MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis 7199-99 complete genome

Total Repeats: 8571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020089	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020089	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020089	TC	4	8	1562	1569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020089	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020089	AC	4	8	1686	1693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020089	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020089	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020089	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_020089	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020089	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020089	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020089	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020089	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020089	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020089	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020089	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020089	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020089	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020089	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020089	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020089	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020089	TCG	2	6	10862	10867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020089	TCC	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_020089	ACG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020089	GGC	2	6	11022	11027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020089	TCG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020089	CCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_020089	ACCCG	2	10	11279	11288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_020089	CGG	2	6	11320	11325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020089	ACG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020089	ACC	2	6	11425	11430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_020089	ACC	3	9	11495	11503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_020089	GCC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_020089	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020089	CCG	2	6	11637	11642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_020089	CGA	2	6	11694	11699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020089	ACT	2	6	11741	11746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020089	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020089	GAC	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020089	GCC	2	6	12315	12320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_020089	CGG	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020089	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_020089	TCG	2	6	13034	13039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020089	CAC	2	6	13577	13582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_020089	CGACC	2	10	13672	13681	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_020089	ATTC	2	8	13691	13698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020089	CGG	2	6	13702	13707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020089	GAC	2	6	14032	14037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020089	C	6	6	23207	23212	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_020089	GC	3	6	23223	23228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020089	TCG	2	6	23254	23259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020089	GGT	2	6	23816	23821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020089	TCG	2	6	25458	25463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020089	TCAA	2	8	25496	25503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020089	GAGC	2	8	25524	25531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020089	GGCC	2	8	25538	25545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020089	CCG	2	6	25559	25564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_020089	CTA	2	6	25594	25599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020089	TCC	2	6	25611	25616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_020089	GTT	2	6	25618	25623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020089	TCG	3	9	25738	25746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020089	GCC	2	6	25752	25757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_020089	AAC	2	6	26864	26869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020089	CGT	2	6	26882	26887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020089	CTT	2	6	26933	26938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020089	CGAGC	2	10	26950	26959	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_020089	CCT	2	6	27432	27437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_020089	TA	3	6	27508	27513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020089	GTA	2	6	27547	27552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020089	GTC	2	6	29502	29507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020089	GCC	3	9	29508	29516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_020089	AC	3	6	29641	29646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020089	AT	3	6	31055	31060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020089	GCG	2	6	31064	31069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020089	ACCGCG	2	12	31070	31081	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020089	ACCA	2	8	31105	31112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020089	CGG	2	6	31116	31121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020089	CAA	2	6	31151	31156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020089	GAG	2	6	31157	31162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020089	GGC	2	6	31854	31859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020089	TCG	2	6	31914	31919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020089	TGC	3	9	31923	31931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020089	AC	3	6	31976	31981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020089	CAC	2	6	31986	31991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_020089	GAT	2	6	32015	32020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020089	TGG	2	6	33180	33185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020089	G	6	6	33184	33189	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020089	CCGCC	2	10	33789	33798	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
89	NC_020089	GCTA	2	8	33836	33843	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_020089	CGG	2	6	33895	33900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020089	GCG	2	6	33916	33921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020089	TGG	2	6	33977	33982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020089	CGG	2	6	34048	34053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020089	GGT	2	6	34110	34115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020089	CCA	2	6	34132	34137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_020089	G	6	6	34172	34177	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020089	ACC	2	6	36505	36510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_020089	TCA	2	6	38943	38948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020089	CG	3	6	38964	38969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020089	GC	3	6	38974	38979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020089	CT	3	6	39013	39018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020089	CG	3	6	39020	39025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020089	GC	3	6	39030	39035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020089	CAC	2	6	39810	39815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_020089	TCG	2	6	39832	39837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020089	GCC	2	6	41206	41211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_020089	GGT	2	6	41267	41272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020089	GAT	2	6	41275	41280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020089	CCG	3	9	41899	41907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_020089	AGC	2	6	41918	41923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020089	GCGTC	2	10	41924	41933	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_020089	GCC	2	6	42348	42353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_020089	CGT	2	6	43383	43388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020089	GTG	2	6	43460	43465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020089	CGG	2	6	46459	46464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020089	CGC	2	6	46514	46519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_020089	CGG	2	6	46526	46531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020089	CTAC	2	8	47199	47206	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020089	GCT	2	6	47316	47321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020089	ATCGG	2	10	47331	47340	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_020089	GTG	2	6	49980	49985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020089	CCT	2	6	51715	51720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_020089	ACG	2	6	51746	51751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020089	AT	3	6	51783	51788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020089	ACA	2	6	51794	51799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020089	TAG	2	6	52686	52691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020089	CTGG	2	8	52696	52703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020089	CCG	2	6	52720	52725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_020089	CAA	2	6	52734	52739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_020089	GGT	2	6	52758	52763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020089	CGT	2	6	52772	52777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020089	GTC	2	6	53243	53248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020089	GCG	2	6	53251	53256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020089	CG	3	6	53260	53265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020089	CGA	2	6	53303	53308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020089	TCC	2	6	53323	53328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_020089	GC	3	6	53398	53403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020089	CGC	2	6	53416	53421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_020089	GAG	2	6	53433	53438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020089	GCC	2	6	53454	53459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_020089	CCG	2	6	53472	53477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_020089	G	6	6	53479	53484	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020089	TGG	2	6	53492	53497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020089	GCC	2	6	53516	53521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_020089	C	6	6	53526	53531	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
146	NC_020089	GCCG	2	8	53550	53557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020089	TGC	2	6	57379	57384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_020089	CGG	2	6	63084	63089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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186	NC_020089	GAG	2	6	79261	79266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_020089	CGG	2	6	79467	79472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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195	NC_020089	CCA	2	6	80383	80388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
196	NC_020089	CGG	2	6	80407	80412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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263	NC_020089	CGGG	2	8	133972	133979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
264	NC_020089	CCG	2	6	136048	136053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_020089	TG	3	6	136094	136099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
266	NC_020089	TGA	2	6	136115	136120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_020089	GAG	2	6	137310	137315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_020089	GAG	2	6	139813	139818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_020089	TTCT	2	8	139888	139895	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
274	NC_020089	ACGC	2	8	139960	139967	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
275	NC_020089	GAA	2	6	139988	139993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_020089	GAT	2	6	140003	140008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_020089	TGT	2	6	140018	140023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_020089	CGA	2	6	140044	140049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_020089	GGGC	2	8	140052	140059	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
280	NC_020089	GCT	2	6	140066	140071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_020089	CG	5	10	140236	140245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
282	NC_020089	AC	3	6	141092	141097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
283	NC_020089	AGCA	2	8	141132	141139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
284	NC_020089	CGC	2	6	141155	141160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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422	NC_020089	CAC	2	6	231027	231032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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424	NC_020089	GAG	2	6	231085	231090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_020089	GCC	2	6	249142	249147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
444	NC_020089	CGG	2	6	249180	249185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_020089	CTG	2	6	249197	249202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
446	NC_020089	CGG	2	6	249213	249218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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450	NC_020089	CCA	2	6	251936	251941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
451	NC_020089	CGCA	2	8	253846	253853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
452	NC_020089	GACG	2	8	256255	256262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
453	NC_020089	GGA	2	6	256266	256271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
454	NC_020089	AGA	2	6	256278	256283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_020089	CCA	2	6	257957	257962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
457	NC_020089	TGG	2	6	261135	261140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_020089	TCG	2	6	268019	268024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
460	NC_020089	CGG	2	6	268026	268031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_020089	GTG	2	6	273101	273106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
462	NC_020089	GCGG	2	8	273136	273143	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
463	NC_020089	TCG	2	6	273157	273162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
464	NC_020089	CCT	2	6	273187	273192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
465	NC_020089	TCG	2	6	273207	273212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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468	NC_020089	GCAGT	2	10	276224	276233	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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470	NC_020089	CG	3	6	278032	278037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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472	NC_020089	TCG	2	6	281364	281369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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