MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 9568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_019950	TCA	2	6	3262676	3262681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_019950	TGA	2	6	3262694	3262699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_019950	GCG	2	6	3262708	3262713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_019950	TCA	2	6	3262731	3262736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_019950	TGA	2	6	3262749	3262754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_019950	GCG	2	6	3262763	3262768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_019950	TCA	2	6	3262810	3262815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_019950	TGA	2	6	3262828	3262833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_019950	GCG	2	6	3262842	3262847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_019950	TCA	2	6	3262896	3262901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_019950	CCT	2	6	3265053	3265058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7012	NC_019950	TGT	2	6	3265077	3265082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_019950	TGG	2	6	3265118	3265123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_019950	GT	3	6	3265129	3265134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_019950	CGA	2	6	3265154	3265159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_019950	CTG	2	6	3265188	3265193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_019950	CGG	2	6	3265214	3265219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_019950	CGT	2	6	3265236	3265241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_019950	AC	4	8	3266202	3266209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7020	NC_019950	GGC	2	6	3266219	3266224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_019950	CCCCGC	2	12	3266235	3266246	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
7022	NC_019950	GTT	2	6	3266281	3266286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_019950	GCC	2	6	3266330	3266335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_019950	GGC	2	6	3266336	3266341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_019950	ACCA	2	8	3266399	3266406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7026	NC_019950	CGGCA	2	10	3266416	3266425	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7027	NC_019950	ACC	3	9	3266454	3266462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7028	NC_019950	ACG	2	6	3266474	3266479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_019950	CGCC	2	8	3266524	3266531	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7030	NC_019950	TGC	2	6	3266621	3266626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_019950	A	6	6	3266736	3266741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_019950	ATC	2	6	3299362	3299367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7034	NC_019950	CGA	2	6	3305837	3305842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_019950	ACG	2	6	3305948	3305953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_019950	C	6	6	3305960	3305965	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7037	NC_019950	GTT	2	6	3306061	3306066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_019950	TGC	2	6	3306155	3306160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_019950	ATT	2	6	3306191	3306196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_019950	CGC	2	6	3306248	3306253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7041	NC_019950	GCG	2	6	3306258	3306263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_019950	CACAT	2	10	3306265	3306274	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7043	NC_019950	TGG	2	6	3306289	3306294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_019950	CTG	2	6	3306318	3306323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_019950	CGA	3	9	3310953	3310961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_019950	GTT	2	6	3311000	3311005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_019950	GC	3	6	3311023	3311028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7048	NC_019950	GAT	2	6	3311059	3311064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7050	NC_019950	CAA	2	6	3311310	3311315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_019950	CGC	2	6	3311318	3311323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7052	NC_019950	CTG	2	6	3311435	3311440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_019950	CCT	2	6	3312272	3312277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7054	NC_019950	TCGCCG	2	12	3312298	3312309	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7055	NC_019950	CCT	2	6	3312329	3312334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7056	NC_019950	TCGCCG	2	12	3312355	3312366	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7057	NC_019950	CCT	2	6	3312386	3312391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7058	NC_019950	TCGCCG	2	12	3312412	3312423	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7059	NC_019950	TTC	2	6	3321502	3321507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_019950	CTTC	2	8	3323389	3323396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7061	NC_019950	AG	3	6	3323410	3323415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_019950	GCTGC	2	10	3323422	3323431	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7063	NC_019950	CGCGA	2	10	3323484	3323493	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7064	NC_019950	GCTG	2	8	3323580	3323587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7065	NC_019950	AC	3	6	3323604	3323609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7066	NC_019950	GGCT	2	8	3323615	3323622	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7067	NC_019950	CTG	2	6	3323659	3323664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_019950	TTCG	2	8	3323699	3323706	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7073	NC_019950	CG	3	6	3325248	3325253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7074	NC_019950	CG	3	6	3325256	3325261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7075	NC_019950	CTTCT	2	10	3325320	3325329	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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7077	NC_019950	GCC	2	6	3327547	3327552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7078	NC_019950	GAC	2	6	3327568	3327573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7082	NC_019950	CGCCAC	2	12	3328440	3328451	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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7090	NC_019950	GCG	2	6	3331264	3331269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7091	NC_019950	GTG	2	6	3331324	3331329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7094	NC_019950	GCT	2	6	3334049	3334054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7098	NC_019950	AATGC	2	10	3335967	3335976	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7099	NC_019950	ACCG	2	8	3335994	3336001	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7100	NC_019950	CAT	2	6	3336742	3336747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7102	NC_019950	AGTC	2	8	3336767	3336774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7103	NC_019950	TGA	2	6	3336811	3336816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7105	NC_019950	TCT	2	6	3336946	3336951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_019950	CGG	2	6	3336968	3336973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7111	NC_019950	ACG	2	6	3337154	3337159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7120	NC_019950	CGG	3	9	3340394	3340402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7126	NC_019950	TCG	2	6	3341846	3341851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7253	NC_019950	CA	3	6	3407618	3407623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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