823004	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18108	NC_021192	GTC	2	6	1823012	1823017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18109	NC_021192	GGC	2	6	1823077	1823082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18110	NC_021192	TGC	2	6	1823140	1823145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18111	NC_021192	CGT	2	6	1823175	1823180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18112	NC_021192	ACG	2	6	1823189	1823194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18113	NC_021192	GCG	2	6	1823205	1823210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18114	NC_021192	GGC	2	6	1823341	1823346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18115	NC_021192	CG	3	6	1823370	1823375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18116	NC_021192	ATC	2	6	1823426	1823431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18117	NC_021192	GCG	2	6	1823432	1823437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18118	NC_021192	CTG	2	6	1823474	1823479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18119	NC_021192	TGG	4	12	1823511	1823522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18120	NC_021192	CAG	2	6	1823621	1823626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18121	NC_021192	CGT	2	6	1823627	1823632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18122	NC_021192	CTGG	2	8	1823647	1823654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18123	NC_021192	GCG	2	6	1823683	1823688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18124	NC_021192	CG	3	6	1823709	1823714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18125	NC_021192	GC	5	10	1823753	1823762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18126	NC_021192	CGG	2	6	1823778	1823783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18127	NC_021192	GGCGC	2	10	1823801	1823810	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18128	NC_021192	CCG	2	6	1823875	1823880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18129	NC_021192	CGA	2	6	1823954	1823959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18130	NC_021192	GCC	2	6	1823979	1823984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18131	NC_021192	GCA	2	6	1824036	1824041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18132	NC_021192	CGG	2	6	1824102	1824107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18133	NC_021192	CCAA	2	8	1824155	1824162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18134	NC_021192	CTG	2	6	1824172	1824177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18135	NC_021192	TCG	2	6	1824179	1824184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18136	NC_021192	CTGG	2	8	1824186	1824193	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18137	NC_021192	GA	3	6	1824210	1824215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18138	NC_021192	GC	3	6	1824249	1824254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18139	NC_021192	CG	3	6	1824267	1824272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18140	NC_021192	ATCG	2	8	1824389	1824396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18141	NC_021192	GGCGCC	2	12	1824453	1824464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18142	NC_021192	CG	3	6	1824500	1824505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18143	NC_021192	TGG	2	6	1824543	1824548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18144	NC_021192	CCAG	2	8	1824549	1824556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18145	NC_021192	CGT	2	6	1824660	1824665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18146	NC_021192	AGT	2	6	1824666	1824671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18148	NC_021192	GT	3	6	1824758	1824763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18149	NC_021192	TAG	2	6	1824781	1824786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18152	NC_021192	CCGC	2	8	1824939	1824946	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18153	NC_021192	TGGG	2	8	1825002	1825009	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18154	NC_021192	TGG	2	6	1825068	1825073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18155	NC_021192	CGC	2	6	1825089	1825094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18156	NC_021192	GT	3	6	1825098	1825103	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18157	NC_021192	GGT	2	6	1825153	1825158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18158	NC_021192	CG	3	6	1825175	1825180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18159	NC_021192	GAG	2	6	1825184	1825189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18160	NC_021192	GC	3	6	1825195	1825200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18161	NC_021192	CGG	2	6	1825201	1825206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18162	NC_021192	GGT	2	6	1825216	1825221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18163	NC_021192	CCGG	2	8	1825235	1825242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18164	NC_021192	GCCG	2	8	1825249	1825256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18165	NC_021192	CGA	2	6	1825261	1825266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18166	NC_021192	GCG	2	6	1825273	1825278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18172	NC_021192	CGAA	2	8	1825419	1825426	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18173	NC_021192	GA	3	6	1825431	1825436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18174	NC_021192	TAC	2	6	1825472	1825477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18178	NC_021192	CGT	2	6	1825595	1825600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18180	NC_021192	CG	3	6	1825701	1825706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18181	NC_021192	GCT	2	6	1825711	1825716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18182	NC_021192	G	7	7	1825777	1825783	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18183	NC_021192	ATC	2	6	1825797	1825802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18185	NC_021192	TTC	2	6	1825836	1825841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18186	NC_021192	CGA	2	6	1825844	1825849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18187	NC_021192	GAA	2	6	1825983	1825988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18188	NC_021192	GCT	2	6	1826026	1826031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18191	NC_021192	CCG	2	6	1827001	1827006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18202	NC_021192	CGCGC	2	10	1829298	1829307	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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18224	NC_021192	GCTG	2	8	1833083	1833090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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18237	NC_021192	CGT	2	6	1833670	1833675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18238	NC_021192	CGT	2	6	1833684	1833689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18239	NC_021192	CGGC	2	8	1833849	1833856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18240	NC_021192	GT	3	6	1833956	1833961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18241	NC_021192	CGC	2	6	1833984	1833989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18247	NC_021192	CGT	2	6	1834448	1834453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18248	NC_021192	ATC	2	6	1834525	1834530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18249	NC_021192	CGG	3	9	1834554	1834562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18250	NC_021192	GGA	2	6	1834587	1834592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18251	NC_021192	GTC	2	6	1834639	1834644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18253	NC_021192	GCC	2	6	1834660	1834665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18257	NC_021192	CGG	2	6	1834842	1834847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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