MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.02

Total Repeats: 574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019760	A	7	7	18	24	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019760	TGT	2	6	27	32	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019760	GGT	2	6	77	82	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019760	CTTTT	2	10	168	177	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019760	AAG	2	6	247	252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019760	CTT	2	6	272	277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019760	AGT	2	6	317	322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019760	TCT	2	6	379	384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019760	AAATCT	2	12	385	396	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019760	TGT	4	12	402	413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019760	T	6	6	424	429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019760	C	7	7	879	885	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_019760	T	6	6	886	891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019760	G	6	6	894	899	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019760	G	6	6	903	908	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019760	CTT	2	6	955	960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019760	C	9	9	1042	1050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_019760	GAGG	2	8	1065	1072	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019760	GTT	2	6	1269	1274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019760	T	6	6	1282	1287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019760	GTT	2	6	1314	1319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019760	GTC	2	6	1334	1339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019760	GGT	2	6	1347	1352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019760	TTTGT	2	10	1378	1387	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019760	G	6	6	1409	1414	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019760	AATT	2	8	1497	1504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019760	CGGG	2	8	1605	1612	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019760	CGC	2	6	2402	2407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019760	GGAA	2	8	2431	2438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019760	GGAC	2	8	2517	2524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019760	AT	3	6	2764	2769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019760	AGAA	2	8	2911	2918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019760	CAA	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019760	ACT	2	6	3854	3859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019760	ATCG	2	8	3871	3878	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019760	TGT	2	6	3981	3986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019760	TTGA	2	8	4349	4356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019760	GGA	2	6	4362	4367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019760	GTT	2	6	4425	4430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019760	GTG	2	6	5118	5123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019760	CAC	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_019760	TC	3	6	5231	5236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019760	TCC	2	6	5308	5313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_019760	TTA	2	6	5315	5320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019760	TGT	2	6	5350	5355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019760	CAT	2	6	5399	5404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019760	CTA	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019760	TAG	2	6	6595	6600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019760	C	7	7	6610	6616	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_019760	C	6	6	6619	6624	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_019760	G	6	6	6632	6637	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019760	G	7	7	6683	6689	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019760	AAT	2	6	6690	6695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019760	CTCCC	2	10	6700	6709	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
55	NC_019760	C	7	7	6755	6761	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_019760	CTGT	2	8	7298	7305	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019760	CAG	2	6	7339	7344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019760	CCT	2	6	8678	8683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019760	TCT	2	6	9055	9060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019760	CTG	2	6	9070	9075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019760	TCA	2	6	9089	9094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019760	TA	3	6	9986	9991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019760	CAG	2	6	10008	10013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019760	T	6	6	10031	10036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019760	CTGC	2	8	10055	10062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019760	T	6	6	10088	10093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019760	C	6	6	10108	10113	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_019760	G	6	6	10121	10126	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019760	ACT	2	6	10144	10149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019760	TTGA	2	8	10206	10213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019760	C	6	6	10219	10224	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_019760	TTA	2	6	10225	10230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019760	GAG	2	6	10247	10252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019760	G	7	7	10255	10261	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019760	G	6	6	10289	10294	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019760	GTTG	2	8	14927	14934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019760	TTC	2	6	14972	14977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019760	TCA	2	6	14988	14993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019760	A	6	6	15005	15010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019760	A	6	6	15103	15108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019760	TC	3	6	15143	15148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019760	GA	3	6	15206	15211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019760	TCGT	2	8	15220	15227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019760	TC	3	6	15250	15255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019760	AGAA	2	8	15297	15304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019760	T	6	6	15330	15335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019760	AAT	2	6	15364	15369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019760	ATCA	2	8	15400	15407	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019760	A	7	7	15532	15538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019760	TTAT	2	8	15543	15550	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019760	CT	3	6	15661	15666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019760	T	6	6	15676	15681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019760	AAGGC	2	10	15712	15721	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019760	TTCTT	2	10	15791	15800	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019760	GAA	2	6	15889	15894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019760	AAAG	2	8	15911	15918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019760	C	6	6	16141	16146	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_019760	TGG	2	6	16160	16165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019760	GAT	2	6	16171	16176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019760	T	6	6	16343	16348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019760	ATCA	2	8	16349	16356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019760	TCC	2	6	17181	17186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_019760	GAG	2	6	17218	17223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019760	TC	3	6	17324	17329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019760	ATT	2	6	17374	17379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019760	CT	3	6	17402	17407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019760	T	6	6	17426	17431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019760	T	6	6	17436	17441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019760	GCCCTT	2	12	17502	17513	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019760	TAGT	2	8	17538	17545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019760	TATT	2	8	18452	18459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019760	GT	3	6	18465	18470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019760	TAT	2	6	18482	18487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019760	TC	3	6	18494	18499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019760	TTA	2	6	18547	18552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019760	AATTAA	2	12	18571	18582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019760	C	7	7	18732	18738	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_019760	GAG	2	6	18846	18851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019760	GATC	2	8	18884	18891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019760	AAAG	2	8	18901	18908	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019760	CTG	2	6	18947	18952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019760	A	8	8	18958	18965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019760	GCG	2	6	18989	18994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019760	GGGAT	2	10	19081	19090	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019760	AAG	2	6	19121	19126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019760	CAA	2	6	19215	19220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019760	GCC	2	6	19274	19279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_019760	TG	3	6	19322	19327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019760	A	6	6	19423	19428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019760	TCT	2	6	19475	19480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019760	CCAA	2	8	19536	19543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019760	AGT	2	6	19582	19587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019760	CA	3	6	19620	19625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019760	T	6	6	19654	19659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019760	AGG	2	6	22248	22253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019760	A	7	7	22254	22260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019760	AC	3	6	22302	22307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019760	TTC	2	6	22354	22359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019760	CAA	2	6	25213	25218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019760	TTG	2	6	25223	25228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019760	T	7	7	25281	25287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019760	ATA	2	6	25393	25398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019760	TTTTC	2	10	25436	25445	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_019760	GA	3	6	25501	25506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019760	AGC	2	6	25531	25536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019760	GTT	2	6	25539	25544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019760	CAGC	2	8	25546	25553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_019760	TTC	3	9	25562	25570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019760	CT	3	6	25601	25606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_019760	CCG	2	6	25619	25624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_019760	AGA	2	6	25633	25638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019760	ATCT	2	8	25669	25676	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_019760	CTTG	2	8	25708	25715	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_019760	T	6	6	25731	25736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019760	GTT	2	6	25782	25787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_019760	T	6	6	25795	25800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019760	TAT	2	6	25840	25845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_019760	GGC	2	6	27058	27063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_019760	TTAA	2	8	27116	27123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019760	GAA	2	6	27534	27539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019760	ATAG	2	8	27558	27565	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_019760	GGT	2	6	27566	27571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_019760	TTAA	2	8	27608	27615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_019760	CTT	2	6	27660	27665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_019760	AGG	2	6	28221	28226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_019760	A	6	6	28227	28232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_019760	CAC	2	6	28244	28249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_019760	AAT	2	6	28255	28260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_019760	TCC	2	6	28371	28376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_019760	TAT	3	9	28406	28414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_019760	CTT	2	6	34815	34820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_019760	CT	3	6	35411	35416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
173	NC_019760	CT	3	6	35530	35535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
174	NC_019760	TGC	2	6	40668	40673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_019760	GCA	2	6	40696	40701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_019760	TCAAGA	2	12	40763	40774	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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179	NC_019760	AGC	2	6	41007	41012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_019760	CTT	2	6	41029	41034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_019760	TAATT	2	10	41366	41375	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_019760	TG	3	6	41381	41386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
183	NC_019760	TTAA	2	8	41444	41451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_019760	ATT	2	6	41479	41484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_019760	TG	3	6	41489	41494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_019760	C	6	6	41744	41749	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
187	NC_019760	C	6	6	41755	41760	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
188	NC_019760	G	6	6	41769	41774	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
189	NC_019760	GACTCC	2	12	41781	41792	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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191	NC_019760	G	6	6	41858	41863	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
192	NC_019760	GTT	2	6	41896	41901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
193	NC_019760	GGGCTT	2	12	41949	41960	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
194	NC_019760	GTT	2	6	42024	42029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
195	NC_019760	CTG	2	6	42086	42091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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201	NC_019760	T	6	6	42474	42479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_019760	AAT	2	6	57118	57123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_019760	TGA	2	6	57350	57355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_019760	A	7	7	57372	57378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_019760	TTCG	2	8	57512	57519	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
287	NC_019760	GTC	2	6	57520	57525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_019760	TTCA	2	8	57630	57637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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290	NC_019760	AAGC	2	8	57771	57778	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
291	NC_019760	GA	3	6	57842	57847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_019760	A	7	7	57855	57861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_019760	CA	3	6	57875	57880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
295	NC_019760	A	6	6	57886	57891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_019760	TTG	2	6	68833	68838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
443	NC_019760	TGG	2	6	68920	68925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_019760	TAAA	2	8	69333	69340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_019760	AATT	2	8	69347	69354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_019760	CAT	2	6	69420	69425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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482	NC_019760	CAG	2	6	76266	76271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_019760	TGG	2	6	77058	77063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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