MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070010 complete genome

Total Repeats: 11722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019951	TCT	2	6	1532	1537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019951	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019951	TC	4	8	1562	1569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019951	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019951	AC	4	8	1686	1693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019951	TCA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019951	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019951	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019951	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_019951	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019951	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019951	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019951	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019951	CG	3	6	1963	1968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019951	GC	3	6	5022	5027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019951	GAA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019951	AGA	2	6	5142	5147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019951	GTG	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019951	GAG	2	6	5223	5228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019951	TCG	2	6	10810	10815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019951	TCC	2	6	10895	10900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_019951	GGC	2	6	10970	10975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019951	GTC	2	6	10977	10982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019951	CCT	2	6	11031	11036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_019951	GGA	2	6	11127	11132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019951	GA	3	6	11137	11142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019951	ACG	2	6	11185	11190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019951	GT	3	6	11263	11268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019951	GTT	2	6	11273	11278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019951	CCG	2	6	11371	11376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_019951	TCA	2	6	11449	11454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019951	GCG	2	6	11509	11514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019951	TCT	2	6	11527	11532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019951	TCG	2	6	11557	11562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019951	GGT	2	6	11580	11585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019951	CGA	2	6	11627	11632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019951	CATA	2	8	11636	11643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019951	GCC	2	6	11714	11719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_019951	GCG	2	6	11765	11770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019951	CGACT	2	10	11848	11857	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_019951	GGTG	2	8	11872	11879	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019951	GT	3	6	11918	11923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019951	GTTGG	2	10	11979	11988	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019951	TGG	2	6	12006	12011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019951	GCT	2	6	12035	12040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019951	CATGC	2	10	12089	12098	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_019951	CA	3	6	12108	12113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019951	CGC	2	6	12122	12127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_019951	GGT	2	6	12128	12133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019951	GGC	2	6	12134	12139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019951	ATC	2	6	12215	12220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019951	CAG	2	6	12223	12228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019951	GAG	2	6	12230	12235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019951	GCA	2	6	12265	12270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019951	GCC	2	6	12276	12281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_019951	CG	3	6	12399	12404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019951	GACA	2	8	12561	12568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019951	GGC	2	6	14071	14076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019951	CGA	2	6	14171	14176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019951	GCG	2	6	14189	14194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019951	TGA	2	6	17117	17122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019951	AGC	2	6	17141	17146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019951	GTC	2	6	17186	17191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019951	CAGC	2	8	17192	17199	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019951	TGA	2	6	17210	17215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019951	TGC	2	6	17222	17227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019951	GAT	2	6	17261	17266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019951	CGCA	2	8	17271	17278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019951	CGT	2	6	17317	17322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019951	GCG	3	9	17334	17342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019951	GAA	2	6	17376	17381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019951	GT	3	6	17407	17412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019951	GGC	2	6	17439	17444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019951	GTG	2	6	17466	17471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019951	TCCT	2	8	19528	19535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019951	ATC	2	6	19930	19935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019951	TTC	2	6	19959	19964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019951	GCC	2	6	20052	20057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_019951	TCC	2	6	20097	20102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_019951	TTC	2	6	20133	20138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019951	GAA	2	6	20163	20168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019951	CCT	2	6	20628	20633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_019951	GCC	2	6	20647	20652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_019951	GCCC	2	8	20655	20662	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_019951	CCAA	2	8	20684	20691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019951	CGCC	2	8	20696	20703	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_019951	TACG	2	8	20727	20734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019951	CG	3	6	20736	20741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019951	CTG	3	9	21214	21222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019951	ATC	2	6	21227	21232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019951	CGTT	2	8	21235	21242	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019951	TCG	2	6	21278	21283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019951	GTA	2	6	22097	22102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019951	GCC	2	6	23119	23124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_019951	CGG	2	6	23199	23204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019951	GCCC	2	8	23257	23264	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_019951	CAC	2	6	24381	24386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_019951	CGACC	2	10	24476	24485	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_019951	ATTC	2	8	24495	24502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019951	CGG	2	6	24506	24511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019951	GAC	2	6	24836	24841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019951	ACCC	2	8	24903	24910	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_019951	GA	3	6	24930	24935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019951	CGCT	2	8	29581	29588	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019951	CG	3	6	29597	29602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019951	GC	3	6	34107	34112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019951	GTT	2	6	34153	34158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019951	GC	3	6	34159	34164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019951	TCG	2	6	34192	34197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019951	GGT	2	6	34754	34759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019951	TCG	2	6	36396	36401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019951	TCAA	2	8	36434	36441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019951	GC	3	6	36464	36469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019951	GCCG	2	8	36477	36484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019951	CCG	2	6	36497	36502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_019951	CTA	2	6	36532	36537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019951	TCC	2	6	36549	36554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_019951	GTT	2	6	36556	36561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019951	GA	4	8	36656	36663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019951	TCG	3	9	36680	36688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019951	GCC	2	6	36694	36699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_019951	AAC	2	6	37806	37811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019951	CGT	2	6	37824	37829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019951	CTT	2	6	37875	37880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019951	CGAGC	2	10	37892	37901	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_019951	CCT	2	6	38374	38379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_019951	TA	3	6	38406	38411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019951	TA	3	6	38451	38456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019951	GTA	2	6	38490	38495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019951	AC	3	6	40585	40590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_019951	GCG	2	6	40647	40652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019951	CAA	2	6	42099	42104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019951	GAG	2	6	42105	42110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019951	AC	3	6	42924	42929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019951	CAC	2	6	42934	42939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_019951	GAT	2	6	42963	42968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019951	TGG	2	6	44128	44133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019951	G	6	6	44132	44137	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019951	AGCT	2	8	44783	44790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019951	TGG	2	6	44925	44930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019951	CGG	2	6	44996	45001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019951	GGT	2	6	45057	45062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019951	GT	3	6	45108	45113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019951	G	6	6	45120	45125	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019951	CG	3	6	49914	49919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019951	GC	3	6	49924	49929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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148	NC_019951	CG	3	6	49970	49975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019951	GC	3	6	49980	49985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_019951	CT	3	6	50019	50024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_019951	CG	3	6	50026	50031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_019951	GC	3	6	50036	50041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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162	NC_019951	GCC	3	9	53354	53362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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285	NC_019951	CCA	2	6	111963	111968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_019951	CGA	2	6	113799	113804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_019951	ACG	2	6	113840	113845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_019951	CTG	2	6	113848	113853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_019951	GGC	3	9	114418	114426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_019951	CGG	2	6	114481	114486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_019951	ACC	2	6	114500	114505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_019951	CCA	2	6	115347	115352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_019951	CGGCG	2	10	115377	115386	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
294	NC_019951	GCC	2	6	115397	115402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
295	NC_019951	CGA	2	6	115441	115446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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297	NC_019951	TGC	2	6	115553	115558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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299	NC_019951	GTT	2	6	115616	115621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_019951	CG	4	8	115665	115672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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307	NC_019951	GCC	3	9	116556	116564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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333	NC_019951	GGT	2	6	147114	147119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_019951	GCATG	2	10	186117	186126	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
409	NC_019951	TA	3	6	188082	188087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_019951	AT	3	6	188093	188098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_019951	GAG	2	6	189741	189746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_019951	CAA	2	6	191902	191907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
415	NC_019951	G	7	7	191950	191956	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
416	NC_019951	GT	3	6	191990	191995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
417	NC_019951	CGT	2	6	192001	192006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
418	NC_019951	GAT	2	6	192032	192037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
419	NC_019951	CGC	2	6	192244	192249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
420	NC_019951	CCA	2	6	192307	192312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
421	NC_019951	GGAT	2	8	192323	192330	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
422	NC_019951	CAG	2	6	192337	192342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_019951	CAT	2	6	192350	192355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_019951	AGC	2	6	192397	192402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_019951	GTA	2	6	192422	192427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
426	NC_019951	TGG	2	6	196012	196017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
427	NC_019951	CGT	2	6	198194	198199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
428	NC_019951	CGCAGA	2	12	198534	198545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_019951	GGT	2	6	198559	198564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
430	NC_019951	CGA	2	6	198580	198585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_019951	ACG	2	6	198586	198591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_019951	GTCGC	2	10	198614	198623	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
433	NC_019951	GTG	2	6	198633	198638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_019951	GCC	2	6	198731	198736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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437	NC_019951	CGC	2	6	198756	198761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
438	NC_019951	CGG	3	9	198765	198773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
439	NC_019951	GC	3	6	198846	198851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
440	NC_019951	GTC	2	6	198928	198933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_019951	TGC	2	6	198963	198968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_019951	GAC	2	6	199006	199011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_019951	GGC	2	6	199012	199017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_019951	TCGGCG	2	12	199050	199061	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_019951	GGCC	2	8	199063	199070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
446	NC_019951	GC	4	8	199101	199108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
447	NC_019951	CGA	3	9	199225	199233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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449	NC_019951	CAG	2	6	199241	199246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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451	NC_019951	GTG	2	6	199283	199288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
452	NC_019951	CAC	2	6	199291	199296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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454	NC_019951	CCG	2	6	199335	199340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
455	NC_019951	GTG	3	9	199370	199378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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