MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 10004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019965	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019965	A	8	8	1553	1560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019965	TC	4	8	1563	1570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019965	CGG	2	6	1644	1649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019965	CCAAC	2	10	1679	1688	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_019965	AC	4	8	1687	1694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019965	CCGA	2	8	1726	1733	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019965	TCG	2	6	1802	1807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019965	ACC	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_019965	TCG	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019965	ATG	2	6	1890	1895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019965	GTT	3	9	1926	1934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019965	CTG	2	6	1938	1943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019965	CGT	2	6	1951	1956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019965	TCG	2	6	1980	1985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019965	GAA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019965	AGA	2	6	5142	5147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019965	GTG	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019965	GCG	2	6	5192	5197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019965	GAG	2	6	5223	5228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019965	CGA	3	9	9831	9839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019965	GAG	2	6	9860	9865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019965	TCG	2	6	10863	10868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019965	TCC	2	6	10948	10953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_019965	ACG	2	6	10978	10983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019965	GGC	2	6	11023	11028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019965	TCG	2	6	11031	11036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019965	CCT	2	6	11084	11089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019965	ACCCG	2	10	11280	11289	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_019965	CGG	2	6	11321	11326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019965	ACG	2	6	11383	11388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019965	ACC	2	6	11426	11431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_019965	ACC	3	9	11496	11504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_019965	GCC	2	6	11533	11538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_019965	GCAC	2	8	11609	11616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019965	CCG	2	6	11638	11643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_019965	TGG	2	6	11645	11650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019965	ACT	2	6	11742	11747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019965	CAT	2	6	11803	11808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019965	GAC	2	6	11864	11869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019965	GCC	2	6	12316	12321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_019965	CGG	2	6	12396	12401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019965	GCCC	2	8	12454	12461	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_019965	TCG	2	6	13035	13040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019965	CAC	2	6	13578	13583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_019965	GTT	2	6	13657	13662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019965	CGACC	2	10	13673	13682	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_019965	ATTC	2	8	13692	13699	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019965	CGG	2	6	13703	13708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019965	GAC	2	6	14033	14038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019965	ACCC	2	8	14099	14106	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_019965	GA	3	6	14127	14132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019965	CGCT	2	8	18775	18782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019965	CG	3	6	18791	18796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019965	C	6	6	23285	23290	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_019965	GC	3	6	23301	23306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019965	TCG	2	6	23332	23337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019965	CGC	2	6	23856	23861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019965	GGT	2	6	23894	23899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019965	TCG	2	6	25536	25541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019965	TCAA	2	8	25574	25581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019965	GAGC	2	8	25602	25609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019965	GGCC	2	8	25616	25623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019965	CCG	2	6	25637	25642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_019965	CTA	2	6	25672	25677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019965	TCC	2	6	25689	25694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_019965	GTT	2	6	25696	25701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019965	TCG	3	9	25816	25824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019965	GCC	2	6	25830	25835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_019965	AAC	2	6	26942	26947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019965	CGT	2	6	26960	26965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019965	CTT	2	6	27011	27016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019965	CGAGC	2	10	27028	27037	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_019965	CCT	2	6	27510	27515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_019965	TA	3	6	27586	27591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019965	GTA	2	6	27625	27630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019965	AC	3	6	29720	29725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019965	CAA	2	6	31234	31239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019965	GAG	2	6	31240	31245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019965	AC	3	6	32059	32064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019965	CAC	2	6	32069	32074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_019965	GAT	2	6	32098	32103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019965	TGG	2	6	33257	33262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019965	G	6	6	33261	33266	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019965	CCGCC	2	10	33866	33875	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
86	NC_019965	GCTA	2	8	33913	33920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019965	CGG	2	6	33972	33977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019965	GCG	2	6	33993	33998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019965	TGG	2	6	34054	34059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019965	CGG	2	6	34125	34130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019965	GGT	2	6	34187	34192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019965	CCA	2	6	34209	34214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_019965	TCA	2	6	39020	39025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019965	ACC	2	6	39027	39032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_019965	CG	3	6	39041	39046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019965	GC	3	6	39051	39056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019965	CAC	2	6	39831	39836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_019965	TCG	2	6	39853	39858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019965	GCC	2	6	41227	41232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019965	GGT	2	6	41288	41293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019965	GAT	2	6	41296	41301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019965	CCG	3	9	41920	41928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_019965	AGC	2	6	41939	41944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019965	GCGTC	2	10	41945	41954	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_019965	GCC	3	9	42369	42377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_019965	CGT	2	6	43404	43409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019965	GTG	2	6	43481	43486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019965	CGG	2	6	46480	46485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019965	TCG	2	6	46520	46525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019965	CGC	2	6	46535	46540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_019965	CGG	2	6	46547	46552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019965	CTAC	2	8	47220	47227	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019965	GCT	2	6	47337	47342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019965	ATCGG	2	10	47352	47361	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019965	CCA	2	6	49033	49038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_019965	GTG	2	6	50001	50006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019965	CCT	2	6	51736	51741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_019965	ACG	2	6	51767	51772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019965	AT	3	6	51804	51809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019965	ACA	2	6	51815	51820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019965	TAG	2	6	52707	52712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019965	CTGG	2	8	52717	52724	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019965	CCG	2	6	52741	52746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_019965	CAA	2	6	52755	52760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019965	GGT	2	6	52779	52784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019965	CGT	2	6	52793	52798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019965	GTC	2	6	53264	53269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019965	GCG	2	6	53272	53277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019965	CG	3	6	53281	53286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019965	GAC	2	6	53325	53330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019965	TCC	2	6	53344	53349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_019965	GC	3	6	53419	53424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019965	CGC	2	6	53437	53442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_019965	GAG	2	6	53454	53459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019965	GCC	2	6	53475	53480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_019965	CCG	2	6	53493	53498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_019965	G	6	6	53500	53505	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019965	TGG	2	6	53513	53518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019965	GCC	2	6	53537	53542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_019965	C	6	6	53547	53552	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_019965	GCCG	2	8	53571	53578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019965	TGC	2	6	57406	57411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019965	CGC	2	6	58033	58038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_019965	TCG	2	6	58042	58047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_019965	GAC	2	6	139364	139369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_019965	GT	3	6	139376	139381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
279	NC_019965	GAG	2	6	139391	139396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
280	NC_019965	TTCT	2	8	139466	139473	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
281	NC_019965	GCC	2	6	139474	139479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
282	NC_019965	ACGC	2	8	139538	139545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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284	NC_019965	CG	5	10	139814	139823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
285	NC_019965	AC	3	6	140670	140675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
286	NC_019965	AGCA	2	8	140710	140717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
287	NC_019965	CGC	2	6	140733	140738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_019965	GGCC	2	8	140755	140762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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322	NC_019965	GAG	3	9	154054	154062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_019965	TCG	2	6	186420	186425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_019965	CGT	2	6	186430	186435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_019965	CGC	2	6	186528	186533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
423	NC_019965	AAC	2	6	186547	186552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_019965	TTGA	2	8	186556	186563	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
425	NC_019965	CGA	2	6	186601	186606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_019965	GC	3	6	188713	188718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
427	NC_019965	CCG	2	6	188719	188724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
428	NC_019965	GGC	2	6	190419	190424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_019965	TGC	2	6	191795	191800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_019965	CGC	2	6	193441	193446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
431	NC_019965	GGAAG	2	10	194809	194818	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
432	NC_019965	CTGG	2	8	196543	196550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
433	NC_019965	CA	3	6	196607	196612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
434	NC_019965	AGG	3	9	196628	196636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
435	NC_019965	ATG	2	6	196645	196650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
436	NC_019965	CGC	2	6	196651	196656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
437	NC_019965	CGG	2	6	196676	196681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
438	NC_019965	GTC	3	9	206635	206643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
439	NC_019965	CCG	2	6	209521	209526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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441	NC_019965	GCCGA	2	10	214765	214774	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
442	NC_019965	CGGG	2	8	218182	218189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
443	NC_019965	TCG	2	6	218246	218251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_019965	ACAGCC	2	12	218317	218328	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
445	NC_019965	GGT	2	6	218417	218422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
446	NC_019965	AT	3	6	218454	218459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_019965	ACC	2	6	218482	218487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
448	NC_019965	CTG	2	6	218505	218510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
449	NC_019965	GC	3	6	218511	218516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
450	NC_019965	CGGT	2	8	218519	218526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
451	NC_019965	GATG	2	8	219266	219273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
452	NC_019965	TGC	2	6	219297	219302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_019965	CGC	2	6	221589	221594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
454	NC_019965	ATG	2	6	221643	221648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
455	NC_019965	CGC	2	6	221999	222004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
456	NC_019965	CAC	2	6	222026	222031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
457	NC_019965	GGTGC	2	10	222037	222046	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
458	NC_019965	ACC	2	6	222088	222093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
459	NC_019965	CAG	2	6	223369	223374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_019965	GC	3	6	224504	224509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
462	NC_019965	GGC	2	6	226481	226486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_019965	ACC	2	6	226671	226676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
464	NC_019965	AACT	2	8	230462	230469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
465	NC_019965	TGT	2	6	230602	230607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_019965	G	6	6	230652	230657	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
468	NC_019965	GAG	2	6	230703	230708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
469	NC_019965	TCC	2	6	230713	230718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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471	NC_019965	GGCCG	2	10	231399	231408	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
472	NC_019965	GTG	2	6	231420	231425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
473	NC_019965	ACAT	2	8	231456	231463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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479	NC_019965	TCG	2	6	241273	241278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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491	NC_019965	CGG	2	6	248828	248833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
492	NC_019965	CCA	2	6	248842	248847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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