MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070010 complete genome

Total Repeats: 11722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_019951	TCA	2	6	3180177	3180182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_019951	CGC	2	6	3180189	3180194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8003	NC_019951	CGG	2	6	3180195	3180200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_019951	GGTT	2	8	3180204	3180211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_019951	CGG	2	6	3181465	3181470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_019951	CAG	2	6	3183806	3183811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_019951	CGC	2	6	3184086	3184091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8008	NC_019951	ACG	2	6	3184093	3184098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_019951	CG	3	6	3184097	3184102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8010	NC_019951	AGG	2	6	3184110	3184115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_019951	GC	3	6	3188781	3188786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8012	NC_019951	CGC	2	6	3188804	3188809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8013	NC_019951	GCCG	2	8	3189579	3189586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8014	NC_019951	CGT	2	6	3189694	3189699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_019951	CCA	2	6	3189773	3189778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8016	NC_019951	GAA	2	6	3189791	3189796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_019951	TCCT	2	8	3191708	3191715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8018	NC_019951	GTG	2	6	3191742	3191747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_019951	CTC	2	6	3191754	3191759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8020	NC_019951	ACA	2	6	3191761	3191766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_019951	GC	4	8	3194676	3194683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8022	NC_019951	CGA	2	6	3194686	3194691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_019951	ACC	2	6	3194704	3194709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8024	NC_019951	GAG	2	6	3194732	3194737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_019951	GCG	2	6	3194740	3194745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_019951	GTC	2	6	3195283	3195288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_019951	GC	3	6	3195290	3195295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8028	NC_019951	GCG	2	6	3196110	3196115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_019951	GCG	2	6	3196125	3196130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_019951	CGC	2	6	3196148	3196153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8031	NC_019951	CAAA	2	8	3196154	3196161	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8032	NC_019951	GCG	2	6	3196182	3196187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_019951	CAG	2	6	3196998	3197003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8035	NC_019951	GCA	2	6	3197055	3197060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_019951	GAT	3	9	3197086	3197094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_019951	TGCG	2	8	3197142	3197149	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8038	NC_019951	CGGC	2	8	3198300	3198307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8039	NC_019951	AACC	2	8	3198328	3198335	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8040	NC_019951	CGC	2	6	3198340	3198345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8041	NC_019951	CGG	2	6	3198355	3198360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_019951	CAA	2	6	3198370	3198375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_019951	CGG	2	6	3198382	3198387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_019951	TTGA	2	8	3198389	3198396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_019951	GCG	2	6	3198405	3198410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_019951	CCG	2	6	3198423	3198428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8047	NC_019951	GCCG	2	8	3198476	3198483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8048	NC_019951	CTT	2	6	3199725	3199730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_019951	GCC	2	6	3199753	3199758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8050	NC_019951	CTC	2	6	3200598	3200603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_019951	CAG	2	6	3200617	3200622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_019951	CGC	2	6	3200814	3200819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8053	NC_019951	AGC	2	6	3200820	3200825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_019951	AC	3	6	3200832	3200837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8055	NC_019951	CGG	2	6	3200869	3200874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_019951	GTG	2	6	3202093	3202098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_019951	ATT	2	6	3202123	3202128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_019951	CAC	2	6	3202154	3202159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8059	NC_019951	CCA	2	6	3203961	3203966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8060	NC_019951	CAC	2	6	3203995	3204000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8061	NC_019951	CCACC	2	10	3204064	3204073	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8062	NC_019951	CAA	2	6	3204093	3204098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_019951	CCG	2	6	3204110	3204115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8064	NC_019951	CAG	2	6	3204160	3204165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_019951	CGAT	2	8	3204216	3204223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8066	NC_019951	GGC	2	6	3204235	3204240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_019951	TCG	2	6	3206925	3206930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_019951	TCG	2	6	3206939	3206944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_019951	TGG	2	6	3206958	3206963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8072	NC_019951	GGGC	2	8	3207530	3207537	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8073	NC_019951	TCA	2	6	3207981	3207986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8075	NC_019951	TCT	2	6	3208030	3208035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8077	NC_019951	GAG	2	6	3210353	3210358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_019951	CT	3	6	3213939	3213944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8080	NC_019951	ATCG	2	8	3214042	3214049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8081	NC_019951	CTGG	2	8	3214146	3214153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8082	NC_019951	CGG	2	6	3214235	3214240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8088	NC_019951	GGT	2	6	3216229	3216234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_019951	GC	4	8	3216284	3216291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8090	NC_019951	GGC	2	6	3218141	3218146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_019951	GC	3	6	3218169	3218174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8092	NC_019951	CT	3	6	3218194	3218199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8093	NC_019951	CTCC	2	8	3220190	3220197	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8094	NC_019951	ATC	2	6	3221480	3221485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_019951	CGC	2	6	3221502	3221507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8096	NC_019951	CGGG	2	8	3221508	3221515	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8097	NC_019951	GC	3	6	3221642	3221647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8098	NC_019951	CTC	3	9	3221810	3221818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8099	NC_019951	CTC	3	9	3221879	3221887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8100	NC_019951	CAC	2	6	3224449	3224454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8101	NC_019951	CGGGTA	2	12	3224489	3224500	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8102	NC_019951	CGTC	2	8	3227701	3227708	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8103	NC_019951	CGA	2	6	3227768	3227773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_019951	GAC	2	6	3227782	3227787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_019951	GAT	2	6	3228486	3228491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_019951	AACCA	2	10	3228510	3228519	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8107	NC_019951	CGA	2	6	3229947	3229952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_019951	GGT	2	6	3230055	3230060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_019951	CG	3	6	3231783	3231788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8110	NC_019951	GTA	2	6	3232394	3232399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_019951	GCC	2	6	3233528	3233533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8112	NC_019951	CCGG	2	8	3233593	3233600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8113	NC_019951	TGGA	2	8	3233655	3233662	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_019951	CAT	2	6	3233724	3233729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_019951	CGG	2	6	3233745	3233750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_019951	CGA	2	6	3233789	3233794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_019951	AGC	2	6	3233863	3233868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_019951	GAG	2	6	3233869	3233874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_019951	CGC	2	6	3235188	3235193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8120	NC_019951	CGC	3	9	3236855	3236863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8121	NC_019951	CCG	2	6	3236899	3236904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8122	NC_019951	CCG	2	6	3236969	3236974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8123	NC_019951	TCG	2	6	3236977	3236982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8125	NC_019951	GGC	2	6	3237005	3237010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_019951	CCCG	2	8	3237051	3237058	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8127	NC_019951	TCG	2	6	3237570	3237575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8129	NC_019951	GTT	2	6	3237616	3237621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_019951	GTC	2	6	3237622	3237627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8134	NC_019951	ATC	2	6	3238226	3238231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8138	NC_019951	CGG	3	9	3238314	3238322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8147	NC_019951	CGCGG	2	10	3238727	3238736	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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8241	NC_019951	CGAA	2	8	3246535	3246542	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8242	NC_019951	TG	3	6	3246690	3246695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8243	NC_019951	CCTC	2	8	3246782	3246789	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8244	NC_019951	GGC	2	6	3246905	3246910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8247	NC_019951	C	9	9	3247070	3247078	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8248	NC_019951	CA	3	6	3247124	3247129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8249	NC_019951	CGG	2	6	3247215	3247220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8251	NC_019951	CGG	2	6	3247410	3247415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8252	NC_019951	CGT	2	6	3247497	3247502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8253	NC_019951	GAA	2	6	3247643	3247648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8254	NC_019951	CACC	2	8	3247702	3247709	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8255	NC_019951	CCTC	2	8	3247864	3247871	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8256	NC_019951	AAC	2	6	3248066	3248071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8257	NC_019951	TGA	2	6	3248273	3248278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8259	NC_019951	TGGC	2	8	3248648	3248655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8260	NC_019951	GC	3	6	3248696	3248701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8261	NC_019951	GCA	2	6	3248770	3248775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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