MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 9568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019950	GCC	2	6	539333	539338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_019950	TCG	2	6	539358	539363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_019950	TCGCT	2	10	540146	540155	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1004	NC_019950	CGGC	2	8	540156	540163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_019950	GTG	2	6	543530	543535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019950	CGGC	2	8	544899	544906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_019950	CGG	2	6	548286	548291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_019950	AGCCT	2	10	548346	548355	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1009	NC_019950	GGC	2	6	549230	549235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_019950	CTT	2	6	549256	549261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_019950	ATAGTC	2	12	549307	549318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1012	NC_019950	TTG	2	6	549321	549326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019950	GC	4	8	549423	549430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_019950	TG	3	6	549459	549464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019950	GGT	2	6	551477	551482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_019950	GTC	2	6	551540	551545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_019950	AATC	2	8	551592	551599	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_019950	CGG	2	6	551607	551612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_019950	TGG	2	6	551642	551647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_019950	ACA	2	6	551648	551653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_019950	GAC	2	6	552198	552203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_019950	GTCT	2	8	552214	552221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_019950	AGC	3	9	553139	553147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_019950	CGC	2	6	553198	553203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_019950	CGG	2	6	553346	553351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_019950	GCA	2	6	553363	553368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_019950	TCG	2	6	553398	553403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1029	NC_019950	CT	3	6	553736	553741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_019950	TGC	2	6	553756	553761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_019950	GTA	2	6	553815	553820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_019950	GTA	2	6	553835	553840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019950	GTA	2	6	553845	553850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_019950	CGG	2	6	555960	555965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_019950	GAG	2	6	555995	556000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_019950	CGA	2	6	558918	558923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_019950	TAGGG	2	10	558936	558945	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019950	TGC	2	6	562695	562700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_019950	GAG	2	6	562770	562775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019950	GAC	2	6	563807	563812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_019950	GCG	2	6	565179	565184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_019950	GAG	2	6	565219	565224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019950	GTA	2	6	566183	566188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1045	NC_019950	CGC	2	6	567089	567094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_019950	CCGG	2	8	567150	567157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_019950	GC	3	6	567168	567173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_019950	GTA	2	6	568635	568640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019950	TGG	2	6	568672	568677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019950	TCG	2	6	568679	568684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_019950	GC	4	8	568743	568750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_019950	GTT	2	6	568802	568807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019950	GC	3	6	568816	568821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_019950	CAC	2	6	568832	568837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_019950	GCA	2	6	568917	568922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_019950	GAC	2	6	568936	568941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_019950	GTCG	2	8	568960	568967	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_019950	TGG	2	6	568986	568991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019950	GCCCGC	2	12	569026	569037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_019950	TAC	2	6	569794	569799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_019950	CTG	2	6	569815	569820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_019950	CG	5	10	569831	569840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_019950	GTC	2	6	569857	569862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_019950	AGCA	2	8	571292	571299	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_019950	TGG	2	6	571313	571318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019950	GCA	2	6	571908	571913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_019950	CGAC	2	8	571962	571969	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_019950	CCGAC	2	10	571972	571981	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1069	NC_019950	AGG	2	6	571986	571991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_019950	TCC	2	6	572039	572044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_019950	GGA	2	6	572047	572052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_019950	GC	3	6	574237	574242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_019950	GGC	2	6	574247	574252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1077	NC_019950	CGA	2	6	576216	576221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1080	NC_019950	GC	3	6	577952	577957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_019950	TAA	2	6	580090	580095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_019950	GC	3	6	583871	583876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_019950	CGCC	2	8	583912	583919	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1100	NC_019950	TGG	2	6	583930	583935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_019950	GCAT	2	8	583995	584002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_019950	GCC	2	6	584674	584679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_019950	ACC	2	6	584718	584723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1106	NC_019950	GAG	2	6	584785	584790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_019950	GA	3	6	584804	584809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_019950	CGG	2	6	585589	585594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_019950	CGG	2	6	585598	585603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_019950	GT	3	6	585672	585677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_019950	CGA	3	9	586982	586990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1115	NC_019950	CAC	2	6	587094	587099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_019950	TGA	2	6	587123	587128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_019950	CGA	3	9	587136	587144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_019950	GAG	3	9	587161	587169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_019950	GTTT	2	8	592705	592712	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_019950	CTG	2	6	592757	592762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_019950	CA	4	8	594686	594693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_019950	ACCAGT	2	12	597368	597379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_019950	GCCG	2	8	597719	597726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_019950	AAG	2	6	597859	597864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_019950	GCT	2	6	597900	597905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_019950	CGC	2	6	597989	597994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_019950	CTC	3	9	601719	601727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_019950	TCG	2	6	601748	601753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_019950	CTC	3	9	601777	601785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_019950	TCG	2	6	601806	601811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_019950	CTC	3	9	601835	601843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_019950	TCG	2	6	601864	601869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1134	NC_019950	TGC	2	6	602851	602856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1402	NC_019950	CGCCGT	2	12	721517	721528	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1403	NC_019950	CGA	2	6	721570	721575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1404	NC_019950	CGA	2	6	721590	721595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1405	NC_019950	CGGC	2	8	729919	729926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1406	NC_019950	CATG	2	8	729933	729940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1442	NC_019950	GCC	2	6	740855	740860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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