MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. Gladysdale MU clone SC5

Total Repeats: 5637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021025	TAA	2	6	55	60	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021025	TGA	2	6	67	72	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021025	TA	3	6	89	94	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021025	AATA	2	8	100	107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021025	TTG	3	9	135	143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021025	TTA	2	6	1385	1390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021025	TAA	2	6	1421	1426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021025	TAGAAA	3	18	1429	1446	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021025	TAGTAA	2	12	1447	1458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021025	TA	3	6	1459	1464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021025	ATT	2	6	1474	1479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021025	ATTTTT	2	12	2662	2673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021025	AAAT	2	8	2675	2682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021025	TA	3	6	4023	4028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021025	ATA	2	6	4050	4055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021025	TAA	3	9	5177	5185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021025	TAA	2	6	5210	5215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021025	A	6	6	5219	5224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021025	GTATT	2	10	5228	5237	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021025	TTG	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021025	AT	3	6	5252	5257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021025	AT	3	6	5261	5266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021025	ATAA	2	8	5275	5282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021025	ATTAT	2	10	5470	5479	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021025	TAT	2	6	5495	5500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021025	A	7	7	9960	9966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021025	T	6	6	9980	9985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021025	ATT	2	6	9986	9991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021025	TAA	2	6	16808	16813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021025	AT	3	6	16823	16828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021025	TTAAAT	2	12	16829	16840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021025	A	7	7	16841	16847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021025	T	8	8	16860	16867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021025	T	6	6	16896	16901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021025	T	7	7	16924	16930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021025	A	7	7	16970	16976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021025	TAT	2	6	18547	18552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021025	T	6	6	18566	18571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021025	AT	3	6	18572	18577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021025	TA	3	6	18581	18586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021025	AT	3	6	18603	18608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021025	GTAA	2	8	18610	18617	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021025	T	7	7	18645	18651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021025	T	6	6	18711	18716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021025	TA	3	6	20379	20384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021025	GA	3	6	20398	20403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021025	TA	3	6	22012	22017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021025	A	7	7	22024	22030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021025	C	7	7	22037	22043	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_021025	GA	3	6	23519	23524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021025	T	7	7	23536	23542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021025	TTA	3	9	25356	25364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021025	ATT	2	6	28191	28196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021025	A	6	6	28202	28207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021025	GCT	2	6	28219	28224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021025	TAT	2	6	28235	28240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021025	TATAT	2	10	28244	28253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021025	TAT	2	6	28257	28262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021025	TAT	2	6	28319	28324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021025	CTTC	2	8	28329	28336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021025	TAT	2	6	28337	28342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021025	AT	3	6	28347	28352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021025	A	6	6	28353	28358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021025	CTA	2	6	28571	28576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021025	TCT	2	6	28579	28584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021025	TTA	2	6	29218	29223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021025	CTT	2	6	29227	29232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021025	ACCT	2	8	29750	29757	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021025	ATTA	2	8	29759	29766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021025	TAT	2	6	29809	29814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021025	AT	3	6	29822	29827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021025	TAT	2	6	29851	29856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021025	AAC	2	6	29910	29915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021025	A	6	6	29921	29926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021025	TTA	2	6	30008	30013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021025	TTA	2	6	30035	30040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021025	A	6	6	30048	30053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021025	T	6	6	30071	30076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021025	TAT	2	6	30083	30088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021025	ATT	2	6	31215	31220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021025	CCT	2	6	31221	31226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_021025	TA	3	6	31287	31292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021025	A	6	6	31292	31297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021025	ATA	2	6	31299	31304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021025	AAT	2	6	31349	31354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021025	A	6	6	31368	31373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021025	TAAT	2	8	31395	31402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021025	TAT	2	6	31403	31408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021025	ATT	2	6	31642	31647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021025	T	6	6	31675	31680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021025	AAT	2	6	31681	31686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021025	ATA	2	6	31705	31710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021025	TAA	2	6	31722	31727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021025	AGAA	2	8	31738	31745	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021025	TAA	2	6	31753	31758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021025	TAAC	2	8	31760	31767	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021025	AGG	2	6	31799	31804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021025	A	6	6	32415	32420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021025	GGT	2	6	32433	32438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021025	AAT	2	6	33502	33507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021025	A	6	6	34396	34401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021025	CTAA	2	8	34408	34415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021025	TA	3	6	34447	34452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021025	TTA	2	6	34460	34465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021025	TA	3	6	34482	34487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021025	AT	4	8	34519	34526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021025	TAT	2	6	34578	34583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021025	TAAA	2	8	34588	34595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021025	A	6	6	37781	37786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021025	TAT	3	9	37815	37823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021025	ATTAT	3	15	37819	37833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021025	TAA	2	6	37874	37879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021025	AAG	2	6	37892	37897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021025	GAA	2	6	37905	37910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021025	T	6	6	43324	43329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021025	TAT	2	6	43333	43338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021025	A	7	7	43341	43347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021025	A	7	7	43368	43374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021025	TAG	2	6	43437	43442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021025	T	6	6	43448	43453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021025	TTTTA	2	10	43467	43476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021025	ATT	2	6	43495	43500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021025	AGA	2	6	43510	43515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021025	TAA	2	6	43537	43542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021025	AAATTT	2	12	43543	43554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021025	TA	3	6	43562	43567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021025	ATG	2	6	43602	43607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021025	TTA	2	6	43642	43647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021025	TTA	2	6	43675	43680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021025	TAAA	2	8	43709	43716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021025	T	6	6	45896	45901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021025	T	7	7	45932	45938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021025	TTA	2	6	45978	45983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021025	A	6	6	45993	45998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021025	T	6	6	46033	46038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021025	T	6	6	46066	46071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021025	TTA	2	6	46123	46128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021025	AAT	2	6	46142	46147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021025	AAG	2	6	46199	46204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021025	AAT	2	6	47139	47144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021025	T	6	6	47523	47528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021025	ATTA	2	8	47535	47542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021025	TAT	2	6	47550	47555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021025	CTT	2	6	47556	47561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021025	CAT	2	6	47565	47570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021025	AAT	2	6	47584	47589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021025	T	6	6	47640	47645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021025	A	7	7	47648	47654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021025	TAT	2	6	47662	47667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021025	ATA	2	6	47689	47694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021025	ACATT	2	10	49374	49383	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_021025	A	6	6	49386	49391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021025	A	7	7	49462	49468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021025	T	6	6	49490	49495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021025	ATA	2	6	51476	51481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_021025	TAATG	2	10	79934	79943	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021025	TAT	2	6	81624	81629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_021025	T	7	7	81664	81670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_021025	A	6	6	81673	81678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_021025	CTT	2	6	81748	81753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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296	NC_021025	T	6	6	81764	81769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_021025	CTTG	2	8	81798	81805	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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299	NC_021025	ATC	2	6	81863	81868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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435	NC_021025	TAAA	2	8	90874	90881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_021025	ATT	2	6	90882	90887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_021025	ATT	2	6	97935	97940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_021025	TTTA	2	8	97954	97961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_021025	AT	3	6	98078	98083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_021025	A	7	7	102601	102607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_021025	T	6	6	102623	102628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_021025	TAA	2	6	102892	102897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_021025	ATT	2	6	102898	102903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_021025	AT	4	8	102906	102913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_021025	ATTT	2	8	102988	102995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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496	NC_021025	A	7	7	111255	111261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_021025	ACAAA	2	10	111271	111280	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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