MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 42850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_021192	GC	3	6	1594818	1594823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16002	NC_021192	CGC	2	6	1594854	1594859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16003	NC_021192	GGT	2	6	1594860	1594865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_021192	CGG	2	6	1594877	1594882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16005	NC_021192	CGG	2	6	1595515	1595520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_021192	CCG	2	6	1595551	1595556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16007	NC_021192	GCA	2	6	1596167	1596172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_021192	ACT	2	6	1596199	1596204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16009	NC_021192	GCA	2	6	1596326	1596331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16010	NC_021192	CGT	2	6	1597036	1597041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16011	NC_021192	CGGC	2	8	1597086	1597093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16012	NC_021192	GCA	2	6	1597134	1597139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_021192	TGG	2	6	1597154	1597159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_021192	GCC	2	6	1597222	1597227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16015	NC_021192	CTG	2	6	1597285	1597290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_021192	GGC	2	6	1597317	1597322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16017	NC_021192	GC	3	6	1597321	1597326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16018	NC_021192	GAA	2	6	1597391	1597396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_021192	CAGGA	2	10	1597445	1597454	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16020	NC_021192	GCC	2	6	1597461	1597466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16021	NC_021192	CGC	2	6	1597631	1597636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16022	NC_021192	ATC	2	6	1597647	1597652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16023	NC_021192	GGGC	2	8	1597670	1597677	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16024	NC_021192	TGG	2	6	1597695	1597700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_021192	CTGC	2	8	1597848	1597855	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16026	NC_021192	CGT	2	6	1597898	1597903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16027	NC_021192	CGG	2	6	1597934	1597939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16028	NC_021192	TGT	2	6	1597951	1597956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_021192	G	6	6	1597976	1597981	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_021192	CCG	3	9	1597993	1598001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16031	NC_021192	CGA	2	6	1598038	1598043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_021192	TCG	2	6	1598044	1598049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16033	NC_021192	TCTT	2	8	1598083	1598090	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16034	NC_021192	GCC	2	6	1598091	1598096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16035	NC_021192	ACT	2	6	1598107	1598112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_021192	GTC	2	6	1599124	1599129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16037	NC_021192	GCC	2	6	1599148	1599153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16038	NC_021192	TCACG	2	10	1599188	1599197	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16039	NC_021192	GAC	2	6	1599226	1599231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16040	NC_021192	GTC	3	9	1599236	1599244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_021192	GC	3	6	1599317	1599322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16042	NC_021192	CGG	2	6	1599331	1599336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_021192	GCG	2	6	1599428	1599433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16044	NC_021192	TCGA	2	8	1599526	1599533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16045	NC_021192	CCG	3	9	1599539	1599547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16046	NC_021192	GC	3	6	1599576	1599581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16047	NC_021192	CGC	2	6	1599594	1599599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16048	NC_021192	CTG	2	6	1599625	1599630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16049	NC_021192	CG	4	8	1599683	1599690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16050	NC_021192	GC	4	8	1599736	1599743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16051	NC_021192	GTT	2	6	1599744	1599749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_021192	CGG	2	6	1599750	1599755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16053	NC_021192	CGC	2	6	1599756	1599761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16054	NC_021192	TGA	2	6	1599812	1599817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_021192	CGG	2	6	1599909	1599914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_021192	GCC	2	6	1599944	1599949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16057	NC_021192	TCG	2	6	1600069	1600074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16058	NC_021192	GC	3	6	1600134	1600139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16059	NC_021192	CGC	2	6	1600193	1600198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16060	NC_021192	TCG	2	6	1600232	1600237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16061	NC_021192	GCA	2	6	1600239	1600244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16062	NC_021192	TCGG	2	8	1600267	1600274	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16063	NC_021192	CCG	3	9	1600334	1600342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16064	NC_021192	CCA	2	6	1600409	1600414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16065	NC_021192	CGG	2	6	1600458	1600463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_021192	CCGC	2	8	1600489	1600496	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16067	NC_021192	TG	3	6	1600584	1600589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_021192	CGC	2	6	1600597	1600602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16069	NC_021192	TCG	2	6	1600649	1600654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16070	NC_021192	GC	3	6	1600726	1600731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16071	NC_021192	GCGG	2	8	1600805	1600812	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16072	NC_021192	CGT	2	6	1600832	1600837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16073	NC_021192	GCCG	2	8	1600865	1600872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16074	NC_021192	TGG	2	6	1600882	1600887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_021192	CGTCG	2	10	1600913	1600922	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16076	NC_021192	GGT	2	6	1600942	1600947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16077	NC_021192	GTG	3	9	1600964	1600972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_021192	TAAC	2	8	1600989	1600996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16079	NC_021192	GC	3	6	1601020	1601025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16080	NC_021192	ATG	2	6	1601828	1601833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_021192	CCAG	2	8	1601864	1601871	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16082	NC_021192	AGC	2	6	1602243	1602248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16083	NC_021192	AAC	2	6	1602253	1602258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16084	NC_021192	CTC	2	6	1602317	1602322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16085	NC_021192	CG	3	6	1602327	1602332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16086	NC_021192	CAAT	2	8	1602345	1602352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16087	NC_021192	CAG	2	6	1602359	1602364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16088	NC_021192	ACC	2	6	1602395	1602400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16089	NC_021192	CGC	2	6	1602437	1602442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16090	NC_021192	TGA	2	6	1603206	1603211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_021192	CCA	2	6	1603212	1603217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16092	NC_021192	CGCGCC	2	12	1603274	1603285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16093	NC_021192	CAC	2	6	1603406	1603411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16094	NC_021192	AGGC	2	8	1603477	1603484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16095	NC_021192	TAC	2	6	1603502	1603507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16096	NC_021192	CGA	2	6	1603585	1603590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16097	NC_021192	GGT	2	6	1603600	1603605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_021192	CGA	2	6	1603769	1603774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16099	NC_021192	CAT	2	6	1603802	1603807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16100	NC_021192	CGACGC	2	12	1603838	1603849	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16101	NC_021192	GGT	3	9	1603853	1603861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_021192	CGGC	2	8	1603946	1603953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16103	NC_021192	GCTG	2	8	1603961	1603968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16104	NC_021192	CGG	2	6	1604015	1604020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16105	NC_021192	CTG	3	9	1604028	1604036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16106	NC_021192	GAC	2	6	1604079	1604084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16107	NC_021192	CGG	2	6	1604085	1604090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_021192	AGC	2	6	1604100	1604105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16109	NC_021192	GTG	2	6	1604155	1604160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_021192	GCAA	2	8	1604165	1604172	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16111	NC_021192	CGA	2	6	1604229	1604234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16112	NC_021192	CGG	2	6	1604292	1604297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_021192	GGC	2	6	1604365	1604370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_021192	TGC	2	6	1604391	1604396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16115	NC_021192	GCT	2	6	1604421	1604426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16116	NC_021192	GAC	2	6	1604431	1604436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16117	NC_021192	GCT	2	6	1604457	1604462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_021192	ACG	2	6	1604474	1604479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16119	NC_021192	GTG	2	6	1605832	1605837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_021192	CGG	2	6	1605862	1605867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_021192	CAG	2	6	1605893	1605898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16122	NC_021192	CGC	2	6	1605996	1606001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16123	NC_021192	AAGG	2	8	1606005	1606012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_021192	CGA	2	6	1606022	1606027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16125	NC_021192	CAG	2	6	1606029	1606034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16127	NC_021192	GGC	2	6	1606083	1606088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16254	NC_021192	CAA	2	6	1610247	1610252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16255	NC_021192	CGCC	2	8	1613479	1613486	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16256	NC_021192	CTG	2	6	1613570	1613575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16257	NC_021192	GCC	2	6	1613615	1613620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16258	NC_021192	GCC	2	6	1613652	1613657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16259	NC_021192	CCAA	2	8	1613676	1613683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16260	NC_021192	CTT	2	6	1613758	1613763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16262	NC_021192	TGG	2	6	1614481	1614486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16265	NC_021192	GCG	2	6	1615203	1615208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16276	NC_021192	TCC	2	6	1615639	1615644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16280	NC_021192	GCC	2	6	1615827	1615832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16283	NC_021192	CCA	2	6	1616036	1616041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16285	NC_021192	CGGC	2	8	1616087	1616094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16286	NC_021192	CTT	2	6	1616100	1616105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16289	NC_021192	TCC	2	6	1616306	1616311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16294	NC_021192	CGGC	2	8	1619681	1619688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16373	NC_021192	GCCC	2	8	1623017	1623024	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16374	NC_021192	CCG	2	6	1623055	1623060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16375	NC_021192	CCAC	2	8	1623064	1623071	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16376	NC_021192	ACC	2	6	1623072	1623077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16377	NC_021192	CGGGC	2	10	1623081	1623090	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16378	NC_021192	CCG	2	6	1623091	1623096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16483	NC_021192	GAGC	2	8	1641222	1641229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16484	NC_021192	CCA	2	6	1641243	1641248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16485	NC_021192	CGC	2	6	1641328	1641333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16496	NC_021192	CAC	2	6	1641759	1641764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16497	NC_021192	GC	3	6	1641766	1641771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16498	NC_021192	GCC	2	6	1641798	1641803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16499	NC_021192	CG	3	6	1641806	1641811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16500	NC_021192	CGT	2	6	1641814	1641819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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