MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. MOTT36Y chromosome

Total Repeats: 11935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017904	CGT	2	6	22	27	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017904	GCC	2	6	114	119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017904	CAC	2	6	125	130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017904	GCA	2	6	148	153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017904	GC	3	6	1581	1586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017904	T	6	6	1589	1594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017904	CG	3	6	1607	1612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017904	CA	3	6	1656	1661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017904	CGT	2	6	1704	1709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017904	GCC	2	6	1744	1749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017904	CGA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017904	TCG	2	6	1769	1774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017904	TTC	2	6	1849	1854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017904	CGT	2	6	1903	1908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017904	GGA	2	6	1954	1959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017904	GTT	2	6	1966	1971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017904	GTC	3	9	1989	1997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017904	G	6	6	2042	2047	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017904	TGAAGG	2	12	2076	2087	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017904	GCC	2	6	5025	5030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017904	TGA	2	6	5223	5228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017904	CCGC	2	8	5233	5240	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_017904	GACC	2	8	7334	7341	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017904	CGCGG	2	10	9913	9922	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017904	GAG	2	6	9926	9931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017904	TGC	2	6	10919	10924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017904	GGC	2	6	10939	10944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017904	TCG	2	6	10958	10963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017904	TCC	2	6	11043	11048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017904	ACG	2	6	11139	11144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017904	ACC	2	6	11187	11192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017904	CA	3	6	11940	11945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017904	CTG	2	6	11952	11957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017904	CG	3	6	11976	11981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017904	CG	3	6	11996	12001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017904	GCC	2	6	13717	13722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017904	GC	3	6	13758	13763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017904	GGCC	2	8	13766	13773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017904	CGG	2	6	13806	13811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017904	TCG	2	6	13835	13840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017904	GC	3	6	13870	13875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017904	CCCG	2	8	14438	14445	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_017904	CG	3	6	14444	14449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017904	ACA	2	6	14734	14739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017904	C	6	6	14745	14750	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_017904	CGCC	2	8	14758	14765	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_017904	CGG	2	6	14777	14782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017904	CAA	2	6	14813	14818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017904	TGC	2	6	14874	14879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017904	CAC	2	6	14900	14905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017904	GGT	2	6	14967	14972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017904	ATTC	2	8	15014	15021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017904	GTCG	2	8	15023	15030	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017904	TGC	2	6	15031	15036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017904	CGC	2	6	16192	16197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017904	GC	3	6	16208	16213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017904	CCGG	2	8	24450	24457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017904	CAT	2	6	24475	24480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017904	CGT	2	6	24985	24990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017904	GGT	2	6	25043	25048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017904	GC	3	6	26755	26760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017904	GCG	2	6	26874	26879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017904	AGGGC	2	10	26880	26889	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017904	GCG	2	6	26913	26918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017904	GTT	2	6	26957	26962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017904	TAC	2	6	27061	27066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017904	A	6	6	27130	27135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017904	CGG	2	6	27593	27598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017904	GCCG	2	8	27994	28001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017904	GCT	2	6	28003	28008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017904	GT	3	6	28021	28026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017904	CAT	2	6	28535	28540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017904	TCG	2	6	28621	28626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017904	ACA	2	6	28692	28697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017904	CA	3	6	28696	28701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017904	CCT	2	6	28759	28764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017904	C	6	6	28769	28774	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_017904	AGCT	2	8	31391	31398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017904	AGGG	2	8	31400	31407	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017904	GC	3	6	31415	31420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017904	TGC	2	6	31448	31453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017904	GCG	2	6	31454	31459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017904	TCC	2	6	33357	33362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017904	CTT	2	6	33373	33378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017904	TCA	2	6	33465	33470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017904	CTA	2	6	33519	33524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017904	ACG	2	6	33588	33593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017904	CGT	2	6	33601	33606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017904	CGTGG	2	10	33622	33631	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017904	AGC	2	6	33657	33662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017904	GAA	2	6	33695	33700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017904	CGC	2	6	33744	33749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017904	TG	3	6	33774	33779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017904	GAT	2	6	33843	33848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017904	CCGG	2	8	33870	33877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017904	TCC	2	6	35227	35232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017904	GC	3	6	36667	36672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017904	CAA	2	6	36726	36731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017904	TA	3	6	37262	37267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017904	ACG	2	6	38953	38958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017904	TGC	2	6	39356	39361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017904	C	6	6	39385	39390	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_017904	ACT	2	6	39391	39396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017904	CGG	2	6	40948	40953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017904	GGC	2	6	41682	41687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017904	AAC	2	6	41706	41711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017904	CG	4	8	41715	41722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017904	GC	3	6	41733	41738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017904	TCG	2	6	41742	41747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017904	TGC	3	9	41751	41759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017904	TGG	2	6	41857	41862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017904	TCGG	2	8	41869	41876	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017904	CGA	2	6	43657	43662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017904	CG	3	6	44010	44015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017904	CGC	2	6	44033	44038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017904	TC	3	6	44062	44067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017904	CGG	2	6	44115	44120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017904	CG	3	6	44235	44240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017904	GCCG	2	8	45030	45037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017904	CGT	2	6	45056	45061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017904	CAA	2	6	46421	46426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017904	CGA	2	6	46468	46473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017904	GAT	2	6	46486	46491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017904	GCC	2	6	47488	47493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_017904	GCC	2	6	47520	47525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017904	GC	3	6	48822	48827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017904	CAG	2	6	52526	52531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017904	TCA	2	6	55664	55669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017904	CGG	3	9	55687	55695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017904	CG	4	8	56523	56530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017904	CGG	2	6	56565	56570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017904	ACG	2	6	58592	58597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017904	GA	3	6	65438	65443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017904	GTT	2	6	65586	65591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017904	CGC	2	6	65611	65616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017904	AAC	2	6	65617	65622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017904	AAGG	2	8	65639	65646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017904	ACG	2	6	67383	67388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017904	ATCGT	2	10	67406	67415	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017904	AT	3	6	67420	67425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017904	GAT	2	6	68385	68390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017904	CGT	2	6	68485	68490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017904	TGG	2	6	68495	68500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017904	GTC	2	6	68966	68971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017904	CG	3	6	73832	73837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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154	NC_017904	GCC	3	9	75701	75709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_017904	GCC	2	6	75736	75741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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160	NC_017904	CGT	2	6	79284	79289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_017904	TCC	2	6	134774	134779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_017904	GGC	2	6	134780	134785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_017904	CGG	2	6	134836	134841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_017904	GAC	2	6	134867	134872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_017904	CGG	2	6	134873	134878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_017904	CGC	2	6	134883	134888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
291	NC_017904	CGG	2	6	134953	134958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_017904	CCG	2	6	134961	134966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_017904	CGC	2	6	134967	134972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
294	NC_017904	GC	3	6	135018	135023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
295	NC_017904	GAA	2	6	135659	135664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_017904	CGG	2	6	135836	135841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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298	NC_017904	GCG	2	6	135882	135887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_017904	TCGAT	2	10	135889	135898	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
300	NC_017904	G	8	8	136847	136854	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
301	NC_017904	CGG	2	6	136877	136882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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309	NC_017904	TGA	2	6	140718	140723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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311	NC_017904	CGG	2	6	142246	142251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
312	NC_017904	CAA	2	6	142274	142279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
313	NC_017904	TCT	2	6	145010	145015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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320	NC_017904	GCC	2	6	145493	145498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
321	NC_017904	CCG	2	6	146473	146478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
322	NC_017904	GCC	2	6	147697	147702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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326	NC_017904	GCG	2	6	149697	149702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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331	NC_017904	CGC	2	6	151304	151309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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372	NC_017904	AAT	2	6	184547	184552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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415	NC_017904	AGT	2	6	193773	193778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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417	NC_017904	CCG	2	6	195823	195828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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419	NC_017904	ACA	2	6	196957	196962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_017904	TGC	2	6	196995	197000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_017904	CCT	2	6	197667	197672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
422	NC_017904	G	6	6	201159	201164	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
423	NC_017904	CGGC	2	8	201187	201194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
424	NC_017904	TGA	2	6	201269	201274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_017904	GT	3	6	206118	206123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_017904	CCG	2	6	207309	207314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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441	NC_017904	GAG	3	9	208766	208774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017904	ACG	2	6	208793	208798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_017904	AGCGA	2	10	208805	208814	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
444	NC_017904	GAG	3	9	208816	208824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
445	NC_017904	CTG	2	6	210726	210731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NC_017904	AGA	2	6	214142	214147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
448	NC_017904	CAC	2	6	214163	214168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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453	NC_017904	CG	3	6	214387	214392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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456	NC_017904	AAG	2	6	214503	214508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_017904	CCG	2	6	215613	215618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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461	NC_017904	CGG	2	6	216639	216644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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467	NC_017904	CGG	2	6	217979	217984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_017904	CGG	2	6	218041	218046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_017904	CCA	2	6	247026	247031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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500	NC_017904	GC	3	6	263496	263501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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