MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 42850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021192	TCGC	2	8	68482	68489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
502	NC_021192	CGA	2	6	68503	68508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_021192	CGGT	2	8	68730	68737	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
504	NC_021192	CGG	2	6	68804	68809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_021192	CTG	2	6	68889	68894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_021192	TGT	2	6	68929	68934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021192	TGG	2	6	69013	69018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021192	TG	3	6	69031	69036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021192	GCC	2	6	69090	69095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_021192	CTG	2	6	69099	69104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_021192	GCT	2	6	69140	69145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_021192	CGC	2	6	69173	69178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_021192	AT	3	6	69194	69199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021192	ATCGG	2	10	69232	69241	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
515	NC_021192	CG	3	6	69292	69297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_021192	CAC	2	6	69314	69319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_021192	CAG	2	6	69378	69383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021192	ATCG	2	8	69420	69427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
519	NC_021192	TCG	2	6	69460	69465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_021192	CAA	2	6	69518	69523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021192	AC	3	6	69524	69529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_021192	GCC	2	6	69558	69563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_021192	CGG	2	6	69583	69588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_021192	AGC	2	6	69691	69696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_021192	CTA	2	6	69704	69709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_021192	CCGCG	2	10	69769	69778	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
527	NC_021192	GT	3	6	69825	69830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021192	CCA	2	6	69864	69869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_021192	ACC	2	6	69974	69979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_021192	GAC	2	6	69980	69985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_021192	GGT	3	9	69997	70005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021192	TCG	2	6	70026	70031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_021192	ACC	2	6	70040	70045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_021192	GCTC	2	8	70074	70081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
535	NC_021192	GGCAA	2	10	70116	70125	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
536	NC_021192	ACG	2	6	70173	70178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_021192	TCGA	2	8	70200	70207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NC_021192	GAC	2	6	70208	70213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_021192	TGC	2	6	70218	70223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_021192	CGA	2	6	70276	70281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_021192	GGA	2	6	70306	70311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021192	CGA	2	6	70354	70359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_021192	TTC	2	6	70370	70375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_021192	ACC	2	6	70376	70381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_021192	CGACC	2	10	70405	70414	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
546	NC_021192	ACG	2	6	70416	70421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_021192	CCG	2	6	70435	70440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_021192	TCG	2	6	70451	70456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_021192	CAG	2	6	70462	70467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_021192	CAA	2	6	70618	70623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_021192	GAT	2	6	70635	70640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021192	CTG	2	6	70672	70677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_021192	CGG	2	6	70731	70736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_021192	GCGT	2	8	70826	70833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
555	NC_021192	CGGGT	2	10	70858	70867	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
556	NC_021192	GGTCG	2	10	70918	70927	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
557	NC_021192	CGG	2	6	70938	70943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_021192	GCC	2	6	70948	70953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_021192	GC	3	6	70955	70960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_021192	CCG	2	6	70963	70968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_021192	CGG	2	6	70974	70979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_021192	CCG	2	6	70987	70992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_021192	CCG	2	6	71023	71028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_021192	GCC	2	6	71029	71034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_021192	C	7	7	71055	71061	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
566	NC_021192	GC	3	6	71100	71105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_021192	GCC	2	6	71137	71142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_021192	GC	3	6	71246	71251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_021192	CGG	2	6	71406	71411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_021192	CGG	2	6	71444	71449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_021192	CGC	2	6	71528	71533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_021192	CCG	2	6	71565	71570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_021192	CGA	2	6	71583	71588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_021192	CGC	2	6	71610	71615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_021192	TGCCT	2	10	71622	71631	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
576	NC_021192	ACG	2	6	71711	71716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_021192	ACG	2	6	72397	72402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_021192	GC	3	6	74664	74669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
579	NC_021192	CGA	2	6	75374	75379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_021192	CGC	2	6	75410	75415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_021192	GCCAA	2	10	75421	75430	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
582	NC_021192	GAC	2	6	76363	76368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_021192	ATC	2	6	77394	77399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_021192	AGC	2	6	78149	78154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_021192	GCAT	2	8	78155	78162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
586	NC_021192	GGC	2	6	78166	78171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_021192	CGA	2	6	78264	78269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_021192	GTA	2	6	78283	78288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021192	TTG	2	6	78317	78322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021192	ATC	2	6	78380	78385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_021192	GCG	2	6	78428	78433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_021192	TCA	2	6	78474	78479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_021192	CGG	2	6	78561	78566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_021192	CGA	2	6	78643	78648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_021192	GCG	2	6	78708	78713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_021192	CAT	2	6	78717	78722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_021192	CGGT	2	8	78751	78758	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
598	NC_021192	CGG	2	6	78787	78792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_021192	GA	3	6	78809	78814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021192	GAG	2	6	78823	78828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021192	AC	3	6	78907	78912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_021192	CGGT	2	8	78936	78943	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
603	NC_021192	CGG	2	6	79029	79034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_021192	GAAC	2	8	79214	79221	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
605	NC_021192	CGGG	2	8	79288	79295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
606	NC_021192	CGG	2	6	79308	79313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_021192	G	6	6	79312	79317	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021192	GGC	2	6	79347	79352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_021192	CG	3	6	79419	79424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_021192	CG	3	6	79426	79431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_021192	CACGA	2	10	79432	79441	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
612	NC_021192	CGC	3	9	79624	79632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_021192	CGC	2	6	79700	79705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_021192	ACC	2	6	79773	79778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_021192	GGC	2	6	79837	79842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_021192	GCA	2	6	79859	79864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_021192	GCACC	2	10	79871	79880	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
618	NC_021192	CCA	2	6	79925	79930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_021192	CGG	2	6	79949	79954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_021192	TCACCT	2	12	79975	79986	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_021192	CCACC	2	10	80064	80073	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
622	NC_021192	ACC	3	9	80101	80109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_021192	GCC	2	6	80243	80248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_021192	TCA	2	6	80252	80257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_021192	ATC	2	6	80260	80265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_021192	TCG	2	6	80369	80374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_021192	GCT	2	6	80386	80391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021192	AAG	2	6	80500	80505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021192	GC	3	6	80536	80541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
630	NC_021192	TCGATC	2	12	80889	80900	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_021192	GT	3	6	80929	80934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021192	TTGC	2	8	81052	81059	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_021192	GGGGT	2	10	81063	81072	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021192	CAC	2	6	81093	81098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_021192	GAT	2	6	81106	81111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021192	GTG	2	6	81200	81205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021192	TCG	2	6	81269	81274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_021192	TAC	2	6	81280	81285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_021192	TGC	2	6	81353	81358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_021192	GAC	2	6	81381	81386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_021192	GGC	2	6	81403	81408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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777	NC_021192	GC	3	6	101677	101682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
778	NC_021192	TCG	2	6	101724	101729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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912	NC_021192	TGC	2	6	115514	115519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
913	NC_021192	CGT	2	6	115523	115528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
914	NC_021192	CGA	2	6	115529	115534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
915	NC_021192	CGAC	2	8	115567	115574	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
916	NC_021192	CCG	2	6	115675	115680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
917	NC_021192	ACGG	2	8	115709	115716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
918	NC_021192	CTG	2	6	115719	115724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
919	NC_021192	TGC	2	6	115767	115772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
920	NC_021192	GGC	2	6	115773	115778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
921	NC_021192	CTGT	2	8	115796	115803	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
922	NC_021192	GCGG	2	8	115809	115816	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
923	NC_021192	CGA	2	6	115820	115825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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925	NC_021192	GCC	2	6	115899	115904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
926	NC_021192	GCCTGG	2	12	115943	115954	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
927	NC_021192	GGC	2	6	115967	115972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
928	NC_021192	GATTT	2	10	115987	115996	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
929	NC_021192	CCG	2	6	116059	116064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
930	NC_021192	ACC	2	6	116084	116089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
931	NC_021192	CCG	2	6	116116	116121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
932	NC_021192	TGC	2	6	116129	116134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
933	NC_021192	C	7	7	116184	116190	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
934	NC_021192	CGG	2	6	116201	116206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
935	NC_021192	GGC	2	6	116214	116219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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938	NC_021192	GAT	2	6	116305	116310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
939	NC_021192	TCGT	2	8	116399	116406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
940	NC_021192	CG	3	6	116439	116444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
941	NC_021192	GC	3	6	116497	116502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
942	NC_021192	TGA	2	6	116545	116550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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944	NC_021192	CGC	2	6	116619	116624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
945	NC_021192	TGC	2	6	116703	116708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
946	NC_021192	TGC	2	6	116712	116717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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948	NC_021192	GCG	2	6	116804	116809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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951	NC_021192	CG	3	6	117061	117066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
952	NC_021192	CTG	2	6	117173	117178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
953	NC_021192	GT	3	6	117180	117185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
954	NC_021192	GGT	2	6	117190	117195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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958	NC_021192	CGC	2	6	117382	117387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
959	NC_021192	CTG	2	6	117404	117409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
960	NC_021192	TGG	2	6	117431	117436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
961	NC_021192	TGG	2	6	117453	117458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
962	NC_021192	GCC	2	6	117467	117472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
963	NC_021192	CTG	2	6	117500	117505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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965	NC_021192	TTG	2	6	117561	117566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
966	NC_021192	GC	3	6	117576	117581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
967	NC_021192	TGG	2	6	117582	117587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
968	NC_021192	TGC	2	6	117631	117636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
969	NC_021192	CCGT	2	8	117655	117662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
970	NC_021192	GCG	2	6	117775	117780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
971	NC_021192	ACG	2	6	117790	117795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
972	NC_021192	TGC	2	6	117860	117865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
973	NC_021192	GTT	2	6	117951	117956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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981	NC_021192	GCC	2	6	118136	118141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
982	NC_021192	CCG	2	6	118144	118149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1000	NC_021192	GCG	2	6	119053	119058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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