MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 9568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_019950	GGA	2	6	4396999	4397004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9502	NC_019950	CG	3	6	4397007	4397012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9503	NC_019950	GC	3	6	4397061	4397066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9504	NC_019950	ACT	2	6	4403781	4403786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9505	NC_019950	GCA	2	6	4404882	4404887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9506	NC_019950	CGC	2	6	4404902	4404907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9507	NC_019950	GCC	2	6	4406260	4406265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9508	NC_019950	CCG	2	6	4406278	4406283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9509	NC_019950	GCT	2	6	4406296	4406301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9510	NC_019950	CCG	2	6	4406311	4406316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9511	NC_019950	AGC	2	6	4406331	4406336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9512	NC_019950	GGC	2	6	4406338	4406343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9513	NC_019950	ACC	2	6	4406350	4406355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9514	NC_019950	GGT	2	6	4406362	4406367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9515	NC_019950	GCC	2	6	4406425	4406430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9516	NC_019950	CCA	2	6	4406458	4406463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9517	NC_019950	CAC	2	6	4406540	4406545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9518	NC_019950	GTG	3	9	4406615	4406623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9519	NC_019950	CAT	2	6	4406627	4406632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9520	NC_019950	GCC	2	6	4406710	4406715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9521	NC_019950	CGG	2	6	4406729	4406734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9522	NC_019950	CGC	2	6	4406748	4406753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9523	NC_019950	GCA	2	6	4406804	4406809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9524	NC_019950	T	6	6	4406811	4406816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9525	NC_019950	CTTTA	2	10	4406922	4406931	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9526	NC_019950	TGA	2	6	4407085	4407090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9527	NC_019950	GCA	2	6	4407091	4407096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9528	NC_019950	CGG	2	6	4407111	4407116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9529	NC_019950	CCA	2	6	4407123	4407128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9530	NC_019950	CGT	2	6	4408728	4408733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9531	NC_019950	GCG	2	6	4408799	4408804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9532	NC_019950	CCA	2	6	4408818	4408823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9533	NC_019950	C	6	6	4408873	4408878	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9534	NC_019950	ACC	2	6	4408915	4408920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9535	NC_019950	TCA	2	6	4408939	4408944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9536	NC_019950	GAG	2	6	4408973	4408978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9537	NC_019950	TC	3	6	4409046	4409051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9538	NC_019950	GCA	2	6	4409082	4409087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9539	NC_019950	CTT	2	6	4409140	4409145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9540	NC_019950	CGC	2	6	4409159	4409164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9541	NC_019950	CGA	2	6	4409167	4409172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9542	NC_019950	GCC	2	6	4412187	4412192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9543	NC_019950	CGC	2	6	4412203	4412208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9544	NC_019950	CGGT	2	8	4414227	4414234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9545	NC_019950	GGA	2	6	4414235	4414240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9546	NC_019950	GTC	2	6	4414294	4414299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9547	NC_019950	CG	3	6	4414311	4414316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9548	NC_019950	CGA	2	6	4414499	4414504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9549	NC_019950	CCCG	2	8	4414537	4414544	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9550	NC_019950	CTA	2	6	4414551	4414556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9551	NC_019950	CCGGG	2	10	4421262	4421271	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9552	NC_019950	GCCA	2	8	4421276	4421283	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9553	NC_019950	CGC	2	6	4421924	4421929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9554	NC_019950	TCGC	2	8	4422764	4422771	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9555	NC_019950	CAG	2	6	4422781	4422786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9556	NC_019950	CGTT	2	8	4422799	4422806	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9557	NC_019950	AG	3	6	4426366	4426371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9558	NC_019950	CCGG	2	8	4426432	4426439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9559	NC_019950	CCG	2	6	4429325	4429330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9560	NC_019950	GCG	2	6	4429417	4429422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9561	NC_019950	TCGG	2	8	4429423	4429430	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9562	NC_019950	GGGT	2	8	4430034	4430041	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9563	NC_019950	CACT	2	8	4432084	4432091	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9564	NC_019950	GGT	2	6	4432127	4432132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9565	NC_019950	GCT	2	6	4432137	4432142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9566	NC_019950	GCT	2	6	4432281	4432286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9567	NC_019950	CAC	2	6	4432328	4432333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9568	NC_019950	AAC	2	6	4432341	4432346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.