MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosarcina mazei Tuc01

Total Repeats: 21022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020389	TTTGAT	2	12	21	32	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020389	A	6	6	53	58	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020389	TTCA	2	8	1865	1872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020389	C	6	6	1925	1930	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_020389	A	6	6	1955	1960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020389	GTA	2	6	2020	2025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020389	A	6	6	2035	2040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020389	AAG	2	6	2057	2062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020389	TAA	2	6	2108	2113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020389	AGG	2	6	2117	2122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020389	A	7	7	3845	3851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020389	TAAA	2	8	3879	3886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020389	GA	3	6	3900	3905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020389	T	6	6	3917	3922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020389	GAA	2	6	3936	3941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020389	TG	3	6	3947	3952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020389	TTTA	2	8	3955	3962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020389	ATA	2	6	4038	4043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020389	AAT	2	6	4055	4060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020389	AAGT	2	8	4065	4072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020389	TTA	2	6	4073	4078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020389	AAT	2	6	4088	4093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020389	A	6	6	4118	4123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020389	TCT	2	6	4135	4140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020389	GTTT	2	8	4148	4155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020389	AGG	2	6	5078	5083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020389	TGA	2	6	7603	7608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020389	T	6	6	7614	7619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020389	T	7	7	7623	7629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020389	AT	3	6	8960	8965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020389	TAT	3	9	8963	8971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020389	AGC	3	9	8993	9001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020389	AAG	2	6	9002	9007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020389	TAA	2	6	9035	9040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020389	AAG	2	6	9059	9064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020389	AGG	2	6	9165	9170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020389	CCT	2	6	9173	9178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_020389	TTTA	2	8	9219	9226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020389	GGAA	2	8	9353	9360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020389	AGA	2	6	9435	9440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020389	GCT	2	6	9454	9459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020389	TTCC	2	8	9464	9471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020389	ACAAGC	2	12	9532	9543	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020389	TAT	2	6	9664	9669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020389	TTG	2	6	9957	9962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020389	CAG	2	6	9963	9968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020389	CCG	2	6	9983	9988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_020389	TTC	2	6	10069	10074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020389	GCT	2	6	10101	10106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020389	AGG	2	6	10219	10224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020389	TTC	2	6	10257	10262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020389	ATA	2	6	10361	10366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020389	AAT	2	6	10382	10387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020389	TAT	2	6	10388	10393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020389	AATAA	2	10	10401	10410	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020389	A	7	7	10430	10436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020389	TAG	2	6	10446	10451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020389	A	6	6	11278	11283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020389	CATGG	2	10	11299	11308	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020389	AT	3	6	11338	11343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020389	A	6	6	11393	11398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020389	T	6	6	11463	11468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020389	CTT	2	6	11514	11519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020389	GAA	2	6	11612	11617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020389	GAA	2	6	11638	11643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020389	CAA	2	6	11744	11749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020389	AGT	2	6	11763	11768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020389	ATA	2	6	11786	11791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020389	AAG	2	6	11817	11822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020389	A	6	6	11851	11856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020389	GA	3	6	11872	11877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020389	GGT	2	6	11884	11889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020389	TTA	2	6	12084	12089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020389	GAA	2	6	12104	12109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020389	A	6	6	12512	12517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020389	TGG	2	6	12520	12525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020389	TTA	2	6	12568	12573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020389	CTT	2	6	12583	12588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020389	TTA	2	6	12603	12608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020389	T	6	6	12631	12636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020389	TAT	2	6	12663	12668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020389	T	6	6	12668	12673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020389	ATG	2	6	12701	12706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020389	TTC	2	6	12795	12800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020389	AGAA	2	8	12825	12832	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020389	ATC	2	6	12833	12838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020389	AAC	2	6	12855	12860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020389	AAT	2	6	12886	12891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020389	TAG	2	6	13157	13162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020389	TAA	2	6	13175	13180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020389	T	6	6	13203	13208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020389	TAAA	2	8	13393	13400	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020389	A	6	6	13398	13403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020389	GA	3	6	13432	13437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020389	A	6	6	13437	13442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020389	TTG	2	6	13819	13824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020389	GCCT	2	8	13827	13834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020389	CA	3	6	13991	13996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020389	AAT	2	6	14004	14009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020389	TAC	2	6	14058	14063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020389	TA	3	6	14106	14111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020389	AAT	2	6	14684	14689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020389	T	7	7	14718	14724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020389	T	6	6	14765	14770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020389	AT	3	6	14776	14781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020389	TCT	2	6	14788	14793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020389	CAG	2	6	15001	15006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020389	AAT	2	6	15010	15015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020389	AATAGG	2	12	15049	15060	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020389	T	7	7	15070	15076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020389	ATA	2	6	15090	15095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020389	TAT	2	6	15585	15590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020389	T	7	7	15750	15756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020389	TCC	2	6	16355	16360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_020389	AAAAAT	2	12	16363	16374	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020389	TTCA	2	8	16397	16404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020389	TA	4	8	16455	16462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020389	TG	3	6	16477	16482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020389	ATAA	2	8	16486	16493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020389	TAA	2	6	16503	16508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020389	CAAA	2	8	16567	16574	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020389	TTGT	2	8	16796	16803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020389	TTTCT	2	10	16828	16837	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_020389	T	7	7	16840	16846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020389	TC	4	8	16850	16857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020389	TAT	2	6	17021	17026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020389	CTG	2	6	17038	17043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020389	AG	3	6	17144	17149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020389	T	7	7	17155	17161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020389	TGT	2	6	17192	17197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020389	TTA	2	6	17229	17234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020389	TAATT	2	10	17550	17559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020389	TCTTT	2	10	17580	17589	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_020389	TGA	2	6	17635	17640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020389	AGG	2	6	17645	17650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020389	ATT	2	6	17689	17694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020389	TAA	2	6	17707	17712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020389	AGG	2	6	17731	17736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020389	AAGA	2	8	17766	17773	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020389	A	6	6	18152	18157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020389	TGC	2	6	18204	18209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_020389	A	6	6	18273	18278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020389	ATT	2	6	18293	18298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020389	T	7	7	18306	18312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020389	AT	3	6	18315	18320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020389	CGG	2	6	18330	18335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_020389	A	6	6	18392	18397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020389	CTT	2	6	18438	18443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_020389	GGAG	2	8	18468	18475	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020389	GTT	2	6	18492	18497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_020389	CGG	2	6	32519	32524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_020389	GTT	2	6	32550	32555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_020389	AT	3	6	57032	57037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_020389	ATAA	2	8	68301	68308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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