MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mesotoga prima MesG1.Ag.4.2 chromosome

Total Repeats: 9215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017934	ATT	2	6	39	44	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017934	TGC	2	6	1413	1418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017934	CCA	2	6	1494	1499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017934	ATAG	2	8	1511	1518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017934	AATC	2	8	1940	1947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017934	GATA	2	8	1949	1956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017934	GCG	2	6	2057	2062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017934	CTT	2	6	2085	2090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017934	CAGAA	2	10	2151	2160	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017934	CCTT	2	8	2195	2202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017934	TTTC	2	8	2255	2262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017934	TTC	2	6	2401	2406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017934	GAA	2	6	2481	2486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017934	CCAC	2	8	2514	2521	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_017934	AAT	2	6	2542	2547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017934	GATA	2	8	2641	2648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017934	AAAG	2	8	2667	2674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017934	TCT	2	6	2683	2688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017934	TCT	2	6	2714	2719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017934	ATC	2	6	2820	2825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017934	GGT	2	6	2842	2847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017934	GAG	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017934	TA	4	8	10704	10711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017934	TAA	2	6	12162	12167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017934	AGTT	2	8	12184	12191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017934	CTTT	2	8	12202	12209	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017934	CAAA	2	8	12234	12241	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017934	GAG	2	6	15159	15164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017934	AGG	2	6	15165	15170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017934	ATG	2	6	17157	17162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017934	GCC	2	6	17163	17168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017934	CTA	2	6	17182	17187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017934	TCT	3	9	17192	17200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017934	T	7	7	25488	25494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017934	AG	3	6	25513	25518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017934	ATTG	2	8	31307	31314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017934	G	6	6	31325	31330	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017934	T	6	6	31345	31350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017934	CCG	2	6	35927	35932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017934	CCA	2	6	35945	35950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017934	TTTC	2	8	36001	36008	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017934	CCA	2	6	36016	36021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017934	CAG	2	6	36041	36046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017934	CCT	2	6	36769	36774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017934	TCAT	2	8	36783	36790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017934	AGA	2	6	36829	36834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017934	ATA	2	6	36835	36840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017934	A	6	6	36866	36871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017934	TTCT	2	8	36882	36889	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017934	GTT	2	6	36990	36995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017934	TGA	2	6	38091	38096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017934	TCA	2	6	38253	38258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017934	AT	3	6	38376	38381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017934	A	6	6	38398	38403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017934	CAA	2	6	38423	38428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017934	TGT	2	6	38459	38464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017934	TAA	2	6	38502	38507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017934	AAC	2	6	38514	38519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017934	AGG	2	6	39129	39134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017934	TAA	2	6	42262	42267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017934	TAC	2	6	42302	42307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017934	GTA	2	6	42446	42451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017934	AGG	2	6	42462	42467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017934	TTC	2	6	45107	45112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017934	AAC	2	6	45114	45119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017934	GAT	2	6	45185	45190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017934	C	6	6	45236	45241	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_017934	GAG	2	6	45313	45318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017934	CAG	2	6	45330	45335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017934	TCT	2	6	45416	45421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017934	GGC	2	6	45471	45476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017934	TGG	2	6	45487	45492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017934	CGT	2	6	45497	45502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017934	CTT	2	6	45506	45511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017934	TA	3	6	45519	45524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017934	GCC	2	6	45543	45548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017934	TC	3	6	45662	45667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017934	CCGT	2	8	45699	45706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017934	AGA	2	6	45727	45732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017934	AG	3	6	45754	45759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017934	ATTG	2	8	45787	45794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017934	TTC	2	6	45801	45806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017934	AG	5	10	45868	45877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017934	GTC	2	6	45906	45911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017934	CTT	2	6	45950	45955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017934	AGG	2	6	46009	46014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017934	CT	3	6	47242	47247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017934	CTTA	2	8	47268	47275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017934	TCTT	2	8	47298	47305	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017934	TCT	2	6	47423	47428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017934	GA	3	6	47470	47475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017934	AAT	2	6	47527	47532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017934	GAC	2	6	47640	47645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017934	TCTT	2	8	47661	47668	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017934	GAC	2	6	47771	47776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017934	ATC	2	6	47826	47831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017934	TTC	3	9	47839	47847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017934	ATTTC	2	10	48781	48790	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017934	TGT	2	6	48817	48822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017934	AG	3	6	51648	51653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017934	TCT	2	6	51654	51659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017934	G	6	6	51700	51705	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017934	TC	3	6	51708	51713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017934	ATC	2	6	51744	51749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017934	CGG	2	6	51780	51785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017934	TTC	2	6	51811	51816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017934	GAAT	2	8	51870	51877	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017934	TTGG	2	8	53376	53383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017934	GATT	2	8	53394	53401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017934	GAT	2	6	53402	53407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017934	AT	3	6	54884	54889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017934	TA	3	6	54894	54899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017934	AGC	2	6	55065	55070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017934	AGCG	2	8	55075	55082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017934	TCT	3	9	55168	55176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017934	ATC	2	6	55191	55196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017934	AAT	2	6	55215	55220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017934	AGG	2	6	55231	55236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017934	G	6	6	55717	55722	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017934	AGG	2	6	55746	55751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017934	AC	3	6	56761	56766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017934	T	6	6	56768	56773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017934	CATTAT	2	12	56808	56819	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017934	TTATGC	2	12	56874	56885	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017934	CTT	2	6	56917	56922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017934	TC	3	6	56967	56972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017934	AGT	2	6	57021	57026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017934	CTTT	2	8	57088	57095	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017934	T	7	7	57150	57156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017934	TTC	2	6	57161	57166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017934	GTT	2	6	57245	57250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017934	G	6	6	57270	57275	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017934	CTG	2	6	57309	57314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017934	ATCTT	2	10	57327	57336	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017934	A	6	6	57344	57349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017934	GATT	2	8	57436	57443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017934	ACG	2	6	57499	57504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017934	CATG	2	8	57550	57557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017934	TGC	2	6	57558	57563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017934	ATC	2	6	57569	57574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017934	TGC	2	6	57586	57591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017934	ATG	2	6	57616	57621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017934	T	8	8	58755	58762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017934	GAA	2	6	58795	58800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017934	TCC	2	6	60125	60130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_017934	TGG	2	6	60177	60182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017934	GGA	2	6	60190	60195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_017934	TCA	3	9	95916	95924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_017934	TCA	2	6	95927	95932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_017934	AAGA	2	8	95945	95952	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
292	NC_017934	TCT	2	6	97901	97906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_017934	ATC	2	6	97964	97969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_017934	A	7	7	97974	97980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_017934	CAAA	2	8	97999	98006	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
296	NC_017934	CAGG	2	8	98174	98181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
297	NC_017934	ACA	2	6	98192	98197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_017934	ACA	2	6	98232	98237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_017934	CT	3	6	98272	98277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
300	NC_017934	T	6	6	98641	98646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_017934	AG	3	6	98854	98859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
304	NC_017934	AGAAT	2	10	98870	98879	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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311	NC_017934	ATCAG	2	10	99235	99244	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
312	NC_017934	TAG	2	6	99251	99256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
313	NC_017934	CAT	2	6	100648	100653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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315	NC_017934	AAG	2	6	105271	105276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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319	NC_017934	CCT	2	6	108789	108794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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323	NC_017934	GT	3	6	108885	108890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
324	NC_017934	ATT	2	6	108922	108927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_017934	TAG	2	6	108934	108939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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327	NC_017934	CTG	2	6	111539	111544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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329	NC_017934	CTG	2	6	111621	111626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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331	NC_017934	GA	3	6	111674	111679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
332	NC_017934	CGC	2	6	111694	111699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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337	NC_017934	GTT	2	6	115894	115899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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339	NC_017934	TCT	2	6	117773	117778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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347	NC_017934	AT	3	6	118378	118383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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371	NC_017934	GAA	2	6	122856	122861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
372	NC_017934	T	6	6	122866	122871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
373	NC_017934	ACC	2	6	122933	122938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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375	NC_017934	ACC	2	6	123016	123021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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396	NC_017934	CAA	2	6	125128	125133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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398	NC_017934	TGG	2	6	125251	125256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
399	NC_017934	TTGG	2	8	125257	125264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
400	NC_017934	GAAGA	2	10	125273	125282	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
401	NC_017934	GAA	2	6	125299	125304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
402	NC_017934	TCC	2	6	126641	126646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
403	NC_017934	AAG	2	6	126701	126706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
404	NC_017934	GAC	2	6	126745	126750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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408	NC_017934	T	8	8	127032	127039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_017934	CTGG	2	8	127045	127052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
410	NC_017934	CT	3	6	127083	127088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
411	NC_017934	TC	3	6	127105	127110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
412	NC_017934	TCCT	2	8	127204	127211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
413	NC_017934	TCC	2	6	127228	127233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
414	NC_017934	TTG	2	6	127320	127325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
415	NC_017934	GCAGAA	2	12	127376	127387	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
416	NC_017934	CTT	2	6	127400	127405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
417	NC_017934	CCT	2	6	127811	127816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
418	NC_017934	C	6	6	128396	128401	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
419	NC_017934	GTC	2	6	128491	128496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_017934	AAG	2	6	128942	128947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
421	NC_017934	TAT	2	6	128972	128977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_017934	GAA	2	6	128990	128995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_017934	AC	3	6	129045	129050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
424	NC_017934	T	6	6	129061	129066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_017934	ATTC	2	8	129087	129094	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
426	NC_017934	GA	3	6	129221	129226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
427	NC_017934	GAT	2	6	129243	129248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_017934	TTCCC	2	10	129492	129501	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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467	NC_017934	TCT	2	6	134544	134549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_017934	TTG	2	6	134718	134723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_017934	A	6	6	136930	136935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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